{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[522.180505864366, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996356595088683, 0, 0.000819311059205333, 0.003695620822566607, 0.7003643404911317, 1, 0.0005555382946891548],
[522.0599938762026, 1220.822603811334, 1, 0, 0.2995382446120431, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.2995382446120431, 0.0005554922930660585],
[522.180505864366, 1220.658168308732, 0, 1, 0.2996149406152684, 0, 0.0008192301710359564, 0.003695255964800209, 0.7003850593847316, 1, 0.0005553447286052939],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005553778720657855],
[522.9936693402994, 1219.882899089556, 0, 1, 0.3000749902854341, 0, 0.0008197508143989375, 0.003697604401858083, 0.6999250097145659, 1, 0.0005553334836792273],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.5517754479929, 1220.324792981862, 0, 1, 0.2998214474354636, 0, 0.0008194539730332786, 0.003696265456021087, 0.7001785525645364, 1, 0.0005554342762754275],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005553892550098138],
[522.180505864366, 1220.94254183396, 1, 0, 0.2995660613597356, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995660613597355, 0.0005553809181347668],
[522.0599938762026, 1220.696062565489, 1, 0, 0.299559994037335, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299559994037335, 0.0005554922958679662],
[522.180505864366, 1220.658168308732, 0, 1, 0.2996149406152684, 0, 0.0008192301710359564, 0.003695255964800209, 0.7003850593847316, 1, 0.0005559864874215686],
[522.1098815556863, 1220.687279941504, 0, 1, 0.2995815537748269, 0, 0.0008192106335767833, 0.00369516783826984, 0.700418446225173, 1, 0.0005555319917155489],
[522.2511301730456, 1220.704845189474, 0, 1, 0.2996352963329564, 0, 0.0008191988456020124, 0.003695114666907719, 0.7003647036670435, 1, 0.0005553980080497213],
[522.6426116076092, 1220.233956822246, 1, 0, 0.2998735659625364, 0.00191335336574275, 0, -0.008630456601214621, 1, 0.2998735659625364, 0.0005557069587443411],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005555381314441063],
[522.0517754479929, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995345653870978, 0, 0.0008191183581367987, 0.0036947516165753, 0.7004654346129022, 1, 0.0005558286425751456],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995175384621367, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004824615378633, 1, 0.0005552682430427805],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554209655412565],
[522.0599938762026, 1220.696062565489, 1, 0, 0.299559994037335, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299559994037335, 0.0005555808522390884],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005555037862842789],
[521.9300836033777, 1220.976160655024, 0, 1, 0.2994596440989036, 0, 0.0008190168098478877, 0.003694293568356886, 0.7005403559010964, 1, 0.0005554607694466325],
[522.0809593666978, 1220.795609063157, 1, 0, 0.2995513100718525, 0.001915411742295744, 0, -0.008639741205840004, 1, 0.2995513100718525, 0.0005553807148548821],
[522.3662421919387, 1220.510326237916, 0, 1, 0.2997149951143899, 0, 0.0008193294054974411, 0.003695703576165952, 0.7002850048856101, 1, 0.0005553977895259175],
[522.144800778137, 1220.731767651718, 1, 0, 0.299587939981621, 0.001915177549426384, 0, -0.008638684845090595, 1, 0.299587939981621, 0.0005553447286211242],
[522.3010178525292, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996568518217295, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719562, 1, 0.2996568518217295, 0.0005554238102043852],
[522.3010178525293, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996568518217295, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719559, 1, 0.2996568518217295, 0.0005554409443531174],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005553447286211242],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005555382946891548],
[522.2800523620341, 1220.596516067821, 1, 0, 0.2996655424844872, 0.001914681587928654, 0, -0.00863644773914944, 1, 0.2996655424844872, 0.0005554734460984726],
[522.2716773584579, 1220.684298004061, 0, 1, 0.2996470850331318, 0, 0.000819212634777967, 0.003695176864976708, 0.7003529149668682, 1, 0.0005554215489109478],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.000555535493874166],
[522.2511301730456, 1220.625438256809, 0, 1, 0.2996489479708468, 0, 0.0008192521380089478, 0.003695355050003422, 0.7003510520291532, 1, 0.0005553892550098138],
[522.0599938762027, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2995599940373351, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584009, 1, 0.299559994037335, 0.0005555889103118325],
[521.7515377934538, 1221.204437569065, 0, 2, 0.2993486612218844, 0, 0.001637727425869176, 0.007387206005251418, 0.4909122985315659, 1, 0.001111151876791573],
[522.2800523620341, 1220.596516067821, 1, 0, 0.2996655424844872, 0.001914681587928654, 0, -0.00863644773914944, 1, 0.2996655424844872, 0.0005555319888874991],
[522.1426116076092, 1220.733956822246, 0, 1, 0.2995866839141705, 0, 0.0008191793096369258, 0.003695026547116643, 0.7004133160858295, 1, 0.0005555185301617055],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005553447286333215],
[522.0599938762026, 1220.696062565489, 1, 0, 0.299559994037335, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299559994037335, 0.0005555352591225801],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.909962634859, 1220.808199550076, 1, 0, 0.2994804174075478, 0.001916039301015651, 0, -0.00864257190005146, 1, 0.2994804174075478, 0.0005554433582293747],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554342766469581],
[522.3010178525292, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2996775717302037, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719562, 1, 0.2996775717302037, 0.0005554324667109343],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005553807145937696],
[522.1426116076092, 1220.733956822246, 0, 1, 0.2995866839141705, 0, 0.0008191793096369258, 0.003695026547116643, 0.7004133160858295, 1, 0.000555492295883822],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995175384621367, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004824615378633, 1, 0.0005553447257531601],
[522.0539646185206, 1220.822603811334, 1, 0, 0.2995358214545481, 0.001915510785806843, 0, -0.008640187955896463, 1, 0.299535821454548, 0.0005555381311820557],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005555381311924942],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554922930406234],
[522.1426116076092, 1220.733956822246, 0, 1, 0.2995866839141705, 0, 0.0008191793096369258, 0.003695026547116643, 0.7004133160858295, 1, 0.0005560377379611726],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005555382946992674],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554027506796663],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554922959202395],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005553447286211242],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005553382185293405],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.000555471658128021],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005552875634994196],
[522.0599938762026, 1220.822603811334, 1, 0, 0.2995382446120431, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.2995382446120431, 0.0005555382946529156],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005553447286211242],
[522.022099619446, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995226384116251, 0, 0.0008191183581367986, 0.003694751616575299, 0.7004773615883749, 1, 0.0005554922930660585],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554210280253096],
[521.863693374526, 1221.012875055329, 1, 0, 0.2994266506461035, 0.001916209180090116, 0, -0.008643338164143536, 1, 0.2994266506461035, 0.0005554503977956493],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995175384621367, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004824615378633, 1, 0.0005555037862842789],
[522.1721308607897, 1221.166543312309, 0, 1, 0.2995242052485681, 0, 0.00081888912325389, 0.003693717619539598, 0.700475794751432, 1, 0.0005557856046378699],
[522.0599938762026, 1220.816574553652, 1, 0, 0.299539280826136, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299539280826136, 0.0005555382945447955],
[522.180505864366, 1220.658168308732, 0, 1, 0.2996149406152684, 0, 0.0008192301710359564, 0.003695255964800209, 0.7003850593847316, 1, 0.0005553447286052939],
[522.0599938762026, 1220.696062565489, 1, 0, 0.299559994037335, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299559994037335, 0.000555492295883822],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554237037552261],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995175384621367, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004824615378633, 1, 0.000555518527288436],
[521.7184001211226, 1221.158168308732, 1, 0, 0.2993432865938034, 0.001916742824803264, 0, -0.008645745245668439, 1, 0.2993432865938034, 0.0005553447286561349],
[522.6426116076092, 1220.233956822246, 0, 1, 0.2998735659625364, 0, 0.0008195149744924466, 0.003696540611909898, 0.7001264340374636, 1, 0.0005555352590744402],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.6178303423692, 1220.258738087486, 1, 0, 0.2998593473622701, 0.001913444092301435, 0, -0.008630865836456435, 1, 0.2998593473622702, 0.0005554494441513027],
[522.338912109286, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996993140942031, 0, 0.000819311059205333, 0.003695620822566607, 0.7003006859057969, 1, 0.0005554778267235866],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554322385353986],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005555382945447955],
[522.180505864366, 1220.733956822246, 0, 1, 0.2996019122243394, 0, 0.0008191793096369258, 0.003695026547116643, 0.7003980877756606, 1, 0.0005554236234994431],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554235797829393],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005553977985218295],
[522.1098815556862, 1220.766686874169, 0, 1, 0.299567904585493, 0, 0.0008191573465692676, 0.003694927479529, 0.700432095414507, 1, 0.0005555319888510411],
[522.2101816929129, 1220.666386736942, 0, 1, 0.2996254532031309, 0, 0.0008192246553730192, 0.003695231085606193, 0.7003745467968692, 1, 0.0005560377377905175],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005553977894629587],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554409444774373],
[522.2716773584579, 1220.684298004061, 0, 1, 0.2996470850331318, 0, 0.000819212634777967, 0.003695176864976708, 0.7003529149668682, 1, 0.0005553447286211242],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005555319917155489],
[522.2716773584579, 1220.684298004061, 0, 1, 0.2996470850331318, 0, 0.000819212634777967, 0.003695176864976708, 0.7003529149668682, 1, 0.0005555050756434397],
[522.2800523620341, 1220.596516067821, 1, 0, 0.2996655424844872, 0.001914681587928654, 0, -0.00863644773914944, 1, 0.2996655424844872, 0.0005554728689601993],
[522.0517754479929, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995345653870978, 0, 0.0008191183581367987, 0.0036947516165753, 0.7004654346129022, 1, 0.0005555380005207307],
[522.2926428489531, 1220.830404849373, 0, 1, 0.2996303924376449, 0, 0.0008191145928441887, 0.003694734632679359, 0.7003696075623551, 1, 0.0005554122096073973],
[522.0809593666978, 1220.795609063157, 1, 0, 0.2995513100718525, 0.001915411742295744, 0, -0.008639741205840004, 1, 0.2995513100718525, 0.0005553702763299678],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[523.0720058954147, 1219.64615628952, 0, 1, 0.3001472167132364, 0, 0.0008199099344044662, 0.003698322135616357, 0.6998527832867636, 1, 0.0005550820570206526],
[522.5304746230223, 1220.346093806833, 0, 1, 0.2998092257868647, 0, 0.0008194396696764361, 0.003696200938664967, 0.7001907742131352, 1, 0.0005554127716988529],
[522.3720683781022, 1220.383988063589, 0, 1, 0.2997390635638738, 0, 0.000819414225179013, 0.003696086167585729, 0.7002609364361263, 1, 0.0005555382946735764],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554238101307433],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554734639477094],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554215489109478],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005555319888619947],
[522.022099619446, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995226384116251, 0, 0.0008191183581367986, 0.003694751616575299, 0.7004773615883749, 1, 0.0005553447286333215],
[522.3720683781022, 1220.383988063589, 0, 1, 0.2997390635638738, 0, 0.000819414225179013, 0.003696086167585729, 0.7002609364361263, 1, 0.0005554922958679662],
[521.680505864366, 1221.196062565489, 0, 1, 0.2993215442298041, 0, 0.0008188693287294095, 0.003693628333479046, 0.7006784557701959, 1, 0.0005555319888874991],
[522.180505864366, 1220.733956822246, 0, 1, 0.2996019122243394, 0, 0.0008191793096369258, 0.003695026547116643, 0.7003980877756606, 1, 0.000555423576921016],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554922930660585],
[522.3010178525293, 1220.569521319644, 1, 0, 0.2996786084298673, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719559, 1, 0.2996786084298673, 0.0005554238680367989],
[522.022099619446, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2995447634314892, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.7004552365685108, 1, 0.0005557069558472205],
[522.0517754479929, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995345653870978, 0, 0.0008191183581367987, 0.0036947516165753, 0.7004654346129022, 1, 0.0005554922930660585],
[522.0517754479929, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995345653870977, 0, 0.0008191183581367986, 0.003694751616575299, 0.7004654346129022, 1, 0.0005555383656015803],
[521.8104161371908, 1221.036476464117, 1, 0, 0.2994011799615721, 0.001916404826493703, 0, -0.008644220655493837, 1, 0.2994011799615721, 0.000555492295883822],
[522.180505864366, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996356595088683, 0, 0.000819311059205333, 0.003695620822566607, 0.7003643404911317, 1, 0.0005553447315012829],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.000555503156586774],
[522.0753768567811, 1220.821246848644, 0, 1, 0.2995446601685651, 0, 0.0008191207374391139, 0.00369476234876191, 0.7004553398314349, 1, 0.000566446302159691],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.022099619446, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995226384116251, 0, 0.0008191183581367987, 0.0036947516165753, 0.7004773615883749, 1, 0.0005554508359795896],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.5636308918384, 1219.996125048177, 0, 0, 0.2998827610419272, 0, 0, 0, 1, 1, 7.803660374298185e-05],
[522.3720683781022, 1220.346093806833, 0, 1, 0.2997455811920716, 0, 0.0008194396696764359, 0.003696200938664966, 0.7002544188079285, 1, 0.0004771965613701915],
[522.180505864366, 1220.698251736017, 1, 0, 0.2996080499502504, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2996080499502505, 0.0005553894785998543],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.0005555319888874991],
[522.1826950348938, 1220.693873394961, 0, 1, 0.2996096823456204, 0, 0.0008192062086940985, 0.003695147879197638, 0.7003903176543796, 1, 0.0005553980078748113],
[521.9099440383737, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994395448971803, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005604551028197, 1, 0.0005553447286052939],
[522.0809593666978, 1220.795609063157, 1, 0, 0.2995513100718525, 0.001915411742295744, 0, -0.008639741205840004, 1, 0.2995513100718525, 0.0005553807147903185],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.0005554922958934016],
[522.2725218804341, 1220.574370720874, 0, 1, 0.2996663241605289, 0, 0.0008192864146487017, 0.003695509659735804, 0.7003336758394711, 1, 0.0005553447286052939],
[522.0809593666978, 1220.92433947953, 1, 0, 0.2995291865792297, 0.001915411742295744, 0, -0.008639741205840004, 1, 0.2995291865792297, 0.0005553807230670931],
[522.2926428489529, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2995933323722582, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7004066676277418, 1, 0.0005553423780211737],
[522.180505864366, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995811979973593, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004188020026407, 1, 0.000555440944140346],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005555319888351811],
[522.1426116076092, 1220.733956822246, 0, 1, 0.2995866839141705, 0, 0.0008191793096369258, 0.003695026547116643, 0.7004133160858295, 1, 0.0005560377378594694],
[522.3010178525293, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2996775717302038, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719559, 1, 0.2996775717302038, 0.000555440944770158],
[522.6426116076092, 1220.233956822246, 0, 1, 0.2998735659625364, 0, 0.0008195149744924466, 0.003696540611909898, 0.7001264340374636, 1, 0.0005555382946529156],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005557826871679948],
[521.8025330434566, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2994122620401949, 0.001916433778439934, 0, -0.008644351247427321, 1, 0.2994122620401949, 0.000555625495595604],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.9230450316198, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2994607044960255, 0.001915991274038142, 0, -0.008642355267435394, 1, 0.2994607044960256, 0.0005555383459518417],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.0517754479929, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995345653870977, 0, 0.0008191183581367986, 0.003694751616575299, 0.7004654346129022, 1, 0.0005556018737787187],
[522.0599938762026, 1220.696062565489, 1, 0, 0.299559994037335, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299559994037335, 0.0005554311983061586],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005553809181468612],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554408772912209],
[521.9300836033777, 1220.976160655024, 0, 1, 0.2994596440989036, 0, 0.0008190168098478877, 0.003694293568356886, 0.7005403559010964, 1, 0.0005553447286052939],
[522.180505864366, 1220.733956822246, 0, 1, 0.2996019122243394, 0, 0.0008191793096369258, 0.003695026547116643, 0.7003980877756606, 1, 0.0005554237614442043],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005553447286211242],
[522.180505864366, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995862985672047, 0, 0.0008191183581367987, 0.0036947516165753, 0.7004137014327954, 1, 0.0005553980078519493],
[522.338912109286, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996993140942031, 0, 0.0008193110592053329, 0.003695620822566607, 0.700300685905797, 1, 0.0005553807145605667],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554922930660585],
[521.9889433506297, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994712962934236, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005287037065764, 1, 0.0005554235798061797],
[522.3010178525293, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2996775717302038, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719559, 1, 0.2996775717302038, 0.0005554238679010833],
[522.0599938762026, 1220.816574553652, 1, 0, 0.299539280826136, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299539280826136, 0.0005554922958679662],
[522.3305371057097, 1220.792510592616, 0, 1, 0.2996521317272531, 0, 0.0008191400187363242, 0.003694849319836761, 0.7003478682727469, 1, 0.0005553423780211737],
[522.3720683781022, 1220.383988063589, 0, 1, 0.2997390635638738, 0, 0.000819414225179013, 0.003696086167585729, 0.7002609364361263, 1, 0.0005555354931440626],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005555400295636502],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005553311331300541],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 1, 1, 0.2995175384621367, 0.001915627711411068, 0.000819098447478668, -0.00494605355903859, 0.9102892441535825, 0.5093243210778559, 0.001111960457310344],
[522.0517754479929, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995345653870978, 0, 0.0008191183581367987, 0.0036947516165753, 0.7004654346129022, 1, 0.0005555382943294881],
[522.5517754479929, 1220.324792981862, 0, 1, 0.2998214474354636, 0, 0.0008194539730332786, 0.003696265456021087, 0.7001785525645364, 1, 0.0005553447286333215],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554409443687037],
[522.0517754479929, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995345653870977, 0, 0.0008191183581367986, 0.003694751616575299, 0.7004654346129022, 1, 0.0005555319888619947],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005553977897084321],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005559864872410926],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554238682439417],
[522.180505864366, 1220.733956822246, 1, 0, 0.2996019122243394, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2996019122243394, 0.0005559864874425202],
[522.3010178525293, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2996775717302038, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719559, 1, 0.2996775717302038, 0.0005554407021177287],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.000555377871926781],
[522.2184001211227, 1220.658168308732, 0, 1, 0.2996301686421692, 0, 0.0008192301710359564, 0.003695255964800209, 0.7003698313578308, 1, 0.0005553865792638338],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005555075833122474],
[522.1310444017756, 1220.599176298523, 0, 1, 0.2996052046380204, 0, 0.000819269764733504, 0.003695434557889433, 0.7003947953619796, 1, 0.0005555903501929402],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.0599938762026, 1220.822603811334, 1, 0, 0.2995382446120431, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.2995382446120431, 0.0005555201870242075],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.0005554807349835503],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.3720683781022, 1220.346093806833, 0, 1, 0.2997455811920716, 0, 0.0008194396696764361, 0.003696200938664967, 0.7002544188079285, 1, 0.0005555534756950498],
[522.3720683781022, 1220.274683634375, 0, 1, 0.2997578641654405, 0, 0.0008194876230830872, 0.003696417239429056, 0.7002421358345594, 1, 0.0005552786486744645],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.66035747926, 0, 1, 0.2996145642709839, 0, 0.0008192287018029016, 0.003695249337612391, 0.700385435729016, 1, 0.0005555996597124591],
[522.3010178525292, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2996775717302038, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719562, 1, 0.2996775717302038, 0.0005554238680691337],
[522.3010178525293, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2996775717302038, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719559, 1, 0.2996775717302038, 0.0005554409446902054],
[522.2184001211227, 1220.658168308732, 0, 1, 0.2996301686421692, 0, 0.0008192301710359564, 0.003695255964800209, 0.7003698313578308, 1, 0.0005559864873894703],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005553809180595336],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005553977895259175],
[522.0220996194458, 1220.824792981862, 0, 1, 0.299522638411625, 0, 0.0008191183581367986, 0.003694751616575299, 0.700477361588375, 1, 0.0005553447315240968],
[522.5304746230223, 1220.346093806833, 0, 1, 0.2998092257868647, 0, 0.0008194396696764359, 0.003696200938664966, 0.7001907742131352, 1, 0.0005553778718234706],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[523.1047173508524, 1219.771851079003, 0, 0, 0.3001387056469029, 0, 0, 0, 1, 1, 6.427550107896287e-05],
[522.6426116076092, 1220.233956822246, 1, 0, 0.2998735659625364, 0.00191335336574275, 0, -0.008630456601214621, 1, 0.2998735659625364, 0.0004922774478116671],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554324672417501],
[522.180505864366, 1220.658168308732, 0, 2, 0.2996149406152684, 0, 0.001638460342071913, 0.007390511929600418, 0.490539231409354, 1, 0.001111421151110548],
[522.2101816929129, 1220.666386736942, 0, 1, 0.2996254532031309, 0, 0.0008192246553730192, 0.003695231085606193, 0.7003745467968692, 1, 0.0005554016871447007],
[522.0809593666978, 1220.92433947953, 1, 0, 0.2995291865792297, 0.001915411742295744, 0, -0.008639741205840004, 1, 0.2995291865792297, 0.0005553809181468612],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554409350281335],
[522.2725218804341, 1220.574370720874, 0, 1, 0.2996663241605289, 0, 0.0008192864146487018, 0.003695509659735805, 0.7003336758394711, 1, 0.0005553447286211242],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005555382944732982],
[522.0809593666978, 1220.875015995821, 1, 0, 0.2995376628822249, 0.001915411742295744, 0, -0.008639741205840004, 1, 0.2995376628822249, 0.0005553977895523978],
[522.5517754479929, 1220.324792981862, 0, 1, 0.2998214474354636, 0, 0.0008194539730332785, 0.003696265456021086, 0.7001785525645364, 1, 0.0005553447286211242],
[522.0599938762027, 1220.816574553652, 1, 0, 0.2995392808261361, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584009, 1, 0.2995392808261361, 0.0005555381312286955],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.00055540168716046],
[522.3720683781022, 1220.383988063589, 0, 2, 0.2997390635638738, 0, 0.001638828450358026, 0.007392172335171457, 0.4903653790984006, 1, 0.001111643714931184],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.2716773584579, 1220.851370339868, 0, 1, 0.2996183648928752, 0, 0.0008191005263168225, 0.003694671183576784, 0.7003816351071248, 1, 0.0005552118295759593],
[522.2800523620341, 1220.596516067821, 1, 0, 0.2996655424844872, 0.001914681587928654, 0, -0.00863644773914944, 1, 0.2996655424844872, 0.0005553258877716093],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 7.721641728760462e-05],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0004780804773274465],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 7.573089954099626e-05],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0004794205284199456],
[522.180505864366, 1220.379250075649, 0, 0, 0.2996628976908045, 0, 0, 0, 1, 1, 7.721641134140569e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996356595088683, 0, 0.0008193110592053329, 0.003695620822566607, 0.7003643404911317, 1, 0.0004780804863839451],
[522.3645378965022, 1220.452678876259, 0, 1, 0.2997242240146008, 0, 0.000819368106038128, 0.003695878140542204, 0.7002757759853993, 1, 0.0005554175705254616],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.2725218804341, 1220.574370720874, 0, 1, 0.2996663241605289, 0, 0.0008192864146487018, 0.003695509659735805, 0.7003336758394711, 1, 0.0005554152266075829],
[522.3594592946981, 1220.517109135157, 0, 2, 0.2997111033314815, 0, 0.001638649704318504, 0.007391366075353302, 0.4904045387972111, 1, 0.001111247585452092],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 7.734787131314725e-05],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0004779593721807379],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 7.721639954016212e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0004780804952653691],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.9230450316198, 1220.953523398235, 0, 0, 0.2994607044960255, 0, 0, 0, 1, 1, 7.721640873932846e-05],
[522.0517754479929, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995345653870977, 0, 0.0008191183581367986, 0.003694751616575299, 0.7004654346129022, 1, 0.0004780804863839451],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 7.72164086828857e-05],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0004780804862229175],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.4215298406924, 1220.455038589162, 0, 0, 0.2997467171822376, 0, 0, 0, 1, 1, 7.66075930539295e-05],
[522.3010178525292, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2996775717302038, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719562, 1, 0.2996775717302038, 0.000478589930760038],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.497318354206, 1220.379250075649, 0, 0, 0.2997902019102363, 0, 0, 0, 1, 1, 7.576701333122963e-05],
[522.338912109286, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996993140942031, 0, 0.0008193110592053329, 0.003695620822566607, 0.700300685905797, 1, 0.0004793845308026948],
[522.680505864366, 1220.233956822246, 0, 2, 0.299888788035347, 0, 0.001639029948984893, 0.007393081223819795, 0.4901557091186154, 1, 0.001112603339877131],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[523.1047173508524, 1219.771851079003, 0, 0, 0.3001387056469029, 0, 0, 0, 1, 1, 7.721641185747025e-05],
[522.6426116076092, 1220.233956822246, 0, 1, 0.2998735659625364, 0, 0.0008195149744924466, 0.003696540611909898, 0.7001264340374636, 1, 0.0004780804863839451],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 7.721640471811613e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0004780804952653691],
[521.4805683470535, 1221.396000082802, 0, 0, 0.2992068272607805, 0, 0, 0, 1, 1, 7.721641129066204e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.0004780804863839451],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.4805683470535, 1221.396000082801, 0, 0, 0.2992068272607805, 0, 0, 0, 1, 1, 7.721640678750152e-05],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.0004780804863839451],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.0599938762026, 1220.696062565489, 1, 0, 0.299559994037335, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299559994037335, 0.0005555498373309486],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005552875634994196],
[522.180505864366, 1220.379250075649, 0, 1, 0.2996628976908045, 0, 0.0008194174064644346, 0.003696100517232929, 0.7003371023091955, 1, 0.0005552803079883947],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996356595088683, 0, 0.0008193110592053329, 0.003695620822566607, 0.7003643404911317, 1, 0.0005558532731988297],
[521.4805683470535, 1221.396000082801, 0, 0, 0.2992068272607805, 0, 0, 0, 1, 1, 7.721641147593156e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.0004780804863839451],
[521.4805683470535, 1221.396000082802, 0, 0, 0.2992068272607805, 0, 0, 0, 1, 1, 7.725300093871268e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.0004780445598555759],
[522.1511653702945, 1220.971882328031, 1, 1, 0.2995492292180745, 0.001915154204991248, 0.0008190196797106388, -0.004944273033358336, 0.9102702592748574, 0.5093687177110066, 0.001111235521903833],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.9255556248581, 1218.958544584712, 1, 0.5, 0.299402446152656, 0.001919660091930957, 0.0004101862218541202, -0.006808699824931948, 0.9623195342637013, 0.4135878972793745, 0.0005565930337582625],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.0517754479929, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995345653870977, 0, 0.0008191183581367986, 0.003694751616575299, 0.7004654346129022, 1, 0.0005554815568248917],
[522.0599938762027, 1220.816574553652, 1, 0, 0.2995392808261361, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584009, 1, 0.2995392808261361, 0.0005554227162986933],
[522.5517754479929, 1220.324792981862, 0, 1, 0.2998214474354636, 0, 0.0008194539730332786, 0.003696265456021087, 0.7001785525645364, 1, 0.0005555460263539622],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996356595088683, 0, 0.000819311059205333, 0.003695620822566607, 0.7003643404911317, 1, 0.0005555075365760842],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.499032413799, 1218.384864048013, 0, 1.5, 0.2997320875687783, 0, 0.001231138078173704, 0.005553226050147962, 0.5859982781757762, 1, 0.0005562210372181305],
[522.3305371057096, 1220.546031324145, 0, 1, 0.299694508817841, 0, 0.0008193054373501346, 0.003695595464377066, 0.700305491182159, 1, 0.0005555844112293322],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.3070471102113, 1220.569521319644, 1, 0, 0.2996810311017917, 0.001914582630145887, 0, -0.008636001375782998, 1, 0.2996810311017917, 0.00055552958359388],
[522.0599938762026, 1220.816574553652, 1, 0, 0.299539280826136, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299539280826136, 0.0005555469470250459],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.680505864366, 1221.196062565489, 0, 1, 0.2993215442298041, 0, 0.0008188693287294095, 0.003693628333479046, 0.7006784557701959, 1, 0.0005557110909404019],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005556857413443109],
[521.680505864366, 1221.196062565489, 0, 1, 0.2993215442298041, 0, 0.0008188693287294095, 0.003693628333479046, 0.7006784557701959, 1, 0.0005555361618248906],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554670171327255],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.9394818880395, 1220.937086541816, 0, 1, 0.2994701353741023, 0, 0.0008190430211538596, 0.003694411798236793, 0.7005298646258977, 1, 0.0005555605913263252],
[522.0599938762027, 1220.816574553652, 1, 0, 0.2995392808261361, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584009, 1, 0.2995392808261361, 0.0005555098560534054],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.3221621021335, 1221.554406327722, 0, 2, 0.2991159394447473, 0, 0.001637258225781746, 0.007385089610515167, 0.4912384663404191, 1, 0.00111167137225471],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.0005552945449503584],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995175384621367, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004824615378633, 1, 0.0005553102327137413],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005553921412947028],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995175384621367, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004824615378633, 1, 0.000555395271360632],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.000555262836678274],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001324209903312036],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0004228588236089123],
[521.9394818880394, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2995115550978354, 0.001915930935867597, 0, -0.00864208310340568, 1, 0.2995115550978353, 0.0005555334786699776],
[521.8273449034524, 1220.561720281605, 0, 1, 0.2994895659816538, 0, 0.0008192949060939602, 0.003695547961625616, 0.7005104340183461, 1, 0.000555763359662647],
[521.8189698998762, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2994631094582813, 0.001916373412396017, 0, -0.008644078957670739, 1, 0.2994631094582813, 0.0005553728751905499],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.9394818880394, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2995115550978354, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001635884050463882],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.0599938762026, 1220.696062565489, 1, 0, 0.299559994037335, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299559994037335, 0.0003917510431820422],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005555876241723103],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002469383216053807],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.000308356693499668],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005550896644196897],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 0, 1, 0.2995641741245016, 0, 0.0008190319949417376, 0.003694362062915081, 0.7004358258754984, 1, 0.0005552793895788073],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005555197619386325],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 0, 1, 0.2995641741245016, 0, 0.0008190319949417376, 0.003694362062915081, 0.7004358258754984, 1, 0.0005553404435368012],
[522.0599938762026, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995157459780068, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.2995157459780068, 0.0005553665671930312],
[522.180505864366, 1220.915629141478, 0, 1, 0.2995706865373867, 0, 0.0008190574157062586, 0.003694476726943637, 0.7004293134626134, 1, 0.0005555234958490485],
[522.0539646185206, 1221.08006464408, 1, 0, 0.2994915800246097, 0.001915510785806843, 0, -0.008640187955896463, 1, 0.2994915800246096, 0.0005554154967677313],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005555221998271299],
[522.0599938762027, 1221.074035386398, 1, 0, 0.2994950388852485, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584009, 1, 0.2994950388852485, 0.0005553848505734906],
[523.1047173508524, 1220.029311911749, 0, 0, 0.3000943751709911, 0, 0, 0, 1, 1, 8.781264040470331e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.6426116076092, 1220.491417654992, 0, 1, 0.2998292746477464, 0, 0.0008193420990385692, 0.003695760832215871, 0.7001707253522536, 1, 0.0004674119069446809],
[521.909962634859, 1221.065660382822, 1, 0, 0.2994361801407504, 0.001916039301015651, 0, -0.00864257190005146, 1, 0.2994361801407504, 0.0005554306944689256],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005554391159825949],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005554532842863509],
[521.8305371057097, 1221.303492156891, 0, 1, 0.299363404273887, 0, 0.0008187972984781556, 0.003693303430631223, 0.7006365957261129, 1, 0.0005554945204754048],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 0, 1, 0.2995641741245016, 0, 0.0008190319949417376, 0.003694362062915081, 0.7004358258754984, 1, 0.0005553864849812687],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005553238583138873],
[522.0220996194458, 1221.082253814608, 0, 1, 0.2994783981756576, 0, 0.0008189456499560477, 0.00369397259139086, 0.7005216018243424, 1, 0.0005553307823695058],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005553218199362663],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 0, 1, 0.2995641741245016, 0, 0.0008190319949417376, 0.003694362062915081, 0.7004358258754984, 1, 0.00055549815116039],
[522.0599938762026, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995157459780068, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.2995157459780068, 0.0005554449263955566],
[522.0517754479929, 1221.082253814608, 0, 1, 0.2994903241426804, 0, 0.0008189456499560478, 0.00369397259139086, 0.7005096758573196, 1, 0.0005554456160028228],
[522.3720683781022, 1220.641448896336, 0, 1, 0.2996947890541544, 0, 0.0008192413922238735, 0.003695306579588395, 0.7003052109458456, 1, 0.0005553821473994157],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005554250313065483],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005551181931955909],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005554456160556194],
[522.022099619446, 1221.111929643155, 0, 1, 0.2994732997325956, 0, 0.0008189257476931123, 0.003693882819360452, 0.7005267002674045, 1, 0.0005553110233491687],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.022099619446, 1221.111929643155, 0, 1, 0.2994732997325956, 0, 0.0008189257476931123, 0.003693882819360452, 0.7005267002674045, 1, 0.0005553521398849263],
[521.8104161371908, 1221.293937296863, 1, 0, 0.2993569576653187, 0.001916404826493703, 0, -0.008644220655493837, 1, 0.2993569576653187, 0.0005551890230603033],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.1426116076092, 1220.991417654992, 0, 1, 0.2995424349718487, 0, 0.0008190065757551164, 0.003694247406003869, 0.7004575650281513, 1, 0.0005553203443114913],
[522.3720683781022, 1220.603554639579, 0, 1, 0.2997013047570334, 0, 0.0008192668259886243, 0.003695421302256365, 0.7002986952429666, 1, 0.0005553491806884605],
[522.180505864366, 1221.336222208814, 0, 1, 0.2994984203228411, 0, 0.0008187753558896969, 0.003693204455417966, 0.700501579677159, 1, 0.0005555908117586766],
[522.2725218804341, 1220.83183155362, 0, 1, 0.2996220627018202, 0, 0.0008191136355999241, 0.003694730314890899, 0.7003779372981798, 1, 0.0005554400674140045],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005553238611784613],
[522.7599313935153, 1220.253585880923, 1, 0, 0.2999173134416987, 0.001912923963652515, 0, -0.008628519721090647, 1, 0.2999173134416987, 0.0005550765890083958],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.5304746230223, 1220.603554639579, 0, 1, 0.2997649439751163, 0, 0.0008192668259886243, 0.003695421302256365, 0.7002350560248837, 1, 0.0005550990905653326],
[522.022099619446, 1221.111929643155, 0, 1, 0.2994732997325956, 0, 0.0008189257476931123, 0.003693882819360452, 0.7005267002674045, 1, 0.0005553019978772537],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005552955168281527],
[522.0599938762026, 1221.074035386398, 1, 0, 0.2994950388852485, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.2994950388852485, 0.0005554219864326195],
[522.0809593666978, 1221.053069895903, 1, 0, 0.2995070663542459, 0.001915411742295744, 0, -0.008639741205840004, 1, 0.2995070663542458, 0.0005553632101904422],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 0, 1, 0.2995641741245016, 0, 0.0008190319949417376, 0.003694362062915081, 0.7004358258754984, 1, 0.0005553632101512152],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 0, 1, 0.2995641741245016, 0, 0.0008190319949417376, 0.003694362062915081, 0.7004358258754984, 1, 0.000555492451924139],
[522.2511301730456, 1220.96230602222, 0, 1, 0.2995910422265388, 0, 0.0008190261034821836, 0.003694335488636168, 0.7004089577734611, 1, 0.0005550787910154593],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005553247287247222],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005553419162126334],
[521.3684313624665, 1221.765597900135, 0, 2, 0.2990983037506423, 0, 0.001636975213115697, 0.007383813041024313, 0.4912631878052269, 1, 0.001111698627875848],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005553590113719528],
[522.022099619446, 1221.111929643155, 0, 1, 0.2994732997325956, 0, 0.0008189257476931123, 0.003693882819360452, 0.7005267002674045, 1, 0.0005555380518320038],
[522.0599938762026, 1221.074035386398, 1, 1, 0.2994950388852485, 0.001915488663621163, 0.0008189511618626454, -0.004946090716942649, 0.9103027216831234, 0.5092927994536205, 0.001111347044618423],
[522.0893343702741, 1220.582589149084, 0, 2, 0.2995912927293309, 0, 0.001638561796456788, 0.007390969554251119, 0.4905723572205697, 1, 0.001111427900258155],
[522.0599938762027, 1221.074035386398, 1, 0, 0.2994950388852485, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584009, 1, 0.2994950388852485, 0.000555449562998105],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 0, 2, 0.2995641741245016, 0, 0.001638063989883475, 0.007388724125830162, 0.4906103461698914, 1, 0.001111186099086144],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 0, 0, 0.2995641741245016, 0, 0, 0, 1, 1, 6.304277606188015e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 0, 1, 0.2995641741245016, 0, 0.0008190319949417376, 0.003694362062915081, 0.7004358258754984, 1, 0.000492111429270341],
[522.022099619446, 1221.111929643155, 0, 1, 0.2994732997325956, 0, 0.0008189257476931123, 0.003693882819360452, 0.7005267002674045, 1, 0.0005551557577591283],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 0, 1, 0.2995641741245016, 0, 0.0008190319949417376, 0.003694362062915081, 0.7004358258754984, 1, 0.0005551736330162564],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005552182184775262],
[522.180505864366, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995862985672047, 0, 0.0008191183581367987, 0.0036947516165753, 0.7004137014327954, 1, 0.0005554565114945318],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.437966697112, 1220.438601732743, 1, 0, 0.2997561480603142, 0.001914102848079873, 0, -0.008633837249504544, 1, 0.2997561480603141, 0.0005550878988455917],
[522.3092362807389, 1220.567332149116, 0, 1, 0.299682287169242, 0, 0.0008192911391780806, 0.003695530970407683, 0.7003177128307581, 1, 0.000555326665534036],
[521.863693374526, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2994368476235736, 0.001916209180090116, 0, -0.008643338164143536, 1, 0.2994368476235736, 0.0005553437377569711],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.022099619446, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995226384116251, 0, 0.0008191183581367986, 0.003694751616575299, 0.7004773615883749, 1, 0.000555217138032801],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005551082506758885],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005553959286266802],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005553887023885798],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554438091366266],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.000555667033164371],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.1426116076092, 1220.733956822246, 0, 1, 0.2995866839141705, 0, 0.0008191793096369258, 0.003695026547116643, 0.7004133160858295, 1, 0.000555356121075455],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005552841406103946],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554352500136061],
[522.3010178525292, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2996775717302037, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719562, 1, 0.2996775717302037, 0.0005553379382252445],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.5420418288558, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2997744065605717, 0.001913721614628517, 0, -0.008632117640980699, 1, 0.2997744065605717, 0.0005552907241310201],
[522.3010178525293, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996568518217295, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719559, 1, 0.2996568518217295, 0.0005553884593228567],
[521.49902891583, 1218.859674709254, 0, 1.5, 0.2996503122198731, 0, 0.001230658484421358, 0.005551062773285499, 0.5861009280582896, 1, 0.0005550859285152317],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005552448526948172],
[522.5636308918384, 1220.07191356169, 1, 0, 0.2998697189180247, 0.001913642551612978, 0, -0.008631761015834195, 1, 0.2998697189180246, 0.0005554067738110253],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.3720683781022, 1220.383988063589, 0, 1, 0.2997390635638738, 0, 0.000819414225179013, 0.003696086167585729, 0.7002609364361263, 1, 0.0005555301910922668],
[522.2162109505949, 1220.66035747926, 1, 0, 0.2996289125747188, 0.001914915659511395, 0, -0.008637503552818043, 1, 0.2996289125747188, 0.0005552904794491337],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554730765433849],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554398170258423],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.9274233726752, 1220.94914505718, 1, 0, 0.2994632166309263, 0.001915975201184176, 0, -0.008642282768507021, 1, 0.2994632166309263, 0.0005553653962881588],
[522.0539646185206, 1220.822603811334, 1, 0, 0.2995358214545481, 0.001915510785806843, 0, -0.008640187955896463, 1, 0.299535821454548, 0.0005555414689504243],
[521.8327262762374, 1221.043842153618, 1, 0, 0.2994088828369256, 0.00191632289361369, 0, -0.008643851085409283, 1, 0.2994088828369256, 0.0005556802883140137],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.9230450316198, 1219.953523398235, 1, 0, 0.3000344685927572, 0.001912327271672513, 0, -0.008625828255765996, 1, 0.3000344685927572, 0.0005553889279771295],
[522.5517754479929, 1220.324792981862, 0, 1, 0.2998214474354636, 0, 0.0008194539730332786, 0.003696265456021087, 0.7001785525645364, 1, 0.0005553072566979599],
[522.3305371057097, 1220.546031324145, 0, 1, 0.299694508817841, 0, 0.0008193054373501346, 0.003695595464377066, 0.7003054911821589, 1, 0.0005555163875901915],
[521.180505864366, 1221.658168308732, 0, 1, 0.2990411640432776, 0, 0.0008185595823293217, 0.003692231177621062, 0.7009588359567224, 1, 0.0005555119129179945],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.180505864366, 1221.696062565489, 1, 0, 0.2990346621814382, 0.001918721035702444, 0, -0.008654668251538189, 1, 0.2990346621814381, 0.0005555137021920497],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.180505864366, 1221.696062565489, 0, 0, 0.2990346621814382, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001812442955039006],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.680505864366, 1221.196062565489, 0, 1, 0.2993215442298041, 0, 0.0008188693287294095, 0.003693628333479046, 0.7006784557701959, 1, 0.0003741205774829466],
[522.5636308918384, 1220.034019304933, 0, 1, 0.2998762398381699, 0, 0.000819649275492917, 0.003697146395962552, 0.7001237601618301, 1, 0.0005555983439150757],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.3720683781022, 1220.383988063589, 0, 1, 0.2997390635638738, 0, 0.000819414225179013, 0.003696086167585729, 0.7002609364361263, 1, 0.0005552972161292433],
[522.180505864366, 1220.658168308732, 0, 1, 0.2996149406152684, 0, 0.0008192301710359564, 0.003695255964800209, 0.7003850593847316, 1, 0.0005555787461294985],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.1912916165422, 1218.44632800877, 0, 1.75, 0.2995976206405548, 0, 0.001436255302980735, 0.006478436906936805, 0.5362389084446602, 1, 0.0005564957981014422],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.680505864366, 1220.196062565489, 0, 1, 0.2998953083265357, 0, 0.0008195404252472984, 0.003696655411214171, 0.7001046916734643, 1, 0.000555388098512382],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005552881400177407],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.6426116076092, 1220.233956822246, 0, 1, 0.2998735659625364, 0, 0.0008195149744924466, 0.003696540611909898, 0.7001264340374636, 1, 0.0005555322922473242],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.7646387866998, 1221.111929643155, 0, 1, 0.2993698166799924, 0, 0.0008189257476931124, 0.003693882819360453, 0.7006301833200077, 1, 0.0005555745338086928],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.0517754479929, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995345653870977, 0, 0.0008191183581367986, 0.003694751616575299, 0.7004654346129022, 1, 0.0005554148725117645],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.863693374526, 1220.974980798572, 0, 1, 0.2994331610308841, 0, 0.0008190176012828331, 0.003694297138238473, 0.7005668389691159, 1, 0.0005555956723239479],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995175384621367, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004824615378633, 1, 0.0005554220530019012],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995175384621367, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004824615378633, 1, 0.0005555874760063295],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005555474650772627],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.0599938762026, 1220.816574553652, 1, 0, 0.299539280826136, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299539280826136, 0.0005555808522390884],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 8.642121810696164e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0004692892782945906],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.9394818880395, 1220.937086541816, 0, 0, 0.2994701353741023, 0, 0, 0, 1, 1, 8.016977449581883e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.0599938762027, 1220.816574553652, 1, 0, 0.2995392808261361, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584009, 1, 0.2995392808261361, 0.000475131349996087],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.9394818880395, 1220.937086541815, 0, 0, 0.2994701353741023, 0, 0, 0, 1, 1, 8.160030951867335e-05],
[522.0599938762027, 1220.816574553652, 1, 0, 0.2995392808261361, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584009, 1, 0.2995392808261361, 0.0004737307297733323],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 8.73275489986033e-05],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0004679698006792136],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.0005556134825373145],
[522.180505864366, 1220.449583297018, 1, 0, 0.2996508031808735, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2996508031808736, 0.0005555825125193765],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554224953980315],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005560599708391374],
[520.9741643725271, 1218.81252953754, 0, 2.75, 0.2994471484327016, 0, 0.002256294494316895, 0.01017734207460535, 0.3758049439886317, 1, 0.001162409194482042],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005555642062344976],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554628963914729],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554833351452161],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005555052598291784],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 7.721641179725232e-05],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0004780804863866101],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.620274051975, 1, 0, 0.2996214552356534, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2996214552356534, 0.000555365261056813],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.658168308732, 0, 1, 0.2996149406152684, 0, 0.0008192301710359564, 0.003695255964800209, 0.7003850593847316, 1, 0.0005552070800219586],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554530826438958],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005555944923059519],
