{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[244.094817779426, 618.0198394115838, 0, 1, 0.2831349818071176, 0, 0.001618071033046608, 0.008960545009209266, 0.7168650181928824, 1, 0.001135823649667784],
[244.1144755403904, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2831993550501488, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523640547286, 1, 0.2831993550501488, 0.001135823654698502],
[244.1144755403904, 618.0001816506194, 1, 0, 0.2831577836012878, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523640547286, 1, 0.2831577836012877, 0.001135823642690323],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001135565722045713],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001134918830668533],
[244.2410272247236, 617.8210538715164, 0, 1, 0.28332185416871, 0, 0.001618591651633747, 0.008963428088003347, 0.71667814583129, 1, 0.001135823640237235],
[244.3872366700213, 617.7274205209885, 0, 1, 0.2834741697424533, 0, 0.001618836993113572, 0.008964786738722441, 0.7165258302575467, 1, 0.001134871782383348],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[242.8087960769543, 616.2729427802502, 0, 1, 0.2826375944155806, 0, 0.001622657641740047, 0.00898594470600738, 0.7173624055844194, 1, 0.001136010325267013],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001138546577540226],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001135917850429482],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823640171549],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001134871778482942],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135870737436869],
[244.2739455585289, 617.840711632481, 0, 1, 0.2833427590181983, 0, 0.001618540153104777, 0.008963142899728343, 0.7166572409818017, 1, 0.001134588552499995],
[244.1144755403904, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2831993550501488, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523640547286, 1, 0.2831993550501488, 0.001135823643376504],
[243.3461794142631, 616.5472111130273, 0, 1, 0.2829957551656981, 0, 0.001621935809578542, 0.008981947347770216, 0.7170042448343019, 1, 0.001136905096208075],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.2410272247236, 618.2629966344265, 0, 1, 0.2831766814627743, 0, 0.001617434660401149, 0.008957020908217523, 0.7168233185372257, 1, 0.001136304791746017],
[244.4921358605307, 617.8016491095821, 1, 0, 0.2835369338409471, 0.004090111105129552, 0, -0.02265019514079907, 1, 0.283536933840947, 0.001134952815520469],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001135823661223132],
[244.7410272247236, 617.3736299662862, 0, 1, 0.2838845450350566, 0, 0.001619764679703939, 0.008969924076501597, 0.7161154549649434, 1, 0.001134902069135898],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001135870713490504],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001134588561697112],
[244.3675789090568, 617.747078281953, 1, 0, 0.283451367948283, 0.004092195881566423, 0, -0.02266174020446759, 1, 0.2834513679482831, 0.001134952749304588],
[244.2410272247236, 617.8210538715164, 0, 1, 0.28332185416871, 0, 0.001618591651633747, 0.008963428088003347, 0.71667814583129, 1, 0.00113458866372552],
[244.3675789090568, 617.747078281953, 1, 0, 0.283451367948283, 0.004092195881566423, 0, -0.02266174020446759, 1, 0.2834513679482831, 0.001134902088675728],
[243.7410272247236, 618.3736299662862, 0, 1, 0.2827246065145143, 0, 0.001617145284889526, 0.008955418406075465, 0.7172753934854857, 1, 0.001135823668271695],
[244.2936033194934, 617.8210538715165, 0, 1, 0.2833655608123685, 0, 0.001618591651633747, 0.008963428088003345, 0.7166344391876315, 1, 0.001139231741624099],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001139363672820193],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.3461794142631, 615.7684777767466, 1, 0, 0.28325227299685, 0.004109372098658013, 0, -0.02275685856651339, 1, 0.2832522729968501, 0.001135999909274125],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.3461794142631, 615.7684777767466, 1, 0, 0.28325227299685, 0.004109372098658013, 0, -0.02275685856651339, 1, 0.2832522729968501, 0.001135383968839313],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001134616852430041],
[244.3655841761976, 617.7490730148122, 0, 1, 0.2834490541808014, 0, 0.001618780251858059, 0.008964472517304764, 0.7165509458191985, 1, 0.001135656445681752],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823649724051],
[244.5711650990484, 617.5764104257668, 1, 0, 0.2836766837164398, 0.004088789451507957, 0, -0.02264287609452667, 1, 0.2836766837164398, 0.001134952776607329],
[244.2654856356123, 617.9072287924874, 0, 1, 0.2833138668713722, 0, 0.001618365918706271, 0.008962178025419319, 0.7166861331286278, 1, 0.001134588654768783],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001134902088154127],
[244.0618994456206, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001135823677146198],
[244.1164702732496, 617.9401296806702, 0, 1, 0.2831791674540843, 0, 0.001618279752306692, 0.008961700853598093, 0.7168208325459158, 1, 0.001136743099966569],
[243.8655841761976, 618.2490730148122, 0, 1, 0.2828690849205303, 0, 0.001617471086731483, 0.008957222629752496, 0.7171309150794698, 1, 0.001135919085580389],
[244.3075269391076, 617.8651874889921, 0, 1, 0.2833626289149765, 0, 0.00161847603692321, 0.008962787837485083, 0.7166373710850236, 1, 0.001134871788391818],
[244.2410272247236, 618.0772161562778, 1, 0, 0.2832376899125972, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2832376899125972, 0.001134871788391818],
[244.3675789090568, 617.747078281953, 1, 0, 0.283451367948283, 0.004092195881566423, 0, -0.02266174020446759, 1, 0.2834513679482831, 0.00113495280178679],
[244.2654856356123, 618.2965954606278, 0, 1, 0.2831859769735907, 0, 0.001617346767460372, 0.008956534175165802, 0.7168140230264093, 1, 0.001134588651264037],
[244.1829699876337, 618.0772161562778, 0, 1, 0.2831894292599049, 0, 0.001617920825845738, 0.008959713192585268, 0.7168105707400951, 1, 0.00113565646397172],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.1617930315951, 616.0109213965046, 0, 1, 0.2830185234565479, 0, 0.001623347842166479, 0.008989766894193252, 0.7169814765434521, 1, 0.001134797194574002],
[244.3075269391076, 617.8071302519022, 0, 1, 0.2833817113551045, 0, 0.001618628130096627, 0.008963630098237649, 0.7166182886448955, 1, 0.001134677997016775],
[244.3675789090568, 617.747078281953, 1, 0, 0.283451367948283, 0.004092195881566423, 0, -0.02266174020446759, 1, 0.2834513679482831, 0.001134902046677428],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 2, 0, 0.2833045757747854, 0.008188632445276366, 0, -0.04534696443555743, 1, 0.08026148265493105, 0.002273707169726762],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001135397815317865],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001134871788391818],
[244.161997986206, 617.9526592048038, 1, 0, 0.2832129067167797, 0.004095641452182479, 0, -0.02268082106677649, 1, 0.2832129067167797, 0.001134918834706067],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001134588596696078],
[243.9899185889165, 617.9456108229904, 1, 0, 0.2830721211311352, 0.00409852999576117, 0, -0.0226968172277727, 1, 0.2830721211311352, 0.001135823661237967],
[244.094817779426, 618.0198394115838, 0, 1, 0.2831349818071176, 0, 0.001618071033046608, 0.008960545009209266, 0.7168650181928824, 1, 0.001135823684735976],
[244.0618994456206, 618.0198394115838, 0, 1, 0.2831076085304333, 0, 0.001618071033046608, 0.008960545009209266, 0.7168923914695667, 1, 0.00113553309515818],
[244.0618994456206, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001135812259608159],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001135823647220118],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001134902088086772],
[244.1884511299538, 617.926206061056, 0, 1, 0.2832435907372023, 0, 0.001618316216712117, 0.008961902785985097, 0.7167564092627976, 1, 0.001135870720524237],
[244.5618994456207, 618.1126670316006, 0, 1, 0.2834926505881616, 0, 0.001617828032553288, 0.008959199322392567, 0.7165073494118384, 1, 0.001134588561630248],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.00113565646397172],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 2, 0.2833045757747854, 0, 0.003236907844908559, 0.01792533074419746, 0.5136523311053603, 1, 0.002272194026223959],
[244.2955980523526, 617.6154729486657, 0, 1, 0.2834348069907365, 0, 0.001619130419815627, 0.008966411675524947, 0.7165651930092636, 1, 0.00113911009176705],
[243.9108893503988, 618.1708495068057, 1, 0, 0.2829324394154697, 0.004099857954941137, 0, -0.02270417119293212, 1, 0.2829324394154697, 0.001135823661223132],
[244.3675789090568, 617.747078281953, 1, 0, 0.283451367948283, 0.004092195881566423, 0, -0.02266174020446759, 1, 0.2834513679482831, 0.001134952781183702],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.00113458865382017],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.00113565646397172],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001134871782892095],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135819260453782],
[244.2410272247236, 617.6945021871833, 0, 1, 0.2833634522426146, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264492436151, 0.7166365477573854, 1, 0.001135533970249725],
[244.1144755403904, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2831993550501488, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523640547286, 1, 0.2831993550501488, 0.001135823642675486],
[244.1144755403904, 618.0001816506193, 1, 0, 0.2831577836012879, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523640547286, 1, 0.283157783601288, 0.001135823642675486],
[244.1884511299538, 617.926206061056, 0, 1, 0.2832435907372023, 0, 0.001618316216712117, 0.008961902785985097, 0.7167564092627976, 1, 0.001135870722986864],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001134588540925615],
[244.1144755403904, 618.0001816506193, 1, 0, 0.2831577836012879, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523640547286, 1, 0.283157783601288, 0.001135823647845551],
[244.4201550038266, 617.6945021871833, 0, 1, 0.2835123529858661, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264492436151, 0.7164876470141339, 1, 0.001134871781343312],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.6884511299538, 615.426206061056, 0, 1, 0.2836506735046587, 0, 0.001624890182042054, 0.008998308055608504, 0.7163493264953413, 1, 0.001137511815322845],
[243.2410272247236, 615.8736299662862, 0, 1, 0.2831298770062108, 0, 0.001623709721188649, 0.008991770905883607, 0.7168701229937892, 1, 0.001137302669716684],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.1884511299538, 617.926206061056, 0, 1, 0.2832435907372023, 0, 0.001618316216712117, 0.008961902785985097, 0.7167564092627976, 1, 0.001135741472785704],
[244.537441034732, 617.5191589191878, 0, 1, 0.2836675005420798, 0, 0.001619382954449946, 0.00896781016045607, 0.7163324994579202, 1, 0.001138858617184151],
[244.094817779426, 618.0198394115838, 0, 1, 0.2831349818071176, 0, 0.001618071033046608, 0.008960545009209266, 0.7168650181928824, 1, 0.001135823647845551],
[244.3781137003312, 617.7365434906786, 0, 1, 0.2834635876584881, 0, 0.001618813085509308, 0.008964654343320942, 0.7165364123415119, 1, 0.001134918841811914],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001135565753157513],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823654698502],
[244.1144755403904, 618.0001816506194, 1, 0, 0.2831577836012878, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523640547286, 1, 0.2831577836012877, 0.001135823652235999],
[244.3200564632412, 617.6483912824709, 1, 0, 0.2834443152788322, 0.004092991850427365, 0, -0.02266614811651764, 1, 0.2834443152788322, 0.001135703538675305],
[243.9236414132875, 618.2490730148122, 0, 1, 0.2829173752907363, 0, 0.001617471086731483, 0.008957222629752496, 0.7170826247092636, 1, 0.001134588536270231],
[244.161997986206, 618.0107164418938, 1, 0, 0.2831938356436675, 0.004095641452182479, 0, -0.02268082106677649, 1, 0.2831938356436675, 0.001134871787400167],
[243.9899185889165, 617.9456108229904, 1, 0, 0.2830721211311352, 0.00409852999576117, 0, -0.0226968172277727, 1, 0.2830721211311352, 0.001135823661924151],
[244.1144755403904, 618.0001816506193, 1, 0, 0.2831577836012879, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523640547286, 1, 0.283157783601288, 0.001135870722986864],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001134588564152024],
[244.161997986206, 618.0988686501015, 1, 0, 0.2831648836606555, 0.004095641452182479, 0, -0.02268082106677649, 1, 0.2831648836606555, 0.001134871787400167],
[244.2410272247236, 617.8210538715165, 0, 1, 0.28332185416871, 0, 0.001618591651633747, 0.008963428088003345, 0.71667814583129, 1, 0.001136048912678273],
[243.1670516351602, 615.9476055558496, 0, 1, 0.2830437702346126, 0, 0.001623514712907391, 0.00899069099007911, 0.7169562297653873, 1, 0.001134670848680308],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001135026865007562],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001136079218078839],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823661223132],
[244.4921358605308, 617.8016491095821, 1, 0, 0.2835369338409471, 0.004090111105129551, 0, -0.02265019514079906, 1, 0.2835369338409471, 0.0011349020737976],
[244.094817779426, 618.0198394115838, 0, 1, 0.2831349818071176, 0, 0.001618071033046608, 0.008960545009209266, 0.7168650181928824, 1, 0.001135870745928618],
[244.216568813835, 617.6945021871833, 0, 1, 0.283343116280202, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264492436151, 0.716656883719798, 1, 0.001135565718635181],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.00113565646397172],
[244.6164702732496, 617.4981869177602, 0, 1, 0.2837400666290406, 0, 0.001619437953318529, 0.008968114732892834, 0.7162599333709594, 1, 0.001134871773396545],
[244.2654856356122, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2832660534675566, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7167339465324434, 1, 0.001134588494601406],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[242.595293317211, 616.5852005414094, 0, 1, 0.2823566119706746, 0, 0.001621835877867199, 0.008981393946480011, 0.7176433880293254, 1, 0.001134851226549026],
[243.8655841761976, 618.2819913486175, 1, 1, 0.2828582844738028, 0.004100619623626271, 0.001617384969953219, -0.0137516434249303, 0.9199911909045373, 0.4857077598521429, 0.002272583467989665],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001136067027764576],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.00113565646397172],
[244.0618994456206, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001135870734566468],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001134588550595813],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.0011349020737976],
[244.4181602709673, 617.6964969200425, 0, 1, 0.2835100392183845, 0, 0.00161891803658625, 0.008965235540826802, 0.7164899607816155, 1, 0.001134871788391818],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135870706503672],
[243.6237411938181, 618.5238343309969, 0, 1, 0.2825777721934868, 0, 0.001616752572003329, 0.008953243642779791, 0.7174222278065132, 1, 0.001138858625168684],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823652235999],
[243.8655841761976, 618.2490730148122, 0, 1, 0.2828690849205303, 0, 0.001617471086731483, 0.008957222629752496, 0.7171309150794698, 1, 0.00113582365217172],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001134952766830475],
[244.594817779426, 617.5198394115838, 0, 1, 0.2837149510673888, 0, 0.001619381169927868, 0.008967800278139367, 0.7162850489326112, 1, 0.00113458864597344],
[244.1164702732496, 617.9981869177601, 0, 1, 0.2831600973687695, 0, 0.001618127724593268, 0.008960858955349522, 0.7168399026312305, 1, 0.001134871788391818],
[244.1884511299538, 617.926206061056, 0, 1, 0.2832435907372023, 0, 0.001618316216712117, 0.008961902785985097, 0.7167564092627977, 1, 0.001135656469434532],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001135870732038155],
[244.2410272247236, 617.6945021871833, 0, 1, 0.2833634522426146, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264492436151, 0.7166365477573854, 1, 0.001134588568806096],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001134902073715049],
[244.1144755403904, 618.0001816506194, 1, 0, 0.2831577836012878, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523640547286, 1, 0.2831577836012877, 0.001135823654698502],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823652250837],
[244.0618994456206, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001134588536270231],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135703554583335],
[243.8655841761976, 618.2490730148122, 0, 1, 0.2828690849205303, 0, 0.001617471086731483, 0.008957222629752496, 0.7171309150794698, 1, 0.001135823647845551],
[243.1881209372278, 616.2189551443772, 0, 1, 0.2829719788275701, 0, 0.001622799804601442, 0.008986731974731772, 0.7170280211724299, 1, 0.001134514423941637],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.161997986206, 618.0988686501015, 1, 0, 0.2831648836606555, 0.004095641452182479, 0, -0.02268082106677649, 1, 0.2831648836606555, 0.001135140389778197],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001138590850342805],
[243.8655841761976, 618.2490730148122, 0, 1, 0.2828690849205303, 0, 0.001617471086731483, 0.008957222629752496, 0.7171309150794698, 1, 0.001135823652235999],
[244.0618994456206, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001135823647845551],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001135703563171325],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.00113556569559573],
[243.7410272247236, 618.3736299662862, 0, 1, 0.2827246065145143, 0, 0.001617145284889526, 0.008955418406075465, 0.7172753934854857, 1, 0.001135823661732235],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823689144962],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001136744009318416],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001135932153238581],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823652235999],
[244.3200564632413, 617.7946007277685, 1, 0, 0.2833962448327912, 0.004092991850427365, 0, -0.02266614811651764, 1, 0.2833962448327911, 0.001135703571113324],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135565690050367],
[244.4373424941467, 617.55076301253, 0, 1, 0.2835739158494147, 0, 0.001619300080080559, 0.008967351219221825, 0.7164260841505854, 1, 0.001135823661223132],
[244.4201550038266, 617.6945021871833, 0, 1, 0.2835123529858661, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264492436151, 0.7164876470141339, 1, 0.001134871784895548],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001134966052886312],
[243.6304593829056, 615.4841978081041, 0, 1, 0.2835831717497266, 0, 0.001624737082708629, 0.008997460222948492, 0.7164168282502734, 1, 0.001133720499516433],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.4513316038027, 615.6633255872071, 0, 1, 0.2833746689874893, 0, 0.001624264364043807, 0.008994842404084965, 0.7166253310125108, 1, 0.001134658467510542],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.2936033194934, 617.8210538715164, 0, 1, 0.2833655608123686, 0, 0.001618591651633747, 0.008963428088003347, 0.7166344391876314, 1, 0.001138144930390134],
[244.4201550038266, 617.6945021871833, 0, 1, 0.2835123529858661, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264492436151, 0.7164876470141339, 1, 0.001134989908298318],
[244.161997986206, 617.9526592048038, 1, 0, 0.2832129067167797, 0.004095641452182478, 0, -0.02268082106677648, 1, 0.2832129067167797, 0.001134871766348038],
[244.6183496702608, 617.496307520749, 1, 2, 0.2837422466140292, 0.004088000762608259, 0.003238885764402399, -0.00470222444134138, 0.8041589974907493, 0.6325417448170976, 0.003422556996402249],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135278070570315],
[243.2125793481165, 615.9601350799833, 0, 1, 0.2830776341751131, 0, 0.001623481688259174, 0.008990508106360954, 0.7169223658248869, 1, 0.001134793800394788],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.161997986206, 617.9526592048039, 1, 0, 0.2832129067167797, 0.004095641452182478, 0, -0.02268082106677648, 1, 0.2832129067167797, 0.001134674472398249],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001134902037848098]
],
"NAMES": [
["epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1"],
["epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_4"],
["epi_isl_420759_England_20200326_null_2"],
["epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1"],
