{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[244.094817779426, 618.0198394115838, 0, 1, 0.2831349818071176, 0, 0.001618071033046608, 0.008960544937221811, 0.7168650181928824, 1, 0.001135823658792793],
[244.1144755403904, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2831993550501488, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523622322364, 1, 0.2831993550501488, 0.001135823663823513],
[244.1144755403904, 618.0001816506194, 1, 0, 0.2831577836012878, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523622322364, 1, 0.2831577836012877, 0.001135823651815331],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001135565731168652],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001134918839786274],
[244.2410272247236, 617.8210538715164, 0, 1, 0.28332185416871, 0, 0.001618591651633747, 0.00896342801599273, 0.71667814583129, 1, 0.001135823649362245],
[244.3872366700213, 617.7274205209885, 0, 1, 0.2834741697424533, 0, 0.001618836993113572, 0.00896478666670091, 0.7165258302575467, 1, 0.001134871791500711],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[242.8087960769543, 616.2729427802502, 0, 1, 0.2826375944155806, 0, 0.001622657641740047, 0.008985944633815869, 0.7173624055844194, 1, 0.001136010334393523],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.00113854658668711],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001135917859555249],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823649296559],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001134871787600304],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135870746562257],
[244.2739455585289, 617.840711632481, 0, 1, 0.2833427590181983, 0, 0.001618540153104777, 0.008963142827720018, 0.7166572409818017, 1, 0.001134588561615081],
[244.1144755403904, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2831993550501488, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523622322364, 1, 0.2831993550501488, 0.001135823652501515],
[243.3461794142631, 616.5472111130273, 0, 1, 0.2829957551656981, 0, 0.001621935809578542, 0.008981947275610819, 0.7170042448343019, 1, 0.001136905105341773],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.2410272247236, 618.2629966344265, 0, 1, 0.2831766814627743, 0, 0.001617434660401149, 0.008957020836258383, 0.7168233185372257, 1, 0.001136304800874893],
[244.4921358605307, 617.8016491095821, 1, 0, 0.2835369338409471, 0.004090111105129552, 0, -0.02265019495883135, 1, 0.283536933840947, 0.001134952824638486],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001135823670348141],
[244.7410272247236, 617.3736299662862, 0, 1, 0.2838845450350566, 0, 0.001619764679703939, 0.008969924004438794, 0.7161154549649434, 1, 0.001134902078253505],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001135870722615894],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.0011345885708122],
[244.3675789090568, 617.747078281953, 1, 0, 0.283451367948283, 0.004092195881566423, 0, -0.02266174002240713, 1, 0.2834513679482831, 0.001134952758422602],
[244.2410272247236, 617.8210538715164, 0, 1, 0.28332185416871, 0, 0.001618591651633747, 0.00896342801599273, 0.71667814583129, 1, 0.001134588672840608],
[244.3675789090568, 617.747078281953, 1, 0, 0.283451367948283, 0.004092195881566423, 0, -0.02266174002240713, 1, 0.2834513679482831, 0.001134902097793334],
[243.7410272247236, 618.3736299662862, 0, 1, 0.2827246065145143, 0, 0.001617145284889526, 0.008955418334129198, 0.7172753934854857, 1, 0.001135823677396706],
[244.2936033194934, 617.8210538715165, 0, 1, 0.2833655608123685, 0, 0.001618591651633747, 0.008963428015992729, 0.7166344391876315, 1, 0.001139231750776489],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001139363681973641],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.3461794142631, 615.7684777767466, 1, 0, 0.28325227299685, 0.004109372098658013, 0, -0.02275685838368876, 1, 0.2832522729968501, 0.001135999918400552],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.3461794142631, 615.7684777767466, 1, 0, 0.28325227299685, 0.004109372098658013, 0, -0.02275685838368876, 1, 0.2832522729968501, 0.00113538397796079],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001134616861545354],
[244.3655841761976, 617.7490730148122, 0, 1, 0.2834490541808014, 0, 0.001618780251858059, 0.008964472445285759, 0.7165509458191985, 1, 0.001135656454805419],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823658849062],
[244.5711650990484, 617.5764104257668, 1, 0, 0.2836766837164398, 0.004088789451507957, 0, -0.02264287591261776, 1, 0.2836766837164398, 0.001134952785725343],
[244.2654856356123, 617.9072287924874, 0, 1, 0.2833138668713722, 0, 0.001618365918706271, 0.008962177953418745, 0.7166861331286278, 1, 0.001134588663883873],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001134902097271734],
[244.0618994456206, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001135823686271208],
[244.1164702732496, 617.9401296806702, 0, 1, 0.2831791674540843, 0, 0.001618279752306692, 0.008961700781601354, 0.7168208325459158, 1, 0.001136743109098967],
[243.8655841761976, 618.2490730148122, 0, 1, 0.2828690849205303, 0, 0.001617471086731483, 0.008957222557791734, 0.7171309150794698, 1, 0.001135919094706166],
[244.3075269391076, 617.8651874889921, 0, 1, 0.2833626289149765, 0, 0.00161847603692321, 0.00896278776547961, 0.7166373710850236, 1, 0.001134871797509183],
[244.2410272247236, 618.0772161562778, 1, 0, 0.2832376899125972, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2832376899125972, 0.001134871797509183],
[244.3675789090568, 617.747078281953, 1, 0, 0.283451367948283, 0.004092195881566423, 0, -0.02266174002240713, 1, 0.2834513679482831, 0.001134952810904804],
[244.2654856356123, 618.2965954606278, 0, 1, 0.2831859769735907, 0, 0.001617346767460372, 0.008956534103210571, 0.7168140230264093, 1, 0.001134588660379123],
[244.1829699876337, 618.0772161562778, 0, 1, 0.2831894292599049, 0, 0.001617920825845738, 0.008959713120604496, 0.7168105707400951, 1, 0.001135656473095387],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.1617930315951, 616.0109213965046, 0, 1, 0.2830185234565479, 0, 0.001623347842166479, 0.008989766821971034, 0.7169814765434521, 1, 0.001134797203690766],
[244.3075269391076, 617.8071302519022, 0, 1, 0.2833817113551045, 0, 0.001618628130096627, 0.008963630026225411, 0.7166182886448955, 1, 0.001134678006132582],
[244.3675789090568, 617.747078281953, 1, 0, 0.283451367948283, 0.004092195881566423, 0, -0.02266174002240713, 1, 0.2834513679482831, 0.001134902055795033],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 2, 0, 0.2833045757747854, 0.008188632445276366, 0, -0.04534696407124784, 1, 0.08026148265493105, 0.002273707187993333],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001135397824439453],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001134871797509183],
[244.161997986206, 617.9526592048038, 1, 0, 0.2832129067167797, 0.004095641452182479, 0, -0.02268082088456273, 1, 0.2832129067167797, 0.001134918843823809],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001134588605811166],
[243.9899185889165, 617.9456108229904, 1, 0, 0.2830721211311352, 0.00409852999576117, 0, -0.02269681704543043, 1, 0.2830721211311352, 0.001135823670362977],
[244.094817779426, 618.0198394115838, 0, 1, 0.2831349818071176, 0, 0.001618071033046608, 0.008960544937221811, 0.7168650181928824, 1, 0.001135823693860987],
[244.0618994456206, 618.0198394115838, 0, 1, 0.2831076085304333, 0, 0.001618071033046608, 0.008960544937221811, 0.7168923914695667, 1, 0.001135533104280857],
[244.0618994456206, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001135812268733077],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001135823656345127],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001134902097204378],
[244.1884511299538, 617.926206061056, 0, 1, 0.2832435907372023, 0, 0.001618316216712117, 0.008961902713986735, 0.7167564092627976, 1, 0.001135870729649625],
[244.5618994456207, 618.1126670316006, 0, 1, 0.2834926505881616, 0, 0.001617828032553288, 0.008959199250415923, 0.7165073494118384, 1, 0.001134588570745335],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001135656473095387],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 2, 0.2833045757747854, 0, 0.003236907844908559, 0.01792533060018849, 0.5136523311053603, 1, 0.002272194044478369],
[244.2955980523526, 617.6154729486657, 0, 1, 0.2834348069907365, 0, 0.001619130419815627, 0.008966411603490362, 0.7165651930092636, 1, 0.001139110100918462],
[243.9108893503988, 618.1708495068057, 1, 0, 0.2829324394154697, 0.004099857954941137, 0, -0.02270417101053077, 1, 0.2829324394154697, 0.001135823670348141],
[244.3675789090568, 617.747078281953, 1, 0, 0.283451367948283, 0.004092195881566423, 0, -0.02266174002240713, 1, 0.2834513679482831, 0.001134952790301715],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001134588662935257],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135656473095387],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001134871792009457],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135819269578756],
[244.2410272247236, 617.6945021871833, 0, 1, 0.2833634522426146, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264420410781, 0.7166365477573854, 1, 0.001135533979372407],
[244.1144755403904, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2831993550501488, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523622322364, 1, 0.2831993550501488, 0.001135823651800496],
[244.1144755403904, 618.0001816506193, 1, 0, 0.2831577836012879, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523622322364, 1, 0.283157783601288, 0.001135823651800496],
[244.1884511299538, 617.926206061056, 0, 1, 0.2832435907372023, 0, 0.001618316216712117, 0.008961902713986735, 0.7167564092627976, 1, 0.001135870732112252],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001134588550040702],
[244.1144755403904, 618.0001816506193, 1, 0, 0.2831577836012879, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523622322364, 1, 0.283157783601288, 0.001135823656970562],
[244.4201550038266, 617.6945021871833, 0, 1, 0.2835123529858661, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264420410781, 0.7164876470141339, 1, 0.001134871790460675],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.6884511299538, 615.426206061056, 0, 1, 0.2836506735046587, 0, 0.001624890182042054, 0.008998307983317669, 0.7163493264953413, 1, 0.001137511824461417],
[243.2410272247236, 615.8736299662862, 0, 1, 0.2831298770062108, 0, 0.001623709721188649, 0.00899177083364529, 0.7168701229937892, 1, 0.001137302678853578],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.1884511299538, 617.926206061056, 0, 1, 0.2832435907372023, 0, 0.001618316216712117, 0.008961902713986735, 0.7167564092627976, 1, 0.001135741481910052],
[244.537441034732, 617.5191589191878, 0, 1, 0.2836675005420798, 0, 0.001619382954449946, 0.008967810088410249, 0.7163324994579202, 1, 0.001138858626333544],
[244.094817779426, 618.0198394115838, 0, 1, 0.2831349818071176, 0, 0.001618071033046608, 0.008960544937221811, 0.7168650181928824, 1, 0.001135823656970562],
[244.3781137003312, 617.7365434906786, 0, 1, 0.2834635876584881, 0, 0.001618813085509308, 0.008964654271300476, 0.7165364123415119, 1, 0.001134918850929654],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001135565762280449],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823663823513],
[244.1144755403904, 618.0001816506194, 1, 0, 0.2831577836012878, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523622322364, 1, 0.2831577836012877, 0.001135823661361009],
[244.3200564632412, 617.6483912824709, 1, 0, 0.2834443152788322, 0.004092991850427365, 0, -0.02266614793442176, 1, 0.2834443152788322, 0.001135703547799349],
[243.9236414132875, 618.2490730148122, 0, 1, 0.2829173752907363, 0, 0.001617471086731483, 0.008957222557791734, 0.7170826247092636, 1, 0.001134588545385318],
[244.161997986206, 618.0107164418938, 1, 0, 0.2831938356436675, 0.004095641452182479, 0, -0.02268082088456273, 1, 0.2831938356436675, 0.001134871796517531],
[243.9899185889165, 617.9456108229904, 1, 0, 0.2830721211311352, 0.00409852999576117, 0, -0.02269681704543043, 1, 0.2830721211311352, 0.00113582367104916],
[244.1144755403904, 618.0001816506193, 1, 0, 0.2831577836012879, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523622322364, 1, 0.283157783601288, 0.001135870732112252],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001134588573267111],
[244.161997986206, 618.0988686501015, 1, 0, 0.2831648836606555, 0.004095641452182479, 0, -0.02268082088456273, 1, 0.2831648836606555, 0.001134871796517531],
[244.2410272247236, 617.8210538715165, 0, 1, 0.28332185416871, 0, 0.001618591651633747, 0.008963428015992729, 0.71667814583129, 1, 0.001136048921805091],
[243.1670516351602, 615.9476055558496, 0, 1, 0.2830437702346126, 0, 0.001623514712907391, 0.008990690917849469, 0.7169562297653873, 1, 0.001134670857796057],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.00113502687412617],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001136079227205903],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823670348141],
[244.4921358605308, 617.8016491095821, 1, 0, 0.2835369338409471, 0.004090111105129551, 0, -0.02265019495883135, 1, 0.2835369338409471, 0.001134902082915205],
[244.094817779426, 618.0198394115838, 0, 1, 0.2831349818071176, 0, 0.001618071033046608, 0.008960544937221811, 0.7168650181928824, 1, 0.001135870755054008],
[244.216568813835, 617.6945021871833, 0, 1, 0.283343116280202, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264420410781, 0.716656883719798, 1, 0.001135565727758119],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135656473095387],
[244.6164702732496, 617.4981869177602, 0, 1, 0.2837400666290406, 0, 0.001619437953318529, 0.008968114660844568, 0.7162599333709594, 1, 0.001134871782513907],
[244.2654856356122, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2832660534675566, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7167339465324434, 1, 0.001134588503716494],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[242.595293317211, 616.5852005414094, 0, 1, 0.2823566119706746, 0, 0.001621835877867199, 0.008981393874325061, 0.7176433880293254, 1, 0.001134851235666223],
[243.8655841761976, 618.2819913486175, 1, 1, 0.2828582844738028, 0.004100619623626271, 0.001617384969953219, -0.013751643314452, 0.9199911909045373, 0.4857077598521429, 0.002272583486247204],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001136067036891541],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135656473095387],
[244.0618994456206, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001135870743691857],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001134588559710901],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001134902082915205],
[244.4181602709673, 617.6964969200425, 0, 1, 0.2835100392183845, 0, 0.00161891803658625, 0.008965235468801666, 0.7164899607816155, 1, 0.001134871797509183],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135870715629059],
[243.6237411938181, 618.5238343309969, 0, 1, 0.2825777721934868, 0, 0.001616752572003329, 0.008953243570850995, 0.7174222278065132, 1, 0.001138858634318075],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823661361009],
[243.8655841761976, 618.2490730148122, 0, 1, 0.2828690849205303, 0, 0.001617471086731483, 0.008957222557791734, 0.7171309150794698, 1, 0.001135823661296729],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001134952775948488],
[244.594817779426, 617.5198394115838, 0, 1, 0.2837149510673888, 0, 0.001619381169927868, 0.008967800206093626, 0.7162850489326112, 1, 0.001134588655088527],
[244.1164702732496, 617.9981869177601, 0, 1, 0.2831600973687695, 0, 0.001618127724593268, 0.008960858883359546, 0.7168399026312305, 1, 0.001134871797509183],
[244.1884511299538, 617.926206061056, 0, 1, 0.2832435907372023, 0, 0.001618316216712117, 0.008961902713986735, 0.7167564092627977, 1, 0.001135656478558199],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001135870741163542],
[244.2410272247236, 617.6945021871833, 0, 1, 0.2833634522426146, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264420410781, 0.7166365477573854, 1, 0.001134588577921184],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001134902082832656],
[244.1144755403904, 618.0001816506194, 1, 0, 0.2831577836012878, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523622322364, 1, 0.2831577836012877, 0.001135823663823513],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823661375847],
[244.0618994456206, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001134588545385318],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.00113570356370738],
[243.8655841761976, 618.2490730148122, 0, 1, 0.2828690849205303, 0, 0.001617471086731483, 0.008957222557791734, 0.7171309150794698, 1, 0.001135823656970562],
[243.1881209372278, 616.2189551443772, 0, 1, 0.2829719788275701, 0, 0.001622799804601442, 0.008986731902533936, 0.7170280211724299, 1, 0.001134514433056128],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.161997986206, 618.0988686501015, 1, 0, 0.2831648836606555, 0.004095641452182479, 0, -0.02268082088456273, 1, 0.2831648836606555, 0.001135140398897716],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001138590859490047],
[243.8655841761976, 618.2490730148122, 0, 1, 0.2828690849205303, 0, 0.001617471086731483, 0.008957222557791734, 0.7171309150794698, 1, 0.001135823661361009],
[244.0618994456206, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001135823656970562],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001135703572295371],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135565704718669],
[243.7410272247236, 618.3736299662862, 0, 1, 0.2827246065145143, 0, 0.001617145284889526, 0.008955418334129198, 0.7172753934854857, 1, 0.001135823670857244],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823698269972],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001136744018450819],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001135932162364462],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823661361009],
[244.3200564632413, 617.7946007277685, 1, 0, 0.2833962448327912, 0.004092991850427365, 0, -0.02266614793442176, 1, 0.2833962448327911, 0.00113570358023737],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135565699173303],
[244.4373424941467, 617.55076301253, 0, 1, 0.2835739158494147, 0, 0.001619300080080559, 0.00896735114717969, 0.7164260841505854, 1, 0.001135823670348141],
[244.4201550038266, 617.6945021871833, 0, 1, 0.2835123529858661, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264420410781, 0.7164876470141339, 1, 0.00113487179401291],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001134966062004431],
[243.6304593829056, 615.4841978081041, 0, 1, 0.2835831717497266, 0, 0.001624737082708629, 0.008997460150664468, 0.7164168282502734, 1, 0.001133720508624547],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.4513316038027, 615.6633255872071, 0, 1, 0.2833746689874893, 0, 0.001624264364043807, 0.008994842331821972, 0.7166253310125108, 1, 0.001134658476626192],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.2936033194934, 617.8210538715164, 0, 1, 0.2833655608123686, 0, 0.001618591651633747, 0.00896342801599273, 0.7166344391876314, 1, 0.001138144939533793],