[521.909962634859, 1220.808199550076, 1, 0, 0.2994804174075478, 0.001916039301015651, 0, -0.00864257190005146, 1, 0.2994804174075478, 0.0005552728558523203],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.2716773584579, 1221.066996814641, 0, 1, 0.2995813063151267, 0, 0.0008189558825262405, 0.003694018746876067, 0.7004186936848733, 1, 0.0005552904794491337],
[522.338912109286, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996993140942031, 0, 0.0008193110592053329, 0.003695620822566607, 0.700300685905797, 1, 0.0005553807231021077],
[522.3010178525293, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2996775717302038, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719559, 1, 0.2996775717302038, 0.0005554322293486005],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002107860612316979],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.000344448076116146],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.2716773584579, 1220.851370339868, 0, 1, 0.2996183648928752, 0, 0.0008191005263168225, 0.003694671183576784, 0.7003816351071248, 1, 0.0005553709384218559],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.863693374526, 1221.012875055329, 0, 0, 0.2994266506461035, 0, 0, 0, 1, 1, 7.809613526747502e-05],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995175384621367, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004824615378633, 1, 0.0004771399641110126],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005553105561893686],
[521.6389745919735, 1221.267269666428, 1, 2, 0.2992926190438479, 0.001917034670927725, 0.001637643167614139, -0.001260235713521732, 0.7848906988314415, 0.6559590988260756, 0.001670120537841545],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554717323366165],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.0599938762026, 1220.822603811334, 1, 0, 0.2995382446120431, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.2995382446120431, 0.0005555382946529156],
[522.2162109505949, 1220.66035747926, 0, 1, 0.2996289125747188, 0, 0.0008192287018029016, 0.003695249337612391, 0.7003710874252812, 1, 0.0005553447286333215],
[522.180505864366, 1220.698251736017, 1, 0, 0.2996080499502504, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2996080499502505, 0.0005553977895744912],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554210233038178],
[522.5636308918384, 1219.91350731677, 0, 1, 0.2998969796694557, 0, 0.000819730246449623, 0.003697511627153153, 0.7001030203305443, 1, 0.0005555270638795292],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.3720683781022, 1220.383988063589, 0, 1, 0.2997390635638738, 0, 0.000819414225179013, 0.003696086167585729, 0.7002609364361263, 1, 0.0005554800117294427],
[522.5304746230222, 1220.346093806833, 0, 1, 0.2998092257868646, 0, 0.0008194396696764359, 0.003696200938664966, 0.7001907742131355, 1, 0.000555432238567787],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005552904794491337],
[522.3010178525293, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2996775717302038, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719559, 1, 0.2996775717302038, 0.0005554237037228841],
[522.338912109286, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996993140942031, 0, 0.0008193110592053329, 0.003695620822566607, 0.700300685905797, 1, 0.0005559864873798623],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554922930660585],
[522.0599938762027, 1220.822603811334, 1, 0, 0.2995382446120432, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584009, 1, 0.2995382446120431, 0.0005555382946424777],
[522.1783166938383, 1220.698251736017, 0, 1, 0.2996071702107195, 0, 0.0008192032704051549, 0.003695134625621135, 0.7003928297892805, 1, 0.0005557069558472205],
[522.338912109286, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996993140942031, 0, 0.0008193110592053329, 0.003695620822566607, 0.700300685905797, 1, 0.0005553977897461331],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005555383655283172],
[521.680505864366, 1221.196062565489, 0, 1, 0.2993215442298041, 0, 0.0008188693287294095, 0.003693628333479046, 0.7006784557701959, 1, 0.0005555185301617055],
[522.180505864366, 1220.658168308732, 0, 1, 0.2996149406152684, 0, 0.0008192301710359564, 0.003695255964800209, 0.7003850593847316, 1, 0.0005553447286052939],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554238678787434],
[522.2716773584579, 1220.851370339868, 0, 1, 0.2996183648928752, 0, 0.0008191005263168225, 0.003694671183576784, 0.7003816351071248, 1, 0.0005553447286491514],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995175384621367, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004824615378633, 1, 0.000555492295883822]
],
"NAMES": [
["epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1"],
["epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1"],
["epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1"],
["epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2"],
["epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1"],
["epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1"],
["Node22"],
["epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1"],
["epi_isl_435017_Texas_20200402_null_1"],
["epi_isl_418768_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_431974_Wales_20200404_null_1"],
["epi_isl_435151_Abruzzo_20200408_null_2"],
["epi_isl_421603_New_York_20200321_null_3"],
["epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1"],
["epi_isl_429696_Minas_gerais_20200317_null_21"],
["epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1"],
["epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1"],
["epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2"],
["epi_isl_433574_Scotland_20200401_null_10"],
["Node50"],
["epi_isl_432847_England_20200406_null_2"],
["epi_isl_417955_Kinshasa_20200321_null_2"],
["epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1"],
["epi_isl_426814_Victoria_20200325_null_3"],
["epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4"],
["epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1"],
["epi_isl_433902_England_20200409_null_2"],
["epi_isl_432027_Wales_20200407_null_4"],
["epi_isl_433620_Scotland_20200404_null_1"],
["epi_isl_434997_Texas_20200331_null_16"],
["epi_isl_428695_Madrid_20200312_null_1"],
["epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1"],
["epi_isl_430379_New_York_20200407_null_2"],
["epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1"],
["epi_isl_434514_Luxembourg_20200416_null_3"],
["epi_isl_418697_England_20200316_null_1"],
["epi_isl_434878_Texas_20200324_null_1"],
["epi_isl_430805_Buenos_Aires_20200401_null_3"],
["epi_isl_434772_Texas_20200318_null_2"],
["epi_isl_435416_Baranya_20200327_null_1"],
["Node862"],
["epi_isl_425259_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_434007_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_418863_Komen_20200305_null_2"],
["epi_isl_433771_England_20200405_null_1"],
["epi_isl_425990_Scotland_20200330_null_2"],
["epi_isl_435482_New_York_20200330_null_2"],
["epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1"],
["epi_isl_429674_Minas_gerais_20200311_null_1"],
["epi_isl_428923_Sverdlovsk_Region_20200327_null_3"],
["epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3"],
["epi_isl_421665_India_20200310_null_1"],
["epi_isl_433832_England_20200407_null_2"],
["epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2"],
["epi_isl_433527_Scotland_20200331_null_28"],
["Node881"],
["epi_isl_435160_Kinshasa_20200412_null_3"],
["epi_isl_432566_England_20200403_null_10"],
["epi_isl_421730_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_428706_Madrid_20200321_null_2"],
["epi_isl_429206_Switzerland_20200407_null_1"],
["epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1"],
["epi_isl_434821_Texas_20200320_null_2"],
["Node896"],
["epi_isl_430660_Victoria_20200327_null_2"],
["epi_isl_435406_Baranya_20200322_null_5"],
["epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1"],
["epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_15"],
["epi_isl_435474_California_20200429_null_1"],
["epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1"],
["epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1"],
["epi_isl_427388_Liege_20200407_null_1"],
["epi_isl_417238_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1"],
["Node915"],
["epi_isl_425435_England_20200401_null_4"],
["epi_isl_433652_Scotland_20200405_null_2"],
["epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_6"],
["epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1"],
["epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1"],
["epi_isl_435467_Louisiana_20200331_null_3"],
["epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1"],
["epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1"],
["epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1"],
["epi_isl_434544_Puerto_Rico_20200323_null_1"],
["epi_isl_431988_Wales_20200406_null_2"],
["epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2"],
["epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1"],
["epi_isl_433232_Scotland_20200402_null_6"],
["epi_isl_424144_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_2"],
["epi_isl_417424_Kasterlee_20200304_null_1"],
["epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1"],
["Node941"],
["epi_isl_432198_Wales_20200330_null_2"],
["epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2"],
["epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2"],
["epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_5"],
["epi_isl_430340_New_York_20200330_null_1"],
["epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1"],
["epi_isl_435444_Alaska_20200409_null_6"],
["epi_isl_429011_California_20200408_null_1"],
["epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7"],
["epi_isl_435530_New_York_20200416_null_7"],
["epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1"],
["epi_isl_423399_England_20200329_null_3"],
["epi_isl_426181_South_Korea_20200223_null_2"],
["epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_2"],
["epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1"],
["epi_isl_434515_Luxembourg_20200415_null_13"],
["epi_isl_429370_Unknown_20200309_null_1"],
["epi_isl_420328_Alken_20200306_null_1"],
["epi_isl_434845_Texas_20200322_null_69"],
["Node844"],
["epi_isl_423312_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_431962_Wales_20200331_null_4"],
["Node840"],
["epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1"],
["epi_isl_434241_Washington_20200402_null_2"],
["epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1"],
["epi_isl_434946_Texas_20200329_null_1"],
["epi_isl_435522_New_York_20200420_null_1"],
["epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_430911_Washington_20200408_null_15"],
["epi_isl_434657_Skane_20200401_null_1"],
["epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1"],
["epi_isl_430610_Victoria_20200408_null_2"],
["epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1"],
["epi_isl_420060_Ile_de_France_20200320_null_1"],
["epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_429780_Luxembourg_20200326_null_2"],
["epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3"],
["epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_18"],
["Node818"],
["epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_6"],
["Node817"],
["epi_isl_429702_Minas_gerais_20200322_null_4"],
["epi_isl_433303_Scotland_20200323_null_1"],
["epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1"],
["epi_isl_431092_Cincinnati_20200413_null_1"],
["epi_isl_435620_California_20200309_null_3"],
["epi_isl_424597_Reykjavik_20200327_null_4"],
["epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4"],
["epi_isl_435038_Louisiana_20200413_null_1"],
["epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_433696_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_435025_Texas_20200403_null_1"],
["epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1"],
["epi_isl_430467_West_Bengal_20200403_null_1"],
["epi_isl_428916_Chechen_Republic_20200326_null_33"],
["epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1"],
["epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_1"],
["epi_isl_435045_Nur_Sultan_20200301_null_1"],
["epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1"],
["epi_isl_422051_Wales_20200330_null_1"],
["epi_isl_432054_Wales_20200331_null_1"],
["epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3"],
["epi_isl_421864_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1"],
["epi_isl_435121_United_Arab_Emirates_20200225_null_1"],
["epi_isl_413749_China_20200201_null_1"],
["epi_isl_423598_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_429328_Unknown_20200315_null_1"],
["epi_isl_435040_Louisiana_20200415_null_2"],
["epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_423089_England_20200323_null_3"],
["epi_isl_435527_New_York_20200420_null_26"],
["Node141"],
["epi_isl_423339_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_432067_Wales_20200327_null_12"],
["Node134"],
["epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1"],
["epi_isl_432291_Wales_20200408_null_2"],
["Node137"],
["epi_isl_432448_Wales_20200401_null_7"],
["epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2"],
["epi_isl_433888_England_20200409_null_1"],
["epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1"],
["epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2"],
["epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1"],
["epi_isl_431916_Wales_20200331_null_1"],
["epi_isl_432416_Wales_20200331_null_1"],
["Node165"],
["epi_isl_423758_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1"],
["epi_isl_435668_California_20200320_null_1"],
["epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2"],
["epi_isl_433687_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_417231_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3"],
["epi_isl_428879_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3"],
["epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2"],
["epi_isl_425505_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_423659_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_426716_Victoria_20200323_null_3"],
["epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1"],
["epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1"],
["Node214"],
["epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_432000_Wales_20200330_null_2"],
["Node211"],
["epi_isl_423346_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_430815_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200418_null_1"],
["Node208"],
["epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3"],
["epi_isl_435459_Louisiana_20200402_null_6"],
["Node204"],
["epi_isl_435542_New_York_20200422_null_1"],
["epi_isl_423404_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_2"],
["Node739"],
["epi_isl_430976_Washington_20200403_null_7"],
["epi_isl_432013_Wales_20200331_null_1"],
["Node237"],
["epi_isl_430619_Victoria_20200408_null_2"],
["epi_isl_434683_Virginia_20200314_null_8"],
["Node234"],
["epi_isl_423112_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_430423_New_York_20200411_null_3"],
["Node231"],
["epi_isl_423687_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_424088_England_20200313_null_6"],
["Node228"],
["epi_isl_423145_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_433448_Scotland_20200412_null_4"],
["Node224"],
["epi_isl_429636_Washington_20200407_null_1"],
["epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1"],
["epi_isl_434268_Washington_20200330_null_4"],
["Node736"],
["epi_isl_430552_Victoria_20200330_null_2"],
["epi_isl_435082_Uttar_Pradesh_20200329_null_1"],
["Node733"],
["epi_isl_406036_California_20200122_null_1"],
["epi_isl_424146_England_20200321_null_1"],
["Node257"],
["epi_isl_420700_England_20200327_null_3"],
["epi_isl_432286_Wales_20200408_null_5"],
["Node254"],
["epi_isl_421931_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_429643_USA_20200408_null_1"],
["epi_isl_435466_Louisiana_20200328_null_2"],
["Node247"],
["epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1"],
["epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1"],
["Node250"],
["epi_isl_423958_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_1"],
["Node730"],
["epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1"],
["epi_isl_417261_England_20200306_null_1"],
["Node698"],
["epi_isl_435147_Abruzzo_20200408_null_2"],
["epi_isl_418090_Wales_20200312_null_1"],
["epi_isl_421915_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_421892_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_421860_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_421827_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1"],
["epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1"],
["epi_isl_423569_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_435042_Louisiana_20200415_null_7"],
["Node567"],
["epi_isl_423907_England_20200318_null_3"],
["epi_isl_423736_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423656_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_435594_California_20200304_null_12"],
["Node335"],
["epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1"],
["epi_isl_423155_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1"],
["epi_isl_435431_Kecskemet_20200325_null_118"],
["epi_isl_421866_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_431950_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_432999_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_433922_England_20200411_null_1"],
["epi_isl_433391_Scotland_20200407_null_1"],
["epi_isl_433908_England_20200411_null_2"],
["Node317"],
["epi_isl_433904_England_20200410_null_1"],
["Node301"],
["epi_isl_431782_Fujian_20200322_null_7"],
["epi_isl_432016_Wales_20200401_null_1"],
["Node322"],
["epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1"],
["epi_isl_433206_Scotland_20200402_null_2"],
["Node331"],
["epi_isl_433673_England_20200403_null_2"],
["epi_isl_433866_England_20200408_null_3"],
["Node327"],
["epi_isl_434742_Texas_20200311_null_3"],
["epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1"],
["Node543"],
["epi_isl_415149_England_20200301_null_1"],
["Node542"],
["epi_isl_423779_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_429001_California_20200325_null_1"],
["epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1"],
["epi_isl_433895_England_20200410_null_49"],
["Node529"],
["epi_isl_423954_England_20200320_null_2"],
["Node528"],
["epi_isl_432022_Wales_20200331_null_2"],
["epi_isl_435052_Gujarat_20200413_null_1"],
["Node519"],
["epi_isl_424846_Massachusetts_20200306_null_2"],
["Node518"],
["epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1"],
["epi_isl_426877_Victoria_20200328_null_18"],
["epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1"],
["epi_isl_434299_Washington_20200323_null_3"],
["Node506"],
["epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1"],
["Node505"],
["epi_isl_430129_Washington_20200306_null_4"],
["epi_isl_434119_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_434087_Washington_20200405_null_2"],
["epi_isl_434327_Washington_20200325_null_4"],
["epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1"],
["epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2"],
["epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1"],
["Node497"],
["epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1"],
["epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_416682_USA_20200309_null_1"],
["epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_430152_Washington_20200305_null_1"],
["epi_isl_430200_Washington_20200304_null_2"],
["epi_isl_424851_Illinois_20200307_null_1"],
["epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1"],
["epi_isl_430137_Washington_20200321_null_1"],
["epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_417368_USA_20200313_null_2"],
["epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1"],
["epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2"],
["epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1"],
["Node482"],
["epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2"],
["epi_isl_434085_Washington_20200403_null_1"],
["epi_isl_434084_Washington_20200401_null_1"],
["epi_isl_434226_Washington_20200401_null_9"],
["Node472"],
["epi_isl_429061_California_20200408_null_1"],
["epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1"],
["epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1"],
["epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1"],
["epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1"],
["epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1"],
["epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9"],
["Node462"],
["epi_isl_429041_California_20200328_null_1"],
["epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1"],
["epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1"],
["epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1"],
["epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1"],
["epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2"],
["epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1"],
["epi_isl_434170_Washington_20200329_null_1"],
["epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1"],
["epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1"],
["epi_isl_430290_Washington_20200302_null_1"],
["epi_isl_417324_California_20200304_null_1"],
["epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1"],
["epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1"],
["epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_429650_Washington_20200402_null_6"],
["Node477"],
["epi_isl_435380_Utah_20200405_null_1067"],
["Node403"],
["epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_4"],
["Node402"],
["epi_isl_413931_California_20200305_null_2"],
["epi_isl_435631_California_20200311_null_6"],
["Node512"],
["epi_isl_435640_California_20200312_null_2"],
["Node511"],
["Node399"],
["epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1"],
["epi_isl_423121_England_20200324_null_1"],
["Node393"],
["epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1"],
["epi_isl_433711_England_20200404_null_5"],
["Node390"],
["epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2"],
["epi_isl_433741_England_20200326_null_18"],
["Node387"],
["epi_isl_420078_Thies_20200320_null_1"],
["epi_isl_433853_England_20200408_null_1"],
["Node384"],
["epi_isl_423061_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_433625_Scotland_20200405_null_8"],
["epi_isl_423091_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2"],
["epi_isl_434783_Texas_20200318_null_486"],
["epi_isl_422003_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_423062_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1"],
["epi_isl_423743_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_425255_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1"],
["epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7"],
["epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2"],
["Node365"],
["epi_isl_421939_England_20200401_null_2"],
["Node352"],
["epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2"],
["epi_isl_435391_Utah_20200405_null_12"],
["Node381"],
["epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2"],
["epi_isl_432133_Wales_20200404_null_7"],
["epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1"],
["epi_isl_434004_England_20200414_null_4"],
["Node524"],
["epi_isl_423709_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_432456_England_20200405_null_1"],
["epi_isl_433900_England_20200410_null_2"],
["Node538"],
["epi_isl_434691_District_of_Columbia_20200322_null_11"],
["epi_isl_428891_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200325_null_4"],
["epi_isl_433981_England_20200413_null_1"],
["Node548"],
["epi_isl_432466_England_20200401_null_7"],
["epi_isl_423870_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_423888_England_20200318_null_2"],
["Node555"],
["epi_isl_435141_United_Arab_Emirates_20200312_null_9"],
["Node554"],
["epi_isl_431951_Wales_20200405_null_1"],
["Node553"],
["epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1"],
["epi_isl_430385_New_York_20200408_null_1"],
["Node561"],
["epi_isl_432265_Wales_20200408_null_5"],
["epi_isl_420634_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1"],
["epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1"],
["epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_430477_Victoria_20200331_null_1"],
["epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1"],
["epi_isl_433279_Scotland_20200320_null_8"],
["epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1"],
["Node586"],
["epi_isl_435065_Delhi_20200315_null_1"],
["epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1"],
["epi_isl_418732_England_20200313_null_1"],
["epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_423426_England_20200330_null_1"],
["Node600"],
["epi_isl_423453_England_20200329_null_7"],
["epi_isl_434013_England_20200414_null_3"],
["Node596"],
["epi_isl_421906_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1"],
["epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1"],
["epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1"],
["epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4"],
["epi_isl_433804_England_20200406_null_1"],
["Node618"],
["epi_isl_426108_Washington_20200325_null_17"],
["epi_isl_415519_Noord_Brabant_20200101_null_2"],
["epi_isl_423385_England_20200328_null_1"],
["Node610"],
["epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1"],
["epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3"],
["Node615"],
["epi_isl_420528_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1"],
["epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2"],
["Node627"],
["epi_isl_421880_England_20200326_null_2"],
["Node626"],
["epi_isl_417242_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_423593_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_423814_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423967_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_424026_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_423247_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_423282_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_424131_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_424142_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1"],
["epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1"],
["epi_isl_424154_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_2"],
["epi_isl_432115_Wales_20200407_null_1"],
["epi_isl_433336_Scotland_20200326_null_1"],
["epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_2"],
["epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5"],
["epi_isl_428836_Singapore_20200408_null_1"],
["epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1"],
["epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3"],
["epi_isl_423531_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_423549_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1"],
["epi_isl_431970_Wales_20200301_null_1"],
["epi_isl_430665_Victoria_20200402_null_1"],
["epi_isl_430671_Victoria_20200404_null_1"],
["epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1"],
["epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1"],
["epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1"],
["epi_isl_430577_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_430592_Victoria_20200408_null_1"],
["epi_isl_430613_Victoria_20200410_null_1"],
["epi_isl_435287_Israel_20200301_null_1"],
["epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1"],
["epi_isl_426507_Arizona_20200318_null_3"],
["epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1"],
["Node727"],
["epi_isl_423362_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_432619_England_20200330_null_10"],
["Node724"],
["epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1"],
["epi_isl_434617_Occitanie_20200301_null_3"],
["Node721"],
["epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1"],
["epi_isl_432559_England_20200402_null_2"],
["epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1"],
["epi_isl_433275_Scotland_20200319_null_1"],
["epi_isl_413695_China_20200101_null_1"],
["epi_isl_424868_Louisiana_20200309_null_1"],
["Node710"],
["epi_isl_432548_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_428771_New_York_20200405_null_1"],
["epi_isl_432899_Scotland_20200406_null_4"],
["epi_isl_423409_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_435379_Utah_20200405_null_9"],
["Node750"],
["epi_isl_423875_England_20200318_null_2"],
["epi_isl_418731_England_20200313_null_2"],
["epi_isl_435166_Kinshasa_20200413_null_16"],
["Node745"],
["epi_isl_434998_Texas_20200401_null_7"],
["epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1"],
["epi_isl_430479_Victoria_20200331_null_1"],
["Node755"],
["epi_isl_433541_Scotland_20200331_null_32"],
["epi_isl_430475_Victoria_20200331_null_1"],
["epi_isl_433348_Scotland_20200327_null_1"],
["epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5"],
["epi_isl_424148_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1"],
["epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2"],
["Node765"],
["epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1"],
["epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5"],
["Node768"],
["epi_isl_423570_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_430921_Connecticut_20200406_null_1"],
["Node775"],
["epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1"],
["epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1"],
["epi_isl_434943_Texas_20200401_null_8"],
["Node780"],
["epi_isl_435671_California_20200321_null_12217"],
["epi_isl_435143_United_Arab_Emirates_20200318_null_1"],
["epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4"],
["epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_429774_Luxembourg_20200323_null_1"],
["epi_isl_421955_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_435385_Utah_20200406_null_4"],
["Node798"],
["epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1"],
["epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_430601_Victoria_20200408_null_1"],
["epi_isl_434711_Kinshasa_20200408_null_1"],
["epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2"],
["epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2"],
["epi_isl_433809_England_20200407_null_1"],
["epi_isl_420756_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_429103_Guangzhou_20200209_null_1"],
["epi_isl_434322_Washington_20200324_null_2"],
["epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_429621_Washington_20200328_null_4"],
["epi_isl_423147_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1"],
["epi_isl_430793_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200301_null_1"]
],
"RESOLVED": [
[522.180505864366, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996356595088683, 0, 0.000819311059205333, 0.003695620822566607, 0.7003643404911317, 1, 0.0005555382946891548],
[522.0599938762026, 1220.822603811334, 1, 0, 0.2995382446120431, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.2995382446120431, 0.0005554922930660585],
[522.180505864366, 1220.658168308732, 0, 1, 0.2996149406152684, 0, 0.0008192301710359564, 0.003695255964800209, 0.7003850593847316, 1, 0.0005553447286052939],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005553778720657855],
[522.9936693402994, 1219.882899089556, 0, 1, 0.3000749902854341, 0, 0.0008197508143989375, 0.003697604401858083, 0.6999250097145659, 1, 0.0005553334836792273],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.5517754479929, 1220.324792981862, 0, 1, 0.2998214474354636, 0, 0.0008194539730332786, 0.003696265456021087, 0.7001785525645364, 1, 0.0005554342762754275],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005553892550098138],
[522.180505864366, 1220.94254183396, 1, 0, 0.2995660613597356, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995660613597355, 0.0005553809181347668],
[522.0599938762026, 1220.696062565489, 1, 0, 0.299559994037335, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299559994037335, 0.0005554922958679662],
[522.180505864366, 1220.658168308732, 0, 1, 0.2996149406152684, 0, 0.0008192301710359564, 0.003695255964800209, 0.7003850593847316, 1, 0.0005559864874215686],
[522.1098815556863, 1220.687279941504, 0, 1, 0.2995815537748269, 0, 0.0008192106335767833, 0.00369516783826984, 0.700418446225173, 1, 0.0005555319917155489],
[522.2511301730456, 1220.704845189474, 0, 1, 0.2996352963329564, 0, 0.0008191988456020124, 0.003695114666907719, 0.7003647036670435, 1, 0.0005553980080497213],
[522.6426116076092, 1220.233956822246, 1, 0, 0.2998735659625364, 0.00191335336574275, 0, -0.008630456601214621, 1, 0.2998735659625364, 0.0005557069587443411],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005555381314441063],
[522.0517754479929, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995345653870978, 0, 0.0008191183581367987, 0.0036947516165753, 0.7004654346129022, 1, 0.0005558286425751456],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995175384621367, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004824615378633, 1, 0.0005552682430427805],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554209655412565],
[522.0599938762026, 1220.696062565489, 1, 0, 0.299559994037335, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299559994037335, 0.0005555808522390884],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005555037862842789],
[521.9300836033777, 1220.976160655024, 0, 1, 0.2994596440989036, 0, 0.0008190168098478877, 0.003694293568356886, 0.7005403559010964, 1, 0.0005554607694466325],
[522.0809593666978, 1220.795609063157, 1, 0, 0.2995513100718525, 0.001915411742295744, 0, -0.008639741205840004, 1, 0.2995513100718525, 0.0005553807148548821],
[522.3662421919387, 1220.510326237916, 0, 1, 0.2997149951143899, 0, 0.0008193294054974411, 0.003695703576165952, 0.7002850048856101, 1, 0.0005553977895259175],
[522.144800778137, 1220.731767651718, 1, 0, 0.299587939981621, 0.001915177549426384, 0, -0.008638684845090595, 1, 0.299587939981621, 0.0005553447286211242],
[522.3010178525292, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996568518217295, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719562, 1, 0.2996568518217295, 0.0005554238102043852],
[522.3010178525293, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996568518217295, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719559, 1, 0.2996568518217295, 0.0005554409443531174],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005553447286211242],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005555382946891548],
[522.2800523620341, 1220.596516067821, 1, 0, 0.2996655424844872, 0.001914681587928654, 0, -0.00863644773914944, 1, 0.2996655424844872, 0.0005554734460984726],
[522.2716773584579, 1220.684298004061, 0, 1, 0.2996470850331318, 0, 0.000819212634777967, 0.003695176864976708, 0.7003529149668682, 1, 0.0005554215489109478],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.000555535493874166],
[522.2511301730456, 1220.625438256809, 0, 1, 0.2996489479708468, 0, 0.0008192521380089478, 0.003695355050003422, 0.7003510520291532, 1, 0.0005553892550098138],
[522.0599938762027, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2995599940373351, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584009, 1, 0.299559994037335, 0.0005555889103118325],
[521.7515377934538, 1221.204437569065, 0, 2, 0.2993486612218844, 0, 0.001637727425869176, 0.007387206005251418, 0.4909122985315659, 1, 0.001111151876791573],
[522.2800523620341, 1220.596516067821, 1, 0, 0.2996655424844872, 0.001914681587928654, 0, -0.00863644773914944, 1, 0.2996655424844872, 0.0005555319888874991],
[522.1426116076092, 1220.733956822246, 0, 1, 0.2995866839141705, 0, 0.0008191793096369258, 0.003695026547116643, 0.7004133160858295, 1, 0.0005555185301617055],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005553447286333215],
[522.0599938762026, 1220.696062565489, 1, 0, 0.299559994037335, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299559994037335, 0.0005555352591225801],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.909962634859, 1220.808199550076, 1, 0, 0.2994804174075478, 0.001916039301015651, 0, -0.00864257190005146, 1, 0.2994804174075478, 0.0005554433582293747],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554342766469581],
[522.3010178525292, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2996775717302037, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719562, 1, 0.2996775717302037, 0.0005554324667109343],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005553807145937696],
[522.1426116076092, 1220.733956822246, 0, 1, 0.2995866839141705, 0, 0.0008191793096369258, 0.003695026547116643, 0.7004133160858295, 1, 0.000555492295883822],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995175384621367, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004824615378633, 1, 0.0005553447257531601],
[522.0539646185206, 1220.822603811334, 1, 0, 0.2995358214545481, 0.001915510785806843, 0, -0.008640187955896463, 1, 0.299535821454548, 0.0005555381311820557],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005555381311924942],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554922930406234],
[522.1426116076092, 1220.733956822246, 0, 1, 0.2995866839141705, 0, 0.0008191793096369258, 0.003695026547116643, 0.7004133160858295, 1, 0.0005560377379611726],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005555382946992674],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554027506796663],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554922959202395],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005553447286211242],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005553382185293405],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.000555471658128021],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005552875634994196],
[522.0599938762026, 1220.822603811334, 1, 0, 0.2995382446120431, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.2995382446120431, 0.0005555382946529156],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005553447286211242],
[522.022099619446, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995226384116251, 0, 0.0008191183581367986, 0.003694751616575299, 0.7004773615883749, 1, 0.0005554922930660585],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554210280253096],
[521.863693374526, 1221.012875055329, 1, 0, 0.2994266506461035, 0.001916209180090116, 0, -0.008643338164143536, 1, 0.2994266506461035, 0.0005554503977956493],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995175384621367, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004824615378633, 1, 0.0005555037862842789],
[522.1721308607897, 1221.166543312309, 0, 1, 0.2995242052485681, 0, 0.00081888912325389, 0.003693717619539598, 0.700475794751432, 1, 0.0005557856046378699],
[522.0599938762026, 1220.816574553652, 1, 0, 0.299539280826136, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299539280826136, 0.0005555382945447955],
[522.180505864366, 1220.658168308732, 0, 1, 0.2996149406152684, 0, 0.0008192301710359564, 0.003695255964800209, 0.7003850593847316, 1, 0.0005553447286052939],
[522.0599938762026, 1220.696062565489, 1, 0, 0.299559994037335, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299559994037335, 0.000555492295883822],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554237037552261],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995175384621367, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004824615378633, 1, 0.000555518527288436],
[521.7184001211226, 1221.158168308732, 1, 0, 0.2993432865938034, 0.001916742824803264, 0, -0.008645745245668439, 1, 0.2993432865938034, 0.0005553447286561349],
[522.6426116076092, 1220.233956822246, 0, 1, 0.2998735659625364, 0, 0.0008195149744924466, 0.003696540611909898, 0.7001264340374636, 1, 0.0005555352590744402],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.6178303423692, 1220.258738087486, 1, 0, 0.2998593473622701, 0.001913444092301435, 0, -0.008630865836456435, 1, 0.2998593473622702, 0.0005554494441513027],
[522.338912109286, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996993140942031, 0, 0.000819311059205333, 0.003695620822566607, 0.7003006859057969, 1, 0.0005554778267235866],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554322385353986],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005555382945447955],
[522.180505864366, 1220.733956822246, 0, 1, 0.2996019122243394, 0, 0.0008191793096369258, 0.003695026547116643, 0.7003980877756606, 1, 0.0005554236234994431],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554235797829393],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005553977985218295],
[522.1098815556862, 1220.766686874169, 0, 1, 0.299567904585493, 0, 0.0008191573465692676, 0.003694927479529, 0.700432095414507, 1, 0.0005555319888510411],
[522.2101816929129, 1220.666386736942, 0, 1, 0.2996254532031309, 0, 0.0008192246553730192, 0.003695231085606193, 0.7003745467968692, 1, 0.0005560377377905175],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005553977894629587],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554409444774373],
[522.2716773584579, 1220.684298004061, 0, 1, 0.2996470850331318, 0, 0.000819212634777967, 0.003695176864976708, 0.7003529149668682, 1, 0.0005553447286211242],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005555319917155489],
[522.2716773584579, 1220.684298004061, 0, 1, 0.2996470850331318, 0, 0.000819212634777967, 0.003695176864976708, 0.7003529149668682, 1, 0.0005555050756434397],
[522.2800523620341, 1220.596516067821, 1, 0, 0.2996655424844872, 0.001914681587928654, 0, -0.00863644773914944, 1, 0.2996655424844872, 0.0005554728689601993],
[522.0517754479929, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995345653870978, 0, 0.0008191183581367987, 0.0036947516165753, 0.7004654346129022, 1, 0.0005555380005207307],
[522.2926428489531, 1220.830404849373, 0, 1, 0.2996303924376449, 0, 0.0008191145928441887, 0.003694734632679359, 0.7003696075623551, 1, 0.0005554122096073973],
[522.0809593666978, 1220.795609063157, 1, 0, 0.2995513100718525, 0.001915411742295744, 0, -0.008639741205840004, 1, 0.2995513100718525, 0.0005553702763299678],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[523.0720058954147, 1219.64615628952, 0, 1, 0.3001472167132364, 0, 0.0008199099344044662, 0.003698322135616357, 0.6998527832867636, 1, 0.0005550820570206526],
[522.5304746230223, 1220.346093806833, 0, 1, 0.2998092257868647, 0, 0.0008194396696764361, 0.003696200938664967, 0.7001907742131352, 1, 0.0005554127716988529],
[522.3720683781022, 1220.383988063589, 0, 1, 0.2997390635638738, 0, 0.000819414225179013, 0.003696086167585729, 0.7002609364361263, 1, 0.0005555382946735764],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554238101307433],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554734639477094],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554215489109478],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005555319888619947],
[522.022099619446, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995226384116251, 0, 0.0008191183581367986, 0.003694751616575299, 0.7004773615883749, 1, 0.0005553447286333215],
[522.3720683781022, 1220.383988063589, 0, 1, 0.2997390635638738, 0, 0.000819414225179013, 0.003696086167585729, 0.7002609364361263, 1, 0.0005554922958679662],
[521.680505864366, 1221.196062565489, 0, 1, 0.2993215442298041, 0, 0.0008188693287294095, 0.003693628333479046, 0.7006784557701959, 1, 0.0005555319888874991],
[522.180505864366, 1220.733956822246, 0, 1, 0.2996019122243394, 0, 0.0008191793096369258, 0.003695026547116643, 0.7003980877756606, 1, 0.000555423576921016],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554922930660585],
[522.3010178525293, 1220.569521319644, 1, 0, 0.2996786084298673, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719559, 1, 0.2996786084298673, 0.0005554238680367989],
[522.022099619446, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2995447634314892, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.7004552365685108, 1, 0.0005557069558472205],
[522.0517754479929, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995345653870978, 0, 0.0008191183581367987, 0.0036947516165753, 0.7004654346129022, 1, 0.0005554922930660585],
[522.0517754479929, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995345653870977, 0, 0.0008191183581367986, 0.003694751616575299, 0.7004654346129022, 1, 0.0005555383656015803],
[521.8104161371908, 1221.036476464117, 1, 0, 0.2994011799615721, 0.001916404826493703, 0, -0.008644220655493837, 1, 0.2994011799615721, 0.000555492295883822],
[522.180505864366, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996356595088683, 0, 0.000819311059205333, 0.003695620822566607, 0.7003643404911317, 1, 0.0005553447315012829],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.000555503156586774],
[522.0753768567811, 1220.821246848644, 0, 1, 0.2995446601685651, 0, 0.0008191207374391139, 0.00369476234876191, 0.7004553398314349, 1, 0.000566446302159691],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.022099619446, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995226384116251, 0, 0.0008191183581367987, 0.0036947516165753, 0.7004773615883749, 1, 0.0005554508359795896],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.5636308918384, 1219.996125048177, 0, 0, 0.2998827610419272, 0, 0, 0, 1, 1, 7.803660374298185e-05],
[522.3720683781022, 1220.346093806833, 0, 1, 0.2997455811920716, 0, 0.0008194396696764359, 0.003696200938664966, 0.7002544188079285, 1, 0.0004771965613701915],
[522.180505864366, 1220.698251736017, 1, 0, 0.2996080499502504, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2996080499502505, 0.0005553894785998543],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.0005555319888874991],
[522.1826950348938, 1220.693873394961, 0, 1, 0.2996096823456204, 0, 0.0008192062086940985, 0.003695147879197638, 0.7003903176543796, 1, 0.0005553980078748113],
[521.9099440383737, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994395448971803, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005604551028197, 1, 0.0005553447286052939],
[522.0809593666978, 1220.795609063157, 1, 0, 0.2995513100718525, 0.001915411742295744, 0, -0.008639741205840004, 1, 0.2995513100718525, 0.0005553807147903185],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.0005554922958934016],
[522.2725218804341, 1220.574370720874, 0, 1, 0.2996663241605289, 0, 0.0008192864146487017, 0.003695509659735804, 0.7003336758394711, 1, 0.0005553447286052939],
[522.0809593666978, 1220.92433947953, 1, 0, 0.2995291865792297, 0.001915411742295744, 0, -0.008639741205840004, 1, 0.2995291865792297, 0.0005553807230670931],
[522.2926428489529, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2995933323722582, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7004066676277418, 1, 0.0005553423780211737],
[522.180505864366, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995811979973593, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004188020026407, 1, 0.000555440944140346],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005555319888351811],
[522.1426116076092, 1220.733956822246, 0, 1, 0.2995866839141705, 0, 0.0008191793096369258, 0.003695026547116643, 0.7004133160858295, 1, 0.0005560377378594694],
[522.3010178525293, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2996775717302038, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719559, 1, 0.2996775717302038, 0.000555440944770158],
[522.6426116076092, 1220.233956822246, 0, 1, 0.2998735659625364, 0, 0.0008195149744924466, 0.003696540611909898, 0.7001264340374636, 1, 0.0005555382946529156],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005557826871679948],
[521.8025330434566, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2994122620401949, 0.001916433778439934, 0, -0.008644351247427321, 1, 0.2994122620401949, 0.000555625495595604],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.9230450316198, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2994607044960255, 0.001915991274038142, 0, -0.008642355267435394, 1, 0.2994607044960256, 0.0005555383459518417],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.0517754479929, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995345653870977, 0, 0.0008191183581367986, 0.003694751616575299, 0.7004654346129022, 1, 0.0005556018737787187],
[522.0599938762026, 1220.696062565489, 1, 0, 0.299559994037335, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299559994037335, 0.0005554311983061586],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005553809181468612],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554408772912209],
[521.9300836033777, 1220.976160655024, 0, 1, 0.2994596440989036, 0, 0.0008190168098478877, 0.003694293568356886, 0.7005403559010964, 1, 0.0005553447286052939],
[522.180505864366, 1220.733956822246, 0, 1, 0.2996019122243394, 0, 0.0008191793096369258, 0.003695026547116643, 0.7003980877756606, 1, 0.0005554237614442043],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005553447286211242],
[522.180505864366, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995862985672047, 0, 0.0008191183581367987, 0.0036947516165753, 0.7004137014327954, 1, 0.0005553980078519493],
[522.338912109286, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996993140942031, 0, 0.0008193110592053329, 0.003695620822566607, 0.700300685905797, 1, 0.0005553807145605667],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554922930660585],
[521.9889433506297, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994712962934236, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005287037065764, 1, 0.0005554235798061797],
[522.3010178525293, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2996775717302038, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719559, 1, 0.2996775717302038, 0.0005554238679010833],
[522.0599938762026, 1220.816574553652, 1, 0, 0.299539280826136, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299539280826136, 0.0005554922958679662],
[522.3305371057097, 1220.792510592616, 0, 1, 0.2996521317272531, 0, 0.0008191400187363242, 0.003694849319836761, 0.7003478682727469, 1, 0.0005553423780211737],
[522.3720683781022, 1220.383988063589, 0, 1, 0.2997390635638738, 0, 0.000819414225179013, 0.003696086167585729, 0.7002609364361263, 1, 0.0005555354931440626],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005555400295636502],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005553311331300541],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 1, 1, 0.2995175384621367, 0.001915627711411068, 0.000819098447478668, -0.00494605355903859, 0.9102892441535825, 0.5093243210778559, 0.001111960457310344],
[522.0517754479929, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995345653870978, 0, 0.0008191183581367987, 0.0036947516165753, 0.7004654346129022, 1, 0.0005555382943294881],
[522.5517754479929, 1220.324792981862, 0, 1, 0.2998214474354636, 0, 0.0008194539730332786, 0.003696265456021087, 0.7001785525645364, 1, 0.0005553447286333215],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554409443687037],
[522.0517754479929, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995345653870977, 0, 0.0008191183581367986, 0.003694751616575299, 0.7004654346129022, 1, 0.0005555319888619947],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005553977897084321],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005559864872410926],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554238682439417],
[522.180505864366, 1220.733956822246, 1, 0, 0.2996019122243394, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2996019122243394, 0.0005559864874425202],
[522.3010178525293, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2996775717302038, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719559, 1, 0.2996775717302038, 0.0005554407021177287],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.000555377871926781],
[522.2184001211227, 1220.658168308732, 0, 1, 0.2996301686421692, 0, 0.0008192301710359564, 0.003695255964800209, 0.7003698313578308, 1, 0.0005553865792638338],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005555075833122474],
[522.1310444017756, 1220.599176298523, 0, 1, 0.2996052046380204, 0, 0.000819269764733504, 0.003695434557889433, 0.7003947953619796, 1, 0.0005555903501929402],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.0599938762026, 1220.822603811334, 1, 0, 0.2995382446120431, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.2995382446120431, 0.0005555201870242075],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.0005554807349835503],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.3720683781022, 1220.346093806833, 0, 1, 0.2997455811920716, 0, 0.0008194396696764361, 0.003696200938664967, 0.7002544188079285, 1, 0.0005555534756950498],
[522.3720683781022, 1220.274683634375, 0, 1, 0.2997578641654405, 0, 0.0008194876230830872, 0.003696417239429056, 0.7002421358345594, 1, 0.0005552786486744645],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.66035747926, 0, 1, 0.2996145642709839, 0, 0.0008192287018029016, 0.003695249337612391, 0.700385435729016, 1, 0.0005555996597124591],