["epi_isl_434622_Occitanie_20200301_null_1"],
["epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1"],
["epi_isl_434024_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_429598_Washington_20200331_null_3"],
["epi_isl_429607_Washington_20200331_null_6"],
["Node298"],
["epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1"],
["epi_isl_423319_England_20200326_null_2"],
["epi_isl_421552_Wyoming_20200319_null_1"],
["epi_isl_416401_Shanghai_20200202_null_2"],
["epi_isl_422507_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_428773_New_York_20200405_null_2"],
["epi_isl_422957_Zuid_Holland_20200329_null_1"],
["epi_isl_422958_Zuid_Holland_20200329_null_10"],
["Node276"],
["epi_isl_434941_Texas_20200401_null_1"],
["epi_isl_430892_Washington_20200312_null_3"],
["epi_isl_420270_South_Yorkshire_20200322_null_9"],
["epi_isl_433194_Scotland_20200419_null_1"],
["epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1"],
["epi_isl_432378_Wales_20200408_null_1"],
["epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1"],
["epi_isl_422804_Netherlands_20200307_null_3"],
["epi_isl_430918_Washington_20200406_null_1"],
["epi_isl_424185_USA_20200318_null_1"],
["epi_isl_418252_Madrid_20200304_null_1"],
["epi_isl_431784_Fujian_20200318_null_13845"],
["epi_isl_420282_South_Yorkshire_20200321_null_1"],
["epi_isl_430881_USA_20200313_null_10"],
["Node240"],
["epi_isl_422886_Noord_Brabant_20200324_null_2"],
["Node239"],
["epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2"],
["epi_isl_428789_New_York_20200406_null_2"],
["epi_isl_417538_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_14"],
["epi_isl_422875_Noord_Brabant_20200311_null_3"],
["epi_isl_420943_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1"],
["epi_isl_427380_Liege_20200408_null_2"],
["epi_isl_430742_Beijing_20200129_null_28"],
["epi_isl_421236_Hangzhou_20200120_null_2"],
["epi_isl_414007_England_20200228_null_3"],
["epi_isl_430324_New_York_20200410_null_2"],
["epi_isl_425130_Duesseldorf_20200321_null_4"],
["epi_isl_427527_New_York_20200312_null_1"],
["epi_isl_429640_Connecticut_20200407_null_1"],
["Node199"],
["epi_isl_428306_Wisconsin_20200324_null_1"],
["epi_isl_402121_Hubei_20191230_null_1"],
["epi_isl_425896_Scotland_20200322_null_3"],
["epi_isl_420841_Sud_Kivu_20200322_null_1"],
["epi_isl_418022_Portugal_20200315_null_1"],
["epi_isl_426914_Victoria_20200329_null_4"],
["epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_2"],
["epi_isl_428286_Wisconsin_20200323_null_3"],
["epi_isl_428957_Luxembourg_20200407_null_5"],
["epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_1"],
["epi_isl_423969_England_20200320_null_2"],
["epi_isl_421969_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_417388_New_South_Wales_20200305_null_4"],
["epi_isl_424973_Taoyuan_20200317_null_1"],
["epi_isl_423092_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1"],
["epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_2"],
["epi_isl_427032_Victoria_20200330_null_1"],
["epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_2"],
["epi_isl_430394_New_Jersey_20200409_null_2"],
["epi_isl_422849_Netherlands_20200316_null_1"],
["epi_isl_427158_Victoria_20200330_null_1"],
["epi_isl_417005_Li_ge_20200305_null_2"],
["epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1"],
["epi_isl_423829_England_20200323_null_7"],
["epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_6"],
["epi_isl_415622_Washington_20200309_null_1"],
["epi_isl_418405_Finland_20200314_null_2"],
["epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_5"],
["epi_isl_434370_Antwerp_20200405_null_1"],
["epi_isl_428717_Kocaeli_20200319_null_1"],
["epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_3"],
["Node174"],
["epi_isl_434077_Washington_20200404_null_2"],
["Node173"],
["epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1"],
["epi_isl_422119_Wales_20200327_null_9"],
["epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_2"],
["epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_1"],
["epi_isl_423903_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_425797_Scotland_20200306_null_5"],
["epi_isl_416703_Washington_20200313_null_2"],
["epi_isl_425645_England_20200318_null_14"],
["epi_isl_423107_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_419840_Victoria_20200316_null_1"],
["epi_isl_432403_Wales_20200330_null_3"],
["epi_isl_427775_New_South_Wales_20200325_null_11"],
["epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1"],
["epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_414590_Minnesota_20200309_null_1"],
["epi_isl_416346_Shanghai_20200130_null_1"],
["Node72"],
["epi_isl_414588_Minnesota_20200305_null_1"],
["epi_isl_430867_Washington_20200311_null_1"],
["epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_433696_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_416704_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1"],
["epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_1"],
["epi_isl_424140_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_433827_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_433893_England_20200410_null_1"],
["Node121"],
["epi_isl_429315_Unknown_20200318_null_4"],
["epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_432276_Wales_20200407_null_2"],
["epi_isl_425919_Scotland_20200324_null_7"],
["epi_isl_423445_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1"],
["epi_isl_430802_Buenos_Aires_20200331_null_1"],
["epi_isl_423217_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_426086_Washington_20200325_null_3"],
["epi_isl_415453_Wales_20200310_null_1"],
["epi_isl_429129_Norrbotten_20200327_null_5"],
["epi_isl_430398_New_York_20200410_null_1"],
["epi_isl_419936_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_418692_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_424099_England_20200313_null_1"],
["epi_isl_430234_Washington_20200319_null_1"],
["epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_9"],
["epi_isl_427080_Victoria_20200323_null_11"],
["epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1"],
["epi_isl_402127_Hubei_20191230_null_1"],
["epi_isl_428922_Sverdlovsk_Region_20200330_null_6"],
["epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1"],
["epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_4"],
["Node21"],
["epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1"],
["epi_isl_424440_Reykjavik_20200319_null_2"],
["epi_isl_420687_England_20200328_null_3"],
["epi_isl_415742_Taoyuan_20200227_null_1"],
["epi_isl_418992_Singapore_20200210_null_1"],
["epi_isl_425672_Scotland_20200311_null_3"],
["epi_isl_427717_New_South_Wales_20200317_null_1"],
["epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_1"],
["epi_isl_421414_New_York_20200318_null_2"],
["epi_isl_420179_South_Yorkshire_20200327_null_1"],
["epi_isl_432352_Wales_20200327_null_3"],
["epi_isl_416153_Copenhagen_20200302_null_1"],
["epi_isl_429467_Unknown_20200323_null_2"],
["epi_isl_434340_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_418357_Ontario_20200312_null_1"],
["epi_isl_426161_Iowa_20200406_null_1"],
["epi_isl_429844_Iowa_20200409_null_1"],
["Node52"],
["epi_isl_430719_Madrid_20200311_null_2"],
["Node51"],
["epi_isl_430639_Victoria_20200326_null_45"],
["epi_isl_419884_Victoria_20200319_null_1"],
["epi_isl_426054_Connecticut_20200330_null_1"],
["epi_isl_428346_Istanbul_20200417_null_29"],
["epi_isl_432745_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_432942_England_20200330_null_1"],
["Node97"],
["epi_isl_422534_New_York_20200319_null_3"]
],
"RESOLVED": [
[244.094817779426, 618.0198394115838, 0, 1, 0.2831349818071176, 0, 0.001618071033046608, 0.008960545009209266, 0.7168650181928824, 1, 0.001135823649667784],
[244.1144755403904, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2831993550501488, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523640547286, 1, 0.2831993550501488, 0.001135823654698502],
[244.1144755403904, 618.0001816506194, 1, 0, 0.2831577836012878, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523640547286, 1, 0.2831577836012877, 0.001135823642690323],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001135565722045713],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001134918830668533],
[244.2410272247236, 617.8210538715164, 0, 1, 0.28332185416871, 0, 0.001618591651633747, 0.008963428088003347, 0.71667814583129, 1, 0.001135823640237235],
[244.3872366700213, 617.7274205209885, 0, 1, 0.2834741697424533, 0, 0.001618836993113572, 0.008964786738722441, 0.7165258302575467, 1, 0.001134871782383348],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[242.8087960769543, 616.2729427802502, 0, 1, 0.2826375944155806, 0, 0.001622657641740047, 0.00898594470600738, 0.7173624055844194, 1, 0.001136010325267013],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001138546577540226],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001135917850429482],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823640171549],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001134871778482942],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135870737436869],
[244.2739455585289, 617.840711632481, 0, 1, 0.2833427590181983, 0, 0.001618540153104777, 0.008963142899728343, 0.7166572409818017, 1, 0.001134588552499995],
[244.1144755403904, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2831993550501488, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523640547286, 1, 0.2831993550501488, 0.001135823643376504],
[243.3461794142631, 616.5472111130273, 0, 1, 0.2829957551656981, 0, 0.001621935809578542, 0.008981947347770216, 0.7170042448343019, 1, 0.001136905096208075],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.2410272247236, 618.2629966344265, 0, 1, 0.2831766814627743, 0, 0.001617434660401149, 0.008957020908217523, 0.7168233185372257, 1, 0.001136304791746017],
[244.4921358605307, 617.8016491095821, 1, 0, 0.2835369338409471, 0.004090111105129552, 0, -0.02265019514079907, 1, 0.283536933840947, 0.001134952815520469],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001135823661223132],
[244.7410272247236, 617.3736299662862, 0, 1, 0.2838845450350566, 0, 0.001619764679703939, 0.008969924076501597, 0.7161154549649434, 1, 0.001134902069135898],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001135870713490504],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001134588561697112],
[244.3675789090568, 617.747078281953, 1, 0, 0.283451367948283, 0.004092195881566423, 0, -0.02266174020446759, 1, 0.2834513679482831, 0.001134952749304588],
[244.2410272247236, 617.8210538715164, 0, 1, 0.28332185416871, 0, 0.001618591651633747, 0.008963428088003347, 0.71667814583129, 1, 0.00113458866372552],
[244.3675789090568, 617.747078281953, 1, 0, 0.283451367948283, 0.004092195881566423, 0, -0.02266174020446759, 1, 0.2834513679482831, 0.001134902088675728],
[243.7410272247236, 618.3736299662862, 0, 1, 0.2827246065145143, 0, 0.001617145284889526, 0.008955418406075465, 0.7172753934854857, 1, 0.001135823668271695],
[244.2936033194934, 617.8210538715165, 0, 1, 0.2833655608123685, 0, 0.001618591651633747, 0.008963428088003345, 0.7166344391876315, 1, 0.001139231741624099],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001139363672820193],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.3461794142631, 615.7684777767466, 1, 0, 0.28325227299685, 0.004109372098658013, 0, -0.02275685856651339, 1, 0.2832522729968501, 0.001135999909274125],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.3461794142631, 615.7684777767466, 1, 0, 0.28325227299685, 0.004109372098658013, 0, -0.02275685856651339, 1, 0.2832522729968501, 0.001135383968839313],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001134616852430041],
[244.3655841761976, 617.7490730148122, 0, 1, 0.2834490541808014, 0, 0.001618780251858059, 0.008964472517304764, 0.7165509458191985, 1, 0.001135656445681752],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823649724051],
[244.5711650990484, 617.5764104257668, 1, 0, 0.2836766837164398, 0.004088789451507957, 0, -0.02264287609452667, 1, 0.2836766837164398, 0.001134952776607329],
[244.2654856356123, 617.9072287924874, 0, 1, 0.2833138668713722, 0, 0.001618365918706271, 0.008962178025419319, 0.7166861331286278, 1, 0.001134588654768783],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001134902088154127],
[244.0618994456206, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001135823677146198],
[244.1164702732496, 617.9401296806702, 0, 1, 0.2831791674540843, 0, 0.001618279752306692, 0.008961700853598093, 0.7168208325459158, 1, 0.001136743099966569],
[243.8655841761976, 618.2490730148122, 0, 1, 0.2828690849205303, 0, 0.001617471086731483, 0.008957222629752496, 0.7171309150794698, 1, 0.001135919085580389],
[244.3075269391076, 617.8651874889921, 0, 1, 0.2833626289149765, 0, 0.00161847603692321, 0.008962787837485083, 0.7166373710850236, 1, 0.001134871788391818],
[244.2410272247236, 618.0772161562778, 1, 0, 0.2832376899125972, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2832376899125972, 0.001134871788391818],
[244.3675789090568, 617.747078281953, 1, 0, 0.283451367948283, 0.004092195881566423, 0, -0.02266174020446759, 1, 0.2834513679482831, 0.00113495280178679],
[244.2654856356123, 618.2965954606278, 0, 1, 0.2831859769735907, 0, 0.001617346767460372, 0.008956534175165802, 0.7168140230264093, 1, 0.001134588651264037],
[244.1829699876337, 618.0772161562778, 0, 1, 0.2831894292599049, 0, 0.001617920825845738, 0.008959713192585268, 0.7168105707400951, 1, 0.00113565646397172],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.1617930315951, 616.0109213965046, 0, 1, 0.2830185234565479, 0, 0.001623347842166479, 0.008989766894193252, 0.7169814765434521, 1, 0.001134797194574002],
[244.3075269391076, 617.8071302519022, 0, 1, 0.2833817113551045, 0, 0.001618628130096627, 0.008963630098237649, 0.7166182886448955, 1, 0.001134677997016775],
[244.3675789090568, 617.747078281953, 1, 0, 0.283451367948283, 0.004092195881566423, 0, -0.02266174020446759, 1, 0.2834513679482831, 0.001134902046677428],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 2, 0, 0.2833045757747854, 0.008188632445276366, 0, -0.04534696443555743, 1, 0.08026148265493105, 0.002273707169726762],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001135397815317865],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001134871788391818],
[244.161997986206, 617.9526592048038, 1, 0, 0.2832129067167797, 0.004095641452182479, 0, -0.02268082106677649, 1, 0.2832129067167797, 0.001134918834706067],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001134588596696078],
[243.9899185889165, 617.9456108229904, 1, 0, 0.2830721211311352, 0.00409852999576117, 0, -0.0226968172277727, 1, 0.2830721211311352, 0.001135823661237967],
[244.094817779426, 618.0198394115838, 0, 1, 0.2831349818071176, 0, 0.001618071033046608, 0.008960545009209266, 0.7168650181928824, 1, 0.001135823684735976],
[244.0618994456206, 618.0198394115838, 0, 1, 0.2831076085304333, 0, 0.001618071033046608, 0.008960545009209266, 0.7168923914695667, 1, 0.00113553309515818],
[244.0618994456206, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001135812259608159],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001135823647220118],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001134902088086772],
[244.1884511299538, 617.926206061056, 0, 1, 0.2832435907372023, 0, 0.001618316216712117, 0.008961902785985097, 0.7167564092627976, 1, 0.001135870720524237],
[244.5618994456207, 618.1126670316006, 0, 1, 0.2834926505881616, 0, 0.001617828032553288, 0.008959199322392567, 0.7165073494118384, 1, 0.001134588561630248],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.00113565646397172],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 2, 0.2833045757747854, 0, 0.003236907844908559, 0.01792533074419746, 0.5136523311053603, 1, 0.002272194026223959],
[244.2955980523526, 617.6154729486657, 0, 1, 0.2834348069907365, 0, 0.001619130419815627, 0.008966411675524947, 0.7165651930092636, 1, 0.00113911009176705],
[243.9108893503988, 618.1708495068057, 1, 0, 0.2829324394154697, 0.004099857954941137, 0, -0.02270417119293212, 1, 0.2829324394154697, 0.001135823661223132],
[244.3675789090568, 617.747078281953, 1, 0, 0.283451367948283, 0.004092195881566423, 0, -0.02266174020446759, 1, 0.2834513679482831, 0.001134952781183702],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.00113458865382017],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.00113565646397172],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001134871782892095],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135819260453782],
[244.2410272247236, 617.6945021871833, 0, 1, 0.2833634522426146, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264492436151, 0.7166365477573854, 1, 0.001135533970249725],
[244.1144755403904, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2831993550501488, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523640547286, 1, 0.2831993550501488, 0.001135823642675486],
[244.1144755403904, 618.0001816506193, 1, 0, 0.2831577836012879, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523640547286, 1, 0.283157783601288, 0.001135823642675486],
[244.1884511299538, 617.926206061056, 0, 1, 0.2832435907372023, 0, 0.001618316216712117, 0.008961902785985097, 0.7167564092627976, 1, 0.001135870722986864],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001134588540925615],
[244.1144755403904, 618.0001816506193, 1, 0, 0.2831577836012879, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523640547286, 1, 0.283157783601288, 0.001135823647845551],
[244.4201550038266, 617.6945021871833, 0, 1, 0.2835123529858661, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264492436151, 0.7164876470141339, 1, 0.001134871781343312],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.6884511299538, 615.426206061056, 0, 1, 0.2836506735046587, 0, 0.001624890182042054, 0.008998308055608504, 0.7163493264953413, 1, 0.001137511815322845],
[243.2410272247236, 615.8736299662862, 0, 1, 0.2831298770062108, 0, 0.001623709721188649, 0.008991770905883607, 0.7168701229937892, 1, 0.001137302669716684],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.1884511299538, 617.926206061056, 0, 1, 0.2832435907372023, 0, 0.001618316216712117, 0.008961902785985097, 0.7167564092627976, 1, 0.001135741472785704],
[244.537441034732, 617.5191589191878, 0, 1, 0.2836675005420798, 0, 0.001619382954449946, 0.00896781016045607, 0.7163324994579202, 1, 0.001138858617184151],
[244.094817779426, 618.0198394115838, 0, 1, 0.2831349818071176, 0, 0.001618071033046608, 0.008960545009209266, 0.7168650181928824, 1, 0.001135823647845551],
[244.3781137003312, 617.7365434906786, 0, 1, 0.2834635876584881, 0, 0.001618813085509308, 0.008964654343320942, 0.7165364123415119, 1, 0.001134918841811914],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001135565753157513],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823654698502],
[244.1144755403904, 618.0001816506194, 1, 0, 0.2831577836012878, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523640547286, 1, 0.2831577836012877, 0.001135823652235999],
[244.3200564632412, 617.6483912824709, 1, 0, 0.2834443152788322, 0.004092991850427365, 0, -0.02266614811651764, 1, 0.2834443152788322, 0.001135703538675305],
[243.9236414132875, 618.2490730148122, 0, 1, 0.2829173752907363, 0, 0.001617471086731483, 0.008957222629752496, 0.7170826247092636, 1, 0.001134588536270231],
[244.161997986206, 618.0107164418938, 1, 0, 0.2831938356436675, 0.004095641452182479, 0, -0.02268082106677649, 1, 0.2831938356436675, 0.001134871787400167],
[243.9899185889165, 617.9456108229904, 1, 0, 0.2830721211311352, 0.00409852999576117, 0, -0.0226968172277727, 1, 0.2830721211311352, 0.001135823661924151],
[244.1144755403904, 618.0001816506193, 1, 0, 0.2831577836012879, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523640547286, 1, 0.283157783601288, 0.001135870722986864],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001134588564152024],
[244.161997986206, 618.0988686501015, 1, 0, 0.2831648836606555, 0.004095641452182479, 0, -0.02268082106677649, 1, 0.2831648836606555, 0.001134871787400167],
[244.2410272247236, 617.8210538715165, 0, 1, 0.28332185416871, 0, 0.001618591651633747, 0.008963428088003345, 0.71667814583129, 1, 0.001136048912678273],
[243.1670516351602, 615.9476055558496, 0, 1, 0.2830437702346126, 0, 0.001623514712907391, 0.00899069099007911, 0.7169562297653873, 1, 0.001134670848680308],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001135026865007562],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001136079218078839],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823661223132],