[244.4201550038266, 617.6945021871833, 0, 1, 0.2835123529858661, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264420410781, 0.7164876470141339, 1, 0.001134989917416629],
[244.161997986206, 617.9526592048038, 1, 0, 0.2832129067167797, 0.004095641452182478, 0, -0.02268082088456273, 1, 0.2832129067167797, 0.001134871775465401],
[244.6183496702608, 617.496307520749, 1, 2, 0.2837422466140292, 0.004088000762608259, 0.003238885764402399, -0.00470222440356453, 0.8041589974907493, 0.6325417448170976, 0.003422557023898478],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.00113527807969094],
[243.2125793481165, 615.9601350799833, 0, 1, 0.2830776341751131, 0, 0.001623481688259174, 0.008990508034132783, 0.7169223658248869, 1, 0.001134793809511523],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.161997986206, 617.9526592048039, 1, 0, 0.2832129067167797, 0.004095641452182478, 0, -0.02268082088456273, 1, 0.2832129067167797, 0.001134674481514028],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001134902046965703]
],
"NAMES": [
["epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1"],
["epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_4"],
["epi_isl_420759_England_20200326_null_2"],
["epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1"],
["epi_isl_434622_Occitanie_20200301_null_1"],
["epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1"],
["epi_isl_434024_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_429598_Washington_20200331_null_3"],
["epi_isl_429607_Washington_20200331_null_6"],
["Node298"],
["epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1"],
["epi_isl_423319_England_20200326_null_2"],
["epi_isl_421552_Wyoming_20200319_null_1"],
["epi_isl_416401_Shanghai_20200202_null_2"],
["epi_isl_422507_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_428773_New_York_20200405_null_2"],
["epi_isl_422957_Zuid_Holland_20200329_null_1"],
["epi_isl_422958_Zuid_Holland_20200329_null_10"],
["Node276"],
["epi_isl_434941_Texas_20200401_null_1"],
["epi_isl_430892_Washington_20200312_null_3"],
["epi_isl_420270_South_Yorkshire_20200322_null_9"],
["epi_isl_433194_Scotland_20200419_null_1"],
["epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1"],
["epi_isl_432378_Wales_20200408_null_1"],
["epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1"],
["epi_isl_422804_Netherlands_20200307_null_3"],
["epi_isl_430918_Washington_20200406_null_1"],
["epi_isl_424185_USA_20200318_null_1"],
["epi_isl_418252_Madrid_20200304_null_1"],
["epi_isl_413015_Ontario_20200123_null_13775"],
["epi_isl_420282_South_Yorkshire_20200321_null_1"],
["epi_isl_430881_USA_20200313_null_10"],
["Node240"],
["epi_isl_422886_Noord_Brabant_20200324_null_2"],
["Node239"],
["epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2"],
["epi_isl_428789_New_York_20200406_null_2"],
["epi_isl_417538_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_14"],
["epi_isl_422875_Noord_Brabant_20200311_null_3"],
["epi_isl_420943_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1"],
["epi_isl_427380_Liege_20200408_null_2"],
["epi_isl_430742_Beijing_20200129_null_28"],
["epi_isl_421236_Hangzhou_20200120_null_2"],
["epi_isl_414007_England_20200228_null_3"],
["epi_isl_430324_New_York_20200410_null_2"],
["epi_isl_425130_Duesseldorf_20200321_null_4"],
["epi_isl_427527_New_York_20200312_null_1"],
["epi_isl_429640_Connecticut_20200407_null_1"],
["Node199"],
["epi_isl_428306_Wisconsin_20200324_null_1"],
["epi_isl_402121_Hubei_20191230_null_1"],
["epi_isl_425896_Scotland_20200322_null_3"],
["epi_isl_420841_Sud_Kivu_20200322_null_1"],
["epi_isl_418022_Portugal_20200315_null_1"],
["epi_isl_426914_Victoria_20200329_null_4"],
["epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_2"],
["epi_isl_428286_Wisconsin_20200323_null_3"],
["epi_isl_428957_Luxembourg_20200407_null_5"],
["epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_1"],
["epi_isl_423969_England_20200320_null_2"],
["epi_isl_421969_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_417388_New_South_Wales_20200305_null_4"],
["epi_isl_424973_Taoyuan_20200317_null_1"],
["epi_isl_423092_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1"],
["epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_2"],
["epi_isl_427032_Victoria_20200330_null_1"],
["epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_1"],
["epi_isl_430394_New_Jersey_20200409_null_2"],
["epi_isl_422849_Netherlands_20200316_null_1"],
["epi_isl_427158_Victoria_20200330_null_1"],
["epi_isl_417005_Li_ge_20200305_null_2"],
["epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1"],
["epi_isl_423829_England_20200323_null_7"],
["epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_6"],
["epi_isl_415622_Washington_20200309_null_1"],
["epi_isl_418405_Finland_20200314_null_2"],
["epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_5"],
["epi_isl_434370_Antwerp_20200405_null_1"],
["epi_isl_428717_Kocaeli_20200319_null_1"],
["epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_3"],
["Node174"],
["epi_isl_434077_Washington_20200404_null_2"],
["Node173"],
["epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1"],
["epi_isl_422119_Wales_20200327_null_9"],
["epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_2"],
["epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_1"],
["epi_isl_423903_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_425797_Scotland_20200306_null_5"],
["epi_isl_416703_Washington_20200313_null_2"],
["epi_isl_425645_England_20200318_null_14"],
["epi_isl_423107_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_419840_Victoria_20200316_null_1"],
["epi_isl_432403_Wales_20200330_null_3"],
["epi_isl_427775_New_South_Wales_20200325_null_11"],
["epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1"],
["epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_414590_Minnesota_20200309_null_1"],
["epi_isl_416346_Shanghai_20200130_null_1"],
["Node72"],
["epi_isl_414588_Minnesota_20200305_null_1"],
["epi_isl_430867_Washington_20200311_null_1"],
["epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_433696_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_416704_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1"],
["epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_1"],
["epi_isl_424140_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_433827_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_433893_England_20200410_null_1"],
["Node121"],
["epi_isl_429315_Unknown_20200318_null_4"],
["epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_432276_Wales_20200407_null_2"],
["epi_isl_425919_Scotland_20200324_null_7"],
["epi_isl_423445_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1"],
["epi_isl_430802_Buenos_Aires_20200331_null_1"],
["epi_isl_423217_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_426086_Washington_20200325_null_3"],
["epi_isl_415453_Wales_20200310_null_1"],
["epi_isl_429129_Norrbotten_20200327_null_5"],
["epi_isl_430398_New_York_20200410_null_1"],
["epi_isl_419936_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_418692_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_424099_England_20200313_null_1"],
["epi_isl_430234_Washington_20200319_null_1"],
["epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_9"],
["epi_isl_427080_Victoria_20200323_null_11"],
["epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1"],
["epi_isl_402127_Hubei_20191230_null_1"],
["epi_isl_428922_Sverdlovsk_Region_20200330_null_6"],
["epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1"],
["epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_4"],
["Node21"],
["epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1"],
["epi_isl_424440_Reykjavik_20200319_null_2"],
["epi_isl_420687_England_20200328_null_3"],
["epi_isl_415742_Taoyuan_20200227_null_1"],
["epi_isl_418992_Singapore_20200210_null_1"],
["epi_isl_425672_Scotland_20200311_null_3"],
["epi_isl_427717_New_South_Wales_20200317_null_1"],
["epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_1"],
["epi_isl_421414_New_York_20200318_null_2"],
["epi_isl_420179_South_Yorkshire_20200327_null_1"],
["epi_isl_432352_Wales_20200327_null_3"],
["epi_isl_416153_Copenhagen_20200302_null_1"],
["epi_isl_429467_Unknown_20200323_null_2"],
["epi_isl_434340_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_418357_Ontario_20200312_null_1"],
["epi_isl_426161_Iowa_20200406_null_1"],
["epi_isl_429844_Iowa_20200409_null_1"],
["Node52"],
["epi_isl_430719_Madrid_20200311_null_2"],
["Node51"],
["epi_isl_430639_Victoria_20200326_null_45"],
["epi_isl_419884_Victoria_20200319_null_1"],
["epi_isl_426054_Connecticut_20200330_null_1"],
["epi_isl_428346_Istanbul_20200417_null_29"],
["epi_isl_432745_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_432942_England_20200330_null_1"],
["Node97"],
["epi_isl_422534_New_York_20200319_null_3"]
],
"RESOLVED": [
[244.094817779426, 618.0198394115838, 0, 1, 0.2831349818071176, 0, 0.001618071033046608, 0.008960544937221811, 0.7168650181928824, 1, 0.001135823658792793],
[244.1144755403904, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2831993550501488, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523622322364, 1, 0.2831993550501488, 0.001135823663823513],
[244.1144755403904, 618.0001816506194, 1, 0, 0.2831577836012878, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523622322364, 1, 0.2831577836012877, 0.001135823651815331],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001135565731168652],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001134918839786274],
[244.2410272247236, 617.8210538715164, 0, 1, 0.28332185416871, 0, 0.001618591651633747, 0.00896342801599273, 0.71667814583129, 1, 0.001135823649362245],
[244.3872366700213, 617.7274205209885, 0, 1, 0.2834741697424533, 0, 0.001618836993113572, 0.00896478666670091, 0.7165258302575467, 1, 0.001134871791500711],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[242.8087960769543, 616.2729427802502, 0, 1, 0.2826375944155806, 0, 0.001622657641740047, 0.008985944633815869, 0.7173624055844194, 1, 0.001136010334393523],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.00113854658668711],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001135917859555249],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823649296559],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001134871787600304],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135870746562257],
[244.2739455585289, 617.840711632481, 0, 1, 0.2833427590181983, 0, 0.001618540153104777, 0.008963142827720018, 0.7166572409818017, 1, 0.001134588561615081],
[244.1144755403904, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2831993550501488, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523622322364, 1, 0.2831993550501488, 0.001135823652501515],
[243.3461794142631, 616.5472111130273, 0, 1, 0.2829957551656981, 0, 0.001621935809578542, 0.008981947275610819, 0.7170042448343019, 1, 0.001136905105341773],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.2410272247236, 618.2629966344265, 0, 1, 0.2831766814627743, 0, 0.001617434660401149, 0.008957020836258383, 0.7168233185372257, 1, 0.001136304800874893],
[244.4921358605307, 617.8016491095821, 1, 0, 0.2835369338409471, 0.004090111105129552, 0, -0.02265019495883135, 1, 0.283536933840947, 0.001134952824638486],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001135823670348141],
[244.7410272247236, 617.3736299662862, 0, 1, 0.2838845450350566, 0, 0.001619764679703939, 0.008969924004438794, 0.7161154549649434, 1, 0.001134902078253505],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001135870722615894],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.0011345885708122],
[244.3675789090568, 617.747078281953, 1, 0, 0.283451367948283, 0.004092195881566423, 0, -0.02266174002240713, 1, 0.2834513679482831, 0.001134952758422602],
[244.2410272247236, 617.8210538715164, 0, 1, 0.28332185416871, 0, 0.001618591651633747, 0.00896342801599273, 0.71667814583129, 1, 0.001134588672840608],
[244.3675789090568, 617.747078281953, 1, 0, 0.283451367948283, 0.004092195881566423, 0, -0.02266174002240713, 1, 0.2834513679482831, 0.001134902097793334],
[243.7410272247236, 618.3736299662862, 0, 1, 0.2827246065145143, 0, 0.001617145284889526, 0.008955418334129198, 0.7172753934854857, 1, 0.001135823677396706],
[244.2936033194934, 617.8210538715165, 0, 1, 0.2833655608123685, 0, 0.001618591651633747, 0.008963428015992729, 0.7166344391876315, 1, 0.001139231750776489],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001139363681973641],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.3461794142631, 615.7684777767466, 1, 0, 0.28325227299685, 0.004109372098658013, 0, -0.02275685838368876, 1, 0.2832522729968501, 0.001135999918400552],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.3461794142631, 615.7684777767466, 1, 0, 0.28325227299685, 0.004109372098658013, 0, -0.02275685838368876, 1, 0.2832522729968501, 0.00113538397796079],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001134616861545354],
[244.3655841761976, 617.7490730148122, 0, 1, 0.2834490541808014, 0, 0.001618780251858059, 0.008964472445285759, 0.7165509458191985, 1, 0.001135656454805419],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823658849062],
[244.5711650990484, 617.5764104257668, 1, 0, 0.2836766837164398, 0.004088789451507957, 0, -0.02264287591261776, 1, 0.2836766837164398, 0.001134952785725343],
[244.2654856356123, 617.9072287924874, 0, 1, 0.2833138668713722, 0, 0.001618365918706271, 0.008962177953418745, 0.7166861331286278, 1, 0.001134588663883873],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001134902097271734],
[244.0618994456206, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001135823686271208],
[244.1164702732496, 617.9401296806702, 0, 1, 0.2831791674540843, 0, 0.001618279752306692, 0.008961700781601354, 0.7168208325459158, 1, 0.001136743109098967],
[243.8655841761976, 618.2490730148122, 0, 1, 0.2828690849205303, 0, 0.001617471086731483, 0.008957222557791734, 0.7171309150794698, 1, 0.001135919094706166],
[244.3075269391076, 617.8651874889921, 0, 1, 0.2833626289149765, 0, 0.00161847603692321, 0.00896278776547961, 0.7166373710850236, 1, 0.001134871797509183],
[244.2410272247236, 618.0772161562778, 1, 0, 0.2832376899125972, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2832376899125972, 0.001134871797509183],
[244.3675789090568, 617.747078281953, 1, 0, 0.283451367948283, 0.004092195881566423, 0, -0.02266174002240713, 1, 0.2834513679482831, 0.001134952810904804],
[244.2654856356123, 618.2965954606278, 0, 1, 0.2831859769735907, 0, 0.001617346767460372, 0.008956534103210571, 0.7168140230264093, 1, 0.001134588660379123],
[244.1829699876337, 618.0772161562778, 0, 1, 0.2831894292599049, 0, 0.001617920825845738, 0.008959713120604496, 0.7168105707400951, 1, 0.001135656473095387],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.1617930315951, 616.0109213965046, 0, 1, 0.2830185234565479, 0, 0.001623347842166479, 0.008989766821971034, 0.7169814765434521, 1, 0.001134797203690766],
[244.3075269391076, 617.8071302519022, 0, 1, 0.2833817113551045, 0, 0.001618628130096627, 0.008963630026225411, 0.7166182886448955, 1, 0.001134678006132582],
[244.3675789090568, 617.747078281953, 1, 0, 0.283451367948283, 0.004092195881566423, 0, -0.02266174002240713, 1, 0.2834513679482831, 0.001134902055795033],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 2, 0, 0.2833045757747854, 0.008188632445276366, 0, -0.04534696407124784, 1, 0.08026148265493105, 0.002273707187993333],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001135397824439453],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001134871797509183],
[244.161997986206, 617.9526592048038, 1, 0, 0.2832129067167797, 0.004095641452182479, 0, -0.02268082088456273, 1, 0.2832129067167797, 0.001134918843823809],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001134588605811166],
[243.9899185889165, 617.9456108229904, 1, 0, 0.2830721211311352, 0.00409852999576117, 0, -0.02269681704543043, 1, 0.2830721211311352, 0.001135823670362977],
[244.094817779426, 618.0198394115838, 0, 1, 0.2831349818071176, 0, 0.001618071033046608, 0.008960544937221811, 0.7168650181928824, 1, 0.001135823693860987],
[244.0618994456206, 618.0198394115838, 0, 1, 0.2831076085304333, 0, 0.001618071033046608, 0.008960544937221811, 0.7168923914695667, 1, 0.001135533104280857],
[244.0618994456206, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001135812268733077],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001135823656345127],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001134902097204378],
[244.1884511299538, 617.926206061056, 0, 1, 0.2832435907372023, 0, 0.001618316216712117, 0.008961902713986735, 0.7167564092627976, 1, 0.001135870729649625],
[244.5618994456207, 618.1126670316006, 0, 1, 0.2834926505881616, 0, 0.001617828032553288, 0.008959199250415923, 0.7165073494118384, 1, 0.001134588570745335],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001135656473095387],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 2, 0.2833045757747854, 0, 0.003236907844908559, 0.01792533060018849, 0.5136523311053603, 1, 0.002272194044478369],
[244.2955980523526, 617.6154729486657, 0, 1, 0.2834348069907365, 0, 0.001619130419815627, 0.008966411603490362, 0.7165651930092636, 1, 0.001139110100918462],
[243.9108893503988, 618.1708495068057, 1, 0, 0.2829324394154697, 0.004099857954941137, 0, -0.02270417101053077, 1, 0.2829324394154697, 0.001135823670348141],
[244.3675789090568, 617.747078281953, 1, 0, 0.283451367948283, 0.004092195881566423, 0, -0.02266174002240713, 1, 0.2834513679482831, 0.001134952790301715],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001134588662935257],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135656473095387],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001134871792009457],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135819269578756],
[244.2410272247236, 617.6945021871833, 0, 1, 0.2833634522426146, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264420410781, 0.7166365477573854, 1, 0.001135533979372407],
[244.1144755403904, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2831993550501488, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523622322364, 1, 0.2831993550501488, 0.001135823651800496],
[244.1144755403904, 618.0001816506193, 1, 0, 0.2831577836012879, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523622322364, 1, 0.283157783601288, 0.001135823651800496],
[244.1884511299538, 617.926206061056, 0, 1, 0.2832435907372023, 0, 0.001618316216712117, 0.008961902713986735, 0.7167564092627976, 1, 0.001135870732112252],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001134588550040702],
[244.1144755403904, 618.0001816506193, 1, 0, 0.2831577836012879, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523622322364, 1, 0.283157783601288, 0.001135823656970562],
[244.4201550038266, 617.6945021871833, 0, 1, 0.2835123529858661, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264420410781, 0.7164876470141339, 1, 0.001134871790460675],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.6884511299538, 615.426206061056, 0, 1, 0.2836506735046587, 0, 0.001624890182042054, 0.008998307983317669, 0.7163493264953413, 1, 0.001137511824461417],