[522.3010178525292, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2996775717302038, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719562, 1, 0.2996775717302038, 0.0005554238680691337],
[522.3010178525293, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2996775717302038, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719559, 1, 0.2996775717302038, 0.0005554409446902054],
[522.2184001211227, 1220.658168308732, 0, 1, 0.2996301686421692, 0, 0.0008192301710359564, 0.003695255964800209, 0.7003698313578308, 1, 0.0005559864873894703],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005553809180595336],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005553977895259175],
[522.0220996194458, 1220.824792981862, 0, 1, 0.299522638411625, 0, 0.0008191183581367986, 0.003694751616575299, 0.700477361588375, 1, 0.0005553447315240968],
[522.5304746230223, 1220.346093806833, 0, 1, 0.2998092257868647, 0, 0.0008194396696764359, 0.003696200938664966, 0.7001907742131352, 1, 0.0005553778718234706],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[523.1047173508524, 1219.771851079003, 0, 0, 0.3001387056469029, 0, 0, 0, 1, 1, 6.427550107896287e-05],
[522.6426116076092, 1220.233956822246, 1, 0, 0.2998735659625364, 0.00191335336574275, 0, -0.008630456601214621, 1, 0.2998735659625364, 0.0004922774478116671],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554324672417501],
[522.180505864366, 1220.658168308732, 0, 2, 0.2996149406152684, 0, 0.001638460342071913, 0.007390511929600418, 0.490539231409354, 1, 0.001111421151110548],
[522.2101816929129, 1220.666386736942, 0, 1, 0.2996254532031309, 0, 0.0008192246553730192, 0.003695231085606193, 0.7003745467968692, 1, 0.0005554016871447007],
[522.0809593666978, 1220.92433947953, 1, 0, 0.2995291865792297, 0.001915411742295744, 0, -0.008639741205840004, 1, 0.2995291865792297, 0.0005553809181468612],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554409350281335],
[522.2725218804341, 1220.574370720874, 0, 1, 0.2996663241605289, 0, 0.0008192864146487018, 0.003695509659735805, 0.7003336758394711, 1, 0.0005553447286211242],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005555382944732982],
[522.0809593666978, 1220.875015995821, 1, 0, 0.2995376628822249, 0.001915411742295744, 0, -0.008639741205840004, 1, 0.2995376628822249, 0.0005553977895523978],
[522.5517754479929, 1220.324792981862, 0, 1, 0.2998214474354636, 0, 0.0008194539730332785, 0.003696265456021086, 0.7001785525645364, 1, 0.0005553447286211242],
[522.0599938762027, 1220.816574553652, 1, 0, 0.2995392808261361, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584009, 1, 0.2995392808261361, 0.0005555381312286955],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.00055540168716046],
[522.3720683781022, 1220.383988063589, 0, 2, 0.2997390635638738, 0, 0.001638828450358026, 0.007392172335171457, 0.4903653790984006, 1, 0.001111643714931184],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.2716773584579, 1220.851370339868, 0, 1, 0.2996183648928752, 0, 0.0008191005263168225, 0.003694671183576784, 0.7003816351071248, 1, 0.0005552118295759593],
[522.2800523620341, 1220.596516067821, 1, 0, 0.2996655424844872, 0.001914681587928654, 0, -0.00863644773914944, 1, 0.2996655424844872, 0.0005553258877716093],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 7.721641728760462e-05],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0004780804773274465],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 7.573089954099626e-05],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0004794205284199456],
[522.180505864366, 1220.379250075649, 0, 0, 0.2996628976908045, 0, 0, 0, 1, 1, 7.721641134140569e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996356595088683, 0, 0.0008193110592053329, 0.003695620822566607, 0.7003643404911317, 1, 0.0004780804863839451],
[522.3645378965022, 1220.452678876259, 0, 1, 0.2997242240146008, 0, 0.000819368106038128, 0.003695878140542204, 0.7002757759853993, 1, 0.0005554175705254616],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.2725218804341, 1220.574370720874, 0, 1, 0.2996663241605289, 0, 0.0008192864146487018, 0.003695509659735805, 0.7003336758394711, 1, 0.0005554152266075829],
[522.3594592946981, 1220.517109135157, 0, 2, 0.2997111033314815, 0, 0.001638649704318504, 0.007391366075353302, 0.4904045387972111, 1, 0.001111247585452092],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 7.734787131314725e-05],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0004779593721807379],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 7.721639954016212e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0004780804952653691],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.9230450316198, 1220.953523398235, 0, 0, 0.2994607044960255, 0, 0, 0, 1, 1, 7.721640873932846e-05],
[522.0517754479929, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995345653870977, 0, 0.0008191183581367986, 0.003694751616575299, 0.7004654346129022, 1, 0.0004780804863839451],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 7.72164086828857e-05],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0004780804862229175],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.4215298406924, 1220.455038589162, 0, 0, 0.2997467171822376, 0, 0, 0, 1, 1, 7.66075930539295e-05],
[522.3010178525292, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2996775717302038, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719562, 1, 0.2996775717302038, 0.000478589930760038],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.497318354206, 1220.379250075649, 0, 0, 0.2997902019102363, 0, 0, 0, 1, 1, 7.576701333122963e-05],
[522.338912109286, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996993140942031, 0, 0.0008193110592053329, 0.003695620822566607, 0.700300685905797, 1, 0.0004793845308026948],
[522.680505864366, 1220.233956822246, 0, 2, 0.299888788035347, 0, 0.001639029948984893, 0.007393081223819795, 0.4901557091186154, 1, 0.001112603339877131],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[523.1047173508524, 1219.771851079003, 0, 0, 0.3001387056469029, 0, 0, 0, 1, 1, 7.721641185747025e-05],
[522.6426116076092, 1220.233956822246, 0, 1, 0.2998735659625364, 0, 0.0008195149744924466, 0.003696540611909898, 0.7001264340374636, 1, 0.0004780804863839451],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 7.721640471811613e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0004780804952653691],
[521.4805683470535, 1221.396000082802, 0, 0, 0.2992068272607805, 0, 0, 0, 1, 1, 7.721641129066204e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.0004780804863839451],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.4805683470535, 1221.396000082801, 0, 0, 0.2992068272607805, 0, 0, 0, 1, 1, 7.721640678750152e-05],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.0004780804863839451],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.0599938762026, 1220.696062565489, 1, 0, 0.299559994037335, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299559994037335, 0.0005555498373309486],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005552875634994196],
[522.180505864366, 1220.379250075649, 0, 1, 0.2996628976908045, 0, 0.0008194174064644346, 0.003696100517232929, 0.7003371023091955, 1, 0.0005552803079883947],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996356595088683, 0, 0.0008193110592053329, 0.003695620822566607, 0.7003643404911317, 1, 0.0005558532731988297],
[521.4805683470535, 1221.396000082801, 0, 0, 0.2992068272607805, 0, 0, 0, 1, 1, 7.721641147593156e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.0004780804863839451],
[521.4805683470535, 1221.396000082802, 0, 0, 0.2992068272607805, 0, 0, 0, 1, 1, 7.725300093871268e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.0004780445598555759],
[522.1511653702945, 1220.971882328031, 1, 1, 0.2995492292180745, 0.001915154204991248, 0.0008190196797106388, -0.004944273033358336, 0.9102702592748574, 0.5093687177110066, 0.001111235521903833],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.9255556248581, 1218.958544584712, 1, 0, 0.299402446152656, 0.001919660091930957, 0, -0.008658904000235414, 1, 0.2994024461526561, 0.0005565930337582625],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.0517754479929, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995345653870977, 0, 0.0008191183581367986, 0.003694751616575299, 0.7004654346129022, 1, 0.0005554815568248917],
[522.0599938762027, 1220.816574553652, 1, 0, 0.2995392808261361, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584009, 1, 0.2995392808261361, 0.0005554227162986933],
[522.5517754479929, 1220.324792981862, 0, 1, 0.2998214474354636, 0, 0.0008194539730332786, 0.003696265456021087, 0.7001785525645364, 1, 0.0005555460263539622],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996356595088683, 0, 0.000819311059205333, 0.003695620822566607, 0.7003643404911317, 1, 0.0005555075365760842],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.499032413799, 1218.385062761938, 0, 1, 0.2997320533360728, 0, 0.0008207585849198737, 0.003702150096292078, 0.7002679466639272, 1, 0.0005562210372181305],
[522.3305371057096, 1220.546031324145, 0, 1, 0.299694508817841, 0, 0.0008193054373501346, 0.003695595464377066, 0.700305491182159, 1, 0.0005555844112293322],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.3070471102113, 1220.569521319644, 1, 0, 0.2996810311017917, 0.001914582630145887, 0, -0.008636001375782998, 1, 0.2996810311017917, 0.00055552958359388],
[522.0599938762026, 1220.816574553652, 1, 0, 0.299539280826136, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299539280826136, 0.0005555469470250459],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.680505864366, 1221.196062565489, 0, 1, 0.2993215442298041, 0, 0.0008188693287294095, 0.003693628333479046, 0.7006784557701959, 1, 0.0005557110909404019],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005556857413443109],
[521.680505864366, 1221.196062565489, 0, 1, 0.2993215442298041, 0, 0.0008188693287294095, 0.003693628333479046, 0.7006784557701959, 1, 0.0005555361618248906],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554670171327255],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.9394818880395, 1220.937086541816, 0, 1, 0.2994701353741023, 0, 0.0008190430211538596, 0.003694411798236793, 0.7005298646258977, 1, 0.0005555605913263252],
[522.0599938762027, 1220.816574553652, 1, 0, 0.2995392808261361, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584009, 1, 0.2995392808261361, 0.0005555098560534054],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.3221621021335, 1221.554406327722, 0, 2, 0.2991159394447473, 0, 0.001637258225781746, 0.007385089610515167, 0.4912384663404191, 1, 0.00111167137225471],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.0005552945449503584],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995175384621367, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004824615378633, 1, 0.0005553102327137413],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005553921412947028],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995175384621367, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004824615378633, 1, 0.000555395271360632],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.000555262836678274],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001324209903312036],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0004228588236089123],
[521.9394818880394, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2995115550978354, 0.001915930935867597, 0, -0.00864208310340568, 1, 0.2995115550978353, 0.0005555334786699776],
[521.8273449034524, 1220.561720281605, 0, 1, 0.2994895659816538, 0, 0.0008192949060939602, 0.003695547961625616, 0.7005104340183461, 1, 0.000555763359662647],
[521.8189698998762, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2994631094582813, 0.001916373412396017, 0, -0.008644078957670739, 1, 0.2994631094582813, 0.0005553728751905499],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.9394818880394, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2995115550978354, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001635884050463882],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.0599938762026, 1220.696062565489, 1, 0, 0.299559994037335, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299559994037335, 0.0003917510431820422],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005555876241723103],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002469383216053807],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.000308356693499668],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005550896644196897],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 0, 1, 0.2995641741245016, 0, 0.0008190319949417376, 0.003694362062915081, 0.7004358258754984, 1, 0.0005552793895788073],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005555197619386325],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 0, 1, 0.2995641741245016, 0, 0.0008190319949417376, 0.003694362062915081, 0.7004358258754984, 1, 0.0005553404435368012],
[522.0599938762026, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995157459780068, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.2995157459780068, 0.0005553665671930312],
[522.180505864366, 1220.915629141478, 0, 1, 0.2995706865373867, 0, 0.0008190574157062586, 0.003694476726943637, 0.7004293134626134, 1, 0.0005555234958490485],
[522.0539646185206, 1221.08006464408, 1, 0, 0.2994915800246097, 0.001915510785806843, 0, -0.008640187955896463, 1, 0.2994915800246096, 0.0005554154967677313],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005555221998271299],
[522.0599938762027, 1221.074035386398, 1, 0, 0.2994950388852485, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584009, 1, 0.2994950388852485, 0.0005553848505734906],
[523.1047173508524, 1220.029311911749, 0, 0, 0.3000943751709911, 0, 0, 0, 1, 1, 8.781264040470331e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.6426116076092, 1220.491417654992, 0, 1, 0.2998292746477464, 0, 0.0008193420990385692, 0.003695760832215871, 0.7001707253522536, 1, 0.0004674119069446809],
[521.909962634859, 1221.065660382822, 1, 0, 0.2994361801407504, 0.001916039301015651, 0, -0.00864257190005146, 1, 0.2994361801407504, 0.0005554306944689256],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005554391159825949],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005554532842863509],
[521.8305371057097, 1221.303492156891, 0, 1, 0.299363404273887, 0, 0.0008187972984781556, 0.003693303430631223, 0.7006365957261129, 1, 0.0005554945204754048],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 0, 1, 0.2995641741245016, 0, 0.0008190319949417376, 0.003694362062915081, 0.7004358258754984, 1, 0.0005553864849812687],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005553238583138873],
[522.0220996194458, 1221.082253814608, 0, 1, 0.2994783981756576, 0, 0.0008189456499560477, 0.00369397259139086, 0.7005216018243424, 1, 0.0005553307823695058],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005553218199362663],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 0, 1, 0.2995641741245016, 0, 0.0008190319949417376, 0.003694362062915081, 0.7004358258754984, 1, 0.00055549815116039],
[522.0599938762026, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995157459780068, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.2995157459780068, 0.0005554449263955566],
[522.0517754479929, 1221.082253814608, 0, 1, 0.2994903241426804, 0, 0.0008189456499560478, 0.00369397259139086, 0.7005096758573196, 1, 0.0005554456160028228],
[522.3720683781022, 1220.641448896336, 0, 1, 0.2996947890541544, 0, 0.0008192413922238735, 0.003695306579588395, 0.7003052109458456, 1, 0.0005553821473994157],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005554250313065483],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005551181931955909],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005554456160556194],
[522.022099619446, 1221.111929643155, 0, 1, 0.2994732997325956, 0, 0.0008189257476931123, 0.003693882819360452, 0.7005267002674045, 1, 0.0005553110233491687],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.022099619446, 1221.111929643155, 0, 1, 0.2994732997325956, 0, 0.0008189257476931123, 0.003693882819360452, 0.7005267002674045, 1, 0.0005553521398849263],
[521.8104161371908, 1221.293937296863, 1, 0, 0.2993569576653187, 0.001916404826493703, 0, -0.008644220655493837, 1, 0.2993569576653187, 0.0005551890230603033],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.1426116076092, 1220.991417654992, 0, 1, 0.2995424349718487, 0, 0.0008190065757551164, 0.003694247406003869, 0.7004575650281513, 1, 0.0005553203443114913],
[522.3720683781022, 1220.603554639579, 0, 1, 0.2997013047570334, 0, 0.0008192668259886243, 0.003695421302256365, 0.7002986952429666, 1, 0.0005553491806884605],
[522.180505864366, 1221.336222208814, 0, 1, 0.2994984203228411, 0, 0.0008187753558896969, 0.003693204455417966, 0.700501579677159, 1, 0.0005555908117586766],
[522.2725218804341, 1220.83183155362, 0, 1, 0.2996220627018202, 0, 0.0008191136355999241, 0.003694730314890899, 0.7003779372981798, 1, 0.0005554400674140045],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005553238611784613],
[522.7599313935153, 1220.253585880923, 1, 0, 0.2999173134416987, 0.001912923963652515, 0, -0.008628519721090647, 1, 0.2999173134416987, 0.0005550765890083958],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.5304746230223, 1220.603554639579, 0, 1, 0.2997649439751163, 0, 0.0008192668259886243, 0.003695421302256365, 0.7002350560248837, 1, 0.0005550990905653326],
[522.022099619446, 1221.111929643155, 0, 1, 0.2994732997325956, 0, 0.0008189257476931123, 0.003693882819360452, 0.7005267002674045, 1, 0.0005553019978772537],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005552955168281527],
[522.0599938762026, 1221.074035386398, 1, 0, 0.2994950388852485, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.2994950388852485, 0.0005554219864326195],
[522.0809593666978, 1221.053069895903, 1, 0, 0.2995070663542459, 0.001915411742295744, 0, -0.008639741205840004, 1, 0.2995070663542458, 0.0005553632101904422],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 0, 1, 0.2995641741245016, 0, 0.0008190319949417376, 0.003694362062915081, 0.7004358258754984, 1, 0.0005553632101512152],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 0, 1, 0.2995641741245016, 0, 0.0008190319949417376, 0.003694362062915081, 0.7004358258754984, 1, 0.000555492451924139],
[522.2511301730456, 1220.96230602222, 0, 1, 0.2995910422265388, 0, 0.0008190261034821836, 0.003694335488636168, 0.7004089577734611, 1, 0.0005550787910154593],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005553247287247222],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005553419162126334],
[521.3684313624665, 1221.765597900135, 0, 2, 0.2990983037506423, 0, 0.001636975213115697, 0.007383813041024313, 0.4912631878052269, 1, 0.001111698627875848],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005553590113719528],
[522.022099619446, 1221.111929643155, 0, 1, 0.2994732997325956, 0, 0.0008189257476931123, 0.003693882819360452, 0.7005267002674045, 1, 0.0005555380518320038],
[522.0599938762026, 1221.074035386398, 1, 1, 0.2994950388852485, 0.001915488663621163, 0.0008189511618626454, -0.004946090716942649, 0.9103027216831234, 0.5092927994536205, 0.001111347044618423],
[522.0893343702741, 1220.582589149084, 0, 2, 0.2995912927293309, 0, 0.001638561796456788, 0.007390969554251119, 0.4905723572205697, 1, 0.001111427900258155],
[522.0599938762027, 1221.074035386398, 1, 0, 0.2994950388852485, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584009, 1, 0.2994950388852485, 0.000555449562998105],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 0, 2, 0.2995641741245016, 0, 0.001638063989883475, 0.007388724125830162, 0.4906103461698914, 1, 0.001111186099086144],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 0, 0, 0.2995641741245016, 0, 0, 0, 1, 1, 6.304277606188015e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 0, 1, 0.2995641741245016, 0, 0.0008190319949417376, 0.003694362062915081, 0.7004358258754984, 1, 0.000492111429270341],
[522.022099619446, 1221.111929643155, 0, 1, 0.2994732997325956, 0, 0.0008189257476931123, 0.003693882819360452, 0.7005267002674045, 1, 0.0005551557577591283],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 0, 1, 0.2995641741245016, 0, 0.0008190319949417376, 0.003694362062915081, 0.7004358258754984, 1, 0.0005551736330162564],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2995641741245016, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2995641741245016, 0.0005552182184775262],
[522.180505864366, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995862985672047, 0, 0.0008191183581367987, 0.0036947516165753, 0.7004137014327954, 1, 0.0005554565114945318],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.437966697112, 1220.438601732743, 1, 0, 0.2997561480603142, 0.001914102848079873, 0, -0.008633837249504544, 1, 0.2997561480603141, 0.0005550878988455917],
[522.3092362807389, 1220.567332149116, 0, 1, 0.299682287169242, 0, 0.0008192911391780806, 0.003695530970407683, 0.7003177128307581, 1, 0.000555326665534036],
[521.863693374526, 1220.953523398235, 1, 0, 0.2994368476235736, 0.001916209180090116, 0, -0.008643338164143536, 1, 0.2994368476235736, 0.0005553437377569711],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.022099619446, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995226384116251, 0, 0.0008191183581367986, 0.003694751616575299, 0.7004773615883749, 1, 0.000555217138032801],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005551082506758885],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005553959286266802],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005553887023885798],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554438091366266],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.000555667033164371],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.1426116076092, 1220.733956822246, 0, 1, 0.2995866839141705, 0, 0.0008191793096369258, 0.003695026547116643, 0.7004133160858295, 1, 0.000555356121075455],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005552841406103946],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554352500136061],
[522.3010178525292, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2996775717302037, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719562, 1, 0.2996775717302037, 0.0005553379382252445],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.5420418288558, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2997744065605717, 0.001913721614628517, 0, -0.008632117640980699, 1, 0.2997744065605717, 0.0005552907241310201],
[522.3010178525293, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996568518217295, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719559, 1, 0.2996568518217295, 0.0005553884593228567],
[521.49902891583, 1218.859476400854, 0, 1, 0.2996503463640875, 0, 0.0008204391230996375, 0.003700709117628828, 0.7003496536359125, 1, 0.0005550859285152317],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005552448526948172],
[522.5636308918384, 1220.07191356169, 1, 0, 0.2998697189180247, 0.001913642551612978, 0, -0.008631761015834195, 1, 0.2998697189180246, 0.0005554067738110253],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.3720683781022, 1220.383988063589, 0, 1, 0.2997390635638738, 0, 0.000819414225179013, 0.003696086167585729, 0.7002609364361263, 1, 0.0005555301910922668],
[522.2162109505949, 1220.66035747926, 1, 0, 0.2996289125747188, 0.001914915659511395, 0, -0.008637503552818043, 1, 0.2996289125747188, 0.0005552904794491337],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554730765433849],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554398170258423],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.9274233726752, 1220.94914505718, 1, 0, 0.2994632166309263, 0.001915975201184176, 0, -0.008642282768507021, 1, 0.2994632166309263, 0.0005553653962881588],
[522.0539646185206, 1220.822603811334, 1, 0, 0.2995358214545481, 0.001915510785806843, 0, -0.008640187955896463, 1, 0.299535821454548, 0.0005555414689504243],
[521.8327262762374, 1221.043842153618, 1, 0, 0.2994088828369256, 0.00191632289361369, 0, -0.008643851085409283, 1, 0.2994088828369256, 0.0005556802883140137],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.9230450316198, 1219.953523398235, 1, 0, 0.3000344685927572, 0.001912327271672513, 0, -0.008625828255765996, 1, 0.3000344685927572, 0.0005553889279771295],
[522.5517754479929, 1220.324792981862, 0, 1, 0.2998214474354636, 0, 0.0008194539730332786, 0.003696265456021087, 0.7001785525645364, 1, 0.0005553072566979599],
[522.3305371057097, 1220.546031324145, 0, 1, 0.299694508817841, 0, 0.0008193054373501346, 0.003695595464377066, 0.7003054911821589, 1, 0.0005555163875901915],
[521.180505864366, 1221.658168308732, 0, 1, 0.2990411640432776, 0, 0.0008185595823293217, 0.003692231177621062, 0.7009588359567224, 1, 0.0005555119129179945],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.180505864366, 1221.696062565489, 1, 0, 0.2990346621814382, 0.001918721035702444, 0, -0.008654668251538189, 1, 0.2990346621814381, 0.0005555137021920497],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.180505864366, 1221.696062565489, 0, 0, 0.2990346621814382, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001812442955039006],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.680505864366, 1221.196062565489, 0, 1, 0.2993215442298041, 0, 0.0008188693287294095, 0.003693628333479046, 0.7006784557701959, 1, 0.0003741205774829466],
[522.5636308918384, 1220.034019304933, 0, 1, 0.2998762398381699, 0, 0.000819649275492917, 0.003697146395962552, 0.7001237601618301, 1, 0.0005555983439150757],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.3720683781022, 1220.383988063589, 0, 1, 0.2997390635638738, 0, 0.000819414225179013, 0.003696086167585729, 0.7002609364361263, 1, 0.0005552972161292433],
[522.180505864366, 1220.658168308732, 0, 1, 0.2996149406152684, 0, 0.0008192301710359564, 0.003695255964800209, 0.7003850593847316, 1, 0.0005555787461294985],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.191391022585, 1218.446228602728, 0, 1, 0.2995976777823651, 0, 0.000820717382946612, 0.003701964248843047, 0.700402322217635, 1, 0.0005564957981014422],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.680505864366, 1220.196062565489, 0, 1, 0.2998953083265357, 0, 0.0008195404252472984, 0.003696655411214171, 0.7001046916734643, 1, 0.000555388098512382],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005552881400177407],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.6426116076092, 1220.233956822246, 0, 1, 0.2998735659625364, 0, 0.0008195149744924466, 0.003696540611909898, 0.7001264340374636, 1, 0.0005555322922473242],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.7646387866998, 1221.111929643155, 0, 1, 0.2993698166799924, 0, 0.0008189257476931124, 0.003693882819360453, 0.7006301833200077, 1, 0.0005555745338086928],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.0517754479929, 1220.824792981862, 0, 1, 0.2995345653870977, 0, 0.0008191183581367986, 0.003694751616575299, 0.7004654346129022, 1, 0.0005554148725117645],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.863693374526, 1220.974980798572, 0, 1, 0.2994331610308841, 0, 0.0008190176012828331, 0.003694297138238473, 0.7005668389691159, 1, 0.0005555956723239479],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995175384621367, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004824615378633, 1, 0.0005554220530019012],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995175384621367, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004824615378633, 1, 0.0005555874760063295],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005555474650772627],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.0599938762026, 1220.816574553652, 1, 0, 0.299539280826136, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.299539280826136, 0.0005555808522390884],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 8.642121810696164e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0004692892782945906],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.9394818880395, 1220.937086541816, 0, 0, 0.2994701353741023, 0, 0, 0, 1, 1, 8.016977449581883e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.0599938762027, 1220.816574553652, 1, 0, 0.2995392808261361, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584009, 1, 0.2995392808261361, 0.000475131349996087],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.9394818880395, 1220.937086541815, 0, 0, 0.2994701353741023, 0, 0, 0, 1, 1, 8.160030951867335e-05],
[522.0599938762027, 1220.816574553652, 1, 0, 0.2995392808261361, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584009, 1, 0.2995392808261361, 0.0004737307297733323],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 8.73275489986033e-05],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0004679698006792136],
[521.8305371057097, 1221.046031324145, 0, 1, 0.2994076267694752, 0, 0.0008189699440860266, 0.003694082173571654, 0.7005923732305248, 1, 0.0005556134825373145],
[522.180505864366, 1220.449583297018, 1, 0, 0.2996508031808735, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2996508031808736, 0.0005555825125193765],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554224953980315],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005560599708391374],
[520.9745407523034, 1218.812153157764, 0, 2, 0.2994473647694385, 0, 0.001640941957149256, 0.00740170561269597, 0.4907739947284843, 1, 0.001162409194482042],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005555642062344976],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554628963914729],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554833351452161],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005555052598291784],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 7.721641179725232e-05],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0004780804863866101],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.620274051975, 1, 0, 0.2996214552356534, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2996214552356534, 0.000555365261056813],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.658168308732, 0, 1, 0.2996149406152684, 0, 0.0008192301710359564, 0.003695255964800209, 0.7003850593847316, 1, 0.0005552070800219586],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554530826438958],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005555944923059519],
[521.909962634859, 1220.808199550076, 1, 0, 0.2994804174075478, 0.001916039301015651, 0, -0.00864257190005146, 1, 0.2994804174075478, 0.0005552728558523203],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.2716773584579, 1221.066996814641, 0, 1, 0.2995813063151267, 0, 0.0008189558825262405, 0.003694018746876067, 0.7004186936848733, 1, 0.0005552904794491337],
[522.338912109286, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996993140942031, 0, 0.0008193110592053329, 0.003695620822566607, 0.700300685905797, 1, 0.0005553807231021077],
[522.3010178525293, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2996775717302038, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719559, 1, 0.2996775717302038, 0.0005554322293486005],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 0, 0.2996084262781699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002107860612316979],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.000344448076116146],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.2716773584579, 1220.851370339868, 0, 1, 0.2996183648928752, 0, 0.0008191005263168225, 0.003694671183576784, 0.7003816351071248, 1, 0.0005553709384218559],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.863693374526, 1221.012875055329, 0, 0, 0.2994266506461035, 0, 0, 0, 1, 1, 7.809613526747502e-05],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995175384621367, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004824615378633, 1, 0.0004771399641110126],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005553105561893686],
[521.6389745919735, 1221.267269666428, 1, 2, 0.2992926190438479, 0.001917034670927725, 0.001637643167614139, -0.001260235713521732, 0.7848906988314415, 0.6559590988260756, 0.001670120537841545],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005554717323366165],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.0599938762026, 1220.822603811334, 1, 0, 0.2995382446120431, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584013, 1, 0.2995382446120431, 0.0005555382946529156],
[522.2162109505949, 1220.66035747926, 0, 1, 0.2996289125747188, 0, 0.0008192287018029016, 0.003695249337612391, 0.7003710874252812, 1, 0.0005553447286333215],
[522.180505864366, 1220.698251736017, 1, 0, 0.2996080499502504, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.2996080499502505, 0.0005553977895744912],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554210233038178],
[522.5636308918384, 1219.91350731677, 0, 1, 0.2998969796694557, 0, 0.000819730246449623, 0.003697511627153153, 0.7001030203305443, 1, 0.0005555270638795292],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.3720683781022, 1220.383988063589, 0, 1, 0.2997390635638738, 0, 0.000819414225179013, 0.003696086167585729, 0.7002609364361263, 1, 0.0005554800117294427],
[522.5304746230222, 1220.346093806833, 0, 1, 0.2998092257868646, 0, 0.0008194396696764359, 0.003696200938664966, 0.7001907742131355, 1, 0.000555432238567787],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 0, 1, 0.2996084262781699, 0, 0.0008192047395469919, 0.003695141252397502, 0.70039157372183, 1, 0.0005552904794491337],
[522.3010178525293, 1220.575550577326, 1, 0, 0.2996775717302038, 0.001914604731408638, 0, -0.008636101066719559, 1, 0.2996775717302038, 0.0005554237037228841],
[522.338912109286, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996993140942031, 0, 0.0008193110592053329, 0.003695620822566607, 0.700300685905797, 1, 0.0005559864873798623],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554922930660585],
[522.0599938762027, 1220.822603811334, 1, 0, 0.2995382446120432, 0.001915488663621163, 0, -0.008640088170584009, 1, 0.2995382446120431, 0.0005555382946424777],
[522.1783166938383, 1220.698251736017, 0, 1, 0.2996071702107195, 0, 0.0008192032704051549, 0.003695134625621135, 0.7003928297892805, 1, 0.0005557069558472205],
[522.338912109286, 1220.537656320569, 0, 1, 0.2996993140942031, 0, 0.0008193110592053329, 0.003695620822566607, 0.700300685905797, 1, 0.0005553977897461331],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005555383655283172],
[521.680505864366, 1221.196062565489, 0, 1, 0.2993215442298041, 0, 0.0008188693287294095, 0.003693628333479046, 0.7006784557701959, 1, 0.0005555185301617055],
[522.180505864366, 1220.658168308732, 0, 1, 0.2996149406152684, 0, 0.0008192301710359564, 0.003695255964800209, 0.7003850593847316, 1, 0.0005553447286052939],
[522.180505864366, 1220.696062565489, 1, 0, 0.2996084262781699, 0.001915046595515279, 0, -0.008638094158567765, 1, 0.29960842627817, 0.0005554238678787434],
[522.2716773584579, 1220.851370339868, 0, 1, 0.2996183648928752, 0, 0.0008191005263168225, 0.003694671183576784, 0.7003816351071248, 1, 0.0005553447286491514],
[522.022099619446, 1220.854468810409, 0, 1, 0.2995175384621367, 0, 0.000819098447478668, 0.003694661806677151, 0.7004824615378633, 1, 0.000555492295883822]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.989513571005285, 0, -9.021288754849879, 1, 0.1111111111111109, 0.2205354052031329],
[1.005270850698152, 2.009920759960007, 1, 0, 0.3334019792124323, 0.9947567855026423, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3334019792124323, 0.2205354052031329],
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4973783927513212, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.2205354052031329],
[0.6867884895248828, 2.269359571752396, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[0.9988925894402182, 2.000553705279892, 0, 2, 0.3330256625026283, 0, 0.9997232239862242, 4.509395939254596, 0.444854766880058, 1, 0.221697814397615],
[0.9233054900148905, 2.005329664853162, 1, 0, 0.3152681850725409, 1.083065151041041, 0, -4.885321733928167, 1, 0.315268185072541, 0.221697814397615],
[0.6834893844893303, 2.316510615510673, 1, 0, 0.2278297948297765, 1.463080514040684, 0, -6.599435894377602, 1, 0.2278297948297765, 0.221697814397615],
[1, 1.924211486486534, 0, 0, 0.3419725299012176, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 1.574943991537199, 0, 0, 0.2412791663099343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -9.021288754849879, 1, 0.1111111111111109, 0.221697814397615],
[1, 1.924211486486534, 0, 0, 0.3419725299012176, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.8411861346717946, 2, 0, 0, 0.2960686469663368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.5, 6.76596656613741, 0.2962962962962963, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095032460974, 2.004695432624909, 1, 0, 0.3154776842480853, 1.082357088531467, 0, -4.88212791575049, 1, 0.3154776842480853, 0.221697814397615],
[0.30093927947312, 2.699060720526881, 0, 1, 0.1003130931577066, 0, 0.3704992601295724, 1.671190404543556, 0.8996869068422934, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.8411861346717946, 2, 0, 0, 0.2960686469663368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.999810027543215, 0, 1, 0.3333544427208213, 0, 0.5000474976258166, 2.255536433611301, 0.6666455572791787, 1, 0.221697814397615],
[0.9239094801123586, 2.076090519887642, 1, 0, 0.3079698267041194, 1.08235711563257, 0, -4.882128037993929, 1, 0.3079698267041194, 0.221697814397615],
[1.382875650971341, 1.300634345077981, 1, 0, 0.5153234580855737, 0.7231308175088581, 0, -3.261785956139031, 1, 0.5153234580855737, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095032460974, 2.004695432624909, 1, 0, 0.3154776842480853, 1.082357088531467, 0, -4.88212791575049, 1, 0.3154776842480853, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9236075957637261, 2, 2, 0, 0.3159136667663687, 2.165421775625623, 0, -9.767447556979246, 1, 0.09980144484977227, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6827304441193628, 2.314952901486434, 0, 1, 0.2277526894627327, 0, 0.4319742312501903, 1.948482137381132, 0.7722473105372673, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.300062482687471, 2.69993751731253, 0, 0, 0.1000208275624903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.000960538402194, 1.922741610525477, 0, 2, 0.3423606398378568, 0, 1.040181368651719, 4.691888242011053, 0.4324895280344732, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.924211486486534, 0, 0, 0.3419725299012176, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.382645102411349, 1.300939265804534, 0, 1, 0.5152232658630992, 0, 0.7686753919150674, 3.467221334606611, 0.4847767341369008, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1.183404602668115, 1.757318092610799, 0, 1, 0.4024196516618084, 0, 0.5690489412274401, 2.566777407227168, 0.5975803483381916, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.001318407373879, 1.998413253138948, 2, 2, 0.3338026599361543, 1.997366657070978, 1.000794003371705, -4.495184837104081, 0.8884712691516065, 0.4082417653990587, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9983869753994513, 2.001613024600549, 0, 1, 0.3327956584664837, 0, 0.4995970688188164, 2.253504709445575, 0.6672043415335163, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095282519492, 2.004695406368005, 1, 0, 0.315477692921338, 1.082357059237191, 0, -4.882127783614428, 1, 0.315477692921338, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.315621813389803, 0, 1, 0.2278195898601768, 0, 0.4318494471841736, 1.947919280835361, 0.7721804101398232, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.001157954734421, 1.998462208002742, 0, 5, 0.3337615766060398, 0, 2.501923719136519, 11.28528815646924, 0.1312648295152868, 1, 0.221697814397615],
[0.999206406531528, 2.000644921654945, 0, 2, 0.3330853089761576, 0, 0.999677643119994, 4.509190340176617, 0.4447752051034271, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6832085327140979, 2.316172766205807, 0, 1, 0.2277831541325291, 0, 0.431746722261194, 1.947455925239102, 0.772216845867471, 1, 0.221697814397615],
[0.9999049578505501, 2.000095042149451, 0, 1, 0.33330165261685, 0, 0.49997624059171, 2.255215018471056, 0.66669834738315, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -2.25532218871247, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.221697814397615],
[0.700218415073537, 1.37672765113411, 0, 1, 0.3371384680932448, 0, 0.7263600750491414, 3.276351988506367, 0.6628615319067552, 1, 0.221697814397615],
[1.001294051513676, 1.998705948486325, 1, 0, 0.3337646838378918, 0.9987076208914659, 0, -4.50481491486553, 1, 0.3337646838378918, 0.221697814397615],
[0.9236075308205385, 2, 2, 0, 0.315913651570503, 2.165421927886608, 0, -9.767448243774401, 1, 0.09980143524860918, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.507041463058146, 0, 0, 0.398876530258968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6996881409026331, 2.141497993769161, 1, 0, 0.2462662098635995, 1.429208159380763, 0, -6.446649748280684, 1, 0.2462662098635995, 0.221697814397615],
[1.000959873697339, 1.922742693364654, 0, 3, 0.3423603635246645, 0, 1.560271174272532, 7.037828399490607, 0.2844224950012551, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.002498291838779, 1.997501708161221, 1, 2, 0.3341660972795931, 0.9975079340691971, 1.001250708236479, 0.01688232325362223, 0.7396296964716409, 0.7048126692179879, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 3, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 1.5, 2.25532218871247, 0.5925925925925928, 0.802469135802469, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6836383104523133, 2.31636168954769, 0, 1, 0.2278794368174375, 0, 0.4317115088340402, 1.947297089991901, 0.7721205631825625, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.184032032136254, 1.756616310769799, 0, 0, 0.4026431909114816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.507041463058146, 0, 0, 0.398876530258968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.375850996200937, 0, 0, 0.3371911506186241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9996031982843949, 2.000322464875632, 0, 1, 0.3332093226708305, 0, 0.4999193967769461, 2.254958616237599, 0.6667906773291694, 1, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6834894311681979, 2, 1, 0, 0.2547017414078862, 1.463080414119692, 0, -6.599435443669543, 1, 0.2547017414078862, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6834893588243757, 2.316510641175628, 1, 0, 0.2278297862747916, 1.463080568979206, 0, -6.599436142185737, 1, 0.2278297862747916, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9996031982864528, 2.000396801713548, 0, 1, 0.3332010660954842, 0, 0.499900819249159, 2.25487481961634, 0.6667989339045158, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9240938692961329, 2.075906130703868, 1, 2, 0.3080312897653775, 1.082141147372489, 0.9634346998733845, -0.5354425699759242, 0.7738042090195953, 0.6686710605941473, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.68348943587376, 2.316510564126244, 1, 0, 0.2278298119579197, 1.463080404046946, 0, -6.599435398234966, 1, 0.2278298119579197, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095032461562, 2.076090496753844, 1, 0, 0.3079698344153853, 1.082357088531398, 0, -4.882127915750179, 1, 0.3079698344153853, 0.221697814397615],
[0, 1.998310956047469, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.999123108408781, 2.00087689159122, 0, 1, 0.3330410361362602, 0, 0.4997808731774291, 2.254333785542298, 0.6669589638637398, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6835843375880504, 2.316415662411953, 0, 1, 0.2278614458626832, 0, 0.4317014498851888, 1.947251717650821, 0.7721385541373168, 1, 0.221697814397615],
[0.9239094801123586, 2, 1, 0, 0.315984296503206, 1.08235711563257, 0, -4.882128037993929, 1, 0.315984296503206, 0.221697814397615],
[0.7435062531322665, 2.256493746867733, 0, 1, 0.2478354177107555, 0, 0.4431654204174562, 1.998961611875159, 0.7521645822892445, 1, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9236073729897443, 2.076392627010257, 1, 2, 0.3078691243299146, 1.082711148962541, 0.96320896827675, -0.5390318394003815, 0.7740115701644683, 0.6684380614984755, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.999031076248301, 2.0009689237517, 0, 1, 0.3330103587494336, 0, 0.4997578863569047, 2.254230100169544, 0.6669896412505665, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.8410091637676446, 2.000176970904151, 0, 1, 0.2960063592823338, 0, 0.4999557611884536, 2.255122643165904, 0.7039936407176662, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.5010213485091974, 2.340363602304748, 0, 1, 0.1763299789300547, 0, 0.4272840335643649, 1.927326323560552, 0.8236700210699454, 1, 0.221697814397615],
[0.999900593957218, 2.000099406042783, 0, 0.75, 0.3333001979857392, 0, 0.3749813622933285, 1.691407573467547, 0.7378154490135775, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1.001158312624298, 1.998841687375703, 1, 0, 0.3337194375414326, 0.9988430275115411, 0, -4.505425685975037, 1, 0.3337194375414326, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0.999632726641041, 2.00036727335896, 0, 1, 0.3332109088803469, 0, 0.4999081985183793, 2.254908104875558, 0.6667890911196531, 1, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 2.006196941081881, 0, 0, 0.1997751251251046, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 2.006196941081881, 0, 0, 0.1997751251251046, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6834894311996526, 2.316510568800351, 1, 0, 0.2278298103998839, 1.463080414052361, 0, -6.599435443365834, 1, 0.2278298103998839, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.923284179229175, 1.076641464177927, 1, 0, 0.6411106166767673, 0.5199439639756127, 0, -2.345282317682633, 1, 0.6411106166767673, 0.221697814397615],
[0.999603060152217, 2.000396939847784, 0, 1, 0.3332010200507389, 0, 0.4999007847293013, 2.254874663909538, 0.6667989799492611, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9996774226876826, 2.000322577312318, 1, 1, 0.3332258075625608, 1.000322681402017, 0.4999193686768382, -2.257141388988641, 0.8889605611742795, 0.5554121762994007, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9996030928475067, 2.000322550559972, 1, 2, 0.3332092897182956, 1.000397064750333, 0.9998387507255359, -0.002518356016787084, 0.7409061168368222, 0.7035382814414411, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.924211486486534, 1.075788513513467, 0, 0, 0.6414038288288444, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095664697017, 2.076090433530299, 1, 0, 0.3079698554899005, 1.082357014465218, 0, -4.882127581663979, 1, 0.3079698554899004, 0.221697814397615],
[0.8411861346717946, 2, 0, 0, 0.2960686469663368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316360550074965, 0, 1, 0.2277634818448197, 0, 0.4317117212031766, 1.947298047913552, 0.7722365181551804, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.001439968013379, 1.921865634514967, 0, 1, 0.3425710836209669, 0, 0.5203277388600458, 2.347013389707298, 0.6574289163790331, 1, 0.221697814397615],
[0, 1.998310956047469, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9984120800796669, 2.001587919920334, 0, 3, 0.3328040266932222, 0, 1.498810004868237, 6.76059892128716, 0.2970025989624432, 1, 0.221697814397615],
[0.9996030741027814, 2.00039692589722, 0, 1, 0.3332010247009271, 0, 0.4999007882155584, 2.254874679634804, 0.6667989752990729, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999998, 4.510644377424939, 0.4444444444444445, 1, 0.221697814397615],
[0.8411861346717946, 2, 0, 0, 0.2960686469663368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9980152399214075, 2.001984760078594, 0, 3, 0.3326717466404691, 0, 1.498512905703751, 6.759258812611334, 0.2971792875702608, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.07141017245805, 1.004378341055416, 0, 0, 0.5161461129027003, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.000547189646975, 1.999000330086685, 0, 1, 0.3335660405659508, 0, 0.5002500424582901, 2.256450041321074, 0.6664339594340492, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9991230457500313, 2.00087695424997, 0, 1, 0.3330410152500103, 0, 0.4997808575264693, 2.254333714946384, 0.6669589847499897, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.375850996200937, 0, 0, 0.3371911506186241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.300062482687471, 2.69993751731253, 0, 0, 0.1000208275624903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.507041463058146, 0, 0, 0.398876530258968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 2.006196941081881, 0, 0, 0.1997751251251046, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9236076036510378, 2, 2, 0, 0.3159136686118975, 2.165421757133617, 0, -9.767447473568385, 0.9999999999999999, 0.09980144601582785, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.7003133383668396, 1.807345543421652, 0, 1, 0.2792697776610542, 0, 0.553297626809541, 2.495728829411019, 0.7207302223389458, 1, 0.221697814397615],
[0.7001144427472237, 2.141071691924571, 0, 1, 0.2464162534807311, 0, 0.4670558224517545, 2.106722719485588, 0.753583746519269, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095282504262, 2.075805717173137, 1, 2, 0.3079990774657577, 1.082357059238975, 0.9634813043696738, -0.5362062553133591, 0.7738454037505689, 0.6686247866929211, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9988096874344755, 2.000967319389785, 0, 2, 0.332961311844934, 0, 0.9995165741187217, 4.508463815191651, 0.4449406114956314, 1, 0.221697814397615],
[0.683886284730997, 2.315716783272271, 1, 2, 0.2279922607180944, 1.462231400638989, 0.8636634732049827, -2.699927056387099, 0.8677608773269113, 0.5398865143967176, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 2, 9.021288754849879, 0.1975308641975309, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.9996774263903818, 2.000322573609619, 0, 1, 0.3332258087967939, 0, 0.4999193696022144, 2.254958493662049, 0.6667741912032061, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095048961714, 2, 1, 0, 0.3159843023010999, 1.08235708659841, 0, -4.882127907031159, 1, 0.3159843023011, 0.221697814397615],
[1.07141017245805, 1.004378341055416, 0, 0, 0.5161461129027003, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.9990014654159831, 2.000998534584018, 0, 1, 0.3330004884719943, 0, 0.4997504909257153, 2.254196742009432, 0.6669995115280057, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9217068379080122, 2, 2, 0, 0.3154686246919861, 2.16988734133662, 0, -9.787590135845578, 1, 0.09952045316505298, 0.221697814397615],
[0.6996881409026621, 2.141497993769132, 1, 0, 0.2462662098636097, 1.429208159380704, 0, -6.446649748280418, 1, 0.2462662098636097, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9996032288161285, 2.000396771183872, 0, 2, 0.3332010762720428, 0, 0.9998016537571007, 4.509749708059624, 0.4446208046847621, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6835847704213548, 2.316415229578649, 0, 1, 0.2278615901404513, 0, 0.4317015305506768, 1.947252081504151, 0.7721384098595487, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.000396616799237, 0, 1, 0.2545802471018895, 0, 0.4999008654594029, 2.254875028054317, 0.7454197528981106, 1, 0.221697814397615],
[0.6832619397641637, 2.31673806023584, 0, 1, 0.2277539799213876, 0, 0.4316413742079248, 1.946980737634951, 0.7722460200786123, 1, 0.221697814397615],
[1.000230496676792, 1.999695166483239, 0, 1, 0.3334184273163555, 0, 0.5000762199963952, 2.255665990010657, 0.6665815726836446, 1, 0.221697814397615],
[1.922127127901753, 1.077798556100573, 2, 0, 0.6407249146710071, 1.0405139030441, 0, -4.693388186398351, 1, 0.4105284162801692, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.924211486486534, 0, 0, 0.3419725299012176, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.0009300164132191543, 2.99906998358678, 0, 1, 0.0003100054710730515, 0, 0.3334367005347558, 1.50401437849422, 0.9996899945289269, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.382875651058936, 1.300634344877112, 1, 0, 0.5153234581399679, 0.7231308174630532, 0, -3.261785955932421, 1, 0.5153234581399679, 0.221697814397615],
[0.6836586820584288, 2.316341317941574, 0, 2, 0.2278862273528094, 0, 0.8634306112439887, 3.894628431904277, 0.5961596779114775, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.999905076304918, 1, 1, 0.3333438807442977, 0.9999999999999998, 0.5000237320501374, -2.255215141873952, 0.8888818571703315, 0.5555696186589267, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0.9991230402171133, 2.000876959782888, 0, 1, 0.3330410134057044, 0, 0.4997808561444521, 2.254333708712596, 0.6669589865942956, 1, 0.221697814397615],