[244.4921358605308, 617.8016491095821, 1, 0, 0.2835369338409471, 0.004090111105129551, 0, -0.02265019514079906, 1, 0.2835369338409471, 0.0011349020737976],
[244.094817779426, 618.0198394115838, 0, 1, 0.2831349818071176, 0, 0.001618071033046608, 0.008960545009209266, 0.7168650181928824, 1, 0.001135870745928618],
[244.216568813835, 617.6945021871833, 0, 1, 0.283343116280202, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264492436151, 0.716656883719798, 1, 0.001135565718635181],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.00113565646397172],
[244.6164702732496, 617.4981869177602, 0, 1, 0.2837400666290406, 0, 0.001619437953318529, 0.008968114732892834, 0.7162599333709594, 1, 0.001134871773396545],
[244.2654856356122, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2832660534675566, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7167339465324434, 1, 0.001134588494601406],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[242.595293317211, 616.5852005414094, 0, 1, 0.2823566119706746, 0, 0.001621835877867199, 0.008981393946480011, 0.7176433880293254, 1, 0.001134851226549026],
[243.8655841761976, 618.2819913486175, 1, 1, 0.2828582844738028, 0.004100619623626271, 0.001617384969953219, -0.0137516434249303, 0.9199911909045373, 0.4857077598521429, 0.002272583467989665],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001136067027764576],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.00113565646397172],
[244.0618994456206, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001135870734566468],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001134588550595813],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.0011349020737976],
[244.4181602709673, 617.6964969200425, 0, 1, 0.2835100392183845, 0, 0.00161891803658625, 0.008965235540826802, 0.7164899607816155, 1, 0.001134871788391818],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135870706503672],
[243.6237411938181, 618.5238343309969, 0, 1, 0.2825777721934868, 0, 0.001616752572003329, 0.008953243642779791, 0.7174222278065132, 1, 0.001138858625168684],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823652235999],
[243.8655841761976, 618.2490730148122, 0, 1, 0.2828690849205303, 0, 0.001617471086731483, 0.008957222629752496, 0.7171309150794698, 1, 0.00113582365217172],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001134952766830475],
[244.594817779426, 617.5198394115838, 0, 1, 0.2837149510673888, 0, 0.001619381169927868, 0.008967800278139367, 0.7162850489326112, 1, 0.00113458864597344],
[244.1164702732496, 617.9981869177601, 0, 1, 0.2831600973687695, 0, 0.001618127724593268, 0.008960858955349522, 0.7168399026312305, 1, 0.001134871788391818],
[244.1884511299538, 617.926206061056, 0, 1, 0.2832435907372023, 0, 0.001618316216712117, 0.008961902785985097, 0.7167564092627977, 1, 0.001135656469434532],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001135870732038155],
[244.2410272247236, 617.6945021871833, 0, 1, 0.2833634522426146, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264492436151, 0.7166365477573854, 1, 0.001134588568806096],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001134902073715049],
[244.1144755403904, 618.0001816506194, 1, 0, 0.2831577836012878, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523640547286, 1, 0.2831577836012877, 0.001135823654698502],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823652250837],
[244.0618994456206, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001134588536270231],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135703554583335],
[243.8655841761976, 618.2490730148122, 0, 1, 0.2828690849205303, 0, 0.001617471086731483, 0.008957222629752496, 0.7171309150794698, 1, 0.001135823647845551],
[243.1881209372278, 616.2189551443772, 0, 1, 0.2829719788275701, 0, 0.001622799804601442, 0.008986731974731772, 0.7170280211724299, 1, 0.001134514423941637],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.161997986206, 618.0988686501015, 1, 0, 0.2831648836606555, 0.004095641452182479, 0, -0.02268082106677649, 1, 0.2831648836606555, 0.001135140389778197],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001138590850342805],
[243.8655841761976, 618.2490730148122, 0, 1, 0.2828690849205303, 0, 0.001617471086731483, 0.008957222629752496, 0.7171309150794698, 1, 0.001135823652235999],
[244.0618994456206, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001135823647845551],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067758346787, 0.7169032014362953, 1, 0.001135703563171325],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.00113556569559573],
[243.7410272247236, 618.3736299662862, 0, 1, 0.2827246065145143, 0, 0.001617145284889526, 0.008955418406075465, 0.7172753934854857, 1, 0.001135823661732235],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823689144962],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001136744009318416],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001135932153238581],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823652235999],
[244.3200564632413, 617.7946007277685, 1, 0, 0.2833962448327912, 0.004092991850427365, 0, -0.02266614811651764, 1, 0.2833962448327911, 0.001135703571113324],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135565690050367],
[244.4373424941467, 617.55076301253, 0, 1, 0.2835739158494147, 0, 0.001619300080080559, 0.008967351219221825, 0.7164260841505854, 1, 0.001135823661223132],
[244.4201550038266, 617.6945021871833, 0, 1, 0.2835123529858661, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264492436151, 0.7164876470141339, 1, 0.001134871784895548],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348221777872, 1, 0.2833045757747854, 0.001134966052886312],
[243.6304593829056, 615.4841978081041, 0, 1, 0.2835831717497266, 0, 0.001624737082708629, 0.008997460222948492, 0.7164168282502734, 1, 0.001133720499516433],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.4513316038027, 615.6633255872071, 0, 1, 0.2833746689874893, 0, 0.001624264364043807, 0.008994842404084965, 0.7166253310125108, 1, 0.001134658467510542],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.2936033194934, 617.8210538715164, 0, 1, 0.2833655608123686, 0, 0.001618591651633747, 0.008963428088003347, 0.7166344391876314, 1, 0.001138144930390134],
[244.4201550038266, 617.6945021871833, 0, 1, 0.2835123529858661, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264492436151, 0.7164876470141339, 1, 0.001134989908298318],
[244.161997986206, 617.9526592048038, 1, 0, 0.2832129067167797, 0.004095641452182478, 0, -0.02268082106677648, 1, 0.2832129067167797, 0.001134871766348038],
[244.6183496702608, 617.496307520749, 1, 2, 0.2837422466140292, 0.004088000762608259, 0.003238885764402399, -0.00470222444134138, 0.8041589974907493, 0.6325417448170976, 0.003422556996402249],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001135278070570315],
[243.2125793481165, 615.9601350799833, 0, 1, 0.2830776341751131, 0, 0.001623481688259174, 0.008990508106360954, 0.7169223658248869, 1, 0.001134793800394788],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.161997986206, 617.9526592048039, 1, 0, 0.2832129067167797, 0.004095641452182478, 0, -0.02268082106677648, 1, 0.2832129067167797, 0.001134674472398249],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665372098732, 0.7166954242252146, 1, 0.001134902037848098]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 1, 0.2139148139313647, 0, 0.4240422529782025, 2.348258893469875, 0.7860851860686353, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.354266092487454, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794587631781, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773009770749],
[0, 1.825863826960409, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1794380692354508],
[0.7503894024464978, 1.354762787093038, 1, 0, 0.3564537548283538, 1.332641421560187, 0, -7.379894451569923, 1, 0.3564537548283537, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -11.07558917526356, 1, 0.1111111111111109, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9988745189810782, 2.00112548101892, 0, 1, 0.3329581729936929, 0, 0.4997187879946571, 2.767339999494724, 0.6670418270063071, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9988732937839342, 2.001126706216064, 0, 1, 0.3329577645946449, 0, 0.4997184820400016, 2.767338305180689, 0.6670422354053551, 1, 0.1805773009770749],
[0.8940518056785308, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3089273674798348, 1.118503417417809, 0, -6.194042171223993, 1, 0.3089273674798348, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.00222290810775216, 2.997777091892244, 0, 1, 0.000740969369250721, 0, 0.3335805062706594, 1.847300322165126, 0.9992590306307493, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.354266092487454, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.883885525820135, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3064911966534356, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.893268347656733, 1.105604946113914, 1, 0, 0.631326555739947, 0.528187143274055, 0, -2.924991903279753, 1, 0.631326555739947, 0.1805773009770749],
[1.392630538846176, 1.249113902947917, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.841941522964726, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.5928276200168103, 2.291057905803322, 0, 0, 0.2055655866743252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2187146280202141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8940518056701048, 2.105948194329893, 1, 0, 0.2980172685567018, 1.118503417428351, 0, -6.194042171282369, 1, 0.2980172685567017, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7488981761144519, 1.363607014617227, 1, 1, 0.3545071412842618, 1.335295013253141, 0.7333491169233285, -3.333452726742395, 0.8743246867784605, 0.5833389693469839, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6439983965680668, 2.354875184568174, 0, 3, 0.2147467637912442, 0, 1.273952870054183, 7.054889308684027, 0.4842049274872613, 1, 0.1805773009770749],
[0.6439949409132005, 2.356005059086796, 0, 2, 0.2146649803044004, 0, 0.8488946117862809, 4.701003986619846, 0.6167510931602878, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.500000000000001, 8.306691881447671, 0.2962962962962963, 1, 0.1805773009770749],
[0.9976384789747782, 2.00236152102522, 0, 1, 0.3325461596582596, 0, 0.4994103160192543, 2.765631745058903, 0.6674538403417405, 1, 0.1805773009770749],
[1.391140712045233, 1.253360010262771, 1, 0, 0.5260504186329381, 0.7188345444436142, 0, -3.980758049622602, 1, 0.5260504186329381, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9996693472444217, 2.000330652755577, 0, 1, 0.3332231157481407, 0, 0.4999173504752523, 2.768439597725071, 0.6667768842518593, 1, 0.1805773009770749],
[0.2491139029479177, 2.750886097052079, 0, 0, 0.083037967649306, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6425398362612844, 2.357460163738712, 1, 0, 0.2141799454204284, 1.556323738336057, 0, -8.618601174760272, 1, 0.2141799454204284, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794587631781, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794587631781, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9990803487211549, 2.000919651278843, 0, 1, 0.3330267829070518, 0, 0.4997701928515081, 2.767624669032772, 0.6669732170929481, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.354266092487454, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.894847810460461, 1.105152189539536, 0, 0, 0.6316159368201543, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2187146280202141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.354266092487454, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.392630538846176, 1.249113902947917, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8940518056718306, 2.105948194328167, 1, 0, 0.2980172685572771, 1.118503417426192, 0, -6.194042171270412, 1, 0.2980172685572771, 0.1805773009770749],
[0.9968541883368701, 2.002780338465179, 0, 2, 0.33232521476529, 0, 0.9986117606550351, 5.530106803300894, 0.4457896188382162, 1, 0.1805773009770749],
[1.393712116646822, 1.250077048098343, 2, 0, 0.5271646223654759, 1.435016583490618, 0, -7.946827069216191, 1, 0.2779025390737349, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.392630538846176, 1.249113902947917, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794587631781, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 2, 1, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0.5000000000000002, -8.306691881447671, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.001869412268064161, 2.997764434376045, 0, 1, 0.0006232134865912376, 0, 0.3335819147537989, 1.847308122055433, 0.9993767865134088, 1, 0.1805773009770749],
[0.883885525820135, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3064911966534356, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.2514734449057646, 2.748526555094232, 0, 1, 0.08382448163525495, 0, 0.3638313037749477, 2.014823024855919, 0.9161755183647451, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794587631781, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9996348761653605, 1.594107980125132, 0, 1, 0.3854024595155951, 0, 0.6273100771514257, 3.473914350016039, 0.6145975404844048, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999669232982368, 0, 1, 0.3333700892767325, 0, 0.5000827054325226, 2.769355299512481, 0.6666299107232675, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.392630538846176, 1.249113902947917, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.883885525820135, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3064911966534356, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.5928276200168103, 1.512324569522725, 0, 0, 0.2816079630549091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 1.814344759966377, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.22919095702292, 1.706007307428967, 1, 1, 0.4187761255890687, 0.813543245080474, 0.5861639605208061, -1.259179771374115, 0.8246265566366084, 0.662178807814746, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794587631781, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773009770749],
[0.99685502091867, 2.003144979081328, 1, 1, 0.3322850069728902, 1.003154901179543, 0.4992149896502323, -2.790715714558656, 0.8895866741410263, 0.5541566880868067, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9968550209367771, 2.003144979063221, 1, 2, 0.3322850069789259, 1.003154901161322, 0.9984299793094895, -0.02616564665805922, 0.7421374079209422, 0.7023037361027715, 0.1805773009770749],
[1.892771257055935, 1.107021688002927, 1, 0, 0.6309673006510772, 0.5283258588549287, 0, -2.925760081672735, 1, 0.6309673006510772, 0.1805773009770749],
[0.9988732470751855, 2.001126752924813, 0, 1, 0.332957749025062, 0, 0.4997184703759605, 2.767338240587625, 0.667042250974938, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.001234814823699, 1.892816990841832, 0, 1, 0.345962989627081, 0, 0.5283130935734307, 2.925689390165946, 0.6540370103729189, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9988732937548687, 2.00112670624513, 0, 1, 0.3329577645849564, 0, 0.4997184820327435, 2.767338305140495, 0.6670422354150436, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8948478104604622, 2.105152189539536, 0, 0, 0.298282603486821, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6415906343510365, 2.357129107848611, 0, 1, 0.2139548505724684, 0, 0.4242448988773109, 2.349381104833163, 0.7860451494275316, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.894847810460461, 0, 0, 0.3454413031270675, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.231176021825085, 1.702275364736457, 1, 1, 0.4197022072583971, 0.8122315430718091, 0.5874490230637966, -1.244799422694603, 0.8238500572224294, 0.6632544717392237, 0.1805773009770749],
[0.7075811094047173, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2358603698015727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9977468870850671, 2.002046110942529, 0, 2, 0.3326052456756513, 0, 0.9989779901015539, 5.532134906747658, 0.4454157580996577, 1, 0.1805773009770749],
[0.642870203784436, 2.357129796215561, 0, 1, 0.2142900679281455, 0, 0.4242447749824929, 2.349380418729111, 0.7857099320718545, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2187146280202141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.9990803105883546, 2.000919689411644, 0, 1, 0.3330267701961184, 0, 0.4997701833270694, 2.767624616288387, 0.6669732298038816, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6425398007056681, 2.357460199294329, 1, 0, 0.2141799335685562, 1.556323824456869, 0, -8.618601651679642, 1, 0.2141799335685562, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 1.814344759966377, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9996692848640142, 2.000330715135984, 0, 1, 0.3332230949546716, 0, 0.4999173348853063, 2.768439511391152, 0.6667769050453284, 1, 0.1805773009770749],
[0.7075811094047173, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2358603698015727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7084999899776819, 2.291500010022314, 0, 1, 0.2361666633258943, 0, 0.4363953723003746, 2.41666793079257, 0.7638333366741057, 1, 0.1805773009770749],
[0.6428702037879598, 2.357129796212037, 0, 1, 0.2142900679293201, 0, 0.4242447749831271, 2.349380418732623, 0.7857099320706799, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.0007833426683779535, 2.999216657331619, 0, 1, 0.0002611142227926515, 0, 0.3334203941404129, 1.846413654076833, 0.9997388857772074, 1, 0.1805773009770749],
[0.8948478104604622, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3091173937458652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8940518056785204, 2.105948194321478, 1, 0, 0.298017268559507, 1.118503417417823, 0, -6.194042171224066, 1, 0.2980172685595071, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.5928276200168103, 2.291057905803322, 0, 0, 0.2055655866743252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6425398362757234, 2.357460163724274, 1, 0, 0.2141799454252413, 1.556323738301084, 0, -8.618601174566598, 1, 0.2141799454252413, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9976384789657834, 2.002361521034215, 0, 1, 0.3325461596552614, 0, 0.499410316017011, 2.76563174504648, 0.6674538403447386, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.841941522964726, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8948478104604622, 2.105152189539536, 0, 0, 0.298282603486821, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.5929812950991176, 2.001125480977586, 0, 1, 0.2285878517290392, 0, 0.499718788004979, 2.767339999551885, 0.7714121482709608, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8948478104604622, 2.105152189539536, 0, 0, 0.298282603486821, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.999080348692761, 2.000919651307238, 1, 1, 0.3330267828975871, 1.000920497844285, 0.4997701928444162, -2.775267446618289, 0.8890931618728832, 0.5551467276680577, 0.1805773009770749],
[0.8940518056701048, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3089273674778228, 1.118503417428351, 0, -6.194042171282369, 1, 0.3089273674778228, 0.1805773009770749],
[0.7075811094047173, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2358603698015727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2187146280202141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794587631781, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.2491139029479177, 2.750886097052079, 0, 0, 0.083037967649306, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7519993227780514, 1.353152866761484, 0, 1, 0.3572185072959204, 0, 0.7390148035478882, 4.092512179267257, 0.6427814927040796, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.354266092487454, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.5932455498971563, 2.291004847477312, 0, 1, 0.205684482331072, 0, 0.4364896918926764, 2.417190253320326, 0.7943155176689279, 1, 0.1805773009770749],
[1.893268347655778, 1.105604946114187, 2, 0, 0.6313265557397721, 1.056374286548643, 0, -5.849983806562454, 1, 0.3985732199822436, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 5.537794587631781, 0.4444444444444445, 1, 0.1805773009770749],
[0.9966168099216196, 2.003383190078379, 1, 1, 0.3322056033072067, 1.003394674908851, 0.4991556308111365, -2.792372249276947, 0.8896394371312948, 0.5540506437457082, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.592827620016811, 0, 0, 0.3856793225588657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9988731086050011, 2.000919802425946, 0, 1, 0.3329806884108262, 0, 0.4997701550994621, 2.767624459969696, 0.6670193115891738, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -2.768897293815891, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -2.768897293815891, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1805773009770749],