[243.2410272247236, 615.8736299662862, 0, 1, 0.2831298770062108, 0, 0.001623709721188649, 0.00899177083364529, 0.7168701229937892, 1, 0.001137302678853578],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.1884511299538, 617.926206061056, 0, 1, 0.2832435907372023, 0, 0.001618316216712117, 0.008961902713986735, 0.7167564092627976, 1, 0.001135741481910052],
[244.537441034732, 617.5191589191878, 0, 1, 0.2836675005420798, 0, 0.001619382954449946, 0.008967810088410249, 0.7163324994579202, 1, 0.001138858626333544],
[244.094817779426, 618.0198394115838, 0, 1, 0.2831349818071176, 0, 0.001618071033046608, 0.008960544937221811, 0.7168650181928824, 1, 0.001135823656970562],
[244.3781137003312, 617.7365434906786, 0, 1, 0.2834635876584881, 0, 0.001618813085509308, 0.008964654271300476, 0.7165364123415119, 1, 0.001134918850929654],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001135565762280449],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823663823513],
[244.1144755403904, 618.0001816506194, 1, 0, 0.2831577836012878, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523622322364, 1, 0.2831577836012877, 0.001135823661361009],
[244.3200564632412, 617.6483912824709, 1, 0, 0.2834443152788322, 0.004092991850427365, 0, -0.02266614793442176, 1, 0.2834443152788322, 0.001135703547799349],
[243.9236414132875, 618.2490730148122, 0, 1, 0.2829173752907363, 0, 0.001617471086731483, 0.008957222557791734, 0.7170826247092636, 1, 0.001134588545385318],
[244.161997986206, 618.0107164418938, 1, 0, 0.2831938356436675, 0.004095641452182479, 0, -0.02268082088456273, 1, 0.2831938356436675, 0.001134871796517531],
[243.9899185889165, 617.9456108229904, 1, 0, 0.2830721211311352, 0.00409852999576117, 0, -0.02269681704543043, 1, 0.2830721211311352, 0.00113582367104916],
[244.1144755403904, 618.0001816506193, 1, 0, 0.2831577836012879, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523622322364, 1, 0.283157783601288, 0.001135870732112252],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001134588573267111],
[244.161997986206, 618.0988686501015, 1, 0, 0.2831648836606555, 0.004095641452182479, 0, -0.02268082088456273, 1, 0.2831648836606555, 0.001134871796517531],
[244.2410272247236, 617.8210538715165, 0, 1, 0.28332185416871, 0, 0.001618591651633747, 0.008963428015992729, 0.71667814583129, 1, 0.001136048921805091],
[243.1670516351602, 615.9476055558496, 0, 1, 0.2830437702346126, 0, 0.001623514712907391, 0.008990690917849469, 0.7169562297653873, 1, 0.001134670857796057],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.00113502687412617],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001136079227205903],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823670348141],
[244.4921358605308, 617.8016491095821, 1, 0, 0.2835369338409471, 0.004090111105129551, 0, -0.02265019495883135, 1, 0.2835369338409471, 0.001134902082915205],
[244.094817779426, 618.0198394115838, 0, 1, 0.2831349818071176, 0, 0.001618071033046608, 0.008960544937221811, 0.7168650181928824, 1, 0.001135870755054008],
[244.216568813835, 617.6945021871833, 0, 1, 0.283343116280202, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264420410781, 0.716656883719798, 1, 0.001135565727758119],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135656473095387],
[244.6164702732496, 617.4981869177602, 0, 1, 0.2837400666290406, 0, 0.001619437953318529, 0.008968114660844568, 0.7162599333709594, 1, 0.001134871782513907],
[244.2654856356122, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2832660534675566, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7167339465324434, 1, 0.001134588503716494],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[242.595293317211, 616.5852005414094, 0, 1, 0.2823566119706746, 0, 0.001621835877867199, 0.008981393874325061, 0.7176433880293254, 1, 0.001134851235666223],
[243.8655841761976, 618.2819913486175, 1, 1, 0.2828582844738028, 0.004100619623626271, 0.001617384969953219, -0.013751643314452, 0.9199911909045373, 0.4857077598521429, 0.002272583486247204],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001136067036891541],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135656473095387],
[244.0618994456206, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001135870743691857],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001134588559710901],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001134902082915205],
[244.4181602709673, 617.6964969200425, 0, 1, 0.2835100392183845, 0, 0.00161891803658625, 0.008965235468801666, 0.7164899607816155, 1, 0.001134871797509183],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135870715629059],
[243.6237411938181, 618.5238343309969, 0, 1, 0.2825777721934868, 0, 0.001616752572003329, 0.008953243570850995, 0.7174222278065132, 1, 0.001138858634318075],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823661361009],
[243.8655841761976, 618.2490730148122, 0, 1, 0.2828690849205303, 0, 0.001617471086731483, 0.008957222557791734, 0.7171309150794698, 1, 0.001135823661296729],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001134952775948488],
[244.594817779426, 617.5198394115838, 0, 1, 0.2837149510673888, 0, 0.001619381169927868, 0.008967800206093626, 0.7162850489326112, 1, 0.001134588655088527],
[244.1164702732496, 617.9981869177601, 0, 1, 0.2831600973687695, 0, 0.001618127724593268, 0.008960858883359546, 0.7168399026312305, 1, 0.001134871797509183],
[244.1884511299538, 617.926206061056, 0, 1, 0.2832435907372023, 0, 0.001618316216712117, 0.008961902713986735, 0.7167564092627977, 1, 0.001135656478558199],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001135870741163542],
[244.2410272247236, 617.6945021871833, 0, 1, 0.2833634522426146, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264420410781, 0.7166365477573854, 1, 0.001134588577921184],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001134902082832656],
[244.1144755403904, 618.0001816506194, 1, 0, 0.2831577836012878, 0.00409643876212717, 0, -0.02268523622322364, 1, 0.2831577836012877, 0.001135823663823513],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823661375847],
[244.0618994456206, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001134588545385318],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.00113570356370738],
[243.8655841761976, 618.2490730148122, 0, 1, 0.2828690849205303, 0, 0.001617471086731483, 0.008957222557791734, 0.7171309150794698, 1, 0.001135823656970562],
[243.1881209372278, 616.2189551443772, 0, 1, 0.2829719788275701, 0, 0.001622799804601442, 0.008986731902533936, 0.7170280211724299, 1, 0.001134514433056128],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.161997986206, 618.0988686501015, 1, 0, 0.2831648836606555, 0.004095641452182479, 0, -0.02268082088456273, 1, 0.2831648836606555, 0.001135140398897716],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001138590859490047],
[243.8655841761976, 618.2490730148122, 0, 1, 0.2828690849205303, 0, 0.001617471086731483, 0.008957222557791734, 0.7171309150794698, 1, 0.001135823661361009],
[244.0618994456206, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001135823656970562],
[244.0618994456207, 618.0527577453892, 0, 1, 0.2830967985637047, 0, 0.001617984852373972, 0.008960067686363168, 0.7169032014362953, 1, 0.001135703572295371],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135565704718669],
[243.7410272247236, 618.3736299662862, 0, 1, 0.2827246065145143, 0, 0.001617145284889526, 0.008955418334129198, 0.7172753934854857, 1, 0.001135823670857244],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823698269972],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001136744018450819],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001135932162364462],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135823661361009],
[244.3200564632413, 617.7946007277685, 1, 0, 0.2833962448327912, 0.004092991850427365, 0, -0.02266614793442176, 1, 0.2833962448327911, 0.00113570358023737],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001135565699173303],
[244.4373424941467, 617.55076301253, 0, 1, 0.2835739158494147, 0, 0.001619300080080559, 0.00896735114717969, 0.7164260841505854, 1, 0.001135823670348141],
[244.4201550038266, 617.6945021871833, 0, 1, 0.2835123529858661, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264420410781, 0.7164876470141339, 1, 0.00113487179401291],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 1, 0, 0.2833045757747854, 0.004094316222638183, 0, -0.02267348203562392, 1, 0.2833045757747854, 0.001134966062004431],
[243.6304593829056, 615.4841978081041, 0, 1, 0.2835831717497266, 0, 0.001624737082708629, 0.008997460150664468, 0.7164168282502734, 1, 0.001133720508624547],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.4513316038027, 615.6633255872071, 0, 1, 0.2833746689874893, 0, 0.001624264364043807, 0.008994842331821972, 0.7166253310125108, 1, 0.001134658476626192],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.2936033194934, 617.8210538715164, 0, 1, 0.2833655608123686, 0, 0.001618591651633747, 0.00896342801599273, 0.7166344391876314, 1, 0.001138144939533793],
[244.4201550038266, 617.6945021871833, 0, 1, 0.2835123529858661, 0, 0.001618923264589725, 0.008965264420410781, 0.7164876470141339, 1, 0.001134989917416629],
[244.161997986206, 617.9526592048038, 1, 0, 0.2832129067167797, 0.004095641452182478, 0, -0.02268082088456273, 1, 0.2832129067167797, 0.001134871775465401],
[244.6183496702608, 617.496307520749, 1, 2, 0.2837422466140292, 0.004088000762608259, 0.003238885764402399, -0.00470222440356453, 0.8041589974907493, 0.6325417448170976, 0.003422557023898478],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.00113527807969094],
[243.2125793481165, 615.9601350799833, 0, 1, 0.2830776341751131, 0, 0.001623481688259174, 0.008990508034132783, 0.7169223658248869, 1, 0.001134793809511523],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.161997986206, 617.9526592048039, 1, 0, 0.2832129067167797, 0.004095641452182478, 0, -0.02268082088456273, 1, 0.2832129067167797, 0.001134674481514028],
[244.2410272247236, 617.8736299662862, 0, 1, 0.2833045757747854, 0, 0.00161845392245428, 0.008962665300094243, 0.7166954242252146, 1, 0.001134902046965703]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 1, 0.2139148139313646, 0, 0.4240422529782021, 2.348258874604371, 0.7860851860686354, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.354266092487455, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794543142104, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773024278014],
[0, 1.825863826960412, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1794380706770249],
[0.7503894024464985, 1.354762787093039, 1, 0, 0.3564537548283538, 1.332641421560186, 0, -7.379894392281132, 1, 0.3564537548283538, 0.1805773024278014],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -11.07558908628421, 1, 0.1111111111111109, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9988745189810787, 2.001125481018922, 0, 1, 0.3329581729936928, 0, 0.4997187879946567, 2.767339977262396, 0.6670418270063072, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9988732937839347, 2.001126706216066, 0, 1, 0.3329577645946449, 0, 0.4997184820400013, 2.767338282948375, 0.6670422354053551, 1, 0.1805773024278014],
[0.8940518056785313, 2, 1, 0, 0.3089273674798349, 1.118503417417809, 0, -6.194042121462137, 1, 0.308927367479835, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.00222290810775216, 2.997777091892248, 0, 1, 0.00074096936925072, 0, 0.333580506270659, 1.847300307324236, 0.9992590306307493, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.354266092487455, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8838855258201362, 2, 0, 0, 0.3064911966534357, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.893268347656736, 1.105604946113915, 1, 0, 0.6313265557399471, 0.5281871432740541, 0, -2.924991879780874, 1, 0.6313265557399471, 0.1805773024278014],
[1.392630538846177, 1.249113902947918, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.841941522964728, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.5928276200168113, 2.291057905803325, 0, 0, 0.2055655866743253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.292418890595281, 0, 0, 0.218714628020214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8940518056701052, 2.105948194329895, 1, 0, 0.2980172685567017, 1.11850341742835, 0, -6.194042121520513, 1, 0.2980172685567017, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7488981761144523, 1.363607014617229, 1, 1, 0.3545071412842618, 1.33529501325314, 0.7333491169233278, -3.333452699962017, 0.8743246867784604, 0.5833389693469839, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6439983965680671, 2.354875184568177, 0, 3, 0.2147467637912441, 0, 1.273952870054182, 7.054889252006271, 0.4842049274872613, 1, 0.1805773024278014],
[0.6439949409132008, 2.356005059086799, 0, 2, 0.2146649803044003, 0, 0.84889461178628, 4.701003948852796, 0.616751093160288, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.5, 8.306691814713156, 0.2962962962962963, 1, 0.1805773024278014],
[0.9976384789747788, 2.002361521025222, 0, 1, 0.3325461596582595, 0, 0.499410316019254, 2.765631722840298, 0.6674538403417405, 1, 0.1805773024278014],
[1.391140712045233, 1.253360010262772, 1, 0, 0.5260504186329381, 0.7188345444436138, 0, -3.980758017641885, 1, 0.5260504186329381, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9996693472444222, 2.000330652755578, 0, 1, 0.3332231157481407, 0, 0.4999173504752519, 2.768439575483909, 0.6667768842518593, 1, 0.1805773024278014],
[0.2491139029479179, 2.750886097052081, 0, 0, 0.08303796764930599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6425398362612846, 2.357460163738715, 1, 0, 0.2141799454204282, 1.556323738336056, 0, -8.618601105519932, 1, 0.2141799454204282, 0.1805773024278014],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794543142104, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773024278014],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794543142104, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9990803487211556, 2.000919651278845, 0, 1, 0.3330267829070518, 0, 0.4997701928515077, 2.767624646798156, 0.6669732170929482, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.354266092487455, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.894847810460464, 1.105152189539538, 0, 0, 0.6316159368201543, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.292418890595281, 0, 0, 0.218714628020214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.354266092487455, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.392630538846177, 1.249113902947918, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8940518056718311, 2.105948194328169, 1, 0, 0.298017268557277, 1.118503417426191, 0, -6.194042121508557, 1, 0.2980172685572771, 0.1805773024278014],
[0.9968541883368708, 2.002780338465181, 0, 2, 0.33232521476529, 0, 0.9986117606550344, 5.530106758872979, 0.4457896188382162, 1, 0.1805773024278014],
[1.393712116646823, 1.250077048098344, 2, 0, 0.5271646223654759, 1.435016583490617, 0, -7.946827005372765, 1, 0.2779025390737349, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.392630538846177, 1.249113902947918, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794543142104, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773024278014],
[1, 2, 2, 1, 0.3333333333333333, 2, 0.5, -8.306691814713156, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.001869412268064164, 2.997764434376048, 0, 1, 0.0006232134865912381, 0, 0.3335819147537986, 1.84730810721448, 0.9993767865134088, 1, 0.1805773024278014],
[0.8838855258201362, 2, 0, 0, 0.3064911966534357, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.2514734449057648, 2.748526555094235, 0, 1, 0.08382448163525494, 0, 0.3638313037749473, 2.01482300866918, 0.9161755183647451, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794543142104, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9996348761653612, 1.594107980125134, 0, 1, 0.385402459515595, 0, 0.6273100771514251, 3.473914322107214, 0.614597540484405, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[1, 1.999669232982369, 0, 1, 0.3333700892767325, 0, 0.5000827054325223, 2.769355277263962, 0.6666299107232676, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.392630538846177, 1.249113902947918, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8838855258201362, 2, 0, 0, 0.3064911966534357, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.5928276200168113, 1.512324569522726, 0, 0, 0.2816079630549093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 1.814344759966379, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.229190957022921, 1.706007307428969, 1, 1, 0.4187761255890686, 0.8135432450804734, 0.5861639605208055, -1.259179761258084, 0.8246265566366087, 0.6621788078147459, 0.1805773024278014],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794543142104, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773024278014],
[0.9968550209186707, 2.00314497908133, 1, 1, 0.3322850069728902, 1.003154901179543, 0.4992149896502318, -2.790715692138532, 0.8895866741410262, 0.5541566880868067, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9968550209367777, 2.003144979063223, 1, 2, 0.3322850069789258, 1.003154901161321, 0.9984299793094888, -0.02616564644785021, 0.7421374079209422, 0.7023037361027715, 0.1805773024278014],
[1.892771257055938, 1.107021688002928, 1, 0, 0.6309673006510772, 0.5283258588549279, 0, -2.925760058167685, 1, 0.6309673006510772, 0.1805773024278014],
[0.9988732470751861, 2.001126752924814, 0, 1, 0.332957749025062, 0, 0.4997184703759601, 2.767338218355311, 0.6670422509749381, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.0012348148237, 1.892816990841834, 0, 1, 0.3459629896270808, 0, 0.5283130935734298, 2.925689366661463, 0.6540370103729192, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9988732937548693, 2.001126706245131, 0, 1, 0.3329577645849564, 0, 0.499718482032743, 2.76733828290818, 0.6670422354150436, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8948478104604627, 2.105152189539538, 0, 0, 0.2982826034868208, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6415906343510367, 2.357129107848613, 0, 1, 0.2139548505724683, 0, 0.4242448988773105, 2.349381085958644, 0.7860451494275317, 1, 0.1805773024278014],
[1, 1.894847810460464, 0, 0, 0.3454413031270673, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.231176021825086, 1.702275364736459, 1, 1, 0.419702207258397, 0.8122315430718084, 0.587449023063796, -1.244799412694102, 0.8238500572224297, 0.6632544717392236, 0.1805773024278014],
[0.7075811094047181, 2.292418890595281, 0, 0, 0.2358603698015728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9977468870850678, 2.002046110942531, 0, 2, 0.3326052456756513, 0, 0.998977990101553, 5.532134862303447, 0.4454157580996579, 1, 0.1805773024278014],