[1.924211486486534, 1.075788513513467, 0, 0, 0.6414038288288444, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.00023053624731, 1.999695114150943, 0, 1, 0.3334184419252275, 0, 0.5000762330834584, 2.255666049041746, 0.6665815580747725, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.375850996200937, 0, 0, 0.3371911506186241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.5010939663110549, 2.005947496747093, 1, 0, 0.1998746226158576, 1.995633687952348, 0, -9.001593873962056, 1, 0.1998746226158576, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9991508084077377, 2.000849191592263, 0, 2, 0.3330502694692459, 0, 0.9995755844089445, 4.508729989625454, 0.4448219430550455, 1, 0.221697814397615],
[0.8405083874227527, 2.000876658643769, 0, 1, 0.295809393586523, 0, 0.4997809313632647, 2.25433404799791, 0.704190606413477, 1, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9990322977675355, 2.000967702232465, 0, 2, 0.3330107659225118, 0, 0.9995163828824496, 4.508462952592835, 0.4448746383752744, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095282504262, 2.000094937180391, 1, 1, 0.3159740483208527, 1.082357059238975, 0.4999762668314822, -2.626912646793139, 0.9001604007877316, 0.5321084974294368, 0.221697814397615],
[1, 1.999905033411732, 0, 1, 0.333343885510509, 0, 0.5000237427744523, 2.255429283924558, 0.6666561144894909, 1, 0.221697814397615],
[0.9990015242226291, 2.000998475777372, 0, 1, 0.3330005080742096, 0, 0.4997505056127082, 2.254196808257233, 0.6669994919257904, 1, 0.221697814397615],
[0.9999050510816097, 2.000094948918391, 1, 1, 0.3333016836938698, 1.000094957934544, 0.4999762638972609, -2.255857575304373, 0.8889099876468316, 0.5555133550345712, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9934818570710116, 2.00651814292899, 3, 0, 0.3311606190236704, 3.019682723592573, 0, -13.62071489878007, 0.9999999999999998, 0.03631750936458245, 0.221697814397615],
[1.000480024182889, 1.923429479063198, 0, 1, 0.3421720210807376, 0, 0.5199046863350809, 2.34510515021421, 0.6578279789192624, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316415688122361, 0, 1, 0.2277592951465043, 0, 0.4317014450936392, 1.947251696037845, 0.7722407048534957, 1, 0.221697814397615],
[0.5010729031571305, 2.006585981244744, 0, 1, 0.1998170111070135, 0, 0.4983589087867896, 2.247919809858761, 0.8001829888929864, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6835309510322956, 2.316469048967708, 1, 0, 0.2278436503440983, 1.462991541918856, 0, -6.59903457277653, 1, 0.2278436503440983, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.375850996200937, 0, 0, 0.3371911506186241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.5013223868874053, 2.340062716611648, 1, 1, 0.1764359172116608, 1.994724405205139, 0.4273389738237335, -7.069918283318301, 0.96887036711768, 0.3217422015410015, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.001306338366776124, 2.998693661633223, 0, 2, 0.0004354461222587081, 0, 0.6669570905454578, 3.008406250452566, 0.9991292973688081, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.376810067193163, 0, 1, 0.3370354310435509, 0, 0.7263165950250874, 3.276155865580338, 0.6629645689564492, 1, 0.221697814397615],
[0.5010729031571189, 2.34031214290941, 0, 1, 0.1763481172151515, 0, 0.4272934287974203, 1.927368702115708, 0.8236518827848485, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.000198308399618, 0, 0.5, 0.2545990611691876, 0, 0.2499752139076928, 1.127549293108332, 0.86336605146995, 1, 0.221697814397615],
[0.9996029394678932, 2, 0, 1, 0.3332450859796847, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6667549140203153, 1, 0.221697814397615],
[0.998124629119134, 2.001875370880867, 0, 2, 0.3327082097063779, 0, 0.9990631929898607, 4.506418774151923, 0.4452783333932673, 1, 0.221697814397615],
[0.9999049578505675, 2.000095042149433, 0, 1, 0.3333016526168557, 0, 0.4999762405917143, 2.255215018471075, 0.6666983473831443, 1, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 1.574943991537199, 0, 0, 0.2412791663099343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.507041463058146, 0, 0, 0.398876530258968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -2.25532218871247, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 2.340341612695529, 0, 0, 0.1762800810071258, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6835842877926875, 2.315820080237834, 0, 2.5, 0.2279066787655393, 0, 1.079531186957862, 4.869381278706352, 0.5238108492261159, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1.924211486486534, 1.075788513513467, 0, 0, 0.6414038288288444, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999998, 4.510644377424939, 0.4444444444444445, 1, 0.221697814397615],
[0.9998995869905453, 2.000100413009456, 0, 3, 0.3332998623301817, 0, 1.499924694023758, 6.765626887659088, 0.2963409265411521, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2, 0, 0, 0.3160549401975649, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2, 0, 0, 0.3160549401975649, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0.9992054884211619, 2.000794511578839, 0, 2, 0.3330684961403872, 0, 0.999602901960076, 4.50885320938387, 0.4447976308404448, 1, 0.221697814397615],
[0.9999050465974497, 2.000094953402551, 0, 1, 0.3333016821991498, 0, 0.4999762627763273, 2.255215118537975, 0.6666983178008502, 1, 0.221697814397615],
[0.300062482687471, 2.69993751731253, 0, 0, 0.1000208275624903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9987470963789227, 2.001252903621078, 0, 1, 0.3329156987929741, 0, 0.4996869701928199, 2.253910222572747, 0.6670843012070259, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095032461031, 2.004695432624903, 1, 0, 0.3154776842480873, 1.08235708853146, 0, -4.88212791575046, 1, 0.3154776842480873, 0.221697814397615],
[0.9996030928454934, 2.000396907154507, 0, 1, 0.3332010309484977, 0, 0.4999007928993772, 2.254874700761845, 0.6667989690515023, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -9.021288754849879, 1, 0.1111111111111109, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.683489435744733, 2.31651056425527, 1, 0, 0.2278298119149108, 1.463080404323142, 0, -6.599435399480788, 1, 0.2278298119149107, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.923533665460865, 1.07606946235128, 1, 0, 0.6412627216000586, 0.5198765261851589, 0, -2.344978129792297, 1, 0.6412627216000586, 0.221697814397615],
[0.6834894311996349, 2.257143806489292, 1, 0, 0.2324293361170046, 1.463080414052398, 0, -6.599435443366004, 1, 0.2324293361170046, 0.221697814397615],
[0.5010729139356948, 2.006585999605689, 0, 1, 0.1998170130833567, 0, 0.4983589042266359, 2.247919789289529, 0.8001829869166432, 1, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 2.340341612695529, 0, 0, 0.1762800810071258, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -2.25532218871247, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.221697814397615],
[1.3790454992085, 1.305335335854951, 0, 1, 0.5137294534349868, 0, 0.7660866694802476, 3.455544528311278, 0.4862705465650132, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.184032032136254, 1.756616310769799, 0, 0, 0.4026431909114816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.3031713666933624, 2.696432019273641, 0, 2, 0.1010704842219089, 0, 0.7417209058876092, 3.345639233760477, 0.8080742743370334, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.8411861346717946, 2, 0, 0, 0.2960686469663368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.300062482687471, 2.69993751731253, 0, 0, 0.1000208275624903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.000089431167848, 1.999910568832153, 15, 0, 0.3333631437226159, 14.99865865244056, 0, -67.65361531954693, 1.000000000000001, 6.978526645440297e-08, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[1.000479860775097, 1.999123334328242, 0, 1, 0.3335374033499887, 0, 0.5002192625279053, 2.256311204001146, 0.6664625966500113, 1, 0.221697814397615],
[0.5013222002949268, 2.006336536352373, 1, 1, 0.1999164371804381, 1.994725147642977, 0.4984208690223293, -6.749296481277105, 0.9600334181450799, 0.3598662925059563, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.7001144249806449, 2.14107170969115, 0, 1, 0.2464162472275052, 0, 0.4670558185761328, 2.106722702004036, 0.7535837527724948, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095514794469, 2.076090448520554, 1, 0, 0.3079698504931488, 1.082357032026252, 0, -4.882127660875561, 1, 0.3079698504931488, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.00069157975698, 1.999085380785635, 1, 1, 0.3335886610636445, 0.9993088981950385, 0.5002287594174707, -2.251173021861495, 0.8887186052097649, 0.5558959273370538, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.001440002779708, 1.921871062109274, 1, 1, 0.3425704554016525, 0.9985620678465899, 0.5203262693921253, -2.157151615381957, 0.8826454830859045, 0.5677863938892094, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 1.574943991537199, 0, 0, 0.2412791663099343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9999050804728647, 2.000094919527136, 2, 1, 0.3333016934909548, 2.000189857075414, 0.4999762712443771, -6.766929975865276, 0.962973508576041, 0.2592170738038977, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9991230912642576, 2.000876908735743, 0, 1, 0.3330410304214191, 0, 0.4997808688950544, 2.254333766226028, 0.6669589695785809, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.184032032136254, 1.756616310769799, 0, 0, 0.4026431909114816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999998, 4.510644377424939, 0.4444444444444445, 1, 0.221697814397615],
[0.5013015089027968, 2.00697540394669, 0, 1, 0.1998589176237729, 0, 0.4982622099072633, 2.247483635601522, 0.8001410823762272, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.999905076304918, 0, 2, 0.3333438807442977, 0, 1.000047464100275, 4.510858471101974, 0.4444303813410732, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.300062482687471, 2.69993751731253, 0, 0, 0.1000208275624903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.683489431110316, 2.316510568889687, 1, 0, 0.2278298103701051, 1.463080414243595, 0, -6.599435444228423, 1, 0.2278298103701051, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.924216970800736, 1, 0, 0.3419718885381377, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3419718885381378, 0.221697814397615],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -2.25532218871247, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.221697814397615],
[0.9956136859283414, 2.004386314071659, 1, 1, 0.3318712286427804, 1.004405638586184, 0.4989058211880451, -2.280129909136248, 0.8898614875991314, 0.5536039448846921, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.000396870462955, 0, 1, 0.2545802230378904, 0, 0.4999008020686256, 2.254874742121064, 0.7454197769621096, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.184032032136254, 1.756616310769799, 0, 0, 0.4026431909114816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -9.021288754849879, 1, 0.1111111111111109, 0.221697814397615],
[0.8411861346717946, 2, 0, 0, 0.2960686469663368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9987936545732771, 2.000980348654501, 0, 1, 0.3329563005408301, 0, 0.4997550329129518, 2.254217229298622, 0.66704369945917, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.501385381280981, 2.340003641107574, 0, 1, 0.1764578441495849, 0, 0.4273497623818562, 1.927622802881604, 0.8235421558504151, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.00032249581259, 0, 1, 0.25458727883982, 0, 0.4999193890452001, 2.254958581362443, 0.74541272116018, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.9236077434687188, 2, 2, 0, 0.3159137013274232, 2.165421429327522, 0, -9.767445994951663, 0.9999999999999999, 0.09980146668639245, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 2.5, 0.3333333333333333, 0, 1.25, 5.638305471781174, 0.3628873693012117, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.375850996200937, 0, 0, 0.3371911506186241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.184032032136254, 1.756616310769799, 0, 0, 0.4026431909114816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.922856067957284, 1.076350318541819, 2, 0, 0.6411216235778242, 1.040119452167145, 0, -4.691608958768041, 1, 0.4110369362190653, 0.221697814397615],
[0.9993549259834268, 2.000645074016574, 1, 2, 0.3331183086611422, 1.000645490405662, 0.9996775669882921, -0.004365958320336713, 0.7410273940481689, 0.7034169116596212, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 2.340341612695529, 0, 0, 0.1762800810071258, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[1.920139357440302, 1.079860642559699, 0, 1, 0.6400464524801005, 0, 0.9260454178879993, 4.177061557436633, 0.3599535475198995, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9233055279837186, 2.076694472016282, 1, 0, 0.3077685093279061, 1.083065106502464, 0, -4.885321533030484, 1, 0.3077685093279061, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.924401661011909, 0, 1, 0.3419502913474539, 0, 0.5196420374497961, 2.343920434496563, 0.6580497086525461, 1, 0.221697814397615],
[0.9987471267326855, 2.001252873267315, 0, 1, 0.3329157089108951, 0, 0.4996869777717622, 2.25391025675866, 0.6670842910891048, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.8411861346717946, 2, 0, 0, 0.2960686469663368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.998809330199986, 2.001190669800015, 0, 1, 0.3329364433999952, 0, 0.4997025096563802, 2.253980315566683, 0.6670635566000047, 1, 0.221697814397615],
[0.0009300164132395807, 2.99906998358676, 0, 1, 0.0003100054710798603, 0, 0.333436700534758, 1.50401437849423, 0.9996899945289202, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0.3026912242962628, 2.697308775703738, 0, 1, 0.1008970747654209, 0, 0.3707399052743215, 1.672275869212673, 0.8991029252345791, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.002509278999660496, 2.997490721000339, 0, 1, 0.0008364263332201656, 0, 0.3336123755092976, 1.504806785830391, 0.9991635736667799, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -9.021288754849879, 1, 0.1111111111111109, 0.221697814397615],
[1, 1.507041463058146, 0, 0, 0.398876530258968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9996774227290671, 2.000322577270933, 0, 1, 0.3332258075763557, 0, 0.4999193686871811, 2.254958489534659, 0.6667741924236443, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.071320732553213, 1.928679267446789, 1, 0, 0.3571069108510708, 0.9334272824318084, 0, -4.210358523236078, 1, 0.3571069108510707, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.256491065349786, 0, 1, 0.2324021122076298, 0, 0.443165947056381, 1.998963987356063, 0.7675978877923703, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999998, 4.510644377424939, 0.4444444444444445, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.924306519875851, 2.07569348012415, 0, 1, 0.3081021732919502, 0, 0.481766700900457, 2.173078260647209, 0.6918978267080498, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.000230496676799, 1.99969516648323, 0, 1, 0.3334184273163579, 0, 0.5000762199963973, 2.255665990010667, 0.6665815726836422, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[1.183404733743877, 1.757317946002146, 0, 1, 0.4024196983600243, 0, 0.569048988701774, 2.566777621367005, 0.5975803016399757, 1, 0.221697814397615],
[0.9992060661634551, 2.000793933836546, 0, 1, 0.3330686887211516, 0, 0.4998015953009655, 2.254427255672315, 0.6669313112788484, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.5010214501993401, 2.340363614950625, 0, 1, 0.176330007623552, 0, 0.4272840312555864, 1.927326313146474, 0.823669992376448, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6996881487625575, 2.141497985909237, 1, 0, 0.246266212630023, 1.429208143325799, 0, -6.446649675862451, 1, 0.246266212630023, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316415549818708, 0, 1, 0.2277593056478746, 0, 0.4317014708687585, 1.947251812300242, 0.7722406943521254, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9236284553751992, 2.07575365785535, 1, 2, 0.3079395757216092, 1.082686435417126, 0.9635054682097401, -0.537582959630059, 0.7739214913274937, 0.6685392993851675, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.00143983826004, 1.92186584589614, 0, 1, 0.3425710296694846, 0, 0.5203276816305114, 2.347013131565221, 0.6574289703305154, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.375850996200937, 0, 0, 0.3371911506186241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.004378341055417, 0, 0, 0.3155824273494288, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.004042740640884532, 2.995957259359115, 0, 2, 0.001347580213628177, 0, 0.6675662657576875, 3.011154023198476, 0.9973066555451759, 1, 0.221697814397615],
[0.684680090371074, 2.315319909628929, 1, 1, 0.2282266967903578, 1.460536116156135, 0.4319057577491603, -4.639785742597021, 0.9479125748721621, 0.4043659684528776, 0.221697814397615],
[0.6834894404820937, 2, 1, 0, 0.2547017439946786, 1.463080394182327, 0, -6.59943535373918, 1, 0.2547017439946786, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 2.340341612695529, 0, 0, 0.1762800810071258, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9988096377235502, 2.00119036227645, 1, 1, 0.33293654590785, 1.001191780927508, 0.4997025864458251, -2.262039415428164, 0.8891532563989502, 0.55502634821465, 0.221697814397615],
[0.9953100517847562, 2.004689948215245, 1, 1, 0.3317700172615853, 1.004712047473884, 0.4988302559656618, -2.281852858508219, 0.8899286556462473, 0.5534686901694179, 0.221697814397615],
[0.9908210469676154, 2.009178953032385, 1, 3, 0.3302736823225384, 1.009263986731485, 1.493147235825959, 2.182625256858098, 0.5980318573331732, 0.7988178423793435, 0.221697814397615],
[0.683489440482277, 2.316510559517726, 1, 0, 0.2278298134940921, 1.463080394181935, 0, -6.599435353737411, 1, 0.227829813494092, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1.00048002176217, 1.92342948300679, 0, 1, 0.3421720200746177, 0, 0.5199046852691244, 2.345105145406059, 0.6578279799253823, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9290828672453209, 2.086729684849134, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[0.6454775164072772, 2.370335035687181, 0, 0, 0.2140310464451772, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[0.7036267834643181, 1.383102901384815, 0, 0, 0.3371911506186241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[0.3016440672338333, 2.714168484860622, 0, 0, 0.1000208275624903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9947567855026423, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.2205354052031329],
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.989513571005285, 0, -9.021288754849879, 1, 0.1111111111111109, 0.2205354052031329],
[1.004389144830574, 2.011423407263881, 0, 2, 0.3330409723684698, 0, 0.9943207346485938, 4.508667140011986, 0.4448343445391963, 1, 0.2205354052031329],
[0.8456199011970046, 2.010541701396303, 0, 0, 0.2960686469663367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[0.7036267834643181, 1.816628920839683, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[0.9284321218746938, 2.087380430219761, 2, 0, 0.3078547177044893, 2.154169327921994, 0, -9.767906998596485, 1, 0.09477452721291058, 0.2205354052031329],
[0.9996236202236967, 2.000376379776304, 0, 0.75, 0.3332078734078988, 0, 0.3749294420702318, 1.691173379805161, 0.7378920771908158, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075693480124144, 0, 1, 0.3080802547991102, 0, 0.4817667009004583, 2.173078260647215, 0.6919197452008898, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 6, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 3, 9.021288754849879, 0.263374485596708, 0.9414723365340649, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0, 1.998310956047469, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.8409367505950377, 2.000448314476665, 1, 0, 0.295960150186056, 1.189150074952023, 0, -5.363833099496791, 1, 0.295960150186056, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 3, 1, 0.3333333333333333, 3, 0.4999999999999999, -11.27661094356235, 0.9876543209876545, 0.1111111111111109, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.924211486486534, 0, 0, 0.3419725299012176, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.924211486486534, 0, 0, 0.3419725299012176, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.5010728808475707, 1.575873077182969, 0, 1, 0.2412546551392758, 0, 0.6345688713634222, 2.862314511704311, 0.7587453448607242, 1, 0.221697814397615],
[0.6834894311995611, 2.316510568800442, 1, 0, 0.2278298103998534, 1.463080414052556, 0, -6.599435443366717, 1, 0.2278298103998534, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.92430651987586, 1, 0, 0.3419614165626013, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3419614165626013, 0.221697814397615],
[0.5013223527968351, 2.340062720784911, 1, 1, 0.1764359070715066, 1.994724540848985, 0.4273389730616181, -7.069918898597085, 0.9688703706958546, 0.3217421848388681, 0.221697814397615],
[0.7428562538513042, 2.257143746148696, 1, 0, 0.2476187512837681, 1.346155457150082, 0, -6.07202854393392, 1, 0.2476187512837681, 0.221697814397615],
[1.184032032136254, 1.756616310769799, 0, 0, 0.4026431909114816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.507658924636631, 1, 0, 0.3987783147761627, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3987783147761627, 0.221697814397615],
[1.924211486486534, 1.075788513513467, 0, 0, 0.6414038288288444, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.001157961061765, 1.998842038938236, 0, 1, 0.3337193203539215, 0, 0.5002896579717672, 2.256628732814198, 0.6662806796460785, 1, 0.221697814397615],
[0.9996774228996694, 2.000322577100332, 0, 1, 0.3332258076332231, 0, 0.4999193687298177, 2.254958489726978, 0.6667741923667769, 1, 0.221697814397615],
[0.6999165215871578, 1.377030468479687, 0, 1, 0.33699296367917, 0, 0.7262003440664981, 3.275631498847607, 0.66300703632083, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.6834894403504177, 2.316510559649585, 1, 0, 0.227829813450139, 1.463080394464193, 0, -6.599435355010578, 1, 0.227829813450139, 0.221697814397615],
[1, 1.924211486486534, 0, 0, 0.3419725299012176, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.924211486486534, 0, 0, 0.3419725299012176, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 1.574943991537199, 0, 0, 0.2412791663099343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.924211486486534, 0, 0, 0.3419725299012176, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6840931092807042, 2.038376882664775, 1, 1, 0.2512766389729242, 1.461789318491249, 0.4905864114258878, -4.380750932093127, 0.9368600507064708, 0.4394133286523191, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.300062482687471, 2.69993751731253, 0, 0, 0.1000208275624903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.375850996200937, 0, 0, 0.3371911506186241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4973783927513212, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.2205354052031329],
[0.7036267834643181, 1.816628920839683, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9947567855026423, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.2205354052031329],
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4973783927513212, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.2205354052031329],
[0.9287348149083369, 2.087077737186118, 1, 0, 0.3079550863542029, 1.07673362077925, 0, -4.882361722316112, 1, 0.3079550863542029, 0.2205354052031329],
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[0.6867884895248828, 2.269359571752396, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[0.6867884895248828, 2.329024062569575, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.8411861346717946, 2, 0, 0, 0.2960686469663368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.839830075833072, 2.001754047255973, 0, 1, 0.2955499606747889, 0, 0.4995618724342339, 2.253345951071352, 0.7044500393252111, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.9999999999999998, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.000563032952009, 1.998246284463398, 0, 4, 0.3336534360958859, 0, 2.001755254645273, 9.02920608434653, 0.1971517563002378, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.3009391936506139, 2.699060806349387, 0, 1, 0.1003130645502046, 0, 0.370499248348743, 1.671190351404424, 0.8996869354497954, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.004378341055417, 0, 0, 0.3155824273494288, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.300062482687471, 2.69993751731253, 0, 0, 0.1000208275624903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.003166073338095897, 2.996833926661904, 0, 2, 0.001055357779365299, 0, 0.6673709818240574, 3.010273166821246, 0.9978903982213119, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.8411861346717946, 2, 0, 0, 0.2960686469663368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9236074336120111, 2.07639256638799, 1, 0, 0.3078691445373369, 1.082711077897279, 0, -4.883724635893057, 1, 0.3078691445373369, 0.221697814397615],
[0.9992805070707267, 2.000719492929274, 0, 2, 0.3330935023569088, 0, 0.9996403829063411, 4.509022272603402, 0.4447642765985744, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095033349327, 2.076090496665068, 1, 0, 0.3079698344449775, 1.082357088427397, 0, -4.882127915281066, 1, 0.3079698344449775, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 2.340341612695529, 0, 0, 0.1762800810071258, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.184032032136254, 1.756616310769799, 0, 0, 0.4026431909114816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.7004028243163389, 1.375385689197127, 0, 1, 0.3374153097758701, 0, 0.7270687835815305, 3.279548720663221, 0.6625846902241299, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9990015242368462, 2.000998475763154, 0, 1, 0.3330005080789487, 0, 0.4997505056162591, 2.25419680827325, 0.6669994919210513, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6999690786722544, 1.807689880753621, 1, 1, 0.2791324857158851, 1.4286345361096, 0.5531922320564757, -3.948808906537158, 0.9220850554180713, 0.4803500268498414, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.642813162241191, 2.356987859290853, 0, 2, 0.214285266798428, 0, 0.8485406456873903, 3.827465092486355, 0.6173476419700173, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.999905076304918, 0, 2, 0.3333438807442978, 0, 1.000047464100275, 4.510858471101974, 0.4444303813410731, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.375850996200937, 0, 0, 0.3371911506186241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615]
],
"RESOLVED": [
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.989513571005285, 0, -9.021288754849879, 1, 0.1111111111111109, 0.2205354052031329],
[1.005270850698152, 2.009920759960007, 1, 0, 0.3334019792124323, 0.9947567855026423, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3334019792124323, 0.2205354052031329],
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4973783927513212, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.2205354052031329],
[0.6867884895248828, 2.269359571752396, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[0.9988925894402182, 2.000553705279892, 0, 2, 0.3330256625026283, 0, 0.9997232239862242, 4.509395939254596, 0.444854766880058, 1, 0.221697814397615],
[0.9233054900148905, 2.005329664853162, 1, 0, 0.3152681850725409, 1.083065151041041, 0, -4.885321733928167, 1, 0.315268185072541, 0.221697814397615],
[0.6834893844893303, 2.316510615510673, 1, 0, 0.2278297948297765, 1.463080514040684, 0, -6.599435894377602, 1, 0.2278297948297765, 0.221697814397615],
[1, 1.924211486486534, 0, 0, 0.3419725299012176, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 1.574943991537199, 0, 0, 0.2412791663099343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -9.021288754849879, 1, 0.1111111111111109, 0.221697814397615],
[1, 1.924211486486534, 0, 0, 0.3419725299012176, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.8411861346717946, 2, 0, 0, 0.2960686469663368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.5, 6.76596656613741, 0.2962962962962963, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095032460974, 2.004695432624909, 1, 0, 0.3154776842480853, 1.082357088531467, 0, -4.88212791575049, 1, 0.3154776842480853, 0.221697814397615],
[0.30093927947312, 2.699060720526881, 0, 1, 0.1003130931577066, 0, 0.3704992601295724, 1.671190404543556, 0.8996869068422934, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.8411861346717946, 2, 0, 0, 0.2960686469663368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.999810027543215, 0, 1, 0.3333544427208213, 0, 0.5000474976258166, 2.255536433611301, 0.6666455572791787, 1, 0.221697814397615],
[0.9239094801123586, 2.076090519887642, 1, 0, 0.3079698267041194, 1.08235711563257, 0, -4.882128037993929, 1, 0.3079698267041194, 0.221697814397615],
[1.382875650971341, 1.300634345077981, 1, 0, 0.5153234580855737, 0.7231308175088581, 0, -3.261785956139031, 1, 0.5153234580855737, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095032460974, 2.004695432624909, 1, 0, 0.3154776842480853, 1.082357088531467, 0, -4.88212791575049, 1, 0.3154776842480853, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9236075957637261, 2, 2, 0, 0.3159136667663687, 2.165421775625623, 0, -9.767447556979246, 1, 0.09980144484977227, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6827304441193628, 2.314952901486434, 0, 1, 0.2277526894627327, 0, 0.4319742312501903, 1.948482137381132, 0.7722473105372673, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.300062482687471, 2.69993751731253, 0, 0, 0.1000208275624903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.000960538402194, 1.922741610525477, 0, 2, 0.3423606398378568, 0, 1.040181368651719, 4.691888242011053, 0.4324895280344732, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.924211486486534, 0, 0, 0.3419725299012176, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.382645102411349, 1.300939265804534, 0, 1, 0.5152232658630992, 0, 0.7686753919150674, 3.467221334606611, 0.4847767341369008, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1.183404602668115, 1.757318092610799, 0, 1, 0.4024196516618084, 0, 0.5690489412274401, 2.566777407227168, 0.5975803483381916, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.001318407373879, 1.998413253138948, 2, 2, 0.3338026599361543, 1.997366657070978, 1.000794003371705, -4.495184837104081, 0.8884712691516065, 0.4082417653990587, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9983869753994513, 2.001613024600549, 0, 1, 0.3327956584664837, 0, 0.4995970688188164, 2.253504709445575, 0.6672043415335163, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095282519492, 2.004695406368005, 1, 0, 0.315477692921338, 1.082357059237191, 0, -4.882127783614428, 1, 0.315477692921338, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.315621813389803, 0, 1, 0.2278195898601768, 0, 0.4318494471841736, 1.947919280835361, 0.7721804101398232, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.001157954734421, 1.998462208002742, 0, 5, 0.3337615766060398, 0, 2.501923719136519, 11.28528815646924, 0.1312648295152868, 1, 0.221697814397615],
[0.999206406531528, 2.000644921654945, 0, 2, 0.3330853089761576, 0, 0.999677643119994, 4.509190340176617, 0.4447752051034271, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6832085327140979, 2.316172766205807, 0, 1, 0.2277831541325291, 0, 0.431746722261194, 1.947455925239102, 0.772216845867471, 1, 0.221697814397615],
[0.9999049578505501, 2.000095042149451, 0, 1, 0.33330165261685, 0, 0.49997624059171, 2.255215018471056, 0.66669834738315, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -2.25532218871247, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.221697814397615],
[0.700218415073537, 1.37672765113411, 0, 1, 0.3371384680932448, 0, 0.7263600750491414, 3.276351988506367, 0.6628615319067552, 1, 0.221697814397615],
[1.001294051513676, 1.998705948486325, 1, 0, 0.3337646838378918, 0.9987076208914659, 0, -4.50481491486553, 1, 0.3337646838378918, 0.221697814397615],
[0.9236075308205385, 2, 2, 0, 0.315913651570503, 2.165421927886608, 0, -9.767448243774401, 1, 0.09980143524860918, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.507041463058146, 0, 0, 0.398876530258968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6996881409026331, 2.141497993769161, 1, 0, 0.2462662098635995, 1.429208159380763, 0, -6.446649748280684, 1, 0.2462662098635995, 0.221697814397615],
[1.000959873697339, 1.922742693364654, 0, 3, 0.3423603635246645, 0, 1.560271174272532, 7.037828399490607, 0.2844224950012551, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.002498291838779, 1.997501708161221, 1, 2, 0.3341660972795931, 0.9975079340691971, 1.001250708236479, 0.01688232325362223, 0.7396296964716409, 0.7048126692179879, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 3, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 1.5, 2.25532218871247, 0.5925925925925928, 0.802469135802469, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6836383104523133, 2.31636168954769, 0, 1, 0.2278794368174375, 0, 0.4317115088340402, 1.947297089991901, 0.7721205631825625, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.184032032136254, 1.756616310769799, 0, 0, 0.4026431909114816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.507041463058146, 0, 0, 0.398876530258968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.375850996200937, 0, 0, 0.3371911506186241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9996031982843949, 2.000322464875632, 0, 1, 0.3332093226708305, 0, 0.4999193967769461, 2.254958616237599, 0.6667906773291694, 1, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6834894311681979, 2, 1, 0, 0.2547017414078862, 1.463080414119692, 0, -6.599435443669543, 1, 0.2547017414078862, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6834893588243757, 2.316510641175628, 1, 0, 0.2278297862747916, 1.463080568979206, 0, -6.599436142185737, 1, 0.2278297862747916, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9996031982864528, 2.000396801713548, 0, 1, 0.3332010660954842, 0, 0.499900819249159, 2.25487481961634, 0.6667989339045158, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9240938692961329, 2.075906130703868, 1, 2, 0.3080312897653775, 1.082141147372489, 0.9634346998733845, -0.5354425699759242, 0.7738042090195953, 0.6686710605941473, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.68348943587376, 2.316510564126244, 1, 0, 0.2278298119579197, 1.463080404046946, 0, -6.599435398234966, 1, 0.2278298119579197, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095032461562, 2.076090496753844, 1, 0, 0.3079698344153853, 1.082357088531398, 0, -4.882127915750179, 1, 0.3079698344153853, 0.221697814397615],
[0, 1.998310956047469, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.999123108408781, 2.00087689159122, 0, 1, 0.3330410361362602, 0, 0.4997808731774291, 2.254333785542298, 0.6669589638637398, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6835843375880504, 2.316415662411953, 0, 1, 0.2278614458626832, 0, 0.4317014498851888, 1.947251717650821, 0.7721385541373168, 1, 0.221697814397615],
[0.9239094801123586, 2, 1, 0, 0.315984296503206, 1.08235711563257, 0, -4.882128037993929, 1, 0.315984296503206, 0.221697814397615],
[0.7435062531322665, 2.256493746867733, 0, 1, 0.2478354177107555, 0, 0.4431654204174562, 1.998961611875159, 0.7521645822892445, 1, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9236073729897443, 2.076392627010257, 1, 2, 0.3078691243299146, 1.082711148962541, 0.96320896827675, -0.5390318394003815, 0.7740115701644683, 0.6684380614984755, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.999031076248301, 2.0009689237517, 0, 1, 0.3330103587494336, 0, 0.4997578863569047, 2.254230100169544, 0.6669896412505665, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.8410091637676446, 2.000176970904151, 0, 1, 0.2960063592823338, 0, 0.4999557611884536, 2.255122643165904, 0.7039936407176662, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.5010213485091974, 2.340363602304748, 0, 1, 0.1763299789300547, 0, 0.4272840335643649, 1.927326323560552, 0.8236700210699454, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1.001158312624298, 1.998841687375703, 1, 0, 0.3337194375414326, 0.9988430275115411, 0, -4.505425685975037, 1, 0.3337194375414326, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0.999632726641041, 2.00036727335896, 0, 1, 0.3332109088803469, 0, 0.4999081985183793, 2.254908104875558, 0.6667890911196531, 1, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 2.006196941081881, 0, 0, 0.1997751251251046, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 2.006196941081881, 0, 0, 0.1997751251251046, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6834894311996526, 2.316510568800351, 1, 0, 0.2278298103998839, 1.463080414052361, 0, -6.599435443365834, 1, 0.2278298103998839, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.923284179229175, 1.076641464177927, 1, 0, 0.6411106166767673, 0.5199439639756127, 0, -2.345282317682633, 1, 0.6411106166767673, 0.221697814397615],
[0.999603060152217, 2.000396939847784, 0, 1, 0.3332010200507389, 0, 0.4999007847293013, 2.254874663909538, 0.6667989799492611, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9996774226876826, 2.000322577312318, 1, 1, 0.3332258075625608, 1.000322681402017, 0.4999193686768382, -2.257141388988641, 0.8889605611742795, 0.5554121762994007, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9996030928475067, 2.000322550559972, 1, 2, 0.3332092897182956, 1.000397064750333, 0.9998387507255359, -0.002518356016787084, 0.7409061168368222, 0.7035382814414411, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.924211486486534, 1.075788513513467, 0, 0, 0.6414038288288444, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095664697017, 2.076090433530299, 1, 0, 0.3079698554899005, 1.082357014465218, 0, -4.882127581663979, 1, 0.3079698554899004, 0.221697814397615],
[0.8411861346717946, 2, 0, 0, 0.2960686469663368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316360550074965, 0, 1, 0.2277634818448197, 0, 0.4317117212031766, 1.947298047913552, 0.7722365181551804, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.001439968013379, 1.921865634514967, 0, 1, 0.3425710836209669, 0, 0.5203277388600458, 2.347013389707298, 0.6574289163790331, 1, 0.221697814397615],
[0, 1.998310956047469, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9984120800796669, 2.001587919920334, 0, 3, 0.3328040266932222, 0, 1.498810004868237, 6.76059892128716, 0.2970025989624432, 1, 0.221697814397615],
[0.9996030741027814, 2.00039692589722, 0, 1, 0.3332010247009271, 0, 0.4999007882155584, 2.254874679634804, 0.6667989752990729, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999998, 4.510644377424939, 0.4444444444444445, 1, 0.221697814397615],
[0.8411861346717946, 2, 0, 0, 0.2960686469663368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9980152399214075, 2.001984760078594, 0, 3, 0.3326717466404691, 0, 1.498512905703751, 6.759258812611334, 0.2971792875702608, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.07141017245805, 1.004378341055416, 0, 0, 0.5161461129027003, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.000547189646975, 1.999000330086685, 0, 1, 0.3335660405659508, 0, 0.5002500424582901, 2.256450041321074, 0.6664339594340492, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9991230457500313, 2.00087695424997, 0, 1, 0.3330410152500103, 0, 0.4997808575264693, 2.254333714946384, 0.6669589847499897, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.375850996200937, 0, 0, 0.3371911506186241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.300062482687471, 2.69993751731253, 0, 0, 0.1000208275624903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.507041463058146, 0, 0, 0.398876530258968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 2.006196941081881, 0, 0, 0.1997751251251046, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9236076036510378, 2, 2, 0, 0.3159136686118975, 2.165421757133617, 0, -9.767447473568385, 0.9999999999999999, 0.09980144601582785, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.7003133383668396, 1.807345543421652, 0, 1, 0.2792697776610542, 0, 0.553297626809541, 2.495728829411019, 0.7207302223389458, 1, 0.221697814397615],
[0.7001144427472237, 2.141071691924571, 0, 1, 0.2464162534807311, 0, 0.4670558224517545, 2.106722719485588, 0.753583746519269, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095282504262, 2.075805717173137, 1, 2, 0.3079990774657577, 1.082357059238975, 0.9634813043696738, -0.5362062553133591, 0.7738454037505689, 0.6686247866929211, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9988096874344755, 2.000967319389785, 0, 2, 0.332961311844934, 0, 0.9995165741187217, 4.508463815191651, 0.4449406114956314, 1, 0.221697814397615],
[0.683886284730997, 2.315716783272271, 1, 2, 0.2279922607180944, 1.462231400638989, 0.8636634732049827, -2.699927056387099, 0.8677608773269113, 0.5398865143967176, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 2, 9.021288754849879, 0.1975308641975309, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.9996774263903818, 2.000322573609619, 0, 1, 0.3332258087967939, 0, 0.4999193696022144, 2.254958493662049, 0.6667741912032061, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095048961714, 2, 1, 0, 0.3159843023010999, 1.08235708659841, 0, -4.882127907031159, 1, 0.3159843023011, 0.221697814397615],
[1.07141017245805, 1.004378341055416, 0, 0, 0.5161461129027003, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.9990014654159831, 2.000998534584018, 0, 1, 0.3330004884719943, 0, 0.4997504909257153, 2.254196742009432, 0.6669995115280057, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9217068379080122, 2, 2, 0, 0.3154686246919861, 2.16988734133662, 0, -9.787590135845578, 1, 0.09952045316505298, 0.221697814397615],
[0.6996881409026621, 2.141497993769132, 1, 0, 0.2462662098636097, 1.429208159380704, 0, -6.446649748280418, 1, 0.2462662098636097, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9996032288161285, 2.000396771183872, 0, 2, 0.3332010762720428, 0, 0.9998016537571007, 4.509749708059624, 0.4446208046847621, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6835847704213548, 2.316415229578649, 0, 1, 0.2278615901404513, 0, 0.4317015305506768, 1.947252081504151, 0.7721384098595487, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.000396616799237, 0, 1, 0.2545802471018895, 0, 0.4999008654594029, 2.254875028054317, 0.7454197528981106, 1, 0.221697814397615],
[0.6832619397641637, 2.31673806023584, 0, 1, 0.2277539799213876, 0, 0.4316413742079248, 1.946980737634951, 0.7722460200786123, 1, 0.221697814397615],
[1.000230496676792, 1.999695166483239, 0, 1, 0.3334184273163555, 0, 0.5000762199963952, 2.255665990010657, 0.6665815726836446, 1, 0.221697814397615],
[1.922127127901753, 1.077798556100573, 2, 0, 0.6407249146710071, 1.0405139030441, 0, -4.693388186398351, 1, 0.4105284162801692, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.924211486486534, 0, 0, 0.3419725299012176, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.0009300164132191543, 2.99906998358678, 0, 1, 0.0003100054710730515, 0, 0.3334367005347558, 1.50401437849422, 0.9996899945289269, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.382875651058936, 1.300634344877112, 1, 0, 0.5153234581399679, 0.7231308174630532, 0, -3.261785955932421, 1, 0.5153234581399679, 0.221697814397615],
[0.6836586820584288, 2.316341317941574, 0, 2, 0.2278862273528094, 0, 0.8634306112439887, 3.894628431904277, 0.5961596779114775, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.999905076304918, 1, 1, 0.3333438807442977, 0.9999999999999998, 0.5000237320501374, -2.255215141873952, 0.8888818571703315, 0.5555696186589267, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0.9991230402171133, 2.000876959782888, 0, 1, 0.3330410134057044, 0, 0.4997808561444521, 2.254333708712596, 0.6669589865942956, 1, 0.221697814397615],
[1.924211486486534, 1.075788513513467, 0, 0, 0.6414038288288444, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.00023053624731, 1.999695114150943, 0, 1, 0.3334184419252275, 0, 0.5000762330834584, 2.255666049041746, 0.6665815580747725, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.375850996200937, 0, 0, 0.3371911506186241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.5010939663110549, 2.005947496747093, 1, 0, 0.1998746226158576, 1.995633687952348, 0, -9.001593873962056, 1, 0.1998746226158576, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9991508084077377, 2.000849191592263, 0, 2, 0.3330502694692459, 0, 0.9995755844089445, 4.508729989625454, 0.4448219430550455, 1, 0.221697814397615],
[0.8405083874227527, 2.000876658643769, 0, 1, 0.295809393586523, 0, 0.4997809313632647, 2.25433404799791, 0.704190606413477, 1, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9990322977675355, 2.000967702232465, 0, 2, 0.3330107659225118, 0, 0.9995163828824496, 4.508462952592835, 0.4448746383752744, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095282504262, 2.000094937180391, 1, 1, 0.3159740483208527, 1.082357059238975, 0.4999762668314822, -2.626912646793139, 0.9001604007877316, 0.5321084974294368, 0.221697814397615],
[1, 1.999905033411732, 0, 1, 0.333343885510509, 0, 0.5000237427744523, 2.255429283924558, 0.6666561144894909, 1, 0.221697814397615],
[0.9990015242226291, 2.000998475777372, 0, 1, 0.3330005080742096, 0, 0.4997505056127082, 2.254196808257233, 0.6669994919257904, 1, 0.221697814397615],
[0.9999050510816097, 2.000094948918391, 1, 1, 0.3333016836938698, 1.000094957934544, 0.4999762638972609, -2.255857575304373, 0.8889099876468316, 0.5555133550345712, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9934818570710116, 2.00651814292899, 3, 0, 0.3311606190236704, 3.019682723592573, 0, -13.62071489878007, 0.9999999999999998, 0.03631750936458245, 0.221697814397615],
[1.000480024182889, 1.923429479063198, 0, 1, 0.3421720210807376, 0, 0.5199046863350809, 2.34510515021421, 0.6578279789192624, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316415688122361, 0, 1, 0.2277592951465043, 0, 0.4317014450936392, 1.947251696037845, 0.7722407048534957, 1, 0.221697814397615],
[0.5010729031571305, 2.006585981244744, 0, 1, 0.1998170111070135, 0, 0.4983589087867896, 2.247919809858761, 0.8001829888929864, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6835309510322956, 2.316469048967708, 1, 0, 0.2278436503440983, 1.462991541918856, 0, -6.59903457277653, 1, 0.2278436503440983, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.375850996200937, 0, 0, 0.3371911506186241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.5013223868874053, 2.340062716611648, 1, 1, 0.1764359172116608, 1.994724405205139, 0.4273389738237335, -7.069918283318301, 0.96887036711768, 0.3217422015410015, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.001306338366776124, 2.998693661633223, 0, 2, 0.0004354461222587081, 0, 0.6669570905454578, 3.008406250452566, 0.9991292973688081, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.376810067193163, 0, 1, 0.3370354310435509, 0, 0.7263165950250874, 3.276155865580338, 0.6629645689564492, 1, 0.221697814397615],
[0.5010729031571189, 2.34031214290941, 0, 1, 0.1763481172151515, 0, 0.4272934287974203, 1.927368702115708, 0.8236518827848485, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9996029394678932, 2, 0, 1, 0.3332450859796847, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6667549140203153, 1, 0.221697814397615],
[0.998124629119134, 2.001875370880867, 0, 2, 0.3327082097063779, 0, 0.9990631929898607, 4.506418774151923, 0.4452783333932673, 1, 0.221697814397615],
[0.9999049578505675, 2.000095042149433, 0, 1, 0.3333016526168557, 0, 0.4999762405917143, 2.255215018471075, 0.6666983473831443, 1, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 1.574943991537199, 0, 0, 0.2412791663099343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.507041463058146, 0, 0, 0.398876530258968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -2.25532218871247, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 2.340341612695529, 0, 0, 0.1762800810071258, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6835842877926875, 2.316018794163117, 0, 2, 0.2278915806910613, 0, 0.8635508507273106, 3.895170789453668, 0.5961514111677478, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1.924211486486534, 1.075788513513467, 0, 0, 0.6414038288288444, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999998, 4.510644377424939, 0.4444444444444445, 1, 0.221697814397615],
[0.9998995869905453, 2.000100413009456, 0, 3, 0.3332998623301817, 0, 1.499924694023758, 6.765626887659088, 0.2963409265411521, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2, 0, 0, 0.3160549401975649, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2, 0, 0, 0.3160549401975649, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0.9992054884211619, 2.000794511578839, 0, 2, 0.3330684961403872, 0, 0.999602901960076, 4.50885320938387, 0.4447976308404448, 1, 0.221697814397615],
[0.9999050465974497, 2.000094953402551, 0, 1, 0.3333016821991498, 0, 0.4999762627763273, 2.255215118537975, 0.6666983178008502, 1, 0.221697814397615],
[0.300062482687471, 2.69993751731253, 0, 0, 0.1000208275624903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9987470963789227, 2.001252903621078, 0, 1, 0.3329156987929741, 0, 0.4996869701928199, 2.253910222572747, 0.6670843012070259, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095032461031, 2.004695432624903, 1, 0, 0.3154776842480873, 1.08235708853146, 0, -4.88212791575046, 1, 0.3154776842480873, 0.221697814397615],
[0.9996030928454934, 2.000396907154507, 0, 1, 0.3332010309484977, 0, 0.4999007928993772, 2.254874700761845, 0.6667989690515023, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -9.021288754849879, 1, 0.1111111111111109, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.683489435744733, 2.31651056425527, 1, 0, 0.2278298119149108, 1.463080404323142, 0, -6.599435399480788, 1, 0.2278298119149107, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.923533665460865, 1.07606946235128, 1, 0, 0.6412627216000586, 0.5198765261851589, 0, -2.344978129792297, 1, 0.6412627216000586, 0.221697814397615],
[0.6834894311996349, 2.257143806489292, 1, 0, 0.2324293361170046, 1.463080414052398, 0, -6.599435443366004, 1, 0.2324293361170046, 0.221697814397615],
[0.5010729139356948, 2.006585999605689, 0, 1, 0.1998170130833567, 0, 0.4983589042266359, 2.247919789289529, 0.8001829869166432, 1, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 2.340341612695529, 0, 0, 0.1762800810071258, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -2.25532218871247, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.221697814397615],
[1.3790454992085, 1.305335335854951, 0, 1, 0.5137294534349868, 0, 0.7660866694802476, 3.455544528311278, 0.4862705465650132, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.184032032136254, 1.756616310769799, 0, 0, 0.4026431909114816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.3031713666933624, 2.696432019273641, 0, 2, 0.1010704842219089, 0, 0.7417209058876092, 3.345639233760477, 0.8080742743370334, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.8411861346717946, 2, 0, 0, 0.2960686469663368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.300062482687471, 2.69993751731253, 0, 0, 0.1000208275624903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.000089431167848, 1.999910568832153, 15, 0, 0.3333631437226159, 14.99865865244056, 0, -67.65361531954693, 1.000000000000001, 6.978526645440297e-08, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[1.000479860775097, 1.999123334328242, 0, 1, 0.3335374033499887, 0, 0.5002192625279053, 2.256311204001146, 0.6664625966500113, 1, 0.221697814397615],
[0.5013222002949268, 2.006336536352373, 1, 1, 0.1999164371804381, 1.994725147642977, 0.4984208690223293, -6.749296481277105, 0.9600334181450799, 0.3598662925059563, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.7001144249806449, 2.14107170969115, 0, 1, 0.2464162472275052, 0, 0.4670558185761328, 2.106722702004036, 0.7535837527724948, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095514794469, 2.076090448520554, 1, 0, 0.3079698504931488, 1.082357032026252, 0, -4.882127660875561, 1, 0.3079698504931488, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.00069157975698, 1.999085380785635, 1, 1, 0.3335886610636445, 0.9993088981950385, 0.5002287594174707, -2.251173021861495, 0.8887186052097649, 0.5558959273370538, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.001440002779708, 1.921871062109274, 1, 1, 0.3425704554016525, 0.9985620678465899, 0.5203262693921253, -2.157151615381957, 0.8826454830859045, 0.5677863938892094, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 1.574943991537199, 0, 0, 0.2412791663099343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9999050804728647, 2.000094919527136, 2, 1, 0.3333016934909548, 2.000189857075414, 0.4999762712443771, -6.766929975865276, 0.962973508576041, 0.2592170738038977, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9991230912642576, 2.000876908735743, 0, 1, 0.3330410304214191, 0, 0.4997808688950544, 2.254333766226028, 0.6669589695785809, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.184032032136254, 1.756616310769799, 0, 0, 0.4026431909114816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999998, 4.510644377424939, 0.4444444444444445, 1, 0.221697814397615],