[0.2491139029479177, 2.750886097052079, 0, 0, 0.083037967649306, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.5933246580604692, 2.290560867759663, 1, 0, 0.205737936803763, 1.685417901337389, 0, -9.333498131923905, 0.9999999999999999, 0.2057379368037631, 0.1805773009770749],
[0.2491139029479177, 2.750886097052079, 0, 0, 0.083037967649306, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.841941522964726, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 1.814344759966377, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.357130077154708, 0, 1, 0.2139950964067162, 0, 0.4242447244180517, 2.349380138713622, 0.7860049035932838, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.5929812951208117, 2.291269011223634, 0, 1, 0.2055928689047684, 0, 0.4364393683594394, 2.416911571930336, 0.7944071310952316, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.592827620016811, 0, 0, 0.3856793225588657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8948478104604622, 2.105152189539536, 0, 0, 0.298282603486821, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8951795041766063, 2.104820495823392, 0, 1, 0.298393168058869, 0, 0.4750998966345615, 2.631005636167292, 0.701606831941131, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 5.537794587631781, 0.4444444444444445, 1, 0.1805773009770749],
[0.002016078153814595, 1.815846658148729, 0, 1, 0.00110903761519157, 0, 0.5507072943149883, 3.049703873826883, 0.9988909623848085, 1, 0.1805773009770749],
[0, 1.814344759966377, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9990803487226304, 2.000919651277368, 0, 1, 0.3330267829075436, 0, 0.4997701928518766, 2.767624669034813, 0.6669732170924564, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 1, 0.2139148139313647, 0, 0.4240422529782025, 2.348258893469875, 0.7860851860686353, 1, 0.1805773009770749],
[1.006349625335295, 2.012699250670589, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1794379373042547],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 1, 0.2139148139313647, 0, 0.4240422529782025, 2.348258893469875, 0.7860851860686353, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 3, 0, 0.3333333333333333, 3.000000000000001, 0, -16.61338376289534, 1, 0.03703703703703698, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.894847810460461, 0, 0, 0.3454413031270675, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.894847810460461, 0, 0, 0.3454413031270675, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9988732003375289, 2.00112679966247, 0, 1, 0.3329577334458431, 0, 0.4997184587047008, 2.767338175954587, 0.6670422665541569, 1, 0.1805773009770749],
[0.7503894230458559, 1.842438196970952, 1, 0, 0.2894096843356643, 1.332641384977105, 0, -7.379894248980328, 1, 0.2894096843356643, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.392630538846176, 1.249113902947917, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7075811094047173, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2358603698015727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.594107095467366, 1, 0, 0.3854890963242346, 1, 0, -5.537794587631781, 1, 0.3854890963242346, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2187146280202141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.008480212124766, 1.991519787875233, 1, 0, 0.3361600707082554, 0.9915910971550957, 0, -5.491227810969346, 1, 0.3361600707082554, 0.1805773009770749],
[0.9986713377593294, 2.001328662240669, 0, 2, 0.3328904459197767, 0, 0.9993361099225044, 5.534118100753841, 0.4450351571451144, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.002818460437183, 1.997181539562815, 0, 1, 0.3342728201457279, 0, 0.5007056094754916, 2.772804814150248, 0.6657271798542721, 1, 0.1805773009770749],
[0.9983446724832633, 2.001655327516735, 1, 2, 0.3327815574944213, 1.001658072169223, 0.999173020702426, -0.0137617045628161, 0.7414761370667302, 0.7029673935040097, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.841941522964726, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.354266092487454, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.2483311015132355, 2.751668898486761, 0, 1, 0.08277703383774528, 0, 0.3634158166885322, 2.012522142717536, 0.9172229661622547, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 1, 0.2139148139313647, 0, 0.4240422529782025, 2.348258893469875, 0.7860851860686353, 1, 0.1805773009770749],
[0.9988734129046701, 2.001126587095329, 0, 1, 0.3329578043015569, 0, 0.4997185117866622, 2.767338469911585, 0.6670421956984431, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999669658142047, 0, 1, 0.3333700420263562, 0, 0.5000825991074596, 2.769354710706122, 0.6666299579736439, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8940518056780394, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3089273674797175, 1.118503417418424, 0, -6.194042171227397, 1, 0.3089273674797175, 0.1805773009770749],
[0.2491139029479177, 2.750886097052079, 0, 0, 0.083037967649306, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 1.814344759966377, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7266886300759939, 2.273311369924001, 0, 1, 0.242229543358665, 0, 0.4398869478374319, 2.436003558903993, 0.757770456641335, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9976384789656498, 2.002361521034349, 0, 1, 0.3325461596552168, 0, 0.4994103160169776, 2.765631745046295, 0.6674538403447832, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999669298571704, 0, 1, 0.3333700819874214, 0, 0.5000826890297643, 2.769355208677375, 0.6666299180125785, 1, 0.1805773009770749],
[0.7075811094047173, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2358603698015727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.5929812951203369, 1.514982112010954, 0, 1, 0.2813053078218848, 0, 0.6600738002593457, 3.655353118513744, 0.7186946921781152, 1, 0.1805773009770749],
[1.234572061810904, 1.699591270578471, 0, 0, 0.4207577840615833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9996692848632973, 2.000330715136701, 0, 1, 0.3332230949544326, 0, 0.499917334885127, 2.76843951139016, 0.6667769050455674, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[9.333734951460727, 21.9578484072487, 0, 0, 0.2982826034868209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01589719946387387],
[0.9977474775946055, 2.002252522405393, 0, 2, 0.3325824925315353, 0, 0.9988750058345852, 5.531564601031428, 0.4454461292754182, 1, 0.1805773009770749],
[1.394208720101428, 1.2486615137323, 1, 0, 0.5275358215673719, 0.7172527223379084, 0, -3.971998243727028, 1, 0.5275358215673719, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8948478104604622, 2.105152189539536, 0, 0, 0.298282603486821, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7488090565196608, 2.135806163352709, 1, 3, 0.2595871544187415, 1.335453933540591, 1.40462184793526, 0.3830377019725741, 0.7220039047990221, 0.6994645000379012, 0.1805773009770749],
[0.642539836238943, 2.357460163761054, 1, 0, 0.2141799454129812, 1.556323738390171, 0, -8.618601175059945, 1, 0.2141799454129811, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -2.768897293815891, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.392630538846176, 1.249113902947917, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7258270487848638, 2.274172951215131, 0, 0, 0.241942349594955, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9977460452260262, 2.002253954773972, 1, 1, 0.3325820150753422, 1.002259046562759, 0.4994371456306533, -2.784524401524535, 0.8893892032484247, 0.5545532333991092, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9988732470960924, 2.001126752903906, 0, 1, 0.332957749032031, 0, 0.4997184703811813, 2.767338240616537, 0.667042250967969, 1, 0.1805773009770749],
[1.392630538846176, 1.249113902947917, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.841941522964726, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.354266092487454, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.6425398007351012, 2.357460199264896, 1, 0, 0.2141799335783673, 1.556323824385578, 0, -8.618601651284845, 1, 0.2141799335783673, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.003142427267976441, 2.99685757273202, 0, 1, 0.001047475755992148, 0, 0.333682858037318, 1.847867125224563, 0.9989525242440078, 1, 0.1805773009770749],
[0.7075811094047173, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2358603698015727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.392630538846176, 1.249113902947917, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.6419512715811199, 2.358048728418877, 0, 1, 0.2139837571937068, 0, 0.424079446683242, 2.348464864568337, 0.7860162428062931, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.883885525820135, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3064911966534356, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.2491139029479177, 2.750886097052079, 0, 0, 0.083037967649306, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7075811094047173, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2358603698015727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.883885525820135, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3064911966534356, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.841941522964726, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8948478104604622, 2.105152189539536, 0, 1, 0.298282603486821, 0, 0.4750250385549236, 2.630591087499033, 0.7017173965131791, 1, 0.1805773009770749],
[0.8940517726838372, 2.105948227316161, 1, 0, 0.2980172575612793, 1.118503458695819, 0, -6.194042399813131, 1, 0.2980172575612793, 0.1805773009770749],
[0.8813946792188742, 2.003220498641492, 1, 1, 0.3055501773628743, 1.134565505757578, 0.4991961697068106, -3.518544870329136, 0.906639089113516, 0.5177394438392647, 0.1805773009770749],
[0.9988745188644718, 2.001125481135527, 0, 1, 0.3329581729548241, 0, 0.4997187879655383, 2.76733999933347, 0.6670418270451759, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.7075811094047173, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2358603698015727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.642088683180646, 2.356627063027158, 0, 1, 0.2141212230577826, 0, 0.4243352780288749, 2.34988160600953, 0.7858787769422174, 1, 0.1805773009770749],
[0.9988745189211373, 2.001125481078861, 0, 1, 0.3329581729737126, 0, 0.4997187879796887, 2.767339999411833, 0.6670418270262874, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8940518056785308, 2.105948194321468, 1, 0, 0.2980172685595104, 1.118503417417809, 0, -6.194042171223993, 1, 0.2980172685595104, 0.1805773009770749],
[0.8957040854974314, 2.104295914502567, 1, 2, 0.298568028499144, 1.116440146016134, 0.9504366692042829, -0.919293155416726, 0.7858018175675867, 0.654890692818427, 0.1805773009770749]
],
"RESOLVED": [
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 1, 0.2139148139313647, 0, 0.4240422529782025, 2.348258893469875, 0.7860851860686353, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.354266092487454, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794587631781, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773009770749],
[0, 1.825863826960409, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1794380692354508],
[0.7503894024464978, 1.354762787093038, 1, 0, 0.3564537548283538, 1.332641421560187, 0, -7.379894451569923, 1, 0.3564537548283537, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -11.07558917526356, 1, 0.1111111111111109, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9988745189810782, 2.00112548101892, 0, 1, 0.3329581729936929, 0, 0.4997187879946571, 2.767339999494724, 0.6670418270063071, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9988732937839342, 2.001126706216064, 0, 1, 0.3329577645946449, 0, 0.4997184820400016, 2.767338305180689, 0.6670422354053551, 1, 0.1805773009770749],
[0.8940518056785308, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3089273674798348, 1.118503417417809, 0, -6.194042171223993, 1, 0.3089273674798348, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.00222290810775216, 2.997777091892244, 0, 1, 0.000740969369250721, 0, 0.3335805062706594, 1.847300322165126, 0.9992590306307493, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.354266092487454, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.883885525820135, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3064911966534356, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.893268347656733, 1.105604946113914, 1, 0, 0.631326555739947, 0.528187143274055, 0, -2.924991903279753, 1, 0.631326555739947, 0.1805773009770749],
[1.392630538846176, 1.249113902947917, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.841941522964726, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.5928276200168103, 2.291057905803322, 0, 0, 0.2055655866743252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2187146280202141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8940518056701048, 2.105948194329893, 1, 0, 0.2980172685567018, 1.118503417428351, 0, -6.194042171282369, 1, 0.2980172685567017, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7488981761144519, 1.363607014617227, 1, 1, 0.3545071412842618, 1.335295013253141, 0.7333491169233285, -3.333452726742395, 0.8743246867784605, 0.5833389693469839, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6439983965680668, 2.354875184568174, 0, 3, 0.2147467637912442, 0, 1.273952870054183, 7.054889308684027, 0.4842049274872613, 1, 0.1805773009770749],
[0.6439949409132005, 2.356005059086796, 0, 2, 0.2146649803044004, 0, 0.8488946117862809, 4.701003986619846, 0.6167510931602878, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.500000000000001, 8.306691881447671, 0.2962962962962963, 1, 0.1805773009770749],
[0.9976384789747782, 2.00236152102522, 0, 1, 0.3325461596582596, 0, 0.4994103160192543, 2.765631745058903, 0.6674538403417405, 1, 0.1805773009770749],
[1.391140712045233, 1.253360010262771, 1, 0, 0.5260504186329381, 0.7188345444436142, 0, -3.980758049622602, 1, 0.5260504186329381, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9996693472444217, 2.000330652755577, 0, 1, 0.3332231157481407, 0, 0.4999173504752523, 2.768439597725071, 0.6667768842518593, 1, 0.1805773009770749],
[0.2491139029479177, 2.750886097052079, 0, 0, 0.083037967649306, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6425398362612844, 2.357460163738712, 1, 0, 0.2141799454204284, 1.556323738336057, 0, -8.618601174760272, 1, 0.2141799454204284, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794587631781, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794587631781, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9990803487211549, 2.000919651278843, 0, 1, 0.3330267829070518, 0, 0.4997701928515081, 2.767624669032772, 0.6669732170929481, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.354266092487454, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.894847810460461, 1.105152189539536, 0, 0, 0.6316159368201543, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2187146280202141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.354266092487454, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.392630538846176, 1.249113902947917, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8940518056718306, 2.105948194328167, 1, 0, 0.2980172685572771, 1.118503417426192, 0, -6.194042171270412, 1, 0.2980172685572771, 0.1805773009770749],
[0.9968541883368701, 2.002780338465179, 0, 2, 0.33232521476529, 0, 0.9986117606550351, 5.530106803300894, 0.4457896188382162, 1, 0.1805773009770749],
[1.393712116646822, 1.250077048098343, 2, 0, 0.5271646223654759, 1.435016583490618, 0, -7.946827069216191, 1, 0.2779025390737349, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.392630538846176, 1.249113902947917, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794587631781, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 2, 1, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0.5000000000000002, -8.306691881447671, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.001869412268064161, 2.997764434376045, 0, 1, 0.0006232134865912376, 0, 0.3335819147537989, 1.847308122055433, 0.9993767865134088, 1, 0.1805773009770749],
[0.883885525820135, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3064911966534356, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.2514734449057646, 2.748526555094232, 0, 1, 0.08382448163525495, 0, 0.3638313037749477, 2.014823024855919, 0.9161755183647451, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794587631781, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9996348761653605, 1.594107980125132, 0, 1, 0.3854024595155951, 0, 0.6273100771514257, 3.473914350016039, 0.6145975404844048, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999669232982368, 0, 1, 0.3333700892767325, 0, 0.5000827054325226, 2.769355299512481, 0.6666299107232675, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.392630538846176, 1.249113902947917, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.883885525820135, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3064911966534356, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.5928276200168103, 1.512324569522725, 0, 0, 0.2816079630549091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 1.814344759966377, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.22919095702292, 1.706007307428967, 1, 1, 0.4187761255890687, 0.813543245080474, 0.5861639605208061, -1.259179771374115, 0.8246265566366084, 0.662178807814746, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794587631781, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773009770749],
[0.99685502091867, 2.003144979081328, 1, 1, 0.3322850069728902, 1.003154901179543, 0.4992149896502323, -2.790715714558656, 0.8895866741410263, 0.5541566880868067, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9968550209367771, 2.003144979063221, 1, 2, 0.3322850069789259, 1.003154901161322, 0.9984299793094895, -0.02616564665805922, 0.7421374079209422, 0.7023037361027715, 0.1805773009770749],
[1.892771257055935, 1.107021688002927, 1, 0, 0.6309673006510772, 0.5283258588549287, 0, -2.925760081672735, 1, 0.6309673006510772, 0.1805773009770749],
[0.9988732470751855, 2.001126752924813, 0, 1, 0.332957749025062, 0, 0.4997184703759605, 2.767338240587625, 0.667042250974938, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.001234814823699, 1.892816990841832, 0, 1, 0.345962989627081, 0, 0.5283130935734307, 2.925689390165946, 0.6540370103729189, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9988732937548687, 2.00112670624513, 0, 1, 0.3329577645849564, 0, 0.4997184820327435, 2.767338305140495, 0.6670422354150436, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8948478104604622, 2.105152189539536, 0, 0, 0.298282603486821, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6415906343510365, 2.357129107848611, 0, 1, 0.2139548505724684, 0, 0.4242448988773109, 2.349381104833163, 0.7860451494275316, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.894847810460461, 0, 0, 0.3454413031270675, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.231176021825085, 1.702275364736457, 1, 1, 0.4197022072583971, 0.8122315430718091, 0.5874490230637966, -1.244799422694603, 0.8238500572224294, 0.6632544717392237, 0.1805773009770749],
[0.7075811094047173, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2358603698015727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9977468870850671, 2.002046110942529, 0, 2, 0.3326052456756513, 0, 0.9989779901015539, 5.532134906747658, 0.4454157580996577, 1, 0.1805773009770749],
[0.642870203784436, 2.357129796215561, 0, 1, 0.2142900679281455, 0, 0.4242447749824929, 2.349380418729111, 0.7857099320718545, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2187146280202141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.9990803105883546, 2.000919689411644, 0, 1, 0.3330267701961184, 0, 0.4997701833270694, 2.767624616288387, 0.6669732298038816, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6425398007056681, 2.357460199294329, 1, 0, 0.2141799335685562, 1.556323824456869, 0, -8.618601651679642, 1, 0.2141799335685562, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 1.814344759966377, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9996692848640142, 2.000330715135984, 0, 1, 0.3332230949546716, 0, 0.4999173348853063, 2.768439511391152, 0.6667769050453284, 1, 0.1805773009770749],