[0.6428702037844364, 2.357129796215564, 0, 1, 0.2142900679281455, 0, 0.4242447749824924, 2.349380399854596, 0.7857099320718546, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.292418890595281, 0, 0, 0.218714628020214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[0.9990803105883551, 2.000919689411646, 0, 1, 0.3330267701961183, 0, 0.499770183327069, 2.767624594053772, 0.6669732298038817, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6425398007056684, 2.357460199294331, 1, 0, 0.2141799335685561, 1.556323824456869, 0, -8.618601582439297, 1, 0.2141799335685561, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 1.814344759966379, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9996692848640149, 2.000330715135986, 0, 1, 0.3332230949546715, 0, 0.4999173348853058, 2.76843948914999, 0.6667769050453285, 1, 0.1805773024278014],
[0.7075811094047181, 2.292418890595281, 0, 0, 0.2358603698015728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7084999899776826, 2.291500010022317, 0, 1, 0.2361666633258942, 0, 0.4363953723003741, 2.416667911377479, 0.7638333366741058, 1, 0.1805773024278014],
[0.6428702037879601, 2.35712979621204, 0, 1, 0.21429006792932, 0, 0.4242447749831266, 2.349380399858108, 0.78570993207068, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.0007833426683779545, 2.999216657331622, 0, 1, 0.0002611142227926515, 0, 0.3334203941404126, 1.846413639243066, 0.9997388857772074, 1, 0.1805773024278014],
[0.8948478104604627, 2, 0, 0, 0.3091173937458652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8940518056785208, 2.10594819432148, 1, 0, 0.2980172685595069, 1.118503417417822, 0, -6.194042121462209, 1, 0.2980172685595068, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[0.5928276200168113, 2.291057905803325, 0, 0, 0.2055655866743253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6425398362757236, 2.357460163724276, 1, 0, 0.2141799454252412, 1.556323738301083, 0, -8.618601105326256, 1, 0.2141799454252412, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9976384789657839, 2.002361521034216, 0, 1, 0.3325461596552613, 0, 0.4994103160170106, 2.765631722827875, 0.6674538403447388, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.841941522964728, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8948478104604627, 2.105152189539538, 0, 0, 0.2982826034868208, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.5929812950991187, 2.001125480977588, 0, 1, 0.2285878517290395, 0, 0.4997187880049787, 2.767339977319557, 0.7714121482709605, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8948478104604627, 2.105152189539538, 0, 0, 0.2982826034868208, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9990803486927616, 2.000919651307239, 1, 1, 0.3330267828975871, 1.000920497844284, 0.4997701928444158, -2.775267424322273, 0.8890931618728832, 0.5551467276680577, 0.1805773024278014],
[0.8940518056701053, 2, 1, 0, 0.3089273674778228, 1.11850341742835, 0, -6.194042121520512, 1, 0.3089273674778228, 0.1805773024278014],
[0.7075811094047181, 2.292418890595281, 0, 0, 0.2358603698015728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.292418890595281, 0, 0, 0.218714628020214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794543142104, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.2491139029479179, 2.750886097052081, 0, 0, 0.08303796764930599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7519993227780519, 1.353152866761485, 0, 1, 0.3572185072959204, 0, 0.7390148035478877, 4.092512146388727, 0.6427814927040796, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.354266092487455, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.5932455498971573, 2.291004847477315, 0, 1, 0.2056844823310721, 0, 0.4364896918926757, 2.417190233901038, 0.7943155176689279, 1, 0.1805773024278014],
[1.893268347655781, 1.105604946114189, 2, 0, 0.6313265557397721, 1.056374286548641, 0, -5.849983759564696, 1, 0.3985732199822436, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 5.537794543142104, 0.4444444444444445, 1, 0.1805773024278014],
[0.9966168099216203, 2.003383190078381, 1, 1, 0.3322056033072067, 1.003394674908851, 0.499155630811136, -2.792372226843515, 0.8896394371312948, 0.5540506437457082, 0.1805773024278014],
[1, 1.592827620016813, 0, 0, 0.3856793225588656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9988731086050017, 2.000919802425948, 0, 1, 0.3329806884108262, 0, 0.4997701550994617, 2.767624437735082, 0.6670193115891738, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.768897271571052, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1805773024278014],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.768897271571052, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1805773024278014],
[0.2491139029479179, 2.750886097052081, 0, 0, 0.08303796764930599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.5933246580604702, 2.290560867759666, 1, 0, 0.2057379368037631, 1.685417901337386, 0, -9.333498056940195, 1, 0.2057379368037631, 0.1805773024278014],
[0.2491139029479179, 2.750886097052081, 0, 0, 0.08303796764930599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.841941522964728, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 1.814344759966379, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.35713007715471, 0, 1, 0.2139950964067161, 0, 0.4242447244180513, 2.34938011983911, 0.7860049035932839, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.5929812951208127, 2.291269011223637, 0, 1, 0.2055928689047684, 0, 0.4364393683594388, 2.416911552513287, 0.7944071310952315, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 1.592827620016813, 0, 0, 0.3856793225588656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8948478104604627, 2.105152189539538, 0, 0, 0.2982826034868208, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8951795041766069, 2.104820495823394, 0, 1, 0.2983931680588689, 0, 0.4750998966345611, 2.63100561503025, 0.701606831941131, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 5.537794543142104, 0.4444444444444445, 1, 0.1805773024278014],
[0.002016078153814597, 1.81584665814873, 0, 1, 0.00110903761519157, 0, 0.5507072943149878, 3.049703849326092, 0.9988909623848085, 1, 0.1805773024278014],
[0, 1.814344759966379, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9990803487226311, 2.00091965127737, 0, 1, 0.3330267829075436, 0, 0.4997701928518762, 2.767624646800197, 0.6669732170924564, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 1, 0.2139148139313646, 0, 0.4240422529782021, 2.348258874604371, 0.7860851860686354, 1, 0.1805773024278014],
[1.006349625335295, 2.01269925067059, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1794379387458278],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 1, 0.2139148139313646, 0, 0.4240422529782021, 2.348258874604371, 0.7860851860686354, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 3, 0, 0.3333333333333333, 3, 0, -16.61338362942631, 1, 0.03703703703703698, 0.1805773024278014],
[1, 1.894847810460464, 0, 0, 0.3454413031270673, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 1.894847810460464, 0, 0, 0.3454413031270673, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9988732003375295, 2.001126799662471, 0, 1, 0.3329577334458431, 0, 0.4997184587047005, 2.767338153722273, 0.6670422665541569, 1, 0.1805773024278014],
[0.7503894230458564, 1.842438196970953, 1, 0, 0.2894096843356642, 1.332641384977104, 0, -7.379894189691542, 1, 0.2894096843356642, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.392630538846177, 1.249113902947918, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7075811094047181, 2.292418890595281, 0, 0, 0.2358603698015728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 1.594107095467368, 1, 0, 0.3854890963242344, 1, 0, -5.537794543142104, 1, 0.3854890963242343, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.292418890595281, 0, 0, 0.218714628020214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.008480212124766, 1.991519787875234, 1, 0, 0.3361600707082554, 0.9915910971550951, 0, -5.491227766853777, 1, 0.3361600707082555, 0.1805773024278014],
[0.9986713377593299, 2.00132866224067, 0, 2, 0.3328904459197766, 0, 0.9993361099225038, 5.534118056293699, 0.4450351571451145, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.002818460437184, 1.997181539562817, 0, 1, 0.3342728201457279, 0, 0.5007056094754913, 2.772804791874017, 0.6657271798542721, 1, 0.1805773024278014],
[0.998344672483264, 2.001655327516737, 1, 2, 0.3327815574944212, 1.001658072169223, 0.9991730207024251, -0.0137617044522582, 0.7414761370667301, 0.7029673935040097, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.841941522964728, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.354266092487455, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.2483311015132358, 2.751668898486764, 0, 1, 0.08277703383774526, 0, 0.3634158166885318, 2.012522126549283, 0.9172229661622547, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 1, 0.2139148139313646, 0, 0.4240422529782021, 2.348258874604371, 0.7860851860686354, 1, 0.1805773024278014],
[0.9988734129046707, 2.00112658709533, 0, 1, 0.3329578043015569, 0, 0.4997185117866618, 2.767338447679269, 0.6670421956984431, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 1.999669658142048, 0, 1, 0.3333700420263561, 0, 0.5000825991074593, 2.769354688457609, 0.6666299579736439, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.89405180567804, 2, 1, 0, 0.3089273674797176, 1.118503417418423, 0, -6.19404212146554, 1, 0.3089273674797175, 0.1805773024278014],
[0.2491139029479179, 2.750886097052081, 0, 0, 0.08303796764930599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 1.814344759966379, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7266886300759946, 2.273311369924006, 0, 1, 0.2422295433586648, 0, 0.4398869478374309, 2.43600353933356, 0.7577704566413352, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9976384789656504, 2.00236152103435, 0, 1, 0.3325461596552167, 0, 0.4994103160169773, 2.765631722827691, 0.6674538403447833, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 1.999669298571705, 0, 1, 0.3333700819874214, 0, 0.5000826890297639, 2.769355186428856, 0.6666299180125786, 1, 0.1805773024278014],
[0.7075811094047181, 2.292418890595281, 0, 0, 0.2358603698015728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.5929812951203379, 1.514982112010955, 0, 1, 0.281305307821885, 0, 0.6600738002593451, 3.655353089147273, 0.718694692178115, 1, 0.1805773024278014],
[1.234572061810905, 1.699591270578472, 0, 0, 0.4207577840615833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9996692848632979, 2.000330715136703, 0, 1, 0.3332230949544326, 0, 0.4999173348851267, 2.768439489148999, 0.6667769050455674, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[9.333734951460912, 21.95784840724913, 0, 0, 0.2982826034868209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01589719959158889],
[0.9977474775946061, 2.002252522405394, 0, 2, 0.3325824925315353, 0, 0.9988750058345846, 5.5315645565918, 0.4454461292754182, 1, 0.1805773024278014],
[1.394208720101429, 1.248661513732301, 1, 0, 0.5275358215673718, 0.7172527223379079, 0, -3.971998211816685, 1, 0.5275358215673718, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8948478104604627, 2.105152189539538, 0, 0, 0.2982826034868208, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7488090565196615, 2.135806163352711, 1, 3, 0.2595871544187415, 1.33545393354059, 1.404621847935259, 0.3830376988953174, 0.7220039047990219, 0.6994645000379013, 0.1805773024278014],
[0.6425398362389432, 2.357460163761056, 1, 0, 0.2141799454129811, 1.55632373839017, 0, -8.618601105819605, 1, 0.2141799454129811, 0.1805773024278014],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.768897271571052, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.392630538846177, 1.249113902947918, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7258270487848645, 2.274172951215137, 0, 0, 0.2419423495949548, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9977460452260268, 2.002253954773974, 1, 1, 0.3325820150753422, 1.002259046562758, 0.499437145630653, -2.78452437915415, 0.8893892032484249, 0.5545532333991092, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9988732470960929, 2.001126752903908, 0, 1, 0.3329577490320309, 0, 0.4997184703811808, 2.767338218384222, 0.6670422509679691, 1, 0.1805773024278014],
[1.392630538846177, 1.249113902947918, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.841941522964728, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.354266092487455, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[0.6425398007351015, 2.357460199264898, 1, 0, 0.2141799335783672, 1.556323824385577, 0, -8.6186015820445, 1, 0.2141799335783672, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.003142427267976447, 2.996857572732023, 0, 1, 0.001047475755992149, 0, 0.3336828580373177, 1.847867110379119, 0.9989525242440078, 1, 0.1805773024278014],
[0.7075811094047181, 2.292418890595281, 0, 0, 0.2358603698015728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.392630538846177, 1.249113902947918, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[0.6419512715811201, 2.35804872841888, 0, 1, 0.2139837571937067, 0, 0.4240794466832417, 2.348464845701178, 0.7860162428062933, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8838855258201362, 2, 0, 0, 0.3064911966534357, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.2491139029479179, 2.750886097052081, 0, 0, 0.08303796764930599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7075811094047181, 2.292418890595281, 0, 0, 0.2358603698015728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8838855258201362, 2, 0, 0, 0.3064911966534357, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.841941522964728, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8948478104604627, 2.105152189539538, 0, 1, 0.2982826034868208, 0, 0.4750250385549232, 2.630591066365322, 0.7017173965131791, 1, 0.1805773024278014],
[0.8940517726838376, 2.105948227316162, 1, 0, 0.2980172575612792, 1.118503458695818, 0, -6.194042350051273, 1, 0.2980172575612792, 0.1805773024278014],
[0.8813946792188754, 2.003220498641494, 1, 1, 0.3055501773628744, 1.134565505757576, 0.4991961697068102, -3.518544842061754, 0.9066390891135161, 0.5177394438392647, 0.1805773024278014],
[0.9988745188644724, 2.001125481135528, 0, 1, 0.332958172954824, 0, 0.4997187879655379, 2.767339977101142, 0.6670418270451759, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[0.7075811094047181, 2.292418890595281, 0, 0, 0.2358603698015728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6420886831806463, 2.35662706302716, 0, 1, 0.2141212230577824, 0, 0.4243352780288745, 2.349881587130989, 0.7858787769422175, 1, 0.1805773024278014],
[0.998874518921138, 2.001125481078863, 0, 1, 0.3329581729737126, 0, 0.4997187879796883, 2.767339977179504, 0.6670418270262874, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8940518056785313, 2.105948194321469, 1, 0, 0.2980172685595104, 1.118503417417809, 0, -6.194042121462137, 1, 0.2980172685595104, 0.1805773024278014],
[0.8957040854974319, 2.104295914502568, 1, 2, 0.2985680284991439, 1.116440146016133, 0.9504366692042822, -0.9192931480312859, 0.7858018175675873, 0.6548906928184268, 0.1805773024278014]
],
"RESOLVED": [
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 1, 0.2139148139313646, 0, 0.4240422529782021, 2.348258874604371, 0.7860851860686354, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.354266092487455, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794543142104, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773024278014],
[0, 1.825863826960412, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1794380706770249],
[0.7503894024464985, 1.354762787093039, 1, 0, 0.3564537548283538, 1.332641421560186, 0, -7.379894392281132, 1, 0.3564537548283538, 0.1805773024278014],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -11.07558908628421, 1, 0.1111111111111109, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9988745189810787, 2.001125481018922, 0, 1, 0.3329581729936928, 0, 0.4997187879946567, 2.767339977262396, 0.6670418270063072, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9988732937839347, 2.001126706216066, 0, 1, 0.3329577645946449, 0, 0.4997184820400013, 2.767338282948375, 0.6670422354053551, 1, 0.1805773024278014],
[0.8940518056785313, 2, 1, 0, 0.3089273674798349, 1.118503417417809, 0, -6.194042121462137, 1, 0.308927367479835, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.00222290810775216, 2.997777091892248, 0, 1, 0.00074096936925072, 0, 0.333580506270659, 1.847300307324236, 0.9992590306307493, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.354266092487455, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8838855258201362, 2, 0, 0, 0.3064911966534357, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.893268347656736, 1.105604946113915, 1, 0, 0.6313265557399471, 0.5281871432740541, 0, -2.924991879780874, 1, 0.6313265557399471, 0.1805773024278014],
[1.392630538846177, 1.249113902947918, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.841941522964728, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.5928276200168113, 2.291057905803325, 0, 0, 0.2055655866743253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.292418890595281, 0, 0, 0.218714628020214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8940518056701052, 2.105948194329895, 1, 0, 0.2980172685567017, 1.11850341742835, 0, -6.194042121520513, 1, 0.2980172685567017, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7488981761144523, 1.363607014617229, 1, 1, 0.3545071412842618, 1.33529501325314, 0.7333491169233278, -3.333452699962017, 0.8743246867784604, 0.5833389693469839, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6439983965680671, 2.354875184568177, 0, 3, 0.2147467637912441, 0, 1.273952870054182, 7.054889252006271, 0.4842049274872613, 1, 0.1805773024278014],
[0.6439949409132008, 2.356005059086799, 0, 2, 0.2146649803044003, 0, 0.84889461178628, 4.701003948852796, 0.616751093160288, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.5, 8.306691814713156, 0.2962962962962963, 1, 0.1805773024278014],
[0.9976384789747788, 2.002361521025222, 0, 1, 0.3325461596582595, 0, 0.499410316019254, 2.765631722840298, 0.6674538403417405, 1, 0.1805773024278014],
[1.391140712045233, 1.253360010262772, 1, 0, 0.5260504186329381, 0.7188345444436138, 0, -3.980758017641885, 1, 0.5260504186329381, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9996693472444222, 2.000330652755578, 0, 1, 0.3332231157481407, 0, 0.4999173504752519, 2.768439575483909, 0.6667768842518593, 1, 0.1805773024278014],
[0.2491139029479179, 2.750886097052081, 0, 0, 0.08303796764930599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6425398362612846, 2.357460163738715, 1, 0, 0.2141799454204282, 1.556323738336056, 0, -8.618601105519932, 1, 0.2141799454204282, 0.1805773024278014],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794543142104, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773024278014],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794543142104, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9990803487211556, 2.000919651278845, 0, 1, 0.3330267829070518, 0, 0.4997701928515077, 2.767624646798156, 0.6669732170929482, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.354266092487455, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.894847810460464, 1.105152189539538, 0, 0, 0.6316159368201543, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.292418890595281, 0, 0, 0.218714628020214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.354266092487455, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.392630538846177, 1.249113902947918, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8940518056718311, 2.105948194328169, 1, 0, 0.298017268557277, 1.118503417426191, 0, -6.194042121508557, 1, 0.2980172685572771, 0.1805773024278014],