[0.5013015089027968, 2.00697540394669, 0, 1, 0.1998589176237729, 0, 0.4982622099072633, 2.247483635601522, 0.8001410823762272, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.999905076304918, 0, 2, 0.3333438807442977, 0, 1.000047464100275, 4.510858471101974, 0.4444303813410732, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.300062482687471, 2.69993751731253, 0, 0, 0.1000208275624903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.683489431110316, 2.316510568889687, 1, 0, 0.2278298103701051, 1.463080414243595, 0, -6.599435444228423, 1, 0.2278298103701051, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.924216970800736, 1, 0, 0.3419718885381377, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3419718885381378, 0.221697814397615],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -2.25532218871247, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.221697814397615],
[0.9956136859283414, 2.004386314071659, 1, 1, 0.3318712286427804, 1.004405638586184, 0.4989058211880451, -2.280129909136248, 0.8898614875991314, 0.5536039448846921, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.000396870462955, 0, 1, 0.2545802230378904, 0, 0.4999008020686256, 2.254874742121064, 0.7454197769621096, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.184032032136254, 1.756616310769799, 0, 0, 0.4026431909114816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -9.021288754849879, 1, 0.1111111111111109, 0.221697814397615],
[0.8411861346717946, 2, 0, 0, 0.2960686469663368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9987936545732771, 2.000980348654501, 0, 1, 0.3329563005408301, 0, 0.4997550329129518, 2.254217229298622, 0.66704369945917, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.501385381280981, 2.340003641107574, 0, 1, 0.1764578441495849, 0, 0.4273497623818562, 1.927622802881604, 0.8235421558504151, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.00032249581259, 0, 1, 0.25458727883982, 0, 0.4999193890452001, 2.254958581362443, 0.74541272116018, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.9236077434687188, 2, 2, 0, 0.3159137013274232, 2.165421429327522, 0, -9.767445994951663, 0.9999999999999999, 0.09980146668639245, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999998, 4.510644377424939, 0.4444444444444445, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.375850996200937, 0, 0, 0.3371911506186241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.184032032136254, 1.756616310769799, 0, 0, 0.4026431909114816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.922856067957284, 1.076350318541819, 2, 0, 0.6411216235778242, 1.040119452167145, 0, -4.691608958768041, 1, 0.4110369362190653, 0.221697814397615],
[0.9993549259834268, 2.000645074016574, 1, 2, 0.3331183086611422, 1.000645490405662, 0.9996775669882921, -0.004365958320336713, 0.7410273940481689, 0.7034169116596212, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 2.340341612695529, 0, 0, 0.1762800810071258, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[1.920139357440302, 1.079860642559699, 0, 1, 0.6400464524801005, 0, 0.9260454178879993, 4.177061557436633, 0.3599535475198995, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9233055279837186, 2.076694472016282, 1, 0, 0.3077685093279061, 1.083065106502464, 0, -4.885321533030484, 1, 0.3077685093279061, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.924401661011909, 0, 1, 0.3419502913474539, 0, 0.5196420374497961, 2.343920434496563, 0.6580497086525461, 1, 0.221697814397615],
[0.9987471267326855, 2.001252873267315, 0, 1, 0.3329157089108951, 0, 0.4996869777717622, 2.25391025675866, 0.6670842910891048, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.8411861346717946, 2, 0, 0, 0.2960686469663368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.998809330199986, 2.001190669800015, 0, 1, 0.3329364433999952, 0, 0.4997025096563802, 2.253980315566683, 0.6670635566000047, 1, 0.221697814397615],
[0.0009300164132395807, 2.99906998358676, 0, 1, 0.0003100054710798603, 0, 0.333436700534758, 1.50401437849423, 0.9996899945289202, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0.3026912242962628, 2.697308775703738, 0, 1, 0.1008970747654209, 0, 0.3707399052743215, 1.672275869212673, 0.8991029252345791, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.002509278999660496, 2.997490721000339, 0, 1, 0.0008364263332201656, 0, 0.3336123755092976, 1.504806785830391, 0.9991635736667799, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -9.021288754849879, 1, 0.1111111111111109, 0.221697814397615],
[1, 1.507041463058146, 0, 0, 0.398876530258968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9996774227290671, 2.000322577270933, 0, 1, 0.3332258075763557, 0, 0.4999193686871811, 2.254958489534659, 0.6667741924236443, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.071320732553213, 1.928679267446789, 1, 0, 0.3571069108510708, 0.9334272824318084, 0, -4.210358523236078, 1, 0.3571069108510707, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.256491065349786, 0, 1, 0.2324021122076298, 0, 0.443165947056381, 1.998963987356063, 0.7675978877923703, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999998, 4.510644377424939, 0.4444444444444445, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.924306519875851, 2.07569348012415, 0, 1, 0.3081021732919502, 0, 0.481766700900457, 2.173078260647209, 0.6918978267080498, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.000230496676799, 1.99969516648323, 0, 1, 0.3334184273163579, 0, 0.5000762199963973, 2.255665990010667, 0.6665815726836422, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[1.183404733743877, 1.757317946002146, 0, 1, 0.4024196983600243, 0, 0.569048988701774, 2.566777621367005, 0.5975803016399757, 1, 0.221697814397615],
[0.9992060661634551, 2.000793933836546, 0, 1, 0.3330686887211516, 0, 0.4998015953009655, 2.254427255672315, 0.6669313112788484, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.5010214501993401, 2.340363614950625, 0, 1, 0.176330007623552, 0, 0.4272840312555864, 1.927326313146474, 0.823669992376448, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6996881487625575, 2.141497985909237, 1, 0, 0.246266212630023, 1.429208143325799, 0, -6.446649675862451, 1, 0.246266212630023, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316415549818708, 0, 1, 0.2277593056478746, 0, 0.4317014708687585, 1.947251812300242, 0.7722406943521254, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9236284553751992, 2.07575365785535, 1, 2, 0.3079395757216092, 1.082686435417126, 0.9635054682097401, -0.537582959630059, 0.7739214913274937, 0.6685392993851675, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.00143983826004, 1.92186584589614, 0, 1, 0.3425710296694846, 0, 0.5203276816305114, 2.347013131565221, 0.6574289703305154, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.375850996200937, 0, 0, 0.3371911506186241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.004378341055417, 0, 0, 0.3155824273494288, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.004042740640884532, 2.995957259359115, 0, 2, 0.001347580213628177, 0, 0.6675662657576875, 3.011154023198476, 0.9973066555451759, 1, 0.221697814397615],
[0.684680090371074, 2.315319909628929, 1, 1, 0.2282266967903578, 1.460536116156135, 0.4319057577491603, -4.639785742597021, 0.9479125748721621, 0.4043659684528776, 0.221697814397615],
[0.6834894404820937, 2, 1, 0, 0.2547017439946786, 1.463080394182327, 0, -6.59943535373918, 1, 0.2547017439946786, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 2.340341612695529, 0, 0, 0.1762800810071258, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9988096377235502, 2.00119036227645, 1, 1, 0.33293654590785, 1.001191780927508, 0.4997025864458251, -2.262039415428164, 0.8891532563989502, 0.55502634821465, 0.221697814397615],
[0.9953100517847562, 2.004689948215245, 1, 1, 0.3317700172615853, 1.004712047473884, 0.4988302559656618, -2.281852858508219, 0.8899286556462473, 0.5534686901694179, 0.221697814397615],
[0.9908210469676154, 2.009178953032385, 1, 3, 0.3302736823225384, 1.009263986731485, 1.493147235825959, 2.182625256858098, 0.5980318573331732, 0.7988178423793435, 0.221697814397615],
[0.683489440482277, 2.316510559517726, 1, 0, 0.2278298134940921, 1.463080394181935, 0, -6.599435353737411, 1, 0.227829813494092, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1.00048002176217, 1.92342948300679, 0, 1, 0.3421720200746177, 0, 0.5199046852691244, 2.345105145406059, 0.6578279799253823, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9290828672453209, 2.086729684849134, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[0.6454775164072772, 2.370335035687181, 0, 0, 0.2140310464451772, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[0.7036267834643181, 1.383102901384815, 0, 0, 0.3371911506186241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[0.3016440672338333, 2.714168484860622, 0, 0, 0.1000208275624903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9947567855026423, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.2205354052031329],
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.989513571005285, 0, -9.021288754849879, 1, 0.1111111111111109, 0.2205354052031329],
[1.004389144830574, 2.011423407263881, 0, 2, 0.3330409723684698, 0, 0.9943207346485938, 4.508667140011986, 0.4448343445391963, 1, 0.2205354052031329],
[0.8456199011970046, 2.010541701396303, 0, 0, 0.2960686469663367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[0.7036267834643181, 1.816628920839683, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[0.9284321218746938, 2.087380430219761, 2, 0, 0.3078547177044893, 2.154169327921994, 0, -9.767906998596485, 1, 0.09477452721291058, 0.2205354052031329],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075693480124144, 0, 1, 0.3080802547991102, 0, 0.4817667009004583, 2.173078260647215, 0.6919197452008898, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 6, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 3, 9.021288754849879, 0.263374485596708, 0.9414723365340649, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[0, 1.998310956047469, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.8409367505950377, 2.000448314476665, 1, 0, 0.295960150186056, 1.189150074952023, 0, -5.363833099496791, 1, 0.295960150186056, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 3, 1, 0.3333333333333333, 3, 0.4999999999999999, -11.27661094356235, 0.9876543209876545, 0.1111111111111109, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.924211486486534, 0, 0, 0.3419725299012176, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.924211486486534, 0, 0, 0.3419725299012176, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.5010728808475707, 1.575873077182969, 0, 1, 0.2412546551392758, 0, 0.6345688713634222, 2.862314511704311, 0.7587453448607242, 1, 0.221697814397615],
[0.6834894311995611, 2.316510568800442, 1, 0, 0.2278298103998534, 1.463080414052556, 0, -6.599435443366717, 1, 0.2278298103998534, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.92430651987586, 1, 0, 0.3419614165626013, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3419614165626013, 0.221697814397615],
[0.5013223527968351, 2.340062720784911, 1, 1, 0.1764359070715066, 1.994724540848985, 0.4273389730616181, -7.069918898597085, 0.9688703706958546, 0.3217421848388681, 0.221697814397615],
[0.7428562538513042, 2.257143746148696, 1, 0, 0.2476187512837681, 1.346155457150082, 0, -6.07202854393392, 1, 0.2476187512837681, 0.221697814397615],
[1.184032032136254, 1.756616310769799, 0, 0, 0.4026431909114816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.507658924636631, 1, 0, 0.3987783147761627, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3987783147761627, 0.221697814397615],
[1.924211486486534, 1.075788513513467, 0, 0, 0.6414038288288444, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.001157961061765, 1.998842038938236, 0, 1, 0.3337193203539215, 0, 0.5002896579717672, 2.256628732814198, 0.6662806796460785, 1, 0.221697814397615],
[0.9996774228996694, 2.000322577100332, 0, 1, 0.3332258076332231, 0, 0.4999193687298177, 2.254958489726978, 0.6667741923667769, 1, 0.221697814397615],
[0.6999165215871578, 1.377030468479687, 0, 1, 0.33699296367917, 0, 0.7262003440664981, 3.275631498847607, 0.66300703632083, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.6834894403504177, 2.316510559649585, 1, 0, 0.227829813450139, 1.463080394464193, 0, -6.599435355010578, 1, 0.227829813450139, 0.221697814397615],
[1, 1.924211486486534, 0, 0, 0.3419725299012176, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.924211486486534, 0, 0, 0.3419725299012176, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 1.574943991537199, 0, 0, 0.2412791663099343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.924211486486534, 0, 0, 0.3419725299012176, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.807103945745618, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6840931092807042, 2.038376882664775, 1, 1, 0.2512766389729242, 1.461789318491249, 0.4905864114258878, -4.380750932093127, 0.9368600507064708, 0.4394133286523191, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.300062482687471, 2.69993751731253, 0, 0, 0.1000208275624903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.375850996200937, 0, 0, 0.3371911506186241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4973783927513212, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.2205354052031329],
[0.7036267834643181, 1.816628920839683, 0, 0, 0.2791886483036978, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9947567855026423, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.2205354052031329],
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4973783927513212, 2.25532218871247, 0.6666666666666667, 1, 0.2205354052031329],
[0.9287348149083369, 2.087077737186118, 1, 0, 0.3079550863542029, 1.07673362077925, 0, -4.882361722316112, 1, 0.3079550863542029, 0.2205354052031329],
[1.005270850698152, 2.010541701396303, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[0.6867884895248828, 2.269359571752396, 0, 0, 0.2323254706085792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[0.6867884895248828, 2.329024062569575, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2205354052031329],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.075788513513467, 0, 0, 0.3080704954955112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.8411861346717946, 2, 0, 0, 0.2960686469663368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.839830075833072, 2.001754047255973, 0, 1, 0.2955499606747889, 0, 0.4995618724342339, 2.253345951071352, 0.7044500393252111, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.9999999999999998, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 2.141248617359265, 0, 0, 0.2463539818004158, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.000563032952009, 1.998246284463398, 0, 4, 0.3336534360958859, 0, 2.001755254645273, 9.02920608434653, 0.1971517563002378, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.3009391936506139, 2.699060806349387, 0, 1, 0.1003130645502046, 0, 0.370499248348743, 1.671190351404424, 0.8996869354497954, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9242114864865338, 2.004378341055417, 0, 0, 0.3155824273494288, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.300062482687471, 2.69993751731253, 0, 0, 0.1000208275624903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.003166073338095897, 2.996833926661904, 0, 2, 0.001055357779365299, 0, 0.6673709818240574, 3.010273166821246, 0.9978903982213119, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.8411861346717946, 2, 0, 0, 0.2960686469663368, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9236074336120111, 2.07639256638799, 1, 0, 0.3078691445373369, 1.082711077897279, 0, -4.883724635893057, 1, 0.3078691445373369, 0.221697814397615],
[0.9992805070707267, 2.000719492929274, 0, 2, 0.3330935023569088, 0, 0.9996403829063411, 4.509022272603402, 0.4447642765985744, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2, 0, 0, 0.2546178780174971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9239095033349327, 2.076090496665068, 1, 0, 0.3079698344449775, 1.082357088427397, 0, -4.882127915281066, 1, 0.3079698344449775, 0.221697814397615],
[0.5008445219762669, 2.340341612695529, 0, 0, 0.1762800810071258, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.184032032136254, 1.756616310769799, 0, 0, 0.4026431909114816, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.7004028243163389, 1.375385689197127, 0, 1, 0.3374153097758701, 0, 0.7270687835815305, 3.279548720663221, 0.6625846902241299, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.9990015242368462, 2.000998475763154, 0, 1, 0.3330005080789487, 0, 0.4997505056162591, 2.25419680827325, 0.6669994919210513, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.6999690786722544, 1.807689880753621, 1, 1, 0.2791324857158851, 1.4286345361096, 0.5531922320564757, -3.948808906537158, 0.9220850554180713, 0.4803500268498414, 0.221697814397615],
[0.7425391672539332, 2.257460832746067, 0, 0, 0.2475130557513111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -4.510644377424939, 1, 0.3333333333333333, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.642813162241191, 2.356987859290853, 0, 2, 0.214285266798428, 0, 0.8485406456873903, 3.827465092486355, 0.6173476419700173, 1, 0.221697814397615],
[0.6831875101599877, 2.316812489840016, 0, 0, 0.227729170053329, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1, 1.999905076304918, 0, 2, 0.3333438807442978, 0, 1.000047464100275, 4.510858471101974, 0.4444303813410731, 1, 0.221697814397615],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[1.383125027472519, 1.300062482687473, 0, 0, 0.515478333972286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615],
[0.699937517312529, 1.375850996200937, 0, 0, 0.3371911506186241, 0, 0, 0, 1, 1, 0.221697814397615]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node134":{
"Global MG94xREV":0.0005555534756950498,
"Nucleotide GTR":0.000554947296551739,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node137":{
"Global MG94xREV":0.0005555996597124591,
"Nucleotide GTR":0.0005549934301765415,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "S", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "TCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node141":{
"Global MG94xREV":0.0005555201870242075,
"Nucleotide GTR":0.000554914044203049,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGT", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node165":{
"Global MG94xREV":0.0004922774478116671,
"Nucleotide GTR":0.0004917403108219069,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTA", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node204":{
"Global MG94xREV":0.0005554152266075829,
"Nucleotide GTR":0.0005548091983115203,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "L", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "TTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node208":{
"Global MG94xREV":0.0004780804863839451,
"Nucleotide GTR":0.0004775588400756261,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "Y", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "TAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node211":{
"Global MG94xREV":0.0004794205284199456,
"Nucleotide GTR":0.0004788974199561925,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACG", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node214":{
"Global MG94xREV":0.0004780804773274465,
"Nucleotide GTR":0.0004775588310290093,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCT", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node22":{
"Global MG94xREV":0.0005554342762754275,
"Nucleotide GTR":0.0005548282271937669,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "I", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATT", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node224":{
"Global MG94xREV":0.0004793845308026948,
"Nucleotide GTR":0.0004788614616168977,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "G", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "GGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node228":{
"Global MG94xREV":0.000478589930760038,
"Nucleotide GTR":0.0004780677285834381,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAC", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node231":{
"Global MG94xREV":0.0004780804862229175,
"Nucleotide GTR":0.0004775588399147744,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTT", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node234":{
"Global MG94xREV":0.0004780804863839451,
"Nucleotide GTR":0.0004775588400756261,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "I", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ATT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node237":{
"Global MG94xREV":0.0004780804952653691,
"Nucleotide GTR":0.0004775588489473599,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "S", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "TCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node247":{
"Global MG94xREV":0.0005552875634994196,
"Nucleotide GTR":0.0005546816744999636,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "V", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GTT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node250":{
"Global MG94xREV":0.0005558532731988297,
"Nucleotide GTR":0.0005552467669385051,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "Y", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "TAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node254":{
"Global MG94xREV":0.0004780804863839451,
"Nucleotide GTR":0.0004775588400756261,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "I", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ATA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node257":{
"Global MG94xREV":0.0004780804863839451,
"Nucleotide GTR":0.0004775588400756261,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "I", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ATA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node301":{
"Global MG94xREV":0.0005554670171327255,
"Nucleotide GTR":0.0005548609323266463,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node317":{
"Global MG94xREV":0.0005556857413443109,
"Nucleotide GTR":0.0005550794178824398,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "V", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GTT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node322":{
"Global MG94xREV":0.0005555098560534054,
"Nucleotide GTR":0.0005549037245046433,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTT", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node327":{
"Global MG94xREV":0.0005553921412947028,
"Nucleotide GTR":0.0005547861381876389,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGC", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node331":{
"Global MG94xREV":0.0005552945449503584,
"Nucleotide GTR":0.0005546886483332559,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "I", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ATA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node335":{
"Global MG94xREV":0.0005555075365760842,
"Nucleotide GTR":0.0005549014075581651,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "Y", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "TAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node352":{
"Global MG94xREV":0.0005552448526948172,
"Nucleotide GTR":0.0005546390102982538,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node365":{
"Global MG94xREV":0.0005553884593228567,
"Nucleotide GTR":0.0005547824602332895,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAC", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node381":{
"Global MG94xREV":0.0005555301910922668,
"Nucleotide GTR":0.0005549240373554038,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "L", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TTA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node384":{
"Global MG94xREV":0.0005554438091366266,
"Nucleotide GTR":0.0005548377496534081,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "V", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GTT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node387":{
"Global MG94xREV":0.0005553959286266802,
"Nucleotide GTR":0.0005547899213871563,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTG", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node390":{
"Global MG94xREV":0.000555217138032801,
"Nucleotide GTR":0.0005546113258764405,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "C", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "TGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node393":{
"Global MG94xREV":0.000555326665534036,
"Nucleotide GTR":0.0005547207338693121,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "V", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "GTT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node399":{
"Global MG94xREV":0.0005554565114945318,
"Nucleotide GTR":0.0005548504381514336,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node402":{
"Global MG94xREV":0.000492111429270341,
"Nucleotide GTR":0.0004915744734278174,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node403":{
"Global MG94xREV":6.304277606188015e-05,
"Nucleotide GTR":6.297398841558324e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node462":{
"Global MG94xREV":0.0005550990905653326,
"Nucleotide GTR":0.0005544934072136975,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "T", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ACA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node472":{
"Global MG94xREV":0.0005553521398849263,
"Nucleotide GTR":0.0005547461804244615,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "F", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "TTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node477":{
"Global MG94xREV":0.001111186099086144,
"Nucleotide GTR":0.001109973654439371,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "S", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "A", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "TCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "GCT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node482":{
"Global MG94xREV":0.0005554250313065483,
"Nucleotide GTR":0.0005548189923123186,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTT", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node497":{
"Global MG94xREV":0.0004674119069446809,
"Nucleotide GTR":0.0004669019014065627,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "L", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CTA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node50":{
"Global MG94xREV":0.0005555037862842789,
"Nucleotide GTR":0.0005548976613584028,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTT", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node505":{
"Global MG94xREV":0.0005553404435368012,
"Nucleotide GTR":0.0005547344968385326,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node506":{
"Global MG94xREV":0.0005555197619386325,
"Nucleotide GTR":0.0005549136195812966,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTC", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node511":{
"Global MG94xREV":0.0005552182184775262,
"Nucleotide GTR":0.0005546124051422649,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCG", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node512":{
"Global MG94xREV":0.0005551736330162564,
"Nucleotide GTR":0.0005545678683293748,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCG", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node518":{
"Global MG94xREV":0.000308356693499668,
"Nucleotide GTR":0.0003080202373267208,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node519":{
"Global MG94xREV":0.0002469383216053807,
"Nucleotide GTR":0.0002466688806482271,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node524":{
"Global MG94xREV":0.0005554398170258423,
"Nucleotide GTR":0.0005548337618985219,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node528":{
"Global MG94xREV":0.0003917510431820422,
"Nucleotide GTR":0.0003913235932206316,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node529":{
"Global MG94xREV":0.0001635884050463882,
"Nucleotide GTR":0.0001634099093955375,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node538":{
"Global MG94xREV":0.0005555414689504243,
"Nucleotide GTR":0.00055493530290799,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATT", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node542":{
"Global MG94xREV":0.0004228588236089123,
"Nucleotide GTR":0.0004223974311225888,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "S", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "TCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node543":{
"Global MG94xREV":0.0001324209903312036,
"Nucleotide GTR":0.0001322765022738211,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "S", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "TCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node548":{
"Global MG94xREV":0.0005553072566979599,
"Nucleotide GTR":0.0005547013462107323,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "I", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATT", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node553":{
"Global MG94xREV":0.0003741205774829466,
"Nucleotide GTR":0.0003737123645906236,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node554":{
"Global MG94xREV":0.0001812442955039006,
"Nucleotide GTR":0.0001810465350423338,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node555":{
"Global MG94xREV":0.0005555137021920497,
"Nucleotide GTR":0.0005549075664466639,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node561":{
"Global MG94xREV":0.0005552972161292433,
"Nucleotide GTR":0.0005546913165975462,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "L", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TTA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node567":{
"Global MG94xREV":0.0005554815568248917,
"Nucleotide GTR":0.0005548754561541685,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "I", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ATT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node586":{
"Global MG94xREV":0.000555388098512382,
"Nucleotide GTR":0.0005547820998165044,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "V", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "GTG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node595":{
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node596":{
"Global MG94xREV":0.0005555322922473242,
"Nucleotide GTR":0.0005549261362178354,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "L", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CTA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node600":{
"Global MG94xREV":0.0005552881400177407,
"Nucleotide GTR":0.0005546822503892301,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCG", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node610":{
"Global MG94xREV":0.0005554220530019012,
"Nucleotide GTR":0.0005548160172573794,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node615":{
"Global MG94xREV":0.0005555474650772627,
"Nucleotide GTR":0.0005549412924922963,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGT", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node618":{
"Global MG94xREV":0.0005554148725117645,
"Nucleotide GTR":0.0005548088446020659,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "I", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ATT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node626":{
"Global MG94xREV":0.0004692892782945906,
"Nucleotide GTR":0.0004687772243067619,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "L", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CTT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node627":{
"Global MG94xREV":8.642121810696164e-05,
"Nucleotide GTR":8.632692162201853e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "L", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CTT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node698":{
"Global MG94xREV":0.0004780445598555759,
"Nucleotide GTR":0.0004775229527476458,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "I", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ATA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node710":{
"Global MG94xREV":0.0005555642062344976,
"Nucleotide GTR":0.0005549580153828096,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "V", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GTT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node721":{
"Global MG94xREV":0.0004679698006792136,
"Nucleotide GTR":0.0004674591864084344,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "V", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GTT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node724":{
"Global MG94xREV":0.0004737307297733323,
"Nucleotide GTR":0.0004732138295999062,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAT", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node727":{
"Global MG94xREV":0.000475131349996087,
"Nucleotide GTR":0.0004746129215687593,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTT", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node730":{
"Global MG94xREV":0.0004780804863839451,
"Nucleotide GTR":0.0004775588400756261,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "I", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ATA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node733":{
"Global MG94xREV":0.0004780804952653691,
"Nucleotide GTR":0.0004775588489473599,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCT", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node736":{
"Global MG94xREV":0.0004780804863839451,
"Nucleotide GTR":0.0004775588400756261,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "L", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CTG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node739":{
"Global MG94xREV":0.0004779593721807379,
"Nucleotide GTR":0.0004774378580233406,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTT", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node745":{
"Global MG94xREV":0.0005552070800219586,
"Nucleotide GTR":0.000554601278840161,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "Y", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "TAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node750":{
"Global MG94xREV":0.0004780804863866101,
"Nucleotide GTR":0.0004775588400782882,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "V", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GTA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node755":{
"Global MG94xREV":0.0005555944923059519,
"Nucleotide GTR":0.0005549882684083281,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "N", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "AAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node765":{
"Global MG94xREV":0.000344448076116146,
"Nucleotide GTR":0.0003440722396776577,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "V", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GTT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node768":{
"Global MG94xREV":0.0005553709384218559,
"Nucleotide GTR":0.0005547649584498085,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "D", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAT", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node775":{
"Global MG94xREV":0.0004771399641110126,
"Nucleotide GTR":0.0004766193440315101,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "F", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "TTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node780":{
"Global MG94xREV":0.0005554717323366165,
"Nucleotide GTR":0.0005548656423856532,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "V", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GTA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node798":{
"Global MG94xREV":0.0005554800117294427,
"Nucleotide GTR":0.0005548739127446143,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "L", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TTA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node817":{
"Global MG94xREV":0.0005556018737787187,
"Nucleotide GTR":0.0005549956418269739,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node818":{
"Global MG94xREV":0.0005555383459518417,
"Nucleotide GTR":0.000554932183316995,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACC", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node840":{
"Global MG94xREV":0.0004771965613701915,
"Nucleotide GTR":0.0004766758795359174,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "L", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "TTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node844":{
"Global MG94xREV":0.0005554508359795896,
"Nucleotide GTR":0.0005548447688291962,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "C", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "TGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node862":{
"Global MG94xREV":0.0005554342766469581,
"Nucleotide GTR":0.0005548282275648931,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACT", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node881":{
"Global MG94xREV":0.000555471658128021,
"Nucleotide GTR":0.0005548655682580292,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "P", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CCC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node896":{
"Global MG94xREV":0.0005555037862842789,
"Nucleotide GTR":0.0005548976613584028,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "F", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "TTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node915":{
"Global MG94xREV":0.0005554778267235866,
"Nucleotide GTR":0.0005548717301228766,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "V", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "GTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node941":{
"Global MG94xREV":0.0005554127716988529,
"Nucleotide GTR":0.0005548067460814065,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "V", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "GTA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406036_California_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":7.721641129066204e-05,
"Nucleotide GTR":7.713215841475819e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "I", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ATA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406036_California_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553977895259175,
"Nucleotide GTR":0.0005547917802559189,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACG", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554734639477094,
"Nucleotide GTR":0.0005548673721073397,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "T", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "ACT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":7.725300093871268e-05,
"Nucleotide GTR":7.716870813887256e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "I", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ATA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413695_China_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001162409194482042,
"Nucleotide GTR":0.001161140858956275,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "Y", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "ILVF", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "TAT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "-TT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413695_China_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413749_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005559864874425202,
"Nucleotide GTR":0.0005553798358285978,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCT", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413749_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005564957981014422,
"Nucleotide GTR":0.0005558885907651425,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "E", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "HPRL", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAA", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CNT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413931_California_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005551557577591283,
"Nucleotide GTR":0.0005545500125764134,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "F", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCG", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "TTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413931_California_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554224953980315,
"Nucleotide GTR":0.0005548164591707997,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "A", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GCA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553894785998543,
"Nucleotide GTR":0.0005547834783981272,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCG", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415149_England_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "AS", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "KCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415149_England_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415519_Noord_Brabant_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555956723239479,
"Nucleotide GTR":0.0005549894471387754,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "S", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "TCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415519_Noord_Brabant_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553218199362663,
"Nucleotide GTR":0.0005547158935587025,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTC", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111347044618423,
"Nucleotide GTR":0.001110134424359708,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "H", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "CAT", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553105561893686,
"Nucleotide GTR":0.0005547046421019778,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "T", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "ACA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005553447286333215,
"Nucleotide GTR":0.0005547387772594703,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "I", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "ATC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555319888351811,
"Nucleotide GTR":0.0005549258331367531,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "T", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "ACT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005558286425751456,
"Nucleotide GTR":0.0005552221631899487,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "I", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "ATT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555808522390884,
"Nucleotide GTR":0.0005549746432245034,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "L", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTT", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CTT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "KGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111698627875848,
"Nucleotide GTR":0.001110485623995307,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "P", "I", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "CCA", "ATA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555908117586766,
"Nucleotide GTR":0.0005549845918769955,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "K", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "AAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416682_USA_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554532842863509,
"Nucleotide GTR":0.0005548472144645452,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCT", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416682_USA_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000555492451924139,
"Nucleotide GTR":0.0005548863393654836,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "T", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "ACT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":8.781264040470331e-05,
"Nucleotide GTR":8.771682570195867e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "L", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CTA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552955168281527,
"Nucleotide GTR":0.0005546896191506087,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGC", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTT", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "ILV", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "NTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTT", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417231_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555382944732982,
"Nucleotide GTR":0.0005549321318946215,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "V", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GTT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417231_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417238_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "V", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "GTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417238_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATY", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417242_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417261_England_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "TI", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "AYA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417261_England_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417324_California_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555380518320038,
"Nucleotide GTR":0.0005549318895180791,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "F", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TTT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417324_California_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417368_USA_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554456160028228,
"Nucleotide GTR":0.0005548395545480854,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "I", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ATT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417368_USA_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417424_Kasterlee_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "V", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "GTA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417424_Kasterlee_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553892550098138,
"Nucleotide GTR":0.0005547832550520512,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "R", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AGA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "PL", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CYG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553809181468612,
"Nucleotide GTR":0.0005547749272856713,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTG", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005550765890083958,
"Nucleotide GTR":0.0005544709302088069,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "T", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAT", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ACA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005555319888619947,
"Nucleotide GTR":0.0005549258331635374,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "I", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "ATT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "L", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CTT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417955_Kinshasa_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553807148548821,
"Nucleotide GTR":0.0005547747242155092,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAG", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417955_Kinshasa_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418090_Wales_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTK", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418090_Wales_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTK", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555492295883822,
"Nucleotide GTR":0.000554886183495427,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "TTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554409444774373,
"Nucleotide GTR":0.0005548348881199245,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "P", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "CCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556134825373145,
"Nucleotide GTR":0.0005550072379189456,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "I", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "ATA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553848505734906,
"Nucleotide GTR":0.0005547788554215266,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTT", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111427900258155,
"Nucleotide GTR":0.001110215191775704,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "Q", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "L", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAG", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CTC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553423780211737,
"Nucleotide GTR":0.0005547364292121375,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "H", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAC", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553980078748113,
"Nucleotide GTR":0.0005547919983665649,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "V", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "GTC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "AV", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GYT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418697_England_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555185301617055,
"Nucleotide GTR":0.0005549123891483934,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "H", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CAC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418697_England_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418731_England_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000555365261056813,
"Nucleotide GTR":0.0005547592872794901,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "Y", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "TAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTT", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418731_England_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418732_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "TI", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "AYA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418732_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418768_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554922958679662,
"Nucleotide GTR":0.000554886183479588,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAT", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418768_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552793895788073,
"Nucleotide GTR":0.000554673509498133,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTC", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418863_Komen_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000555492295883822,
"Nucleotide GTR":0.000554886183495427,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "F", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "TTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418863_Komen_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554945204754048,
"Nucleotide GTR":0.0005548884056596989,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "I", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ATA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554449263955566,
"Nucleotide GTR":0.0005548388656932666,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAT", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553419162126334,
"Nucleotide GTR":0.0005547359679074891,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGC", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554503977956493,