[0.7075811094047173, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2358603698015727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7084999899776819, 2.291500010022314, 0, 1, 0.2361666633258943, 0, 0.4363953723003746, 2.41666793079257, 0.7638333366741057, 1, 0.1805773009770749],
[0.6428702037879598, 2.357129796212037, 0, 1, 0.2142900679293201, 0, 0.4242447749831271, 2.349380418732623, 0.7857099320706799, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.0007833426683779535, 2.999216657331619, 0, 1, 0.0002611142227926515, 0, 0.3334203941404129, 1.846413654076833, 0.9997388857772074, 1, 0.1805773009770749],
[0.8948478104604622, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3091173937458652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8940518056785204, 2.105948194321478, 1, 0, 0.298017268559507, 1.118503417417823, 0, -6.194042171224066, 1, 0.2980172685595071, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.5928276200168103, 2.291057905803322, 0, 0, 0.2055655866743252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6425398362757234, 2.357460163724274, 1, 0, 0.2141799454252413, 1.556323738301084, 0, -8.618601174566598, 1, 0.2141799454252413, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9976384789657834, 2.002361521034215, 0, 1, 0.3325461596552614, 0, 0.499410316017011, 2.76563174504648, 0.6674538403447386, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.841941522964726, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8948478104604622, 2.105152189539536, 0, 0, 0.298282603486821, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.5929812950991176, 2.001125480977586, 0, 1, 0.2285878517290392, 0, 0.499718788004979, 2.767339999551885, 0.7714121482709608, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8948478104604622, 2.105152189539536, 0, 0, 0.298282603486821, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.999080348692761, 2.000919651307238, 1, 1, 0.3330267828975871, 1.000920497844285, 0.4997701928444162, -2.775267446618289, 0.8890931618728832, 0.5551467276680577, 0.1805773009770749],
[0.8940518056701048, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3089273674778228, 1.118503417428351, 0, -6.194042171282369, 1, 0.3089273674778228, 0.1805773009770749],
[0.7075811094047173, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2358603698015727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2187146280202141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794587631781, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.2491139029479177, 2.750886097052079, 0, 0, 0.083037967649306, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7519993227780514, 1.353152866761484, 0, 1, 0.3572185072959204, 0, 0.7390148035478882, 4.092512179267257, 0.6427814927040796, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.354266092487454, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.5932455498971563, 2.291004847477312, 0, 1, 0.205684482331072, 0, 0.4364896918926764, 2.417190253320326, 0.7943155176689279, 1, 0.1805773009770749],
[1.893268347655778, 1.105604946114187, 2, 0, 0.6313265557397721, 1.056374286548643, 0, -5.849983806562454, 1, 0.3985732199822436, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 5.537794587631781, 0.4444444444444445, 1, 0.1805773009770749],
[0.9966168099216196, 2.003383190078379, 1, 1, 0.3322056033072067, 1.003394674908851, 0.4991556308111365, -2.792372249276947, 0.8896394371312948, 0.5540506437457082, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.592827620016811, 0, 0, 0.3856793225588657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9988731086050011, 2.000919802425946, 0, 1, 0.3329806884108262, 0, 0.4997701550994621, 2.767624459969696, 0.6670193115891738, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -2.768897293815891, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -2.768897293815891, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1805773009770749],
[0.2491139029479177, 2.750886097052079, 0, 0, 0.083037967649306, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.5933246580604692, 2.290560867759663, 1, 0, 0.205737936803763, 1.685417901337389, 0, -9.333498131923905, 0.9999999999999999, 0.2057379368037631, 0.1805773009770749],
[0.2491139029479177, 2.750886097052079, 0, 0, 0.083037967649306, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.841941522964726, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 1.814344759966377, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.357130077154708, 0, 1, 0.2139950964067162, 0, 0.4242447244180517, 2.349380138713622, 0.7860049035932838, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.5929812951208117, 2.291269011223634, 0, 1, 0.2055928689047684, 0, 0.4364393683594394, 2.416911571930336, 0.7944071310952316, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.592827620016811, 0, 0, 0.3856793225588657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8948478104604622, 2.105152189539536, 0, 0, 0.298282603486821, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8951795041766063, 2.104820495823392, 0, 1, 0.298393168058869, 0, 0.4750998966345615, 2.631005636167292, 0.701606831941131, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 5.537794587631781, 0.4444444444444445, 1, 0.1805773009770749],
[0.002016078153814595, 1.815846658148729, 0, 1, 0.00110903761519157, 0, 0.5507072943149883, 3.049703873826883, 0.9988909623848085, 1, 0.1805773009770749],
[0, 1.814344759966377, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9990803487226304, 2.000919651277368, 0, 1, 0.3330267829075436, 0, 0.4997701928518766, 2.767624669034813, 0.6669732170924564, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 1, 0.2139148139313647, 0, 0.4240422529782025, 2.348258893469875, 0.7860851860686353, 1, 0.1805773009770749],
[1.006349625335295, 2.012699250670589, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1794379373042547],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 1, 0.2139148139313647, 0, 0.4240422529782025, 2.348258893469875, 0.7860851860686353, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 3, 0, 0.3333333333333333, 3.000000000000001, 0, -16.61338376289534, 1, 0.03703703703703698, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.894847810460461, 0, 0, 0.3454413031270675, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.894847810460461, 0, 0, 0.3454413031270675, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9988732003375289, 2.00112679966247, 0, 1, 0.3329577334458431, 0, 0.4997184587047008, 2.767338175954587, 0.6670422665541569, 1, 0.1805773009770749],
[0.7503894230458559, 1.842438196970952, 1, 0, 0.2894096843356643, 1.332641384977105, 0, -7.379894248980328, 1, 0.2894096843356643, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.392630538846176, 1.249113902947917, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7075811094047173, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2358603698015727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.594107095467366, 1, 0, 0.3854890963242346, 1, 0, -5.537794587631781, 1, 0.3854890963242346, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2187146280202141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.008480212124766, 1.991519787875233, 1, 0, 0.3361600707082554, 0.9915910971550957, 0, -5.491227810969346, 1, 0.3361600707082554, 0.1805773009770749],
[0.9986713377593294, 2.001328662240669, 0, 2, 0.3328904459197767, 0, 0.9993361099225044, 5.534118100753841, 0.4450351571451144, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.002818460437183, 1.997181539562815, 0, 1, 0.3342728201457279, 0, 0.5007056094754916, 2.772804814150248, 0.6657271798542721, 1, 0.1805773009770749],
[0.9983446724832633, 2.001655327516735, 1, 2, 0.3327815574944213, 1.001658072169223, 0.999173020702426, -0.0137617045628161, 0.7414761370667302, 0.7029673935040097, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.841941522964726, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.354266092487454, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.2483311015132355, 2.751668898486761, 0, 1, 0.08277703383774528, 0, 0.3634158166885322, 2.012522142717536, 0.9172229661622547, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 1, 0.2139148139313647, 0, 0.4240422529782025, 2.348258893469875, 0.7860851860686353, 1, 0.1805773009770749],
[0.9988734129046701, 2.001126587095329, 0, 1, 0.3329578043015569, 0, 0.4997185117866622, 2.767338469911585, 0.6670421956984431, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999669658142047, 0, 1, 0.3333700420263562, 0, 0.5000825991074596, 2.769354710706122, 0.6666299579736439, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8940518056780394, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3089273674797175, 1.118503417418424, 0, -6.194042171227397, 1, 0.3089273674797175, 0.1805773009770749],
[0.2491139029479177, 2.750886097052079, 0, 0, 0.083037967649306, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 1.814344759966377, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7266886300759939, 2.273311369924001, 0, 1, 0.242229543358665, 0, 0.4398869478374319, 2.436003558903993, 0.757770456641335, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9976384789656498, 2.002361521034349, 0, 1, 0.3325461596552168, 0, 0.4994103160169776, 2.765631745046295, 0.6674538403447832, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999669298571704, 0, 1, 0.3333700819874214, 0, 0.5000826890297643, 2.769355208677375, 0.6666299180125785, 1, 0.1805773009770749],
[0.7075811094047173, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2358603698015727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.5929812951203369, 1.514982112010954, 0, 1, 0.2813053078218848, 0, 0.6600738002593457, 3.655353118513744, 0.7186946921781152, 1, 0.1805773009770749],
[1.234572061810904, 1.699591270578471, 0, 0, 0.4207577840615833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9996692848632973, 2.000330715136701, 0, 1, 0.3332230949544326, 0, 0.499917334885127, 2.76843951139016, 0.6667769050455674, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[9.333734951460727, 21.9578484072487, 0, 0, 0.2982826034868209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01589719946387387],
[0.9977474775946055, 2.002252522405393, 0, 2, 0.3325824925315353, 0, 0.9988750058345852, 5.531564601031428, 0.4454461292754182, 1, 0.1805773009770749],
[1.394208720101428, 1.2486615137323, 1, 0, 0.5275358215673719, 0.7172527223379084, 0, -3.971998243727028, 1, 0.5275358215673719, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8948478104604622, 2.105152189539536, 0, 0, 0.298282603486821, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7488090565196608, 2.135806163352709, 1, 3, 0.2595871544187415, 1.335453933540591, 1.40462184793526, 0.3830377019725741, 0.7220039047990221, 0.6994645000379012, 0.1805773009770749],
[0.642539836238943, 2.357460163761054, 1, 0, 0.2141799454129812, 1.556323738390171, 0, -8.618601175059945, 1, 0.2141799454129811, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -2.768897293815891, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.392630538846176, 1.249113902947917, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7258270487848638, 2.274172951215131, 0, 0, 0.241942349594955, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9977460452260262, 2.002253954773972, 1, 1, 0.3325820150753422, 1.002259046562759, 0.4994371456306533, -2.784524401524535, 0.8893892032484247, 0.5545532333991092, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9988732470960924, 2.001126752903906, 0, 1, 0.332957749032031, 0, 0.4997184703811813, 2.767338240616537, 0.667042250967969, 1, 0.1805773009770749],
[1.392630538846176, 1.249113902947917, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.841941522964726, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.354266092487454, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.6425398007351012, 2.357460199264896, 1, 0, 0.2141799335783673, 1.556323824385578, 0, -8.618601651284845, 1, 0.2141799335783673, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.003142427267976441, 2.99685757273202, 0, 1, 0.001047475755992148, 0, 0.333682858037318, 1.847867125224563, 0.9989525242440078, 1, 0.1805773009770749],
[0.7075811094047173, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2358603698015727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[1.392630538846176, 1.249113902947917, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.6419512715811199, 2.358048728418877, 0, 1, 0.2139837571937068, 0, 0.424079446683242, 2.348464864568337, 0.7860162428062931, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 2.132999428768051, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.883885525820135, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3064911966534356, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.2491139029479177, 2.750886097052079, 0, 0, 0.083037967649306, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7075811094047173, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2358603698015727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.883885525820135, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3064911966534356, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.7508860970520813, 1.841941522964726, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8948478104604622, 2.105152189539536, 0, 1, 0.298282603486821, 0, 0.4750250385549236, 2.630591087499033, 0.7017173965131791, 1, 0.1805773009770749],
[0.8940517726838372, 2.105948227316161, 1, 0, 0.2980172575612793, 1.118503458695819, 0, -6.194042399813131, 1, 0.2980172575612793, 0.1805773009770749],
[0.8813946792188742, 2.003220498641492, 1, 1, 0.3055501773628743, 1.134565505757578, 0.4991961697068106, -3.518544870329136, 0.906639089113516, 0.5177394438392647, 0.1805773009770749],
[0.9988745188644718, 2.001125481135527, 0, 1, 0.3329581729548241, 0, 0.4997187879655383, 2.76733999933347, 0.6670418270451759, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.768897293815891, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773009770749],
[0.7075811094047173, 2.292418890595279, 0, 0, 0.2358603698015727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.6417444417940935, 2.358255558205903, 0, 0, 0.2139148139313647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.642088683180646, 2.356627063027158, 0, 1, 0.2141212230577826, 0, 0.4243352780288749, 2.34988160600953, 0.7858787769422174, 1, 0.1805773009770749],
[0.9988745189211373, 2.001125481078861, 0, 1, 0.3329581729737126, 0, 0.4997187879796887, 2.767339999411833, 0.6670418270262874, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.9999999999999996, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773009770749],
[0.8940518056785308, 2.105948194321468, 1, 0, 0.2980172685595104, 1.118503417417809, 0, -6.194042171223993, 1, 0.2980172685595104, 0.1805773009770749],
[0.8957040854974314, 2.104295914502567, 1, 2, 0.298568028499144, 1.116440146016134, 0.9504366692042829, -0.919293155416726, 0.7858018175675867, 0.654890692818427, 0.1805773009770749]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node121":{
"Global MG94xREV":0.002272583467989665,
"Nucleotide GTR":0.002240239409318057,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "F", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAG", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTT", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node168":{
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "F", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "TTC", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node173":{
"Global MG94xREV":0.001135741472785704,
"Nucleotide GTR":0.001119577274924995,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "H", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CAC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node174":{
"Global MG94xREV":0.001137302669716684,
"Nucleotide GTR":0.001121116252454205,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "N", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "AAC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node199":{
"Global MG94xREV":0.001134677997016775,
"Nucleotide GTR":0.001118528934847738,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "R", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AGA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node21":{
"Global MG94xREV":0.001135140389778197,
"Nucleotide GTR":0.001118984746702971,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTG", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node239":{
"Global MG94xREV":0.001134616852430041,
"Nucleotide GTR":0.001118468660488269,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCT", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node240":{
"Global MG94xREV":0.001135383968839313,
"Nucleotide GTR":0.001119224859077142,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCC", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node276":{
"Global MG94xREV":0.001136304791746017,
"Nucleotide GTR":0.00112013257656856,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "K", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "AAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node298":{
"Global MG94xREV":0.001138546577540226,
"Nucleotide GTR":0.001122342456625409,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "H", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CAT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node51":{
"Global MG94xREV":0.001138144930390134,
"Nucleotide GTR":0.001121946525832568,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "I"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "ATC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node52":{
"Global MG94xREV":0.001134658467510542,
"Nucleotide GTR":0.001118509683291029,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "L"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "CTC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node72":{
"Global MG94xREV":0.001135026865007562,
"Nucleotide GTR":0.00111887283764938,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTC", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node97":{
"Global MG94xREV":0.001134674472398249,
"Nucleotide GTR":0.001118525460392592,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAG", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_402121_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002273707169726762,
"Nucleotide GTR":0.00224134711821026,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCA", "TGG", "CAA", "CCA", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_402121_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_402127_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135703554583335,
"Nucleotide GTR":0.001119539896385341,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "N", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "AAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_402127_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414007_England_20200228_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00113495280178679,
"Nucleotide GTR":0.001118799828517575,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAC", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414007_England_20200228_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001134952781183702,
"Nucleotide GTR":0.001118799808207716,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAC", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135870706503672,
"Nucleotide GTR":0.001119704669351683,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "S", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "TCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414588_Minnesota_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136079218078839,
"Nucleotide GTR":0.001119910213330406,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "F", "F", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "TTC", "TTT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414588_Minnesota_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414590_Minnesota_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134670848680308,
"Nucleotide GTR":0.001118521888248441,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "F", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTC", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TTT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414590_Minnesota_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415453_Wales_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134952766830475,