[0.9968541883368708, 2.002780338465181, 0, 2, 0.33232521476529, 0, 0.9986117606550344, 5.530106758872979, 0.4457896188382162, 1, 0.1805773024278014],
[1.393712116646823, 1.250077048098344, 2, 0, 0.5271646223654759, 1.435016583490617, 0, -7.946827005372765, 1, 0.2779025390737349, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.392630538846177, 1.249113902947918, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794543142104, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773024278014],
[1, 2, 2, 1, 0.3333333333333333, 2, 0.5, -8.306691814713156, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.001869412268064164, 2.997764434376048, 0, 1, 0.0006232134865912381, 0, 0.3335819147537986, 1.84730810721448, 0.9993767865134088, 1, 0.1805773024278014],
[0.8838855258201362, 2, 0, 0, 0.3064911966534357, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.2514734449057648, 2.748526555094235, 0, 1, 0.08382448163525494, 0, 0.3638313037749473, 2.01482300866918, 0.9161755183647451, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794543142104, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9996348761653612, 1.594107980125134, 0, 1, 0.385402459515595, 0, 0.6273100771514251, 3.473914322107214, 0.614597540484405, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[1, 1.999669232982369, 0, 1, 0.3333700892767325, 0, 0.5000827054325223, 2.769355277263962, 0.6666299107232676, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.392630538846177, 1.249113902947918, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8838855258201362, 2, 0, 0, 0.3064911966534357, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.5928276200168113, 1.512324569522726, 0, 0, 0.2816079630549093, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 1.814344759966379, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.229190957022921, 1.706007307428969, 1, 1, 0.4187761255890686, 0.8135432450804734, 0.5861639605208055, -1.259179761258084, 0.8246265566366087, 0.6621788078147459, 0.1805773024278014],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794543142104, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773024278014],
[0.9968550209186707, 2.00314497908133, 1, 1, 0.3322850069728902, 1.003154901179543, 0.4992149896502318, -2.790715692138532, 0.8895866741410262, 0.5541566880868067, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9968550209367777, 2.003144979063223, 1, 2, 0.3322850069789258, 1.003154901161321, 0.9984299793094888, -0.02616564644785021, 0.7421374079209422, 0.7023037361027715, 0.1805773024278014],
[1.892771257055938, 1.107021688002928, 1, 0, 0.6309673006510772, 0.5283258588549279, 0, -2.925760058167685, 1, 0.6309673006510772, 0.1805773024278014],
[0.9988732470751861, 2.001126752924814, 0, 1, 0.332957749025062, 0, 0.4997184703759601, 2.767338218355311, 0.6670422509749381, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.0012348148237, 1.892816990841834, 0, 1, 0.3459629896270808, 0, 0.5283130935734298, 2.925689366661463, 0.6540370103729192, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9988732937548693, 2.001126706245131, 0, 1, 0.3329577645849564, 0, 0.499718482032743, 2.76733828290818, 0.6670422354150436, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8948478104604627, 2.105152189539538, 0, 0, 0.2982826034868208, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6415906343510367, 2.357129107848613, 0, 1, 0.2139548505724683, 0, 0.4242448988773105, 2.349381085958644, 0.7860451494275317, 1, 0.1805773024278014],
[1, 1.894847810460464, 0, 0, 0.3454413031270673, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.231176021825086, 1.702275364736459, 1, 1, 0.419702207258397, 0.8122315430718084, 0.587449023063796, -1.244799412694102, 0.8238500572224297, 0.6632544717392236, 0.1805773024278014],
[0.7075811094047181, 2.292418890595281, 0, 0, 0.2358603698015728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9977468870850678, 2.002046110942531, 0, 2, 0.3326052456756513, 0, 0.998977990101553, 5.532134862303447, 0.4454157580996579, 1, 0.1805773024278014],
[0.6428702037844364, 2.357129796215564, 0, 1, 0.2142900679281455, 0, 0.4242447749824924, 2.349380399854596, 0.7857099320718546, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.292418890595281, 0, 0, 0.218714628020214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[0.9990803105883551, 2.000919689411646, 0, 1, 0.3330267701961183, 0, 0.499770183327069, 2.767624594053772, 0.6669732298038817, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6425398007056684, 2.357460199294331, 1, 0, 0.2141799335685561, 1.556323824456869, 0, -8.618601582439297, 1, 0.2141799335685561, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 1.814344759966379, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9996692848640149, 2.000330715135986, 0, 1, 0.3332230949546715, 0, 0.4999173348853058, 2.76843948914999, 0.6667769050453285, 1, 0.1805773024278014],
[0.7075811094047181, 2.292418890595281, 0, 0, 0.2358603698015728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7084999899776826, 2.291500010022317, 0, 1, 0.2361666633258942, 0, 0.4363953723003741, 2.416667911377479, 0.7638333366741058, 1, 0.1805773024278014],
[0.6428702037879601, 2.35712979621204, 0, 1, 0.21429006792932, 0, 0.4242447749831266, 2.349380399858108, 0.78570993207068, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.0007833426683779545, 2.999216657331622, 0, 1, 0.0002611142227926515, 0, 0.3334203941404126, 1.846413639243066, 0.9997388857772074, 1, 0.1805773024278014],
[0.8948478104604627, 2, 0, 0, 0.3091173937458652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8940518056785208, 2.10594819432148, 1, 0, 0.2980172685595069, 1.118503417417822, 0, -6.194042121462209, 1, 0.2980172685595068, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[0.5928276200168113, 2.291057905803325, 0, 0, 0.2055655866743253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6425398362757236, 2.357460163724276, 1, 0, 0.2141799454252412, 1.556323738301083, 0, -8.618601105326256, 1, 0.2141799454252412, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9976384789657839, 2.002361521034216, 0, 1, 0.3325461596552613, 0, 0.4994103160170106, 2.765631722827875, 0.6674538403447388, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.841941522964728, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8948478104604627, 2.105152189539538, 0, 0, 0.2982826034868208, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.5929812950991187, 2.001125480977588, 0, 1, 0.2285878517290395, 0, 0.4997187880049787, 2.767339977319557, 0.7714121482709605, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8948478104604627, 2.105152189539538, 0, 0, 0.2982826034868208, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9990803486927616, 2.000919651307239, 1, 1, 0.3330267828975871, 1.000920497844284, 0.4997701928444158, -2.775267424322273, 0.8890931618728832, 0.5551467276680577, 0.1805773024278014],
[0.8940518056701053, 2, 1, 0, 0.3089273674778228, 1.11850341742835, 0, -6.194042121520512, 1, 0.3089273674778228, 0.1805773024278014],
[0.7075811094047181, 2.292418890595281, 0, 0, 0.2358603698015728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.292418890595281, 0, 0, 0.218714628020214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.537794543142104, 1, 0.3333333333333333, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.2491139029479179, 2.750886097052081, 0, 0, 0.08303796764930599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7519993227780519, 1.353152866761485, 0, 1, 0.3572185072959204, 0, 0.7390148035478877, 4.092512146388727, 0.6427814927040796, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.354266092487455, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.5932455498971573, 2.291004847477315, 0, 1, 0.2056844823310721, 0, 0.4364896918926757, 2.417190233901038, 0.7943155176689279, 1, 0.1805773024278014],
[1.893268347655781, 1.105604946114189, 2, 0, 0.6313265557397721, 1.056374286548641, 0, -5.849983759564696, 1, 0.3985732199822436, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 5.537794543142104, 0.4444444444444445, 1, 0.1805773024278014],
[0.9966168099216203, 2.003383190078381, 1, 1, 0.3322056033072067, 1.003394674908851, 0.499155630811136, -2.792372226843515, 0.8896394371312948, 0.5540506437457082, 0.1805773024278014],
[1, 1.592827620016813, 0, 0, 0.3856793225588656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9988731086050017, 2.000919802425948, 0, 1, 0.3329806884108262, 0, 0.4997701550994617, 2.767624437735082, 0.6670193115891738, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.768897271571052, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1805773024278014],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.768897271571052, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1805773024278014],
[0.2491139029479179, 2.750886097052081, 0, 0, 0.08303796764930599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.5933246580604702, 2.290560867759666, 1, 0, 0.2057379368037631, 1.685417901337386, 0, -9.333498056940195, 1, 0.2057379368037631, 0.1805773024278014],
[0.2491139029479179, 2.750886097052081, 0, 0, 0.08303796764930599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.841941522964728, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 1.814344759966379, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.35713007715471, 0, 1, 0.2139950964067161, 0, 0.4242447244180513, 2.34938011983911, 0.7860049035932839, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.5929812951208127, 2.291269011223637, 0, 1, 0.2055928689047684, 0, 0.4364393683594388, 2.416911552513287, 0.7944071310952315, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 1.592827620016813, 0, 0, 0.3856793225588656, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8948478104604627, 2.105152189539538, 0, 0, 0.2982826034868208, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8951795041766069, 2.104820495823394, 0, 1, 0.2983931680588689, 0, 0.4750998966345611, 2.63100561503025, 0.701606831941131, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 5.537794543142104, 0.4444444444444445, 1, 0.1805773024278014],
[0.002016078153814597, 1.81584665814873, 0, 1, 0.00110903761519157, 0, 0.5507072943149878, 3.049703849326092, 0.9988909623848085, 1, 0.1805773024278014],
[0, 1.814344759966379, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9990803487226311, 2.00091965127737, 0, 1, 0.3330267829075436, 0, 0.4997701928518762, 2.767624646800197, 0.6669732170924564, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 1, 0.2139148139313646, 0, 0.4240422529782021, 2.348258874604371, 0.7860851860686354, 1, 0.1805773024278014],
[1.006349625335295, 2.01269925067059, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1794379387458278],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 1, 0.2139148139313646, 0, 0.4240422529782021, 2.348258874604371, 0.7860851860686354, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 3, 0, 0.3333333333333333, 3, 0, -16.61338362942631, 1, 0.03703703703703698, 0.1805773024278014],
[1, 1.894847810460464, 0, 0, 0.3454413031270673, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 1.894847810460464, 0, 0, 0.3454413031270673, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9988732003375295, 2.001126799662471, 0, 1, 0.3329577334458431, 0, 0.4997184587047005, 2.767338153722273, 0.6670422665541569, 1, 0.1805773024278014],
[0.7503894230458564, 1.842438196970953, 1, 0, 0.2894096843356642, 1.332641384977104, 0, -7.379894189691542, 1, 0.2894096843356642, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.392630538846177, 1.249113902947918, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7075811094047181, 2.292418890595281, 0, 0, 0.2358603698015728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 1.594107095467368, 1, 0, 0.3854890963242344, 1, 0, -5.537794543142104, 1, 0.3854890963242343, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.292418890595281, 0, 0, 0.218714628020214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.008480212124766, 1.991519787875234, 1, 0, 0.3361600707082554, 0.9915910971550951, 0, -5.491227766853777, 1, 0.3361600707082555, 0.1805773024278014],
[0.9986713377593299, 2.00132866224067, 0, 2, 0.3328904459197766, 0, 0.9993361099225038, 5.534118056293699, 0.4450351571451145, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.002818460437184, 1.997181539562817, 0, 1, 0.3342728201457279, 0, 0.5007056094754913, 2.772804791874017, 0.6657271798542721, 1, 0.1805773024278014],
[0.998344672483264, 2.001655327516737, 1, 2, 0.3327815574944212, 1.001658072169223, 0.9991730207024251, -0.0137617044522582, 0.7414761370667301, 0.7029673935040097, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.841941522964728, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.354266092487455, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.2483311015132358, 2.751668898486764, 0, 1, 0.08277703383774526, 0, 0.3634158166885318, 2.012522126549283, 0.9172229661622547, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 1, 0.2139148139313646, 0, 0.4240422529782021, 2.348258874604371, 0.7860851860686354, 1, 0.1805773024278014],
[0.9988734129046707, 2.00112658709533, 0, 1, 0.3329578043015569, 0, 0.4997185117866618, 2.767338447679269, 0.6670421956984431, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 1.999669658142048, 0, 1, 0.3333700420263561, 0, 0.5000825991074593, 2.769354688457609, 0.6666299579736439, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.89405180567804, 2, 1, 0, 0.3089273674797176, 1.118503417418423, 0, -6.19404212146554, 1, 0.3089273674797175, 0.1805773024278014],
[0.2491139029479179, 2.750886097052081, 0, 0, 0.08303796764930599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 1.814344759966379, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7266886300759946, 2.273311369924006, 0, 1, 0.2422295433586648, 0, 0.4398869478374309, 2.43600353933356, 0.7577704566413352, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9976384789656504, 2.00236152103435, 0, 1, 0.3325461596552167, 0, 0.4994103160169773, 2.765631722827691, 0.6674538403447833, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 1.999669298571705, 0, 1, 0.3333700819874214, 0, 0.5000826890297639, 2.769355186428856, 0.6666299180125786, 1, 0.1805773024278014],
[0.7075811094047181, 2.292418890595281, 0, 0, 0.2358603698015728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.5929812951203379, 1.514982112010955, 0, 1, 0.281305307821885, 0, 0.6600738002593451, 3.655353089147273, 0.718694692178115, 1, 0.1805773024278014],
[1.234572061810905, 1.699591270578472, 0, 0, 0.4207577840615833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9996692848632979, 2.000330715136703, 0, 1, 0.3332230949544326, 0, 0.4999173348851267, 2.768439489148999, 0.6667769050455674, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2, 0, 0, 0.2429244977830878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[9.333734951460912, 21.95784840724913, 0, 0, 0.2982826034868209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01589719959158889],
[0.9977474775946061, 2.002252522405394, 0, 2, 0.3325824925315353, 0, 0.9988750058345846, 5.5315645565918, 0.4454461292754182, 1, 0.1805773024278014],
[1.394208720101429, 1.248661513732301, 1, 0, 0.5275358215673718, 0.7172527223379079, 0, -3.971998211816685, 1, 0.5275358215673718, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8948478104604627, 2.105152189539538, 0, 0, 0.2982826034868208, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7488090565196615, 2.135806163352711, 1, 3, 0.2595871544187415, 1.33545393354059, 1.404621847935259, 0.3830376988953174, 0.7220039047990219, 0.6994645000379013, 0.1805773024278014],
[0.6425398362389432, 2.357460163761056, 1, 0, 0.2141799454129811, 1.55632373839017, 0, -8.618601105819605, 1, 0.2141799454129811, 0.1805773024278014],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.768897271571052, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.392630538846177, 1.249113902947918, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7258270487848645, 2.274172951215137, 0, 0, 0.2419423495949548, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9977460452260268, 2.002253954773974, 1, 1, 0.3325820150753422, 1.002259046562758, 0.499437145630653, -2.78452437915415, 0.8893892032484249, 0.5545532333991092, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.9988732470960929, 2.001126752903908, 0, 1, 0.3329577490320309, 0, 0.4997184703811808, 2.767338218384222, 0.6670422509679691, 1, 0.1805773024278014],
[1.392630538846177, 1.249113902947918, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.841941522964728, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.354266092487455, 0, 0, 0.3566896972025211, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[0.6425398007351015, 2.357460199264898, 1, 0, 0.2141799335783672, 1.556323824385577, 0, -8.6186015820445, 1, 0.2141799335783672, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.003142427267976447, 2.996857572732023, 0, 1, 0.001047475755992149, 0, 0.3336828580373177, 1.847867110379119, 0.9989525242440078, 1, 0.1805773024278014],
[0.7075811094047181, 2.292418890595281, 0, 0, 0.2358603698015728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1.392630538846177, 1.249113902947918, 0, 0, 0.5271632322997889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[0.6419512715811201, 2.35804872841888, 0, 1, 0.2139837571937067, 0, 0.4240794466832417, 2.348464845701178, 0.7860162428062933, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 2.132999428768053, 0, 0, 0.2603730593080809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8838855258201362, 2, 0, 0, 0.3064911966534357, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.2491139029479179, 2.750886097052081, 0, 0, 0.08303796764930599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7075811094047181, 2.292418890595281, 0, 0, 0.2358603698015728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8838855258201362, 2, 0, 0, 0.3064911966534357, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.7508860970520819, 1.841941522964728, 0, 0, 0.2896012412299179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8948478104604627, 2.105152189539538, 0, 1, 0.2982826034868208, 0, 0.4750250385549232, 2.630591066365322, 0.7017173965131791, 1, 0.1805773024278014],
[0.8940517726838376, 2.105948227316162, 1, 0, 0.2980172575612792, 1.118503458695818, 0, -6.194042350051273, 1, 0.2980172575612792, 0.1805773024278014],
[0.8813946792188754, 2.003220498641494, 1, 1, 0.3055501773628744, 1.134565505757576, 0.4991961697068102, -3.518544842061754, 0.9066390891135161, 0.5177394438392647, 0.1805773024278014],
[0.9988745188644724, 2.001125481135528, 0, 1, 0.332958172954824, 0, 0.4997187879655379, 2.767339977101142, 0.6670418270451759, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.768897271571052, 0.6666666666666667, 1, 0.1805773024278014],