"Nucleotide GTR":0.0005548443311233698,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "F", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCG", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "TTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554235797829393,
"Nucleotide GTR":0.0005548175423725054,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "G", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GGG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005559864873798623,
"Nucleotide GTR":0.0005553798357660081,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "V", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GTT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "V", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "GTT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "IV", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "RTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATW", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555185301617055,
"Nucleotide GTR":0.0005549123891483934,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "M", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "ATG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "ED", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAM", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553447286491514,
"Nucleotide GTR":0.0005547387772752826,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "D", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAT", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554494441513027,
"Nucleotide GTR":0.000554843378519571,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "V", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAC", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "GTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553977895259175,
"Nucleotide GTR":0.0005547917802559189,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "R", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CGA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "I", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ATA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005550896644196897,
"Nucleotide GTR":0.0005544839913531718,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554922930660585,
"Nucleotide GTR":0.0005548861806807378,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGT", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554409350281335,
"Nucleotide GTR":0.0005548348786809318,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTC", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554922930660585,
"Nucleotide GTR":0.0005548861806807378,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "S", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "TCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554922958679662,
"Nucleotide GTR":0.000554886183479588,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAT", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005554175705254616,
"Nucleotide GTR":0.0005548115396718882,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "S", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "L", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "TTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420060_Ile_de_France_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005560377378594694,
"Nucleotide GTR":0.0005554310303248574,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "H", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CAC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420060_Ile_de_France_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420078_Thies_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "V", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GTT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420078_Thies_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554922958934016,
"Nucleotide GTR":0.0005548861835049959,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "I", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ATA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "PS", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "YCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552904794491337,
"Nucleotide GTR":0.0005546845872680079,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGG", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420328_Alken_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000566446302159691,
"Nucleotide GTR":0.0005658282375642981,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "C", "A", "N", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "TGT", "GCT", "AAC", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420328_Alken_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420528_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACY", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420528_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553334836792273,
"Nucleotide GTR":0.0005547275445750442,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "R", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "I", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AGA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATT", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420634_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "AS", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "KCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420634_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420700_England_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "TI", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "AYA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420700_England_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420756_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005557069558472205,
"Nucleotide GTR":0.0005551006092376413,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "I", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "ATC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420756_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "LF", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "YTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "AV", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GYT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "AS", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "KCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "CF", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TKC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005553977895523978,
"Nucleotide GTR":0.000554791780282369,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGG", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "QR", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CRA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "HR", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CRT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554409443531174,
"Nucleotide GTR":0.0005548348879957408,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAC", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555518527288436,
"Nucleotide GTR":0.0005549123862782594,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "S", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "AGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554730765433849,
"Nucleotide GTR":0.0005548669851257222,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005560377377905175,
"Nucleotide GTR":0.0005554310302559802,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "I", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "ATT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553821473994157,
"Nucleotide GTR":0.0005547761551969554,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "L", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TTA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554922930406234,
"Nucleotide GTR":0.0005548861806553304,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "L", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CTT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421603_New_York_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005553980080497213,
"Nucleotide GTR":0.0005547919985412846,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "R", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AGG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421603_New_York_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421665_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554922959202395,
"Nucleotide GTR":0.0005548861835318044,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "V", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GTT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421665_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421730_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553447286211242,
"Nucleotide GTR":0.0005547387772472868,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "S", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "TCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421730_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421827_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCW", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421827_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "LV", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "STC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421860_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421864_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553977897084321,
"Nucleotide GTR":0.0005547917804382334,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "A", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "GCT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421864_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421866_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "SL", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TYA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421866_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421880_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "PL", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CYT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421880_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421892_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCY", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421892_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421906_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "QP", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CMA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421906_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421915_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "IV", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "RTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421915_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421931_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "AV", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GYT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421931_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421939_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005550859285152317,
"Nucleotide GTR":0.0005544802595250583,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "H", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "YF", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "CAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TWT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421939_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421955_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555270638795292,
"Nucleotide GTR":0.0005549209135548508,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "Y", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "L", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "TAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TTA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421955_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422003_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "IV", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "RTA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422003_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTR", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422051_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553447286333215,
"Nucleotide GTR":0.0005547387772594703,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "I", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATT", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422051_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554409446902054,
"Nucleotide GTR":0.0005548348883324604,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAC", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555262836678274,
"Nucleotide GTR":0.0005546569746589085,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "S", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "TCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTW", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005562210372181305,
"Nucleotide GTR":0.0005556141296807228,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "HY", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "T", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "YAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "ACT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACR", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCG", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553447315240968,
"Nucleotide GTR":0.0005547387801470912,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "C", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "TGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553379382252445,
"Nucleotide GTR":0.0005547319942605879,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAC", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "NS", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "ART", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "TA", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "RCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCY", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005557826871679948,
"Nucleotide GTR":0.0005551762579259617,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCT", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "HR", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CRT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAY", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "AV", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GYT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552682430427805,
"Nucleotide GTR":0.0005546623751243869,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "F", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "TTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553447286052939,
"Nucleotide GTR":0.000554738777231474,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "S", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "TCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000555356121075455,
"Nucleotide GTR":0.0005547501572710072,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "F", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "TTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005555745338086928,
"Nucleotide GTR":0.0005549683316883155,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "I", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ATT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555382946891548,
"Nucleotide GTR":0.0005549321321102423,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "Y", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "TAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555874760063295,
"Nucleotide GTR":0.0005549812597643764,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGT", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005554238102043852,
"Nucleotide GTR":0.0005548177725425325,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAC", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554219864326195,
"Nucleotide GTR":0.000554815950760733,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423061_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "LF", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "YTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423061_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423062_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "VF", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "KTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423062_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423089_England_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005555903501929402,
"Nucleotide GTR":0.0005549841308148853,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGT", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423089_England_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423091_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTY", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423091_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423112_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTY", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423112_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423121_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005550878988455917,
"Nucleotide GTR":0.0005544822277055395,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "V", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "GTT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423121_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423145_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "SG", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "RGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423145_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423147_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554238678787434,
"Nucleotide GTR":0.0005548178301539607,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGC", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423147_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423155_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "AV", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GYT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423155_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423247_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "VF", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "KTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423247_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423282_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "MV", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "RTG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423282_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423312_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "VL", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "KTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423312_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423339_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554807349835503,
"Nucleotide GTR":0.0005548746352095612,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "I", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "ATA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423339_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423346_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":7.721641134140569e-05,
"Nucleotide GTR":7.713215846544632e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "Y", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "TAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423346_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423362_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAY", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423362_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423385_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "YTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423385_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423399_England_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005557069558472205,
"Nucleotide GTR":0.0005551006092376413,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "Y", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TAT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423399_England_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423404_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTY", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423404_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423409_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "AV", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GYA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423409_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423426_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "PL", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CYA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCG", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423426_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423453_England_20200329_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "PL", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CYA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423453_England_20200329_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTR", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423531_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423549_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "HY", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "YAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423549_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005565930337582625,
"Nucleotide GTR":0.0005559857203255561,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "I", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "PS", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ATT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "YCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCA", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423569_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423570_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "VF", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "KTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423570_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423593_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "TS", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AST", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423593_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423598_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554407021177287,
"Nucleotide GTR":0.0005548346460246614,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAC", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423598_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423656_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "Y", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "TAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGY", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423656_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423659_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "ED", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAK", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423659_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAY", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423687_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423709_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "TP", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "MCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423709_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423736_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555460263539622,
"Nucleotide GTR":0.0005549398553388253,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "I", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATT", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423736_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423743_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGR", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423743_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423758_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554324672417501,
"Nucleotide GTR":0.0005548264201339743,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCC", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423758_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423779_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555334786699776,
"Nucleotide GTR":0.0005549273213459507,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423779_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423814_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCY", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423814_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423870_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555119129179945,
"Nucleotide GTR":0.000554905779124933,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "S", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "TCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423870_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423875_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTY", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423875_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423888_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423888_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423907_England_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005554227162986933,
"Nucleotide GTR":0.0005548166798304307,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAT", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423907_England_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423954_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAY", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423954_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423958_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":7.721641147593156e-05,
"Nucleotide GTR":7.713215859982546e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "I", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ATA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423958_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "KE", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "RAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423967_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424026_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAY", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424026_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424088_England_20200313_null_6":{
"Global MG94xREV":7.66075930539295e-05,
"Nucleotide GTR":7.652400447576359e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAC", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424088_England_20200313_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424131_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "PL", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CYA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424131_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424142_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "IL", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "MTA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424142_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424144_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554122096073973,
"Nucleotide GTR":0.0005548061846032643,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "D", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAC", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424144_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424146_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "TI", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "AYA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424146_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424148_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554322293486005,
"Nucleotide GTR":0.0005548261825003964,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAC", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424148_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424154_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "RW", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "YGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424154_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553632101904422,
"Nucleotide GTR":0.0005547572386508737,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAG", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553632101512152,
"Nucleotide GTR":0.0005547572386116893,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "A", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "GCA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555449562998105,
"Nucleotide GTR":0.0005548434972366955,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "S", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "A", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTT", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "TCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "GCT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7":{
"Global MG94xREV":0.000555423576921016,
"Nucleotide GTR":0.0005548175395137047,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "A", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553447286333215,
"Nucleotide GTR":0.0005547387772594703,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "C", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "TGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554408772912209,
"Nucleotide GTR":0.0005548348210070169,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCC", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "T", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ACA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAC", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552907241310201,
"Nucleotide GTR":0.0005546848316829153,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAC", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAC", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005554027506796663,
"Nucleotide GTR":0.00055479673599642,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACT", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424597_Reykjavik_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005553447286211242,
"Nucleotide GTR":0.0005547387772472868,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCT", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424597_Reykjavik_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553437377569711,
"Nucleotide GTR":0.0005547377874642908,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "C", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "TGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555050756434397,
"Nucleotide GTR":0.00055489894931071,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "N", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAT", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424846_Massachusetts_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "PL", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CYT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424846_Massachusetts_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005550787910154593,
"Nucleotide GTR":0.0005544731298132017,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "R", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AGG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424851_Illinois_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553307823695058,
"Nucleotide GTR":0.0005547248462127936,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "C", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "TGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424851_Illinois_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "TI", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "AYA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "PL", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CYA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424868_Louisiana_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "V", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GTT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424868_Louisiana_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "LF", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "YTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555440944770158,
"Nucleotide GTR":0.0005548348884123256,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTC", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":7.734787131314725e-05,
"Nucleotide GTR":7.726347499772354e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTT", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "S", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "TCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553728751905499,
"Nucleotide GTR":0.0005547668931052425,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAT", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000555625495595604,
"Nucleotide GTR":0.0005550192378694678,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAT", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACC", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553382185293405,
"Nucleotide GTR":0.0005547322742588363,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "P", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "S", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CCC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "TCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425255_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552841406103946,
"Nucleotide GTR":0.0005546782553457436,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACT", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425255_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425259_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554324667109343,
"Nucleotide GTR":0.0005548264196037383,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTC", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425259_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425435_England_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005554322385353986,
"Nucleotide GTR":0.0005548261916771702,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTC", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425435_England_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425505_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00055540168716046,
"Nucleotide GTR":0.0005547956736376479,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "S", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "TCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425505_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555400295636502,
"Nucleotide GTR":0.0005549338650917703,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCT", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555808522390884,
"Nucleotide GTR":0.0005549746432245034,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTT", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAT", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTG", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001670120537841545,
"Nucleotide GTR":0.001668298224992927,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "I", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "Y", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "V", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCG", "ATA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TAT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GTA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425990_Scotland_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555381311820557,
"Nucleotide GTR":0.0005549319687815505,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATT", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425990_Scotland_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552803079883947,
"Nucleotide GTR":0.0005546744269056185,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "Y", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "V", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "TAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GTT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005551181931955909,
"Nucleotide GTR":0.0005545124890005689,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTT", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426108_Washington_20200325_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426108_Washington_20200325_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554391159825949,
"Nucleotide GTR":0.0005548330616202011,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTT", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426181_South_Korea_20200223_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554922930660585,
"Nucleotide GTR":0.0005548861806807378,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "I", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ATT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426181_South_Korea_20200223_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553892550098138,
"Nucleotide GTR":0.0005547832550520512,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCG", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "GV", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GKT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553203443114913,
"Nucleotide GTR":0.0005547144195440216,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "F", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "TTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554306944689256,
"Nucleotide GTR":0.0005548246492954694,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "TTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554352500136061,
"Nucleotide GTR":0.0005548291998694744,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "V", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GTT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426507_Arizona_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":8.016977449581883e-05,
"Nucleotide GTR":8.008229912693111e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTT", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426507_Arizona_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555844112293322,
"Nucleotide GTR":0.0005549781983314389,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "I", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATA", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554922930660585,
"Nucleotide GTR":0.0005548861806807378,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTT", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005559864872410926,
"Nucleotide GTR":0.0005553798356273898,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCT", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002107860612316979,
"Nucleotide GTR":0.0002105560669654224,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "V", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GTT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426716_Victoria_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005552118295759593,
"Nucleotide GTR":0.0005546060232117969,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "D", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAT", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426716_Victoria_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555075833122474,
"Nucleotide GTR":0.0005549014542433335,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "V", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GTT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555432238567787,
"Nucleotide GTR":0.0005548261917095237,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "T", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ACA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555381312286955,
"Nucleotide GTR":0.0005549319688281393,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAT", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "GC", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "KGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554209655412565,
"Nucleotide GTR":0.0005548149309832907,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACC", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "GV", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GKT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426814_Victoria_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005553447286211242,
"Nucleotide GTR":0.0005547387772472868,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGT", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426814_Victoria_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "GV", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "D", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GKT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAT", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "GV", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GKT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426877_Victoria_20200328_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426877_Victoria_20200328_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "N", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "AAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553491806884605,
"Nucleotide GTR":0.0005547432244568537,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "L", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "TTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":7.721641728760462e-05,
"Nucleotide GTR":7.71321644051573e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCT", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552786486744645,
"Nucleotide GTR":0.0005546727694022104,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "S", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "TCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005553807231021077,
"Nucleotide GTR":0.0005547747324537357,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "G", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "GGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554238680367989,
"Nucleotide GTR":0.000554817830311844,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGC", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554067738110253,
"Nucleotide GTR":0.0005548007547380339,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "L", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TTA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553977985218295,
"Nucleotide GTR":0.0005547917892420135,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCG", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554400674140045,
"Nucleotide GTR":0.0005548340120134795,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "L", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "TTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554728689601993,
"Nucleotide GTR":0.0005548667777690367,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAA", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGT", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427388_Liege_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555352590744402,
"Nucleotide GTR":0.0005549290998077675,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "L", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CTA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427388_Liege_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "ND", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "RAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "D", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAT", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005557069587443411,
"Nucleotide GTR":0.0005551006121316009,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTA", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553977895744912,
"Nucleotide GTR":0.0005547917803044384,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCG", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553258877716093,
"Nucleotide GTR":0.0005547199569555226,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAA", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005559864873894703,
"Nucleotide GTR":0.0005553798357756067,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "V", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GTC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "I", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATT", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553778720657855,
"Nucleotide GTR":0.0005547718845282558,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "A", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "GCT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553447286561349,
"Nucleotide GTR":0.0005547387772822583,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTT", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554238101307433,
"Nucleotide GTR":0.0005548177724689709,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACC", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553447286052939,
"Nucleotide GTR":0.000554738777231474,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "S", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "TCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005553980078519493,
"Nucleotide GTR":0.000554791998343729,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "C", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TGT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428695_Madrid_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555535493874166,
"Nucleotide GTR":0.000554929334351298,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "I", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ATA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428695_Madrid_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428706_Madrid_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554922930660585,
"Nucleotide GTR":0.0005548861806807378,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "C", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "TGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428706_Madrid_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACC", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428771_New_York_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554833351452161,
"Nucleotide GTR":0.0005548772325341207,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTA", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428771_New_York_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428836_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAR", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428836_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428879_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005553447286211242,
"Nucleotide GTR":0.0005547387772472868,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "I", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATT", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428879_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428891_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "I", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATT", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428891_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428916_Chechen_Republic_20200326_null_33":{
"Global MG94xREV":0.0005555354931440626,
"Nucleotide GTR":0.0005549293336219894,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "L", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TTA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428916_Chechen_Republic_20200326_null_33",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428923_Sverdlovsk_Region_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005555382946992674,
"Nucleotide GTR":0.0005549321321203442,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "V", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GTC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428923_Sverdlovsk_Region_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429001_California_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555763359662647,
"Nucleotide GTR":0.0005551569515093685,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "E", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAA", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429001_California_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429011_California_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555319888874991,
"Nucleotide GTR":0.0005549258331890138,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "M", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "ATG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429011_California_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429041_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553019978772537,
"Nucleotide GTR":0.000554696093128065,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "F", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "TTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429041_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429061_California_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551890230603033,
"Nucleotide GTR":0.0005545832415809361,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "TTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429061_California_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429103_Guangzhou_20200209_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553977897461331,
"Nucleotide GTR":0.0005547917804758932,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "G", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GGT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429103_Guangzhou_20200209_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "QL", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CWG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429206_Switzerland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554210280253096,
"Nucleotide GTR":0.0005548149933991668,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGC", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429206_Switzerland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATM", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429328_Unknown_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555377871926781,
"Nucleotide GTR":0.0005547718843894032,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "A", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "GCT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429328_Unknown_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429370_Unknown_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555503156586774,
"Nucleotide GTR":0.0005548970323479772,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "I", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "ATA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429370_Unknown_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429621_Washington_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005553447286052939,
"Nucleotide GTR":0.000554738777231474,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "S", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "TCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429621_Washington_20200328_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429636_Washington_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001112603339877131,
"Nucleotide GTR":0.001111389348841312,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "T", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "V", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "ACA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "GTG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429636_Washington_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429643_USA_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555498373309486,