"Nucleotide GTR":0.001118799794058768,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "P", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CCT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415453_Wales_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415622_Washington_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135870722986864,
"Nucleotide GTR":0.001119704685600283,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "F", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TTC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415622_Washington_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136743099966569,
"Nucleotide GTR":0.001120564646661008,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "K", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "AAA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415742_Taoyuan_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135703563171325,
"Nucleotide GTR":0.001119539904851105,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "S", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "AGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415742_Taoyuan_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416153_Copenhagen_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135565690050367,
"Nucleotide GTR":0.001119403993979883,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "G", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GGT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416153_Copenhagen_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416346_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTC", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416346_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002272194026223959,
"Nucleotide GTR":0.002239855510199075,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "G", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "S", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GGT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "AGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416401_Shanghai_20200202_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135870737436869,
"Nucleotide GTR":0.00111970469984463,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "S", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "TCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416401_Shanghai_20200202_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134588561697112,
"Nucleotide GTR":0.001118440772397155,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "S", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "TCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416703_Washington_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135703538675305,
"Nucleotide GTR":0.001119539880703718,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTA", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416703_Washington_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416704_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135565718635181,
"Nucleotide GTR":0.001119404022157871,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "E", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAG", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416704_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417005_Li_ge_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135819260453782,
"Nucleotide GTR":0.001119653955496708,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "N", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "AAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417005_Li_ge_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417388_New_South_Wales_20200305_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001135870720524237,
"Nucleotide GTR":0.001119704683172704,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "F", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "TTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417388_New_South_Wales_20200305_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417538_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134952776607329,
"Nucleotide GTR":0.001118799803696475,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "CTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417538_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001134918841811914,
"Nucleotide GTR":0.001118766351870785,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "G", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "GGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418022_Portugal_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134918834706067,
"Nucleotide GTR":0.001118766344866071,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAG", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418022_Portugal_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001137511815322845,
"Nucleotide GTR":0.00112132242144021,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "L", "N", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CTA", "AAC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135917850429482,
"Nucleotide GTR":0.001119751142311643,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "F", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TTT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418252_Madrid_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001139363672820193,
"Nucleotide GTR":0.001123147922771374,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "-", "D", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "---", "GAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418252_Madrid_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418357_Ontario_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134966052886312,
"Nucleotide GTR":0.001118812891023653,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTG", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418357_Ontario_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418405_Finland_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001134588540925615,
"Nucleotide GTR":0.001118440751921281,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACT", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418405_Finland_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418692_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135870732038155,
"Nucleotide GTR":0.001119704694522752,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCT", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418692_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418992_Singapore_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113556569559573,
"Nucleotide GTR":0.001119403999446325,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "G", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GGT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418992_Singapore_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00113911009176705,
"Nucleotide GTR":0.001122897950756393,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "E", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAA", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0011349020737976,
"Nucleotide GTR":0.001118749822503653,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "CTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419840_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135823661924151,
"Nucleotide GTR":0.001119658294324088,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "TTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419840_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419884_Victoria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871766348038,
"Nucleotide GTR":0.001118719946398392,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAG", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419884_Victoria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419936_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135656469434532,
"Nucleotide GTR":0.001119493481365858,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "S", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "AGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419936_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134514423941637,
"Nucleotide GTR":0.001118367689791443,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "T", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTG", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "ACA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135823649667784,
"Nucleotide GTR":0.001119658282242159,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "I", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ATT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420179_South_Yorkshire_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135823652235999,
"Nucleotide GTR":0.001119658284773823,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "V", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GTT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420179_South_Yorkshire_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420270_South_Yorkshire_20200322_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001134902069135898,
"Nucleotide GTR":0.001118749817908298,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "T", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ACG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420270_South_Yorkshire_20200322_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420282_South_Yorkshire_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135999909274125,
"Nucleotide GTR":0.001119832033271312,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCA", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420282_South_Yorkshire_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113565646397172,
"Nucleotide GTR":0.001119493475980795,
"amino-acid": [
["S", "N", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AAT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136744009318416,
"Nucleotide GTR":0.001120565543070696,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCA", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420687_England_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001135823647845551,
"Nucleotide GTR":0.00111965828044586,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "F", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "TTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420687_England_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420759_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135823642690323,
"Nucleotide GTR":0.001119658275364002,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAT", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420759_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420841_Sud_Kivu_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871788391818,
"Nucleotide GTR":0.001118719968128439,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "S", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AGC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420841_Sud_Kivu_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420943_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135823677146198,
"Nucleotide GTR":0.001119658309329492,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "F", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "TTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420943_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113565646397172,
"Nucleotide GTR":0.001119493475980795,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "T", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "ACT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421236_Hangzhou_20200120_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001134871788391818,
"Nucleotide GTR":0.001118719968128439,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGG", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421236_Hangzhou_20200120_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001138858617184151,
"Nucleotide GTR":0.001122650055231769,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "K", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "AAG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135565753157513,
"Nucleotide GTR":0.00111940405618887,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACG", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135533970249725,
"Nucleotide GTR":0.001119372725624527,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "Y", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "TAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421414_New_York_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135932153238581,
"Nucleotide GTR":0.001119765241559066,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCT", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421414_New_York_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTG", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421552_Wyoming_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871778482942,
"Nucleotide GTR":0.001118719958360587,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTG", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421552_Wyoming_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421969_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134902088086772,
"Nucleotide GTR":0.001118749836589458,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCC", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421969_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136048912678273,
"Nucleotide GTR":0.001119880339244978,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "S", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "TCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001135823647845551,
"Nucleotide GTR":0.00111965828044586,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "I", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ATT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422507_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134588552499995,
"Nucleotide GTR":0.001118440763330932,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "I", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "ATT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422507_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422534_New_York_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001134902037848098,
"Nucleotide GTR":0.001118749787065795,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "T", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ACC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422534_New_York_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135823661237967,
"Nucleotide GTR":0.001119658293647672,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "TTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422804_Netherlands_20200307_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001134902088675728,
"Nucleotide GTR":0.001118749837170031,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAC", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422804_Netherlands_20200307_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422849_Netherlands_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113565646397172,
"Nucleotide GTR":0.001119493475980795,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "T", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "ACA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422849_Netherlands_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422875_Noord_Brabant_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001134902088154127,
"Nucleotide GTR":0.001118749836655853,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "A", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GCG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422875_Noord_Brabant_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422886_Noord_Brabant_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCT", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422886_Noord_Brabant_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422957_Zuid_Holland_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136905096208075,
"Nucleotide GTR":0.001120724337325616,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "K", "N", "Y", "G", "D", "S", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "AAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422957_Zuid_Holland_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422958_Zuid_Holland_20200329_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "K", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "AAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422958_Zuid_Holland_20200329_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423092_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113565646397172,
"Nucleotide GTR":0.001119493475980795,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTA", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423092_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423107_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871787400167,
"Nucleotide GTR":0.001118719967150901,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGG", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423107_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423217_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135823652235999,
"Nucleotide GTR":0.001119658284773823,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "V", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GTT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423217_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423319_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135823640171549,
"Nucleotide GTR":0.001119658272881077,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "V", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GTC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423319_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423445_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0011349020737976,
"Nucleotide GTR":0.001118749822503653,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCC", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423445_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423829_England_20200323_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001135823642675486,
"Nucleotide GTR":0.001119658275349376,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAT", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423829_England_20200323_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423903_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135823654698502,
"Nucleotide GTR":0.001119658287201279,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "V", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GTT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423903_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423969_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135823647220118,
"Nucleotide GTR":0.001119658279829328,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTT", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423969_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424099_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134588568806096,
"Nucleotide GTR":0.001118440779404961,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "Y", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "TAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424099_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424140_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134588494601406,
"Nucleotide GTR":0.001118440706256373,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "D", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAT", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424140_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424185_USA_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001139231741624099,
"Nucleotide GTR":0.001123017869257844,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "-", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "L", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "---", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "CTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424185_USA_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424440_Reykjavik_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135823652235999,
"Nucleotide GTR":0.001119658284773823,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "I", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ATA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424440_Reykjavik_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_14":{