[0.7075811094047181, 2.292418890595281, 0, 0, 0.2358603698015728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6417444417940937, 2.358255558205906, 0, 0, 0.2139148139313646, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.6420886831806463, 2.35662706302716, 0, 1, 0.2141212230577824, 0, 0.4243352780288745, 2.349881587130989, 0.7858787769422175, 1, 0.1805773024278014],
[0.998874518921138, 2.001125481078863, 0, 1, 0.3329581729737126, 0, 0.4997187879796883, 2.767339977179504, 0.6670418270262874, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1805773024278014],
[0.8940518056785313, 2.105948194321469, 1, 0, 0.2980172685595104, 1.118503417417809, 0, -6.194042121462137, 1, 0.2980172685595104, 0.1805773024278014],
[0.8957040854974319, 2.104295914502568, 1, 2, 0.2985680284991439, 1.116440146016133, 0.9504366692042822, -0.9192931480312859, 0.7858018175675873, 0.6548906928184268, 0.1805773024278014]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node121":{
"Global MG94xREV":0.002272583486247204,
"Nucleotide GTR":0.002240239409318057,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "F", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAG", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTT", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node168":{
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "F", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "TTC", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node173":{
"Global MG94xREV":0.001135741481910052,
"Nucleotide GTR":0.001119577274924995,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "H", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CAC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node174":{
"Global MG94xREV":0.001137302678853578,
"Nucleotide GTR":0.001121116252454205,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "N", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "AAC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node199":{
"Global MG94xREV":0.001134678006132582,
"Nucleotide GTR":0.001118528934847738,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "R", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AGA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node21":{
"Global MG94xREV":0.001135140398897716,
"Nucleotide GTR":0.001118984746702971,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTG", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node239":{
"Global MG94xREV":0.001134616861545354,
"Nucleotide GTR":0.001118468660488269,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCT", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node240":{
"Global MG94xREV":0.00113538397796079,
"Nucleotide GTR":0.001119224859077142,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCC", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node276":{
"Global MG94xREV":0.001136304800874893,
"Nucleotide GTR":0.00112013257656856,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "K", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "AAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node298":{
"Global MG94xREV":0.00113854658668711,
"Nucleotide GTR":0.001122342456625409,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "H", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CAT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node51":{
"Global MG94xREV":0.001138144939533793,
"Nucleotide GTR":0.001121946525832568,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "I"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "ATC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node52":{
"Global MG94xREV":0.001134658476626192,
"Nucleotide GTR":0.001118509683291029,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "L"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "CTC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node72":{
"Global MG94xREV":0.00113502687412617,
"Nucleotide GTR":0.00111887283764938,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTC", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node97":{
"Global MG94xREV":0.001134674481514028,
"Nucleotide GTR":0.001118525460392592,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAG", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_402121_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002273707187993333,
"Nucleotide GTR":0.00224134711821026,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCA", "TGG", "CAA", "CCA", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_402121_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_402127_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113570356370738,
"Nucleotide GTR":0.001119539896385341,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "N", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "AAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_402127_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413015_Ontario_20200123_null_13775":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413015_Ontario_20200123_null_13775",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414007_England_20200228_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001134952810904804,
"Nucleotide GTR":0.001118799828517575,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAC", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414007_England_20200228_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134952790301715,
"Nucleotide GTR":0.001118799808207716,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAC", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135870715629059,
"Nucleotide GTR":0.001119704669351683,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "S", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "TCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414588_Minnesota_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136079227205903,
"Nucleotide GTR":0.001119910213330406,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "F", "F", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "TTC", "TTT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414588_Minnesota_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414590_Minnesota_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134670857796057,
"Nucleotide GTR":0.001118521888248441,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "F", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTC", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TTT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414590_Minnesota_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415453_Wales_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134952775948488,
"Nucleotide GTR":0.001118799794058768,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "P", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CCT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415453_Wales_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415622_Washington_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135870732112252,
"Nucleotide GTR":0.001119704685600283,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "F", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TTC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415622_Washington_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136743109098967,
"Nucleotide GTR":0.001120564646661008,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "K", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "AAA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415742_Taoyuan_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135703572295371,
"Nucleotide GTR":0.001119539904851105,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "S", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "AGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415742_Taoyuan_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416153_Copenhagen_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135565699173303,
"Nucleotide GTR":0.001119403993979883,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "G", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GGT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416153_Copenhagen_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416346_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTC", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416346_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002272194044478369,
"Nucleotide GTR":0.002239855510199075,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "G", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "S", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GGT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "AGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416401_Shanghai_20200202_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135870746562257,
"Nucleotide GTR":0.00111970469984463,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "S", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "TCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416401_Shanghai_20200202_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0011345885708122,
"Nucleotide GTR":0.001118440772397155,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "S", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "TCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416703_Washington_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135703547799349,
"Nucleotide GTR":0.001119539880703718,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTA", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416703_Washington_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416704_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135565727758119,
"Nucleotide GTR":0.001119404022157871,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "E", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAG", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416704_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417005_Li_ge_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135819269578756,
"Nucleotide GTR":0.001119653955496708,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "N", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "AAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417005_Li_ge_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417388_New_South_Wales_20200305_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001135870729649625,
"Nucleotide GTR":0.001119704683172704,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "F", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "TTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417388_New_South_Wales_20200305_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417538_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134952785725343,
"Nucleotide GTR":0.001118799803696475,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "CTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417538_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001134918850929654,
"Nucleotide GTR":0.001118766351870785,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "G", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "GGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418022_Portugal_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134918843823809,
"Nucleotide GTR":0.001118766344866071,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAG", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418022_Portugal_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001137511824461417,
"Nucleotide GTR":0.00112132242144021,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "L", "N", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CTA", "AAC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135917859555249,
"Nucleotide GTR":0.001119751142311643,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "F", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TTT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418252_Madrid_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001139363681973641,
"Nucleotide GTR":0.001123147922771374,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "-", "D", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "---", "GAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418252_Madrid_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418357_Ontario_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134966062004431,
"Nucleotide GTR":0.001118812891023653,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTG", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418357_Ontario_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418405_Finland_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001134588550040702,
"Nucleotide GTR":0.001118440751921281,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACT", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418405_Finland_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418692_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135870741163542,
"Nucleotide GTR":0.001119704694522752,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCT", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418692_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418992_Singapore_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135565704718669,
"Nucleotide GTR":0.001119403999446325,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "G", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GGT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418992_Singapore_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001139110100918462,
"Nucleotide GTR":0.001122897950756393,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "E", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAA", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134902082915205,
"Nucleotide GTR":0.001118749822503653,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "CTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419840_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113582367104916,
"Nucleotide GTR":0.001119658294324088,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "TTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419840_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419884_Victoria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871775465401,
"Nucleotide GTR":0.001118719946398392,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAG", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419884_Victoria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419936_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135656478558199,
"Nucleotide GTR":0.001119493481365858,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "S", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "AGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419936_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134514433056128,
"Nucleotide GTR":0.001118367689791443,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "T", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTG", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "ACA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135823658792793,
"Nucleotide GTR":0.001119658282242159,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "I", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ATT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420179_South_Yorkshire_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135823661361009,
"Nucleotide GTR":0.001119658284773823,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "V", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GTT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420179_South_Yorkshire_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420270_South_Yorkshire_20200322_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001134902078253505,
"Nucleotide GTR":0.001118749817908298,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "T", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ACG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420270_South_Yorkshire_20200322_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420282_South_Yorkshire_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135999918400552,
"Nucleotide GTR":0.001119832033271312,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCA", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420282_South_Yorkshire_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135656473095387,
"Nucleotide GTR":0.001119493475980795,
"amino-acid": [
["S", "N", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AAT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136744018450819,
"Nucleotide GTR":0.001120565543070696,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCA", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420687_England_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001135823656970562,
"Nucleotide GTR":0.00111965828044586,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "F", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "TTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420687_England_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420759_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135823651815331,
"Nucleotide GTR":0.001119658275364002,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAT", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420759_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420841_Sud_Kivu_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871797509183,
"Nucleotide GTR":0.001118719968128439,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "S", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AGC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420841_Sud_Kivu_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420943_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135823686271208,
"Nucleotide GTR":0.001119658309329492,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "F", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "TTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420943_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135656473095387,
"Nucleotide GTR":0.001119493475980795,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "T", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "ACT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421236_Hangzhou_20200120_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001134871797509183,
"Nucleotide GTR":0.001118719968128439,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGG", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421236_Hangzhou_20200120_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001138858626333544,
"Nucleotide GTR":0.001122650055231769,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "K", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "AAG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135565762280449,
"Nucleotide GTR":0.00111940405618887,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACG", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135533979372407,