"Nucleotide GTR":0.0005549436621575533,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "V", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAT", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GTT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429643_USA_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429650_Washington_20200402_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "S", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "A", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "TCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "GCT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429650_Washington_20200402_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429674_Minas_gerais_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005560377379611726,
"Nucleotide GTR":0.0005554310304264493,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "D", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GAC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429674_Minas_gerais_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429696_Minas_gerais_20200317_null_21":{
"Global MG94xREV":0.0005555381314441063,
"Nucleotide GTR":0.0005549319690433155,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCT", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429696_Minas_gerais_20200317_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429702_Minas_gerais_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005554311983061586,
"Nucleotide GTR":0.0005548251525829527,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAT", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429702_Minas_gerais_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429774_Luxembourg_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554210233038178,
"Nucleotide GTR":0.0005548149886828264,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGC", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429774_Luxembourg_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429780_Luxembourg_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555382946529156,
"Nucleotide GTR":0.0005549321320740432,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "L", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CTA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429780_Luxembourg_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430129_Washington_20200306_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005553665671930312,
"Nucleotide GTR":0.0005547605919905472,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430129_Washington_20200306_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430137_Washington_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00055549815116039,
"Nucleotide GTR":0.0005548920323831474,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "N", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "AAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430137_Washington_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430152_Washington_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553864849812687,
"Nucleotide GTR":0.0005547804880459578,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "S", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "TCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430152_Washington_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430200_Washington_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553238583138873,
"Nucleotide GTR":0.0005547179297121957,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCT", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430200_Washington_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430290_Washington_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553590113719528,
"Nucleotide GTR":0.0005547530444138263,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACC", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430290_Washington_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553778718234706,
"Nucleotide GTR":0.0005547718842862052,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "V", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "GTA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430340_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555319888619947,
"Nucleotide GTR":0.0005549258331635374,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "T", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "ACA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430340_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555983439150757,
"Nucleotide GTR":0.0005549921158148594,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "S", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "L", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "TCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TTA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430379_New_York_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555889103118325,
"Nucleotide GTR":0.0005549826925048708,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAT", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430379_New_York_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430385_New_York_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "L", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TTA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430385_New_York_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430423_New_York_20200411_null_3":{
"Global MG94xREV":7.72164086828857e-05,
"Nucleotide GTR":7.713215580982726e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTT", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430423_New_York_20200411_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553311331300541,
"Nucleotide GTR":0.0005547251965906175,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACC", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430467_West_Bengal_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553423780211737,
"Nucleotide GTR":0.0005547364292121375,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "A", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GCA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430467_West_Bengal_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430475_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAR", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430475_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430477_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGY", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430477_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "TI", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "AYA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430479_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "N", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "YTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "AAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430479_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "VF", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "KTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTY", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430552_Victoria_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":7.721640471811613e-05,
"Nucleotide GTR":7.71321518493837e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCT", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430552_Victoria_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430577_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "IV", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "RTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430577_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111643714931184,
"Nucleotide GTR":0.001110430770967616,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "L", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "S", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TTA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "TCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430592_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "LF", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTK", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430592_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430601_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552904794491337,
"Nucleotide GTR":0.0005546845872680079,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "L", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CTT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430601_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "SL", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TYA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430610_Victoria_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000555440944140346,
"Nucleotide GTR":0.0005548348877832021,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "H", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "CAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430610_Victoria_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430613_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "PA", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "SCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430613_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430619_Victoria_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "TI", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "AYT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430619_Victoria_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430660_Victoria_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005557856046378699,
"Nucleotide GTR":0.0005551791722125081,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "H", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAT", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430660_Victoria_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430665_Victoria_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "IF", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "WTT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430665_Victoria_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430671_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "YC", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TRT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430671_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "YAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAY", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTY", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "PL", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CYT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "LF", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "YTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430793_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555492295883822,
"Nucleotide GTR":0.000554886183495427,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "F", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TTT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430793_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430805_Buenos_Aires_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005555352591225801,
"Nucleotide GTR":0.0005549290998558548,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAT", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430805_Buenos_Aires_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430815_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "HY", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "YAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430815_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430911_Washington_20200408_null_15":{
"Global MG94xREV":0.0005553447286052939,
"Nucleotide GTR":0.000554738777231474,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "L", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "TTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430911_Washington_20200408_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430921_Connecticut_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":7.809613526747502e-05,
"Nucleotide GTR":7.801092250138955e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "F", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "TTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430921_Connecticut_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "Y", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "TAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430976_Washington_20200403_null_7":{
"Global MG94xREV":7.721639954016212e-05,
"Nucleotide GTR":7.713214667707945e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "S", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "TCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430976_Washington_20200403_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431092_Cincinnati_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553447286052939,
"Nucleotide GTR":0.000554738777231474,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "F", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431092_Cincinnati_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431782_Fujian_20200322_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTT", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431782_Fujian_20200322_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431916_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTW", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431916_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431950_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGY", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431950_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431951_Wales_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "TM", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "AYG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431951_Wales_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431962_Wales_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":7.803660374298185e-05,
"Nucleotide GTR":7.795145593332287e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "L", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "TTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431962_Wales_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431970_Wales_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTR", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431970_Wales_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431974_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005559864874215686,
"Nucleotide GTR":0.0005553798358076694,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "Y", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "TAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431974_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431988_Wales_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555319917155489,
"Nucleotide GTR":0.0005549258360139783,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "T", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "ACA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431988_Wales_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432000_Wales_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":7.573089954099626e-05,
"Nucleotide GTR":7.56482675463922e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACG", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432000_Wales_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432013_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "PS", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "YCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432013_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432016_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555605913263252,
"Nucleotide GTR":0.0005549544044189604,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTT", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432016_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432022_Wales_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555876241723103,
"Nucleotide GTR":0.0005549814077686891,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432022_Wales_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432027_Wales_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005555382946891548,
"Nucleotide GTR":0.0005549321321102423,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "V", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GTA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432027_Wales_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432054_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554409443687037,
"Nucleotide GTR":0.0005548348880113098,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "A", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432054_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432067_Wales_20200327_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432067_Wales_20200327_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432115_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTK", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432115_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432133_Wales_20200404_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGY", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432133_Wales_20200404_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432198_Wales_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555382946735764,
"Nucleotide GTR":0.0005549321320946811,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "L", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TTA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432198_Wales_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432265_Wales_20200408_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005555787461294985,
"Nucleotide GTR":0.000554972539412946,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "S", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "TCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432265_Wales_20200408_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432286_Wales_20200408_null_5":{
"Global MG94xREV":7.721640678750152e-05,
"Nucleotide GTR":7.713215391651112e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "I", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ATA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432286_Wales_20200408_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432291_Wales_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "S", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "TCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432291_Wales_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432416_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":6.427550107896287e-05,
"Nucleotide GTR":6.420536837367976e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTA", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432416_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432448_Wales_20200401_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005554238680691337,
"Nucleotide GTR":0.0005548178303441439,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTC", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432448_Wales_20200401_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432456_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATT", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432456_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432466_England_20200401_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005555163875901915,
"Nucleotide GTR":0.0005549102489146964,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "I", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATA", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432466_England_20200401_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432548_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554628963914729,
"Nucleotide GTR":0.0005548568160816437,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACG", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432548_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432559_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555825125193765,
"Nucleotide GTR":0.0005549763016932161,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGA", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432559_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432566_England_20200403_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0005555382946529156,
"Nucleotide GTR":0.0005549321320740432,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGT", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432566_England_20200403_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432619_England_20200330_null_10":{
"Global MG94xREV":8.160030951867335e-05,
"Nucleotide GTR":8.151127325505166e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAT", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432619_England_20200330_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432847_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554607694466325,
"Nucleotide GTR":0.00055485469145757,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "F", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTT", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432847_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432899_Scotland_20200406_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005555052598291784,
"Nucleotide GTR":0.0005548991332954784,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTT", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432899_Scotland_20200406_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432999_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00055552958359388,
"Nucleotide GTR":0.0005549234305198751,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATC", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432999_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005550820570206526,
"Nucleotide GTR":0.0005544763922547704,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "L", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "TTA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553977894629587,
"Nucleotide GTR":0.0005547917801930275,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "A", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "GCT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433206_Scotland_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00111167137225471,
"Nucleotide GTR":0.001110458398113501,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "F", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "I", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "TTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ATA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433206_Scotland_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433232_Scotland_20200402_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005555380005207307,
"Nucleotide GTR":0.0005549318382627932,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "I", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ATT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433232_Scotland_20200402_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433275_Scotland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005560599708391374,
"Nucleotide GTR":0.0005554532390455317,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTA", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433275_Scotland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433279_Scotland_20200320_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "V", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "GTG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433279_Scotland_20200320_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433303_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553809181468612,
"Nucleotide GTR":0.0005547749272856713,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCG", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433303_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433336_Scotland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGW", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433336_Scotland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433348_Scotland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552904794491337,
"Nucleotide GTR":0.0005546845872680079,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "H", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAT", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433348_Scotland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_15":{
"Global MG94xREV":0.000555492295883822,
"Nucleotide GTR":0.000554886183495427,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAT", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433391_Scotland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "V", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GTT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433391_Scotland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433448_Scotland_20200412_null_4":{
"Global MG94xREV":7.576701333122963e-05,
"Nucleotide GTR":7.568434193191047e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "G", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "GGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433448_Scotland_20200412_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433527_Scotland_20200331_null_28":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "P", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CCC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433527_Scotland_20200331_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433541_Scotland_20200331_null_32":{
"Global MG94xREV":0.0005552728558523203,
"Nucleotide GTR":0.0005546669829007683,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "TTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433541_Scotland_20200331_null_32",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555382943294881,
"Nucleotide GTR":0.0005549321317509683,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "I", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ATT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433574_Scotland_20200401_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTT", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433574_Scotland_20200401_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111421151110548,
"Nucleotide GTR":0.001110208449992272,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "S", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "A", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "TCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GCC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433620_Scotland_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554734460984726,
"Nucleotide GTR":0.0005548673542775793,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAA", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433620_Scotland_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433625_Scotland_20200405_null_8":{
"Global MG94xREV":0.000555667033164371,
"Nucleotide GTR":0.0005550607301154905,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCA", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433625_Scotland_20200405_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433652_Scotland_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555382945447955,
"Nucleotide GTR":0.00055493213196604,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTT", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433652_Scotland_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433673_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553102327137413,
"Nucleotide GTR":0.0005547043189793046,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "F", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "TTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGC", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433673_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433687_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553447286211242,
"Nucleotide GTR":0.0005547387772472868,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "L", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "TTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433687_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433696_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554235798061797,
"Nucleotide GTR":0.0005548175423957212,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "V", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "GTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433696_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433711_England_20200404_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "C", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "TGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433711_England_20200404_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433741_England_20200326_null_18":{
"Global MG94xREV":0.0005551082506758885,
"Nucleotide GTR":0.0005545025573294133,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTG", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433741_England_20200326_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433771_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553447257531601,
"Nucleotide GTR":0.0005547387743824513,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "F", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "TTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433771_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433804_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "I", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ATT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433804_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433809_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555382946424777,
"Nucleotide GTR":0.0005549321320636164,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGT", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433809_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433832_England_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553447286211242,
"Nucleotide GTR":0.0005547387772472868,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "S", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "TCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433832_England_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433853_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553887023885798,
"Nucleotide GTR":0.000554782703033798,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "V", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GTT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433853_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433866_England_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGC", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433866_England_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433888_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553809180595336,
"Nucleotide GTR":0.0005547749271984391,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "S", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AGC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433888_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433895_England_20200410_null_49":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433895_England_20200410_null_49",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433900_England_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553653962881588,
"Nucleotide GTR":0.0005547594223632818,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATT", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433900_England_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433902_England_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553447286211242,
"Nucleotide GTR":0.0005547387772472868,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "S", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "TCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433902_England_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433904_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555361618248906,
"Nucleotide GTR":0.0005549300015732022,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433904_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433908_England_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005557110909404019,
"Nucleotide GTR":0.0005551047398189137,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "V", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GTT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433908_England_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433922_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555469470250459,
"Nucleotide GTR":0.0005549407750053404,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGT", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433922_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433981_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553889279771295,
"Nucleotide GTR":0.000554782928376201,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "I", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATT", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433981_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434004_England_20200414_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434004_England_20200414_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434007_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553807145937696,
"Nucleotide GTR":0.0005547747239546814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACG", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434007_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434013_England_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "L", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CTA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434013_England_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434084_Washington_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553110233491687,
"Nucleotide GTR":0.000554705108752048,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "R", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "F", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CGT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "TTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434084_Washington_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434085_Washington_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554456160556194,
"Nucleotide GTR":0.000554839554600824,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGT", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434085_Washington_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434087_Washington_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554154967677313,
"Nucleotide GTR":0.0005548094681768912,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATT", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434087_Washington_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434119_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555234958490485,
"Nucleotide GTR":0.0005549173494175436,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "S", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "TCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434119_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434170_Washington_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553247287247222,
"Nucleotide GTR":0.000554718799173302,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTC", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434170_Washington_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111151876791573,
"Nucleotide GTR":0.001109939469485653,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "F", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "I", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "TTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "ATA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434226_Washington_20200401_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "F", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "TTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434226_Washington_20200401_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434241_Washington_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555319888874991,
"Nucleotide GTR":0.0005549258331890138,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "I", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "ATA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434241_Washington_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434268_Washington_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":7.721641185747025e-05,
"Nucleotide GTR":7.713215898094782e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "L", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CTG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434268_Washington_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434299_Washington_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTC", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434299_Washington_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434322_Washington_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555383655283172,
"Nucleotide GTR":0.0005549322028721096,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGT", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434322_Washington_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434327_Washington_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005555221998271299,
"Nucleotide GTR":0.0005549160548097487,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTT", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434327_Washington_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434514_Luxembourg_20200416_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005555319888874991,
"Nucleotide GTR":0.0005549258331890138,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAA", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434514_Luxembourg_20200416_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434515_Luxembourg_20200415_null_13":{
"Global MG94xREV":0.0005553447315012829,
"Nucleotide GTR":0.0005547387801243022,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "Y", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "TAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434515_Luxembourg_20200415_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434544_Puerto_Rico_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553447286211242,
"Nucleotide GTR":0.0005547387772472868,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "N", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAT", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434544_Puerto_Rico_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553238611784613,
"Nucleotide GTR":0.0005547179325736439,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTT", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553702763299678,
"Nucleotide GTR":0.0005547642970803463,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAG", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005554215489109478,
"Nucleotide GTR":0.000554815513716453,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "S", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "TCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434617_Occitanie_20200301_null_3":{
"Global MG94xREV":8.73275489986033e-05,
"Nucleotide GTR":8.723226359196771e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "V", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GTT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434617_Occitanie_20200301_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434657_Skane_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553807230670931,
"Nucleotide GTR":0.0005547747324187594,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTG", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434657_Skane_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434683_Virginia_20200314_null_8":{
"Global MG94xREV":7.721640873932846e-05,
"Nucleotide GTR":7.713215586620831e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "I", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ATT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434683_Virginia_20200314_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434691_District_of_Columbia_20200322_null_11":{
"Global MG94xREV":0.0005556802883140137,
"Nucleotide GTR":0.0005550739708020879,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATA", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434691_District_of_Columbia_20200322_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434711_Kinshasa_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554237037228841,
"Nucleotide GTR":0.0005548176661772172,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAC", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434711_Kinshasa_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434742_Texas_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000555395271360632,
"Nucleotide GTR":0.0005547892648382691,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "F", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "TTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434742_Texas_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434772_Texas_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACT", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434772_Texas_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434783_Texas_20200318_null_486":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434783_Texas_20200318_null_486",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434821_Texas_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "F", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "TTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434821_Texas_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434845_Texas_20200322_null_69":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "C", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "TGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434845_Texas_20200322_null_69",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434878_Texas_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553447286333215,
"Nucleotide GTR":0.0005547387772594703,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "L", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CTT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434878_Texas_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434943_Texas_20200401_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "V", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GTA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434943_Texas_20200401_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434946_Texas_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553447286052939,
"Nucleotide GTR":0.000554738777231474,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "I", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "ATA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434946_Texas_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434997_Texas_20200331_null_16":{
"Global MG94xREV":0.0005554215489109478,
"Nucleotide GTR":0.000554815513716453,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "N", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAT", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434997_Texas_20200331_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434998_Texas_20200401_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005554530826438958,
"Nucleotide GTR":0.0005548470130421079,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTT", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434998_Texas_20200401_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435017_Texas_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553809181347668,
"Nucleotide GTR":0.0005547749272735906,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGG", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435017_Texas_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435025_Texas_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554238679010833,
"Nucleotide GTR":0.0005548178301762757,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAC", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435025_Texas_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555383656015803,
"Nucleotide GTR":0.0005549322029452937,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "I", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ATT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435038_Louisiana_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553807145605667,
"Nucleotide GTR":0.0005547747239215148,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "G", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GGT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435038_Louisiana_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435040_Louisiana_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553865792638338,
"Nucleotide GTR":0.0005547805822256487,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "G", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "GGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435040_Louisiana_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435042_Louisiana_20200415_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "I", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ATT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435042_Louisiana_20200415_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435045_Nur_Sultan_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111960457310344,
"Nucleotide GTR":0.001110747167740759,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "D", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACG", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GAT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435045_Nur_Sultan_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435052_Gujarat_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435052_Gujarat_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435065_Delhi_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGR", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435065_Delhi_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435082_Uttar_Pradesh_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCY", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435082_Uttar_Pradesh_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005554236234994431,
"Nucleotide GTR":0.0005548175860413093,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "CAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "V", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGR", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "GTG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435121_United_Arab_Emirates_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554238682439417,
"Nucleotide GTR":0.0005548178305187602,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTC", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435121_United_Arab_Emirates_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435141_United_Arab_Emirates_20200312_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435141_United_Arab_Emirates_20200312_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435143_United_Arab_Emirates_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555382946529156,
"Nucleotide GTR":0.0005549321320740432,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGT", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435143_United_Arab_Emirates_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435147_Abruzzo_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001111235521903833,
"Nucleotide GTR":0.001110023023330511,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "D", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAT", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAT", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435147_Abruzzo_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435151_Abruzzo_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555319917155489,
"Nucleotide GTR":0.0005549258360139783,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "K", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AAG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435151_Abruzzo_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435160_Kinshasa_20200412_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005552875634994196,
"Nucleotide GTR":0.0005546816744999636,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "S", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "TCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435160_Kinshasa_20200412_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435166_Kinshasa_20200413_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "Y", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "TAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435166_Kinshasa_20200413_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435287_Israel_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "AG", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GSC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435287_Israel_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435379_Utah_20200405_null_9":{
"Global MG94xREV":7.721641179725232e-05,
"Nucleotide GTR":7.71321589207956e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "V", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GTA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435379_Utah_20200405_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435380_Utah_20200405_null_1067":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435380_Utah_20200405_null_1067",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435385_Utah_20200406_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "L", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TTA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435385_Utah_20200406_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435391_Utah_20200405_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "L", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TTA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435391_Utah_20200405_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435406_Baranya_20200322_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005555382945447955,
"Nucleotide GTR":0.00055493213196604,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAT", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435406_Baranya_20200322_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435416_Baranya_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554433582293747,
"Nucleotide GTR":0.0005548372992381539,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACT", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "TTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435416_Baranya_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435431_Kecskemet_20200325_null_118":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435431_Kecskemet_20200325_null_118",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435444_Alaska_20200409_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005554922958679662,
"Nucleotide GTR":0.000554886183479588,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "L", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TTA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435444_Alaska_20200409_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435459_Louisiana_20200402_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "L", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "TTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435459_Louisiana_20200402_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435466_Louisiana_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "V", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GTT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435466_Louisiana_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435467_Louisiana_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005555319888510411,
"Nucleotide GTR":0.0005549258331525958,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "K", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435467_Louisiana_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435474_California_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554237037552261,