"Global MG94xREV":0.001134588654768783,
"Nucleotide GTR":0.001118440864144202,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "N", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAT", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424973_Taoyuan_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134588561630248,
"Nucleotide GTR":0.001118440772331241,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "C", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGT", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424973_Taoyuan_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425130_Duesseldorf_20200321_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00113565646397172,
"Nucleotide GTR":0.001119493475980795,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "R", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "AGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425130_Duesseldorf_20200321_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425645_England_20200318_null_14":{
"Global MG94xREV":0.001134588536270231,
"Nucleotide GTR":0.001118440747332155,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "I", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "ATA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425645_England_20200318_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425672_Scotland_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001135823661732235,
"Nucleotide GTR":0.001119658294134904,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "M", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ATG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425672_Scotland_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425797_Scotland_20200306_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001135823652235999,
"Nucleotide GTR":0.001119658284773823,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAT", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425797_Scotland_20200306_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425896_Scotland_20200322_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001135397815317865,
"Nucleotide GTR":0.001119238508488645,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCT", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425896_Scotland_20200322_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425919_Scotland_20200324_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001134588550595813,
"Nucleotide GTR":0.001118440761453852,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGT", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425919_Scotland_20200324_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001138590850342805,
"Nucleotide GTR":0.001122386099324784,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCT", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001135823642675486,
"Nucleotide GTR":0.001119658275349376,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAT", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_426054_Connecticut_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003422556996402249,
"Nucleotide GTR":0.003373846185178897,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "N", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTA", "AAC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426054_Connecticut_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426086_Washington_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00113582365217172,
"Nucleotide GTR":0.001119658284710457,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "I", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ATA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426086_Washington_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426161_Iowa_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001133720499516433,
"Nucleotide GTR":0.001117585064726,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "R", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "L"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "CGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "CTC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426161_Iowa_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871788391818,
"Nucleotide GTR":0.001118719968128439,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "R", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CGA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426914_Victoria_20200329_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001134588596696078,
"Nucleotide GTR":0.001118440806898004,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "F", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "TTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426914_Victoria_20200329_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427032_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135823661223132,
"Nucleotide GTR":0.001119658293633047,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "TTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427032_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427080_Victoria_20200323_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001135823652250837,
"Nucleotide GTR":0.001119658284788449,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "S", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "TCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427080_Victoria_20200323_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427158_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871782892095,
"Nucleotide GTR":0.001118719962706989,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "A", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "GCG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427158_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427380_Liege_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135919085580389,
"Nucleotide GTR":0.001119752359883528,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "I", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ATA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427380_Liege_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427527_New_York_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "R", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AGA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427527_New_York_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427717_New_South_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135823689144962,
"Nucleotide GTR":0.001119658321157487,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "V", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GTA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427717_New_South_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113458866372552,
"Nucleotide GTR":0.001118440872973464,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "S", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "TCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427775_New_South_Wales_20200325_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001134588564152024,
"Nucleotide GTR":0.001118440774817127,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACT", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427775_New_South_Wales_20200325_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428286_Wisconsin_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001135823684735976,
"Nucleotide GTR":0.00111965831681125,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "I", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ATT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428286_Wisconsin_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428306_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134902046677428,
"Nucleotide GTR":0.001118749795769463,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAC", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428306_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428346_Istanbul_20200417_null_29":{
"Global MG94xREV":0.001135278070570315,
"Nucleotide GTR":0.001119120467982631,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "V", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GTT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428346_Istanbul_20200417_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871787400167,
"Nucleotide GTR":0.001118719967150901,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTG", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428717_Kocaeli_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "N", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "AAC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428717_Kocaeli_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428773_New_York_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135823643376504,
"Nucleotide GTR":0.001119658276040418,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAT", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428773_New_York_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428789_New_York_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135823649724051,
"Nucleotide GTR":0.001119658282297626,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "V", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GTA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428789_New_York_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428922_Sverdlovsk_Region_20200330_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001135823647845551,
"Nucleotide GTR":0.00111965828044586,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "I", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ATA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428922_Sverdlovsk_Region_20200330_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428957_Luxembourg_20200407_null_5":{
"Global MG94xREV":0.00113553309515818,
"Nucleotide GTR":0.001119371862987536,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "C", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "TGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428957_Luxembourg_20200407_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429129_Norrbotten_20200327_null_5":{
"Global MG94xREV":0.00113458864597344,
"Nucleotide GTR":0.001118440855474036,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "I", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATT", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429129_Norrbotten_20200327_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135823640237235,
"Nucleotide GTR":0.001119658272945828,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "S", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "TCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429315_Unknown_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001136067027764576,
"Nucleotide GTR":0.001119898196512186,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "V", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GTA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429315_Unknown_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429467_Unknown_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135823661223132,
"Nucleotide GTR":0.001119658293633047,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "L", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TTA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429467_Unknown_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "H", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CAT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429607_Washington_20200331_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001136010325267013,
"Nucleotide GTR":0.001119842301020805,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "H", "G", "C", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CAT", "GGA", "TGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429607_Washington_20200331_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429640_Connecticut_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134797194574002,
"Nucleotide GTR":0.001118646435951198,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "I", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "ATA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429640_Connecticut_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001135823647845551,
"Nucleotide GTR":0.00111965828044586,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_429844_Iowa_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "L"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "CTC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429844_Iowa_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430234_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134902073715049,
"Nucleotide GTR":0.001118749822422277,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCC", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430234_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001134588651264037,
"Nucleotide GTR":0.001118440860689335,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "H", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAT", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430394_New_Jersey_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00113458865382017,
"Nucleotide GTR":0.001118440863209088,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "F", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "TTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430394_New_Jersey_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430398_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871788391818,
"Nucleotide GTR":0.001118719968128439,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "M", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATG", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430398_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430639_Victoria_20200326_null_45":{
"Global MG94xREV":0.001134989908298318,
"Nucleotide GTR":0.001118836406918605,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "R", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "CGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430639_Victoria_20200326_null_45",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001135823654698502,
"Nucleotide GTR":0.001119658287201279,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAT", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001135823654698502,
"Nucleotide GTR":0.001119658287201279,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAT", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430719_Madrid_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "I"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "ATC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430719_Madrid_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430742_Beijing_20200129_null_28":{
"Global MG94xREV":0.001134871788391818,
"Nucleotide GTR":0.001118719968128439,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "R", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AGG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430742_Beijing_20200129_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430802_Buenos_Aires_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001138858625168684,
"Nucleotide GTR":0.001122650063102664,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "M", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "ATG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430802_Buenos_Aires_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135812259608159,
"Nucleotide GTR":0.001119647054289124,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "S", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "AGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430867_Washington_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135823661223132,
"Nucleotide GTR":0.001119658293633047,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "L", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CTC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430867_Washington_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430881_USA_20200313_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCC", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430881_USA_20200313_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430892_Washington_20200312_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001135823661223132,
"Nucleotide GTR":0.001119658293633047,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGT", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430892_Washington_20200312_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430918_Washington_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135823668271695,
"Nucleotide GTR":0.001119658300581296,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "M", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ATG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430918_Washington_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431784_Fujian_20200318_null_13845":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431784_Fujian_20200318_null_13845",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432276_Wales_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135870734566468,
"Nucleotide GTR":0.001119704697015082,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "F", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "TTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432276_Wales_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432352_Wales_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001135703571113324,
"Nucleotide GTR":0.001119539912680071,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAA", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432352_Wales_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432378_Wales_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134952749304588,
"Nucleotide GTR":0.001118799776782315,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTC", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432378_Wales_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432403_Wales_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001135870722986864,
"Nucleotide GTR":0.001119704685600283,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAT", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432403_Wales_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432745_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134793800394788,
"Nucleotide GTR":0.001118643090078913,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "N", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAT", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432745_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432942_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAG", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432942_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433194_Scotland_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135870713490504,
"Nucleotide GTR":0.001119704676239078,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "F", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TTT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433194_Scotland_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433696_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135870745928618,
"Nucleotide GTR":0.001119704708215524,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "I", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ATT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433696_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433827_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "F", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAG", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTT", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433827_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433893_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134851226549026,
"Nucleotide GTR":0.00111869969892768,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "V", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "F", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAG", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GTA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTT", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433893_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434024_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871782383348,