"Nucleotide GTR":0.001119372725624527,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "Y", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "TAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421414_New_York_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135932162364462,
"Nucleotide GTR":0.001119765241559066,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCT", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421414_New_York_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTG", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421552_Wyoming_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871787600304,
"Nucleotide GTR":0.001118719958360587,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTG", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421552_Wyoming_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421969_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134902097204378,
"Nucleotide GTR":0.001118749836589458,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCC", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421969_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136048921805091,
"Nucleotide GTR":0.001119880339244978,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "S", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "TCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001135823656970562,
"Nucleotide GTR":0.00111965828044586,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "I", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ATT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422507_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134588561615081,
"Nucleotide GTR":0.001118440763330932,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "I", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "ATT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422507_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422534_New_York_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001134902046965703,
"Nucleotide GTR":0.001118749787065795,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "T", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ACC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422534_New_York_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135823670362977,
"Nucleotide GTR":0.001119658293647672,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "TTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422804_Netherlands_20200307_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001134902097793334,
"Nucleotide GTR":0.001118749837170031,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAC", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422804_Netherlands_20200307_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422849_Netherlands_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135656473095387,
"Nucleotide GTR":0.001119493475980795,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "T", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "ACA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422849_Netherlands_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422875_Noord_Brabant_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001134902097271734,
"Nucleotide GTR":0.001118749836655853,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "A", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GCG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422875_Noord_Brabant_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422886_Noord_Brabant_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCT", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422886_Noord_Brabant_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422957_Zuid_Holland_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136905105341773,
"Nucleotide GTR":0.001120724337325616,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "K", "N", "Y", "G", "D", "S", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "AAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422957_Zuid_Holland_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422958_Zuid_Holland_20200329_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "K", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "AAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422958_Zuid_Holland_20200329_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423092_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135656473095387,
"Nucleotide GTR":0.001119493475980795,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTA", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423092_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423107_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871796517531,
"Nucleotide GTR":0.001118719967150901,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGG", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423107_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423217_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135823661361009,
"Nucleotide GTR":0.001119658284773823,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "V", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GTT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423217_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423319_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135823649296559,
"Nucleotide GTR":0.001119658272881077,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "V", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GTC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423319_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423445_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134902082915205,
"Nucleotide GTR":0.001118749822503653,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCC", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423445_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423829_England_20200323_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001135823651800496,
"Nucleotide GTR":0.001119658275349376,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAT", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423829_England_20200323_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423903_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135823663823513,
"Nucleotide GTR":0.001119658287201279,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "V", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GTT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423903_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423969_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135823656345127,
"Nucleotide GTR":0.001119658279829328,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTT", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423969_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424099_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134588577921184,
"Nucleotide GTR":0.001118440779404961,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "Y", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "TAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424099_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424140_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134588503716494,
"Nucleotide GTR":0.001118440706256373,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "D", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAT", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424140_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424185_USA_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001139231750776489,
"Nucleotide GTR":0.001123017869257844,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "-", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "L", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "---", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "CTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424185_USA_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424440_Reykjavik_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135823661361009,
"Nucleotide GTR":0.001119658284773823,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "I", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ATA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424440_Reykjavik_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_14":{
"Global MG94xREV":0.001134588663883873,
"Nucleotide GTR":0.001118440864144202,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "N", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAT", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424973_Taoyuan_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134588570745335,
"Nucleotide GTR":0.001118440772331241,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "C", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGT", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424973_Taoyuan_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425130_Duesseldorf_20200321_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001135656473095387,
"Nucleotide GTR":0.001119493475980795,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "R", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "AGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425130_Duesseldorf_20200321_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425645_England_20200318_null_14":{
"Global MG94xREV":0.001134588545385318,
"Nucleotide GTR":0.001118440747332155,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "I", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "ATA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425645_England_20200318_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425672_Scotland_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001135823670857244,
"Nucleotide GTR":0.001119658294134904,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "M", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ATG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425672_Scotland_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425797_Scotland_20200306_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001135823661361009,
"Nucleotide GTR":0.001119658284773823,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAT", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425797_Scotland_20200306_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425896_Scotland_20200322_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001135397824439453,
"Nucleotide GTR":0.001119238508488645,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCT", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425896_Scotland_20200322_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425919_Scotland_20200324_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001134588559710901,
"Nucleotide GTR":0.001118440761453852,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGT", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425919_Scotland_20200324_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001138590859490047,
"Nucleotide GTR":0.001122386099324784,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCT", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001135823651800496,
"Nucleotide GTR":0.001119658275349376,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAT", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_426054_Connecticut_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003422557023898478,
"Nucleotide GTR":0.003373846185178897,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "N", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTA", "AAC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426054_Connecticut_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426086_Washington_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001135823661296729,
"Nucleotide GTR":0.001119658284710457,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "I", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ATA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426086_Washington_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426161_Iowa_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001133720508624547,
"Nucleotide GTR":0.001117585064726,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "R", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "L"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "CGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "CTC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426161_Iowa_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871797509183,
"Nucleotide GTR":0.001118719968128439,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "R", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CGA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426914_Victoria_20200329_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001134588605811166,
"Nucleotide GTR":0.001118440806898004,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "F", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "TTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426914_Victoria_20200329_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427032_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135823670348141,
"Nucleotide GTR":0.001119658293633047,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "TTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427032_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427080_Victoria_20200323_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001135823661375847,
"Nucleotide GTR":0.001119658284788449,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "S", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "TCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427080_Victoria_20200323_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427158_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871792009457,
"Nucleotide GTR":0.001118719962706989,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "A", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "GCG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427158_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427380_Liege_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135919094706166,
"Nucleotide GTR":0.001119752359883528,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "I", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ATA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427380_Liege_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427527_New_York_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "R", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AGA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427527_New_York_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427717_New_South_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135823698269972,
"Nucleotide GTR":0.001119658321157487,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "V", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GTA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427717_New_South_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134588672840608,
"Nucleotide GTR":0.001118440872973464,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "S", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "TCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427775_New_South_Wales_20200325_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001134588573267111,
"Nucleotide GTR":0.001118440774817127,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACT", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427775_New_South_Wales_20200325_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428286_Wisconsin_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001135823693860987,
"Nucleotide GTR":0.00111965831681125,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "I", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ATT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428286_Wisconsin_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428306_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134902055795033,
"Nucleotide GTR":0.001118749795769463,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAC", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428306_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428346_Istanbul_20200417_null_29":{
"Global MG94xREV":0.00113527807969094,
"Nucleotide GTR":0.001119120467982631,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "V", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GTT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428346_Istanbul_20200417_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871796517531,
"Nucleotide GTR":0.001118719967150901,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTG", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428717_Kocaeli_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "N", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "AAC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428717_Kocaeli_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428773_New_York_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135823652501515,
"Nucleotide GTR":0.001119658276040418,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAT", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428773_New_York_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428789_New_York_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135823658849062,
"Nucleotide GTR":0.001119658282297626,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "V", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GTA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428789_New_York_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428922_Sverdlovsk_Region_20200330_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001135823656970562,
"Nucleotide GTR":0.00111965828044586,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "I", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ATA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428922_Sverdlovsk_Region_20200330_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428957_Luxembourg_20200407_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001135533104280857,
"Nucleotide GTR":0.001119371862987536,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "C", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "TGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428957_Luxembourg_20200407_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429129_Norrbotten_20200327_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001134588655088527,
"Nucleotide GTR":0.001118440855474036,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "I", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATT", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429129_Norrbotten_20200327_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135823649362245,
"Nucleotide GTR":0.001119658272945828,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "S", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "TCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429315_Unknown_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001136067036891541,