"Nucleotide GTR":0.0005548176662095233,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCC", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435474_California_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435482_New_York_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555381311924942,
"Nucleotide GTR":0.0005549319687919772,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTT", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435482_New_York_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435522_New_York_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553807147903185,
"Nucleotide GTR":0.0005547747241510161,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAG", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435522_New_York_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435527_New_York_20200420_null_26":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGT", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435527_New_York_20200420_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435530_New_York_20200416_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005554922930660585,
"Nucleotide GTR":0.0005548861806807378,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTT", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435530_New_York_20200416_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435542_New_York_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111247585452092,
"Nucleotide GTR":0.001110035073715911,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "T", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "G", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "ACT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "GGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435542_New_York_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435594_California_20200304_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "Y", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "TAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435594_California_20200304_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435620_California_20200309_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005554237614442043,
"Nucleotide GTR":0.0005548177238355551,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "P", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "CCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435620_California_20200309_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435631_California_20200311_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCG", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435631_California_20200311_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435640_California_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCG", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435640_California_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435668_California_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554016871447007,
"Nucleotide GTR":0.0005547956736219057,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "I", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "ATT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435668_California_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435671_California_20200321_null_12217":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435671_California_20200321_null_12217",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 506, 507, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 522, 523, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 532, 533, 534, 535, 536, 537, 538, 539, 540, 541, 542, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 549, 550, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 562, 563, 564, 565, 566, 567, 568, 569, 570, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 581, 582, 583, 584, 585, 586, 587, 588, 589, 590, 591, 592, 593, 594, 595, 596, 597, 598, 599, 600]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":12993.8582357771,
"Equilibrium frequencies": [
[0.03289472756541341],
[0.01229486386313785],
[0.01087233080473381],
[0.0395711042559125],
[0.02471498027985392],
[0.009237569069896676],
[0.008168769323311689],
[0.029731179849175],
[0.01802342076574217],
[0.006736505241522184],
[0.005957082101026209],
[0.02168148864437626],
[0.02623954012413809],
[0.009807394604989078],
[0.008672665241759697],
[0.03156516726927384],
[0.01846210680996322],
[0.006900470277609828],
[0.006102076151598805],
[0.02220921124542121],
[0.01387123832612484],
[0.005184569061826235],
[0.004584707122228936],
[0.01668657133183941],
[0.01011561255816283],
[0.003780851476807073],
[0.003343401638033411],
[0.01216869658991652],
[0.01472689480260375],
[0.005504382620731696],
[0.004867517802116527],
[0.01771589347991503],
[0.03379981595159668],
[0.01263315328870314],
[0.01117147966749727],
[0.04065989110843324],
[0.02539500541675653],
[0.009491737962619777],
[0.008393530517312679],
[0.0305492241857789],
[0.01851932968555093],
[0.006921858126583776],
[0.006120989396335384],
[0.02227804818505543],
[0.02696151305970719],
[0.01007724207334219],
[0.008911290978117071],
[0.03243367320982435],
[0.01223773346147443],
[0.03938722966359731],
[0.02460013746693553],
[0.00919464496457665],
[0.008130811597408291],
[0.02959302831975441],
[0.006705202800556594],
[0.005929401396549772],
[0.02158074152194348],
[0.02611761315663016],
[0.00976182269794792],
[0.008632366068522036],
[0.03141849377172719]
],
"Log Likelihood":-5885.693718872335,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.5819511102432378, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":610
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":14033.2597555615,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3033022618277015],
[0.1867146431592145],
[0.1946686986468291],
[0.3153143963662549]
],
"Log Likelihood":-6004.500464613471,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2103985193805572,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.140081721126585,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.02009887314284197,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.619303409831078,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.9467587185501606
},
"display order":0,
"estimated parameters":1011
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-05/sequences.helicase.compressed.fas",
"number of sequences":503,
"number of sites":601,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1,epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1,epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1,epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2,(epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1,epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1)Node22,epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1,epi_isl_435017_Texas_20200402_null_1,epi_isl_418768_England_20200318_null_1,epi_isl_431974_Wales_20200404_null_1,epi_isl_435151_Abruzzo_20200408_null_2,epi_isl_421603_New_York_20200321_null_3,epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1,epi_isl_429696_Minas_gerais_20200317_null_21,epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1,epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1,epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1,(epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2,epi_isl_433574_Scotland_20200401_null_10)Node50,epi_isl_432847_England_20200406_null_2,epi_isl_417955_Kinshasa_20200321_null_2,epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1,epi_isl_426814_Victoria_20200325_null_3,epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4,epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1,epi_isl_433902_England_20200409_null_2,epi_isl_432027_Wales_20200407_null_4,epi_isl_433620_Scotland_20200404_null_1,epi_isl_434997_Texas_20200331_null_16,epi_isl_428695_Madrid_20200312_null_1,epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1,epi_isl_430379_New_York_20200407_null_2,epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1,epi_isl_434514_Luxembourg_20200416_null_3,epi_isl_418697_England_20200316_null_1,epi_isl_434878_Texas_20200324_null_1,epi_isl_430805_Buenos_Aires_20200401_null_3,(epi_isl_434772_Texas_20200318_null_2,epi_isl_435416_Baranya_20200327_null_1)Node862,epi_isl_425259_England_20200101_null_1,epi_isl_434007_England_20200101_null_1,epi_isl_418863_Komen_20200305_null_2,epi_isl_433771_England_20200405_null_1,epi_isl_425990_Scotland_20200330_null_2,epi_isl_435482_New_York_20200330_null_2,epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1,epi_isl_429674_Minas_gerais_20200311_null_1,epi_isl_428923_Sverdlovsk_Region_20200327_null_3,epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3,epi_isl_421665_India_20200310_null_1,epi_isl_433832_England_20200407_null_2,(epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2,epi_isl_433527_Scotland_20200331_null_28)Node881,epi_isl_435160_Kinshasa_20200412_null_3,epi_isl_432566_England_20200403_null_10,epi_isl_421730_New_York_20200318_null_1,epi_isl_428706_Madrid_20200321_null_2,epi_isl_429206_Switzerland_20200407_null_1,(epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1,epi_isl_434821_Texas_20200320_null_2)Node896,epi_isl_430660_Victoria_20200327_null_2,epi_isl_435406_Baranya_20200322_null_5,epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1,epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_15,epi_isl_435474_California_20200429_null_1,epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1,epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1,epi_isl_427388_Liege_20200407_null_1,(epi_isl_417238_England_20200303_null_1,epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1)Node915,epi_isl_425435_England_20200401_null_4,epi_isl_433652_Scotland_20200405_null_2,epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_6,epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1,epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1,epi_isl_435467_Louisiana_20200331_null_3,epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1,epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1,epi_isl_434544_Puerto_Rico_20200323_null_1,epi_isl_431988_Wales_20200406_null_2,epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2,epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1,epi_isl_433232_Scotland_20200402_null_6,epi_isl_424144_England_20200321_null_1,epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_2,(epi_isl_417424_Kasterlee_20200304_null_1,epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1)Node941,epi_isl_432198_Wales_20200330_null_2,epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2,epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2,epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_5,epi_isl_430340_New_York_20200330_null_1,epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1,epi_isl_435444_Alaska_20200409_null_6,epi_isl_429011_California_20200408_null_1,epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7,epi_isl_435530_New_York_20200416_null_7,epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1,epi_isl_423399_England_20200329_null_3,epi_isl_426181_South_Korea_20200223_null_2,epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_2,epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1,epi_isl_434515_Luxembourg_20200415_null_13,epi_isl_429370_Unknown_20200309_null_1,(epi_isl_420328_Alken_20200306_null_1,epi_isl_434845_Texas_20200322_null_69)Node844,(epi_isl_423312_England_20200325_null_1,epi_isl_431962_Wales_20200331_null_4)Node840,epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_434241_Washington_20200402_null_2,epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1,epi_isl_434946_Texas_20200329_null_1,epi_isl_435522_New_York_20200420_null_1,epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1,epi_isl_430911_Washington_20200408_null_15,epi_isl_434657_Skane_20200401_null_1,epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1,epi_isl_430610_Victoria_20200408_null_2,epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1,epi_isl_420060_Ile_de_France_20200320_null_1,epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1,epi_isl_429780_Luxembourg_20200326_null_2,epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1,((epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3,epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_18)Node818,epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_6)Node817,epi_isl_429702_Minas_gerais_20200322_null_4,epi_isl_433303_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1,epi_isl_431092_Cincinnati_20200413_null_1,epi_isl_435620_California_20200309_null_3,epi_isl_424597_Reykjavik_20200327_null_4,epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4,epi_isl_435038_Louisiana_20200413_null_1,epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_433696_England_20200401_null_1,epi_isl_435025_Texas_20200403_null_1,epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_430467_West_Bengal_20200403_null_1,epi_isl_428916_Chechen_Republic_20200326_null_33,epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1,epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_1,epi_isl_435045_Nur_Sultan_20200301_null_1,epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_422051_Wales_20200330_null_1,epi_isl_432054_Wales_20200331_null_1,epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3,epi_isl_421864_England_20200327_null_1,epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_435121_United_Arab_Emirates_20200225_null_1,epi_isl_413749_China_20200201_null_1,epi_isl_423598_England_20200321_null_1,epi_isl_429328_Unknown_20200315_null_1,epi_isl_435040_Louisiana_20200415_null_2,epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1,(epi_isl_423089_England_20200323_null_3,epi_isl_435527_New_York_20200420_null_26)Node141,epi_isl_423339_England_20200327_null_1,(epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_432067_Wales_20200327_null_12)Node134,(epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1,epi_isl_432291_Wales_20200408_null_2)Node137,epi_isl_432448_Wales_20200401_null_7,epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1,epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2,epi_isl_433888_England_20200409_null_1,epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1,epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2,epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1,(epi_isl_431916_Wales_20200331_null_1,epi_isl_432416_Wales_20200331_null_1)Node165,epi_isl_423758_England_20200322_null_1,epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1,epi_isl_435668_California_20200320_null_1,epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2,epi_isl_433687_England_20200101_null_1,epi_isl_417231_England_20200303_null_1,epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3,epi_isl_428879_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3,epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2,epi_isl_425505_England_20200318_null_1,epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_423659_England_20200323_null_1,epi_isl_426716_Victoria_20200323_null_3,epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1,(epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1,epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1)Node214,(epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1,epi_isl_432000_Wales_20200330_null_2)Node211,(epi_isl_423346_England_20200327_null_1,epi_isl_430815_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200418_null_1)Node208,(epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3,epi_isl_435459_Louisiana_20200402_null_6)Node204,epi_isl_435542_New_York_20200422_null_1,(epi_isl_423404_England_20200330_null_1,epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_2)Node739,(epi_isl_430976_Washington_20200403_null_7,epi_isl_432013_Wales_20200331_null_1)Node237,(epi_isl_430619_Victoria_20200408_null_2,epi_isl_434683_Virginia_20200314_null_8)Node234,(epi_isl_423112_England_20200324_null_2,epi_isl_430423_New_York_20200411_null_3)Node231,(epi_isl_423687_England_20200323_null_1,epi_isl_424088_England_20200313_null_6)Node228,(epi_isl_423145_England_20200324_null_1,epi_isl_433448_Scotland_20200412_null_4)Node224,epi_isl_429636_Washington_20200407_null_1,(epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1,epi_isl_434268_Washington_20200330_null_4)Node736,(epi_isl_430552_Victoria_20200330_null_2,epi_isl_435082_Uttar_Pradesh_20200329_null_1)Node733,(epi_isl_406036_California_20200122_null_1,epi_isl_424146_England_20200321_null_1)Node257,(epi_isl_420700_England_20200327_null_3,epi_isl_432286_Wales_20200408_null_5)Node254,epi_isl_421931_England_20200331_null_1,(epi_isl_429643_USA_20200408_null_1,epi_isl_435466_Louisiana_20200328_null_2)Node247,(epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1,epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1)Node250,(epi_isl_423958_England_20200319_null_1,epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_1)Node730,(epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1,epi_isl_417261_England_20200306_null_1)Node698,epi_isl_435147_Abruzzo_20200408_null_2,epi_isl_418090_Wales_20200312_null_1,epi_isl_421915_England_20200327_null_2,epi_isl_421892_England_20200327_null_1,epi_isl_421860_England_20200327_null_1,epi_isl_421827_England_20200324_null_2,epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1,epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1,epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1,epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1,(epi_isl_423569_England_20200331_null_1,epi_isl_435042_Louisiana_20200415_null_7)Node567,epi_isl_423907_England_20200318_null_3,epi_isl_423736_England_20200323_null_1,(epi_isl_423656_England_20200322_null_1,epi_isl_435594_California_20200304_null_12)Node335,epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1,(epi_isl_423155_England_20200323_null_1,epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1,epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1,epi_isl_435431_Kecskemet_20200325_null_118,epi_isl_421866_England_20200327_null_1,epi_isl_431950_Wales_20200326_null_1,epi_isl_432999_England_20200402_null_1,epi_isl_433922_England_20200411_null_1,(epi_isl_433391_Scotland_20200407_null_1,epi_isl_433908_England_20200411_null_2)Node317,epi_isl_433904_England_20200410_null_1)Node301,(epi_isl_431782_Fujian_20200322_null_7,epi_isl_432016_Wales_20200401_null_1)Node322,(epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1,epi_isl_433206_Scotland_20200402_null_2)Node331,(epi_isl_433673_England_20200403_null_2,epi_isl_433866_England_20200408_null_3)Node327,epi_isl_434742_Texas_20200311_null_3,((epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1,epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1)Node543,epi_isl_415149_England_20200301_null_1)Node542,((epi_isl_423779_England_20200323_null_1,epi_isl_429001_California_20200325_null_1,epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1,epi_isl_433895_England_20200410_null_49)Node529,epi_isl_423954_England_20200320_null_2)Node528,((epi_isl_432022_Wales_20200331_null_2,epi_isl_435052_Gujarat_20200413_null_1)Node519,epi_isl_424846_Massachusetts_20200306_null_2)Node518,(epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1,epi_isl_426877_Victoria_20200328_null_18,((((epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1,epi_isl_434299_Washington_20200323_null_3)Node506,epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1)Node505,epi_isl_430129_Washington_20200306_null_4,epi_isl_434119_Washington_20200325_null_1,epi_isl_434087_Washington_20200405_null_2,epi_isl_434327_Washington_20200325_null_4,epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1,(epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2,epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1)Node497,epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1,epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1,epi_isl_416682_USA_20200309_null_1,epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1,epi_isl_430152_Washington_20200305_null_1,epi_isl_430200_Washington_20200304_null_2,epi_isl_424851_Illinois_20200307_null_1,epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1,epi_isl_430137_Washington_20200321_null_1,epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1,epi_isl_417368_USA_20200313_null_2,epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1,(epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2,epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1)Node482,epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2,epi_isl_434085_Washington_20200403_null_1,(epi_isl_434084_Washington_20200401_null_1,epi_isl_434226_Washington_20200401_null_9)Node472,epi_isl_429061_California_20200408_null_1,epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1,epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1,epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1,epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1,epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1,(epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9)Node462,epi_isl_429041_California_20200328_null_1,epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1,epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1,epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1,epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1,epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2,epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1,epi_isl_434170_Washington_20200329_null_1,epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1,epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1,epi_isl_430290_Washington_20200302_null_1,epi_isl_417324_California_20200304_null_1,epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1,epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1,(epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1,epi_isl_429650_Washington_20200402_null_6)Node477,epi_isl_435380_Utah_20200405_null_1067)Node403,epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_4)Node402,((epi_isl_413931_California_20200305_null_2,epi_isl_435631_California_20200311_null_6)Node512,epi_isl_435640_California_20200312_null_2)Node511)Node399,(epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1,epi_isl_423121_England_20200324_null_1)Node393,(epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1,epi_isl_433711_England_20200404_null_5)Node390,(epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2,epi_isl_433741_England_20200326_null_18)Node387,(epi_isl_420078_Thies_20200320_null_1,epi_isl_433853_England_20200408_null_1)Node384,(epi_isl_423061_England_20200323_null_1,epi_isl_433625_Scotland_20200405_null_8,epi_isl_423091_England_20200324_null_1,epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2,epi_isl_434783_Texas_20200318_null_486,epi_isl_422003_England_20200331_null_1,epi_isl_423062_England_20200323_null_1,epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_423743_England_20200323_null_1,epi_isl_425255_England_20200331_null_1,epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1,epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1,(epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7,epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2)Node365,epi_isl_421939_England_20200401_null_2)Node352,(epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2,epi_isl_435391_Utah_20200405_null_12)Node381,epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2,epi_isl_432133_Wales_20200404_null_7,(epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1,epi_isl_434004_England_20200414_null_4)Node524,epi_isl_423709_England_20200323_null_1,(epi_isl_432456_England_20200405_null_1,epi_isl_433900_England_20200410_null_2)Node538,epi_isl_434691_District_of_Columbia_20200322_null_11,(epi_isl_428891_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200325_null_4,epi_isl_433981_England_20200413_null_1)Node548,epi_isl_432466_England_20200401_null_7,(((epi_isl_423870_England_20200318_null_1,epi_isl_423888_England_20200318_null_2)Node555,epi_isl_435141_United_Arab_Emirates_20200312_null_9)Node554,epi_isl_431951_Wales_20200405_null_1)Node553,(epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1,epi_isl_430385_New_York_20200408_null_1)Node561,epi_isl_432265_Wales_20200408_null_5,epi_isl_420634_England_20200320_null_1,epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1,epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1,epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_430477_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1,(epi_isl_433279_Scotland_20200320_null_8,epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1)Node586,epi_isl_435065_Delhi_20200315_null_1,epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1,epi_isl_418732_England_20200313_null_1,(epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1,epi_isl_423426_England_20200330_null_1)Node600,(epi_isl_423453_England_20200329_null_7,epi_isl_434013_England_20200414_null_3)Node596,epi_isl_421906_England_20200327_null_1,epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1,epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1,epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1,(epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4,epi_isl_433804_England_20200406_null_1)Node618,(epi_isl_426108_Washington_20200325_null_17,epi_isl_415519_Noord_Brabant_20200101_null_2,epi_isl_423385_England_20200328_null_1)Node610,(epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1,epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3)Node615,epi_isl_420528_England_20200327_null_1,((epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1,epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2)Node627,epi_isl_421880_England_20200326_null_2)Node626,epi_isl_417242_England_20200303_null_1,epi_isl_423593_England_20200402_null_1,epi_isl_423814_England_20200323_null_1,epi_isl_423967_England_20200320_null_1,epi_isl_424026_England_20200319_null_1,epi_isl_423247_England_20200325_null_1,epi_isl_423282_England_20200326_null_1,epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1,epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1,epi_isl_424131_England_20200321_null_1,epi_isl_424142_England_20200321_null_1,epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1,epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1,epi_isl_424154_England_20200320_null_1,epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_2,epi_isl_432115_Wales_20200407_null_1,epi_isl_433336_Scotland_20200326_null_1,epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_2,epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5,epi_isl_428836_Singapore_20200408_null_1,epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1,epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3,epi_isl_423531_England_20200326_null_1,epi_isl_423549_England_20200331_null_1,epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1,epi_isl_431970_Wales_20200301_null_1,epi_isl_430665_Victoria_20200402_null_1,epi_isl_430671_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1,epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_430577_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1,epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1,epi_isl_430592_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_430613_Victoria_20200410_null_1,epi_isl_435287_Israel_20200301_null_1,epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1,(epi_isl_426507_Arizona_20200318_null_3,epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1)Node727,(epi_isl_423362_England_20200328_null_1,epi_isl_432619_England_20200330_null_10)Node724,(epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1,epi_isl_434617_Occitanie_20200301_null_3)Node721,epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1,epi_isl_432559_England_20200402_null_2,epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1,epi_isl_433275_Scotland_20200319_null_1,(epi_isl_413695_China_20200101_null_1,epi_isl_424868_Louisiana_20200309_null_1)Node710,epi_isl_432548_England_20200329_null_1,epi_isl_428771_New_York_20200405_null_1,epi_isl_432899_Scotland_20200406_null_4,(epi_isl_423409_England_20200330_null_1,epi_isl_435379_Utah_20200405_null_9)Node750,epi_isl_423875_England_20200318_null_2,(epi_isl_418731_England_20200313_null_2,epi_isl_435166_Kinshasa_20200413_null_16)Node745,epi_isl_434998_Texas_20200401_null_7,(epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1,epi_isl_430479_Victoria_20200331_null_1)Node755,epi_isl_433541_Scotland_20200331_null_32,epi_isl_430475_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_433348_Scotland_20200327_null_1,epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5,epi_isl_424148_England_20200320_null_1,(epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1,epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2)Node765,(epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5)Node768,(epi_isl_423570_England_20200401_null_1,epi_isl_430921_Connecticut_20200406_null_1)Node775,epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1,(epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_434943_Texas_20200401_null_8)Node780,epi_isl_435671_California_20200321_null_12217,epi_isl_435143_United_Arab_Emirates_20200318_null_1,epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4,epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1,epi_isl_429774_Luxembourg_20200323_null_1,(epi_isl_421955_England_20200330_null_1,epi_isl_435385_Utah_20200406_null_4)Node798,epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1,epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1,epi_isl_430601_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_434711_Kinshasa_20200408_null_1,epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2,epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2,epi_isl_433809_England_20200407_null_1,epi_isl_420756_England_20200327_null_2,epi_isl_429103_Guangzhou_20200209_null_1,epi_isl_434322_Washington_20200324_null_2,epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1,epi_isl_429621_Washington_20200328_null_4,epi_isl_423147_England_20200323_null_1,epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1,epi_isl_430793_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200301_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node134":"test",
"Node137":"test",
"Node141":"test",
"Node165":"test",
"Node204":"test",
"Node208":"test",
"Node211":"test",
"Node214":"test",
"Node22":"test",
"Node224":"test",
"Node228":"test",
"Node231":"test",
"Node234":"test",
"Node237":"test",
"Node247":"test",
"Node250":"test",
"Node254":"test",
"Node257":"test",
"Node301":"test",
"Node317":"test",
"Node322":"test",
"Node327":"test",
"Node331":"test",
"Node335":"test",
"Node352":"test",
"Node365":"test",
"Node381":"test",
"Node384":"test",
"Node387":"test",
"Node390":"test",
"Node393":"test",
"Node399":"test",
"Node402":"test",
"Node403":"test",
"Node462":"test",
"Node472":"test",
"Node477":"test",
"Node482":"test",
"Node497":"test",
"Node50":"test",
"Node505":"test",
"Node506":"test",
"Node511":"test",
"Node512":"test",
"Node518":"test",
"Node519":"test",
"Node524":"test",
"Node528":"test",
"Node529":"test",
"Node538":"test",
"Node542":"test",
"Node543":"test",
"Node548":"test",
"Node553":"test",
"Node554":"test",
"Node555":"test",
"Node561":"test",
"Node567":"test",
"Node586":"test",
"Node596":"test",
"Node600":"test",
"Node610":"test",
"Node615":"test",
"Node618":"test",
"Node626":"test",
"Node627":"test",
"Node698":"test",
"Node710":"test",
"Node721":"test",
"Node724":"test",
"Node727":"test",
"Node730":"test",
"Node733":"test",
"Node736":"test",
"Node739":"test",
"Node745":"test",
"Node750":"test",
"Node755":"test",
"Node765":"test",
"Node768":"test",
"Node775":"test",
"Node780":"test",
"Node798":"test",
"Node817":"test",
"Node818":"test",
"Node840":"test",
"Node844":"test",
"Node862":"test",
"Node881":"test",
"Node896":"test",
"Node915":"test",
"Node941":"test",
"epi_isl_406036_California_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2":"test",
"epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1":"test",
"epi_isl_413695_China_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_413749_China_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413931_California_20200305_null_2":"test",
"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1":"test",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_415149_England_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_415519_Noord_Brabant_20200101_null_2":"test",
"epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1":"test",
"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4":"test",
"epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1":"test",
"epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_416682_USA_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2":"test",
"epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2":"test",
"epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_417231_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417238_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417261_England_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_417324_California_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417368_USA_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_417424_Kasterlee_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1":"test",
"epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3":"test",
"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_417955_Kinshasa_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_418090_Wales_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_418697_England_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418731_England_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_418732_England_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418768_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_418863_Komen_20200305_null_2":"test",
"epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1":"test",
"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2":"test",
"epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1":"test",
"epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_420060_Ile_de_France_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420078_Thies_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_420328_Alken_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_420528_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420634_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420700_England_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_420756_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3":"test",
"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":"test",
"epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421603_New_York_20200321_null_3":"test",
"epi_isl_421665_India_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_421730_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421827_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421864_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421866_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421880_England_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_421892_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421906_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421915_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_421931_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421939_England_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_421955_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422003_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422051_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4":"test",
"epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4":"test",
"epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423061_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423062_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423089_England_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_423091_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423112_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423121_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423145_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423147_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423155_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423247_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423282_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423312_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423339_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423346_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423362_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423385_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423399_England_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_423404_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423409_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423426_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423453_England_20200329_null_7":"test",
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423549_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423570_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_423593_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_423598_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_423656_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423659_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423709_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423736_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423743_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423758_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423779_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423814_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423870_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423875_England_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_423888_England_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_423907_England_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_423954_England_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_423958_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424026_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424088_England_20200313_null_6":"test",
"epi_isl_424131_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424142_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424144_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424146_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424148_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424154_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7":"test",
"epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9":"test",
"epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7":"test",
"epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2":"test",
"epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3":"test",
"epi_isl_424597_Reykjavik_20200327_null_4":"test",
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_424846_Massachusetts_20200306_null_2":"test",
"epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_424851_Illinois_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_424868_Louisiana_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_2":"test",
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_425255_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425259_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_425435_England_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_425505_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_425990_Scotland_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_426108_Washington_20200325_null_17":"test",
"epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426181_South_Korea_20200223_null_2":"test",
"epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_426507_Arizona_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426716_Victoria_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426814_Victoria_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426877_Victoria_20200328_null_18":"test",
"epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5":"test",
"epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_427388_Liege_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5":"test",
"epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5":"test",
"epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4":"test",
"epi_isl_428695_Madrid_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_428706_Madrid_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_18":"test",
"epi_isl_428771_New_York_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_428836_Singapore_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_428879_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_428891_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_428916_Chechen_Republic_20200326_null_33":"test",
"epi_isl_428923_Sverdlovsk_Region_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_429001_California_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_429011_California_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_429041_California_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_429061_California_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_429103_Guangzhou_20200209_null_1":"test",
"epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_429206_Switzerland_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_429328_Unknown_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_429370_Unknown_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_429621_Washington_20200328_null_4":"test",
"epi_isl_429636_Washington_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_429643_USA_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_429650_Washington_20200402_null_6":"test",
"epi_isl_429674_Minas_gerais_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_429696_Minas_gerais_20200317_null_21":"test",
"epi_isl_429702_Minas_gerais_20200322_null_4":"test",
"epi_isl_429774_Luxembourg_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_429780_Luxembourg_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_430129_Washington_20200306_null_4":"test",
"epi_isl_430137_Washington_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_430152_Washington_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_430200_Washington_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_430290_Washington_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_430340_New_York_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_430379_New_York_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_430385_New_York_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_6":"test",
"epi_isl_430423_New_York_20200411_null_3":"test",
"epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_1":"test",
"epi_isl_430467_West_Bengal_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_430475_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430477_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430479_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_430552_Victoria_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_430577_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430592_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430601_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430610_Victoria_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_430613_Victoria_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430619_Victoria_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_430660_Victoria_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_430665_Victoria_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_430671_Victoria_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_4":"test",
"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_430793_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_430805_Buenos_Aires_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_430815_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200418_null_1":"test",
"epi_isl_430911_Washington_20200408_null_15":"test",
"epi_isl_430921_Connecticut_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430976_Washington_20200403_null_7":"test",
"epi_isl_431092_Cincinnati_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_431782_Fujian_20200322_null_7":"test",
"epi_isl_431916_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_431950_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_431951_Wales_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_431962_Wales_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_431970_Wales_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_431974_Wales_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_431988_Wales_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_432000_Wales_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_432013_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_432016_Wales_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_432022_Wales_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_432027_Wales_20200407_null_4":"test",
"epi_isl_432054_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_432067_Wales_20200327_null_12":"test",
"epi_isl_432115_Wales_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_432133_Wales_20200404_null_7":"test",
"epi_isl_432198_Wales_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_432265_Wales_20200408_null_5":"test",
"epi_isl_432286_Wales_20200408_null_5":"test",
"epi_isl_432291_Wales_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_432416_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_432448_Wales_20200401_null_7":"test",
"epi_isl_432456_England_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_432466_England_20200401_null_7":"test",
"epi_isl_432548_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_432559_England_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_432566_England_20200403_null_10":"test",
"epi_isl_432619_England_20200330_null_10":"test",
"epi_isl_432847_England_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_432899_Scotland_20200406_null_4":"test",
"epi_isl_432999_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_433206_Scotland_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_433232_Scotland_20200402_null_6":"test",
"epi_isl_433275_Scotland_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_433279_Scotland_20200320_null_8":"test",
"epi_isl_433303_Scotland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_433336_Scotland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_433348_Scotland_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_433353_Scotland_20200326_null_15":"test",
"epi_isl_433391_Scotland_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_433448_Scotland_20200412_null_4":"test",
"epi_isl_433527_Scotland_20200331_null_28":"test",
"epi_isl_433541_Scotland_20200331_null_32":"test",
"epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_433574_Scotland_20200401_null_10":"test",
"epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_433620_Scotland_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_433625_Scotland_20200405_null_8":"test",
"epi_isl_433652_Scotland_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_433673_England_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_433687_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_433696_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_433711_England_20200404_null_5":"test",
"epi_isl_433741_England_20200326_null_18":"test",
"epi_isl_433771_England_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_433804_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_433809_England_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_433832_England_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_433853_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_433866_England_20200408_null_3":"test",
"epi_isl_433888_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_433895_England_20200410_null_49":"test",
"epi_isl_433900_England_20200410_null_2":"test",
"epi_isl_433902_England_20200409_null_2":"test",
"epi_isl_433904_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_433908_England_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_433922_England_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_433981_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_434004_England_20200414_null_4":"test",
"epi_isl_434007_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_434013_England_20200414_null_3":"test",
"epi_isl_434084_Washington_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_434085_Washington_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_434087_Washington_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_434119_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_434170_Washington_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_434226_Washington_20200401_null_9":"test",
"epi_isl_434241_Washington_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_434268_Washington_20200330_null_4":"test",
"epi_isl_434299_Washington_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_434322_Washington_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_434327_Washington_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_434514_Luxembourg_20200416_null_3":"test",
"epi_isl_434515_Luxembourg_20200415_null_13":"test",
"epi_isl_434544_Puerto_Rico_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_2":"test",
"epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_5":"test",
"epi_isl_434617_Occitanie_20200301_null_3":"test",
"epi_isl_434657_Skane_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_434683_Virginia_20200314_null_8":"test",
"epi_isl_434691_District_of_Columbia_20200322_null_11":"test",
"epi_isl_434711_Kinshasa_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_434742_Texas_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_434772_Texas_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_434783_Texas_20200318_null_486":"test",
"epi_isl_434821_Texas_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_434845_Texas_20200322_null_69":"test",
"epi_isl_434878_Texas_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_434943_Texas_20200401_null_8":"test",
"epi_isl_434946_Texas_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_434997_Texas_20200331_null_16":"test",
"epi_isl_434998_Texas_20200401_null_7":"test",
"epi_isl_435017_Texas_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_435025_Texas_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_435037_Louisiana_20200413_null_2":"test",
"epi_isl_435038_Louisiana_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_435040_Louisiana_20200415_null_2":"test",
"epi_isl_435042_Louisiana_20200415_null_7":"test",
"epi_isl_435045_Nur_Sultan_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_435052_Gujarat_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_435065_Delhi_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_435082_Uttar_Pradesh_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_6":"test",
"epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_435121_United_Arab_Emirates_20200225_null_1":"test",
"epi_isl_435141_United_Arab_Emirates_20200312_null_9":"test",
"epi_isl_435143_United_Arab_Emirates_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_435147_Abruzzo_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_435151_Abruzzo_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_435160_Kinshasa_20200412_null_3":"test",
"epi_isl_435166_Kinshasa_20200413_null_16":"test",
"epi_isl_435287_Israel_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_435379_Utah_20200405_null_9":"test",
"epi_isl_435380_Utah_20200405_null_1067":"test",
"epi_isl_435385_Utah_20200406_null_4":"test",
"epi_isl_435391_Utah_20200405_null_12":"test",
"epi_isl_435406_Baranya_20200322_null_5":"test",
"epi_isl_435416_Baranya_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_435431_Kecskemet_20200325_null_118":"test",
"epi_isl_435444_Alaska_20200409_null_6":"test",
"epi_isl_435459_Louisiana_20200402_null_6":"test",
"epi_isl_435466_Louisiana_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_435467_Louisiana_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_435474_California_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_435482_New_York_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_435522_New_York_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_435527_New_York_20200420_null_26":"test",
"epi_isl_435530_New_York_20200416_null_7":"test",
"epi_isl_435542_New_York_20200422_null_1":"test",
"epi_isl_435594_California_20200304_null_12":"test",
"epi_isl_435620_California_20200309_null_3":"test",
"epi_isl_435631_California_20200311_null_6":"test",
"epi_isl_435640_California_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_435668_California_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_435671_California_20200321_null_12217":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":28
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":30
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":59
}
}
}