"Nucleotide GTR":0.001118719962205482,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "V", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "GTT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434024_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434077_Washington_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "H", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CAC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434077_Washington_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434340_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871784895548,
"Nucleotide GTR":0.001118719964681927,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "G", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "GGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434340_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434370_Antwerp_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871781343312,
"Nucleotide GTR":0.001118719961180249,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "G", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GGT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434370_Antwerp_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134588536270231,
"Nucleotide GTR":0.001118440747332155,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "F", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "TTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135565722045713,
"Nucleotide GTR":0.001119404025519864,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGG", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434622_Occitanie_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134918830668533,
"Nucleotide GTR":0.001118766340886001,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "S", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AGT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434622_Occitanie_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871773396545,
"Nucleotide GTR":0.001118719953346582,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "V", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "GTA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434941_Texas_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134952815520469,
"Nucleotide GTR":0.001118799842055794,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "CTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434941_Texas_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135656445681752,
"Nucleotide GTR":0.001119493457951135,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "I", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATA", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":5294.622569014438,
"Equilibrium frequencies": [
[0.03664239121591539],
[0.01166403148402283],
[0.01683666603160466],
[0.05006938327411346],
[0.02214602647583784],
[0.007049538566903888],
[0.01017578927924346],
[0.030261067873097],
[0.01754295944778515],
[0.005584287065660322],
[0.008060744389958163],
[0.0239712838383722],
[0.03149385920003237],
[0.01002514718807449],
[0.01447098761303039],
[0.04303425772012602],
[0.01666812220653309],
[0.005305808265921742],
[0.007658768919084049],
[0.02277587710640948],
[0.01007392431114191],
[0.003206738600667134],
[0.004628827257886209],
[0.01376534556483564],
[0.007980052126427042],
[0.002540215748975461],
[0.003666722288284816],
[0.01090420890140856],
[0.01432612546512741],
[0.004560302232588147],
[0.006582654187657153],
[0.01957569478803409],
[0.03079699564038676],
[0.009803321094578602],
[0.01415078855849237],
[0.04208204015189854],
[0.01861317065279386],
[0.005924957441570552],
[0.008552491463336566],
[0.02543365605889906],
[0.01474441016824955],
[0.00469345091051566],
[0.006774850155739541],
[0.02014725293212226],
[0.02646978573988573],
[0.008425880626242116],
[0.01216249615928495],
[0.03616919648023283],
[0.009653385174449771],
[0.04143842057132979],
[0.01832849336420796],
[0.005834338768862043],
[0.008421686232682794],
[0.02504466353415761],
[0.00462166739204692],
[0.006671232883385021],
[0.01983911277458763],
[0.02606494623271937],
[0.00829701183245243],
[0.01197647807060741],
[0.03561601029952278]
],
"Log Likelihood":-2463.581837571494,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.625016426152634, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":183
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":5659.943200587383,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3154430708610275],
[0.159727785114782],
[0.1944691015898446],
[0.3303600424343459]
],
"Log Likelihood":-2514.254034567295,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2156482065930219,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.09102808181556647,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.752306972506806,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.6558180415157091
},
"display order":0,
"estimated parameters":315
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-03/sequences.methyltransferase.compressed.fas",
"number of sequences":155,
"number of sites":299,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1,epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_4,epi_isl_420759_England_20200326_null_2,epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1,epi_isl_434622_Occitanie_20200301_null_1,epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1,epi_isl_434024_England_20200415_null_1,(epi_isl_429598_Washington_20200331_null_3,epi_isl_429607_Washington_20200331_null_6)Node298,epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1,epi_isl_423319_England_20200326_null_2,epi_isl_421552_Wyoming_20200319_null_1,epi_isl_416401_Shanghai_20200202_null_2,epi_isl_422507_New_York_20200320_null_1,epi_isl_428773_New_York_20200405_null_2,(epi_isl_422957_Zuid_Holland_20200329_null_1,epi_isl_422958_Zuid_Holland_20200329_null_10)Node276,epi_isl_434941_Texas_20200401_null_1,epi_isl_430892_Washington_20200312_null_3,epi_isl_420270_South_Yorkshire_20200322_null_9,epi_isl_433194_Scotland_20200419_null_1,epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1,epi_isl_432378_Wales_20200408_null_1,epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1,epi_isl_422804_Netherlands_20200307_null_3,epi_isl_430918_Washington_20200406_null_1,epi_isl_424185_USA_20200318_null_1,epi_isl_418252_Madrid_20200304_null_1,epi_isl_431784_Fujian_20200318_null_13845,((epi_isl_420282_South_Yorkshire_20200321_null_1,epi_isl_430881_USA_20200313_null_10)Node240,epi_isl_422886_Noord_Brabant_20200324_null_2)Node239,epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2,epi_isl_428789_New_York_20200406_null_2,epi_isl_417538_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_14,epi_isl_422875_Noord_Brabant_20200311_null_3,epi_isl_420943_Wales_20200321_null_1,epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1,epi_isl_427380_Liege_20200408_null_2,epi_isl_430742_Beijing_20200129_null_28,epi_isl_421236_Hangzhou_20200120_null_2,epi_isl_414007_England_20200228_null_3,epi_isl_430324_New_York_20200410_null_2,epi_isl_425130_Duesseldorf_20200321_null_4,(epi_isl_427527_New_York_20200312_null_1,epi_isl_429640_Connecticut_20200407_null_1)Node199,epi_isl_428306_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_402121_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_425896_Scotland_20200322_null_3,epi_isl_420841_Sud_Kivu_20200322_null_1,epi_isl_418022_Portugal_20200315_null_1,epi_isl_426914_Victoria_20200329_null_4,epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_2,epi_isl_428286_Wisconsin_20200323_null_3,epi_isl_428957_Luxembourg_20200407_null_5,epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_1,epi_isl_423969_England_20200320_null_2,epi_isl_421969_England_20200401_null_1,epi_isl_417388_New_South_Wales_20200305_null_4,epi_isl_424973_Taoyuan_20200317_null_1,epi_isl_423092_England_20200324_null_1,epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_2,epi_isl_427032_Victoria_20200330_null_1,epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_2,epi_isl_430394_New_Jersey_20200409_null_2,epi_isl_422849_Netherlands_20200316_null_1,epi_isl_427158_Victoria_20200330_null_1,epi_isl_417005_Li_ge_20200305_null_2,epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1,epi_isl_423829_England_20200323_null_7,epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_6,epi_isl_415622_Washington_20200309_null_1,epi_isl_418405_Finland_20200314_null_2,epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_5,epi_isl_434370_Antwerp_20200405_null_1,((epi_isl_428717_Kocaeli_20200319_null_1,epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_3)Node174,epi_isl_434077_Washington_20200404_null_2)Node173,epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1,epi_isl_422119_Wales_20200327_null_9,epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_2,epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_1,epi_isl_423903_England_20200318_null_1,epi_isl_425797_Scotland_20200306_null_5,epi_isl_416703_Washington_20200313_null_2,epi_isl_425645_England_20200318_null_14,epi_isl_423107_England_20200323_null_1,epi_isl_419840_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_432403_Wales_20200330_null_3,epi_isl_427775_New_South_Wales_20200325_null_11,epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1,epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1,(epi_isl_414590_Minnesota_20200309_null_1,epi_isl_416346_Shanghai_20200130_null_1)Node72,epi_isl_414588_Minnesota_20200305_null_1,epi_isl_430867_Washington_20200311_null_1,epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1,epi_isl_433696_England_20200401_null_1,epi_isl_416704_Washington_20200315_null_1,epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1,epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_1,epi_isl_424140_England_20200321_null_1,(epi_isl_433827_England_20200408_null_1,epi_isl_433893_England_20200410_null_1)Node121,epi_isl_429315_Unknown_20200318_null_4,epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1,epi_isl_432276_Wales_20200407_null_2,epi_isl_425919_Scotland_20200324_null_7,epi_isl_423445_England_20200327_null_1,epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_430802_Buenos_Aires_20200331_null_1,epi_isl_423217_England_20200325_null_1,epi_isl_426086_Washington_20200325_null_3,epi_isl_415453_Wales_20200310_null_1,epi_isl_429129_Norrbotten_20200327_null_5,epi_isl_430398_New_York_20200410_null_1,epi_isl_419936_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_418692_England_20200317_null_1,epi_isl_424099_England_20200313_null_1,epi_isl_430234_Washington_20200319_null_1,epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_9,epi_isl_427080_Victoria_20200323_null_11,epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1,epi_isl_402127_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_428922_Sverdlovsk_Region_20200330_null_6,(epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1,epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_4)Node21,epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_424440_Reykjavik_20200319_null_2,epi_isl_420687_England_20200328_null_3,epi_isl_415742_Taoyuan_20200227_null_1,epi_isl_418992_Singapore_20200210_null_1,epi_isl_425672_Scotland_20200311_null_3,epi_isl_427717_New_South_Wales_20200317_null_1,epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_1,epi_isl_421414_New_York_20200318_null_2,epi_isl_420179_South_Yorkshire_20200327_null_1,epi_isl_432352_Wales_20200327_null_3,epi_isl_416153_Copenhagen_20200302_null_1,epi_isl_429467_Unknown_20200323_null_2,epi_isl_434340_Washington_20200325_null_1,epi_isl_418357_Ontario_20200312_null_1,((epi_isl_426161_Iowa_20200406_null_1,epi_isl_429844_Iowa_20200409_null_1)Node52,epi_isl_430719_Madrid_20200311_null_2)Node51,epi_isl_430639_Victoria_20200326_null_45,epi_isl_419884_Victoria_20200319_null_1,epi_isl_426054_Connecticut_20200330_null_1,epi_isl_428346_Istanbul_20200417_null_29,(epi_isl_432745_England_20200401_null_1,epi_isl_432942_England_20200330_null_1)Node97,epi_isl_422534_New_York_20200319_null_3)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node121":"test",
"Node173":"test",
"Node174":"test",
"Node199":"test",
"Node21":"test",
"Node239":"test",
"Node240":"test",
"Node276":"test",
"Node298":"test",
"Node51":"test",
"Node52":"test",
"Node72":"test",
"Node97":"test",
"epi_isl_402121_Hubei_20191230_null_1":"test",
"epi_isl_402127_Hubei_20191230_null_1":"test",
"epi_isl_414007_England_20200228_null_3":"test",
"epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_2":"test",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_414588_Minnesota_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_414590_Minnesota_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_415453_Wales_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_415622_Washington_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_415742_Taoyuan_20200227_null_1":"test",
"epi_isl_416153_Copenhagen_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_416346_Shanghai_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_416401_Shanghai_20200202_null_2":"test",
"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1":"test",
"epi_isl_416703_Washington_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_416704_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_417005_Li_ge_20200305_null_2":"test",
"epi_isl_417388_New_South_Wales_20200305_null_4":"test",
"epi_isl_417538_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_2":"test",
"epi_isl_418022_Portugal_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1":"test",
"epi_isl_418252_Madrid_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_418357_Ontario_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418405_Finland_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_418692_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418992_Singapore_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_2":"test",
"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419840_Victoria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419884_Victoria_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419936_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_420179_South_Yorkshire_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420270_South_Yorkshire_20200322_null_9":"test",
"epi_isl_420282_South_Yorkshire_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420687_England_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_420759_England_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_420841_Sud_Kivu_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420943_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421236_Hangzhou_20200120_null_2":"test",
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":"test",
"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_1":"test",
"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421414_New_York_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_421552_Wyoming_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421969_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_9":"test",
"epi_isl_422507_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422534_New_York_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422804_Netherlands_20200307_null_3":"test",
"epi_isl_422849_Netherlands_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_422875_Noord_Brabant_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_422886_Noord_Brabant_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_422957_Zuid_Holland_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422958_Zuid_Holland_20200329_null_10":"test",
"epi_isl_423092_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423107_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423217_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423319_England_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_423445_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423829_England_20200323_null_7":"test",
"epi_isl_423903_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423969_England_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_424099_England_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_424140_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424185_USA_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_424440_Reykjavik_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_14":"test",
"epi_isl_424973_Taoyuan_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425130_Duesseldorf_20200321_null_4":"test",
"epi_isl_425645_England_20200318_null_14":"test",
"epi_isl_425672_Scotland_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_425797_Scotland_20200306_null_5":"test",
"epi_isl_425896_Scotland_20200322_null_3":"test",
"epi_isl_425919_Scotland_20200324_null_7":"test",
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_6":"test",
"epi_isl_426054_Connecticut_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_426086_Washington_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_426161_Iowa_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426914_Victoria_20200329_null_4":"test",
"epi_isl_427032_Victoria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427080_Victoria_20200323_null_11":"test",
"epi_isl_427158_Victoria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427380_Liege_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_427527_New_York_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_427717_New_South_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_427775_New_South_Wales_20200325_null_11":"test",
"epi_isl_428286_Wisconsin_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_428306_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_428346_Istanbul_20200417_null_29":"test",
"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_428717_Kocaeli_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_428773_New_York_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_428789_New_York_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_428922_Sverdlovsk_Region_20200330_null_6":"test",
"epi_isl_428957_Luxembourg_20200407_null_5":"test",
"epi_isl_429129_Norrbotten_20200327_null_5":"test",
"epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_429315_Unknown_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_429467_Unknown_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_429607_Washington_20200331_null_6":"test",
"epi_isl_429640_Connecticut_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_5":"test",
"epi_isl_429844_Iowa_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_430234_Washington_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_2":"test",
"epi_isl_430394_New_Jersey_20200409_null_2":"test",
"epi_isl_430398_New_York_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430639_Victoria_20200326_null_45":"test",
"epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_9":"test",
"epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_4":"test",
"epi_isl_430719_Madrid_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_430742_Beijing_20200129_null_28":"test",
"epi_isl_430802_Buenos_Aires_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_430867_Washington_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_430881_USA_20200313_null_10":"test",
"epi_isl_430892_Washington_20200312_null_3":"test",
"epi_isl_430918_Washington_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_431784_Fujian_20200318_null_13845":"test",
"epi_isl_432276_Wales_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_432352_Wales_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_432378_Wales_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_432403_Wales_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_432745_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_432942_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_433194_Scotland_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_433696_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_433827_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_433893_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_434024_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_434077_Washington_20200404_null_2":"test",
"epi_isl_434340_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_434370_Antwerp_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_434622_Occitanie_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_434941_Texas_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":3
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":9
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":13
}
}
}