"Nucleotide GTR":0.001119898196512186,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "V", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GTA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429315_Unknown_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429467_Unknown_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135823670348141,
"Nucleotide GTR":0.001119658293633047,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "L", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TTA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429467_Unknown_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "H", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CAT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429607_Washington_20200331_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001136010334393523,
"Nucleotide GTR":0.001119842301020805,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "H", "G", "C", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CAT", "GGA", "TGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429607_Washington_20200331_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429640_Connecticut_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134797203690766,
"Nucleotide GTR":0.001118646435951198,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "I", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "ATA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429640_Connecticut_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001135823656970562,
"Nucleotide GTR":0.00111965828044586,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_429844_Iowa_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "L"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "CTC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429844_Iowa_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430234_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134902082832656,
"Nucleotide GTR":0.001118749822422277,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCC", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430234_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001134588660379123,
"Nucleotide GTR":0.001118440860689335,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "H", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAT", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430394_New_Jersey_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001134588662935257,
"Nucleotide GTR":0.001118440863209088,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "F", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "TTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430394_New_Jersey_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430398_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871797509183,
"Nucleotide GTR":0.001118719968128439,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "M", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATG", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430398_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430639_Victoria_20200326_null_45":{
"Global MG94xREV":0.001134989917416629,
"Nucleotide GTR":0.001118836406918605,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "R", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "CGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430639_Victoria_20200326_null_45",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001135823663823513,
"Nucleotide GTR":0.001119658287201279,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAT", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001135823663823513,
"Nucleotide GTR":0.001119658287201279,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAT", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430719_Madrid_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "I"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "ATC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430719_Madrid_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430742_Beijing_20200129_null_28":{
"Global MG94xREV":0.001134871797509183,
"Nucleotide GTR":0.001118719968128439,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "R", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AGG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430742_Beijing_20200129_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430802_Buenos_Aires_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001138858634318075,
"Nucleotide GTR":0.001122650063102664,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "M", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "ATG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430802_Buenos_Aires_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135812268733077,
"Nucleotide GTR":0.001119647054289124,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "S", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "AGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430867_Washington_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135823670348141,
"Nucleotide GTR":0.001119658293633047,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "L", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CTC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430867_Washington_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430881_USA_20200313_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCC", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430881_USA_20200313_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430892_Washington_20200312_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001135823670348141,
"Nucleotide GTR":0.001119658293633047,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGT", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430892_Washington_20200312_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430918_Washington_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135823677396706,
"Nucleotide GTR":0.001119658300581296,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "M", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ATG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430918_Washington_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432276_Wales_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135870743691857,
"Nucleotide GTR":0.001119704697015082,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "F", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "TTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432276_Wales_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432352_Wales_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00113570358023737,
"Nucleotide GTR":0.001119539912680071,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAA", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432352_Wales_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432378_Wales_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134952758422602,
"Nucleotide GTR":0.001118799776782315,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTC", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432378_Wales_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432403_Wales_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001135870732112252,
"Nucleotide GTR":0.001119704685600283,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAT", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432403_Wales_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432745_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134793809511523,
"Nucleotide GTR":0.001118643090078913,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "N", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAT", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432745_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432942_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAG", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432942_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433194_Scotland_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135870722615894,
"Nucleotide GTR":0.001119704676239078,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "F", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TTT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433194_Scotland_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433696_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135870755054008,
"Nucleotide GTR":0.001119704708215524,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "I", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ATT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433696_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433827_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "F", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAG", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTT", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433827_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433893_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134851235666223,
"Nucleotide GTR":0.00111869969892768,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "V", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "F", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAG", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GTA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTT", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433893_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434024_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871791500711,
"Nucleotide GTR":0.001118719962205482,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "V", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "GTT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434024_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434077_Washington_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "H", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CAC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434077_Washington_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434340_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113487179401291,
"Nucleotide GTR":0.001118719964681927,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "G", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "GGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434340_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434370_Antwerp_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871790460675,
"Nucleotide GTR":0.001118719961180249,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "G", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GGT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434370_Antwerp_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134588545385318,
"Nucleotide GTR":0.001118440747332155,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "F", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "TTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135565731168652,
"Nucleotide GTR":0.001119404025519864,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGG", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434622_Occitanie_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134918839786274,
"Nucleotide GTR":0.001118766340886001,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "S", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AGT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434622_Occitanie_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134871782513907,
"Nucleotide GTR":0.001118719953346582,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "V", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "GTA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434941_Texas_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134952824638486,
"Nucleotide GTR":0.001118799842055794,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "CTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434941_Texas_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135656454805419,
"Nucleotide GTR":0.001119493457951135,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "I", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATA", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":5294.622569006494,
"Equilibrium frequencies": [
[0.03664239121591539],
[0.01166403148402283],
[0.01683666603160466],
[0.05006938327411346],
[0.02214602647583784],
[0.007049538566903888],
[0.01017578927924346],
[0.030261067873097],
[0.01754295944778515],
[0.005584287065660322],
[0.008060744389958163],
[0.0239712838383722],
[0.03149385920003237],
[0.01002514718807449],
[0.01447098761303039],
[0.04303425772012602],
[0.01666812220653309],
[0.005305808265921742],
[0.007658768919084049],
[0.02277587710640948],
[0.01007392431114191],
[0.003206738600667134],
[0.004628827257886209],
[0.01376534556483564],
[0.007980052126427042],
[0.002540215748975461],
[0.003666722288284816],
[0.01090420890140856],
[0.01432612546512741],
[0.004560302232588147],
[0.006582654187657153],
[0.01957569478803409],
[0.03079699564038676],
[0.009803321094578602],
[0.01415078855849237],
[0.04208204015189854],
[0.01861317065279386],
[0.005924957441570552],
[0.008552491463336566],
[0.02543365605889906],
[0.01474441016824955],
[0.00469345091051566],
[0.006774850155739541],
[0.02014725293212226],
[0.02646978573988573],
[0.008425880626242116],
[0.01216249615928495],
[0.03616919648023283],
[0.009653385174449771],
[0.04143842057132979],
[0.01832849336420796],
[0.005834338768862043],
[0.008421686232682794],
[0.02504466353415761],
[0.00462166739204692],
[0.006671232883385021],
[0.01983911277458763],
[0.02606494623271937],
[0.00829701183245243],
[0.01197647807060741],
[0.03561601029952278]
],
"Log Likelihood":-2463.581837567522,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.6250164177450469, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":183
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":5659.943200587383,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3154430708610275],
[0.159727785114782],
[0.1944691015898446],
[0.3303600424343459]
],
"Log Likelihood":-2514.254034567295,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2156482065930219,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.09102808181556647,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.752306972506806,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.6558180415157091
},
"display order":0,
"estimated parameters":315
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-02/sequences.methyltransferase.compressed.fas",
"number of sequences":155,
"number of sites":299,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1,epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_4,epi_isl_420759_England_20200326_null_2,epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1,epi_isl_434622_Occitanie_20200301_null_1,epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1,epi_isl_434024_England_20200415_null_1,(epi_isl_429598_Washington_20200331_null_3,epi_isl_429607_Washington_20200331_null_6)Node298,epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1,epi_isl_423319_England_20200326_null_2,epi_isl_421552_Wyoming_20200319_null_1,epi_isl_416401_Shanghai_20200202_null_2,epi_isl_422507_New_York_20200320_null_1,epi_isl_428773_New_York_20200405_null_2,(epi_isl_422957_Zuid_Holland_20200329_null_1,epi_isl_422958_Zuid_Holland_20200329_null_10)Node276,epi_isl_434941_Texas_20200401_null_1,epi_isl_430892_Washington_20200312_null_3,epi_isl_420270_South_Yorkshire_20200322_null_9,epi_isl_433194_Scotland_20200419_null_1,epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1,epi_isl_432378_Wales_20200408_null_1,epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1,epi_isl_422804_Netherlands_20200307_null_3,epi_isl_430918_Washington_20200406_null_1,epi_isl_424185_USA_20200318_null_1,epi_isl_418252_Madrid_20200304_null_1,epi_isl_413015_Ontario_20200123_null_13775,((epi_isl_420282_South_Yorkshire_20200321_null_1,epi_isl_430881_USA_20200313_null_10)Node240,epi_isl_422886_Noord_Brabant_20200324_null_2)Node239,epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2,epi_isl_428789_New_York_20200406_null_2,epi_isl_417538_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_14,epi_isl_422875_Noord_Brabant_20200311_null_3,epi_isl_420943_Wales_20200321_null_1,epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1,epi_isl_427380_Liege_20200408_null_2,epi_isl_430742_Beijing_20200129_null_28,epi_isl_421236_Hangzhou_20200120_null_2,epi_isl_414007_England_20200228_null_3,epi_isl_430324_New_York_20200410_null_2,epi_isl_425130_Duesseldorf_20200321_null_4,(epi_isl_427527_New_York_20200312_null_1,epi_isl_429640_Connecticut_20200407_null_1)Node199,epi_isl_428306_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_402121_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_425896_Scotland_20200322_null_3,epi_isl_420841_Sud_Kivu_20200322_null_1,epi_isl_418022_Portugal_20200315_null_1,epi_isl_426914_Victoria_20200329_null_4,epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_2,epi_isl_428286_Wisconsin_20200323_null_3,epi_isl_428957_Luxembourg_20200407_null_5,epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_1,epi_isl_423969_England_20200320_null_2,epi_isl_421969_England_20200401_null_1,epi_isl_417388_New_South_Wales_20200305_null_4,epi_isl_424973_Taoyuan_20200317_null_1,epi_isl_423092_England_20200324_null_1,epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_2,epi_isl_427032_Victoria_20200330_null_1,epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_1,epi_isl_430394_New_Jersey_20200409_null_2,epi_isl_422849_Netherlands_20200316_null_1,epi_isl_427158_Victoria_20200330_null_1,epi_isl_417005_Li_ge_20200305_null_2,epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1,epi_isl_423829_England_20200323_null_7,epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_6,epi_isl_415622_Washington_20200309_null_1,epi_isl_418405_Finland_20200314_null_2,epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_5,epi_isl_434370_Antwerp_20200405_null_1,((epi_isl_428717_Kocaeli_20200319_null_1,epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_3)Node174,epi_isl_434077_Washington_20200404_null_2)Node173,epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1,epi_isl_422119_Wales_20200327_null_9,epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_2,epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_1,epi_isl_423903_England_20200318_null_1,epi_isl_425797_Scotland_20200306_null_5,epi_isl_416703_Washington_20200313_null_2,epi_isl_425645_England_20200318_null_14,epi_isl_423107_England_20200323_null_1,epi_isl_419840_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_432403_Wales_20200330_null_3,epi_isl_427775_New_South_Wales_20200325_null_11,epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1,epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1,(epi_isl_414590_Minnesota_20200309_null_1,epi_isl_416346_Shanghai_20200130_null_1)Node72,epi_isl_414588_Minnesota_20200305_null_1,epi_isl_430867_Washington_20200311_null_1,epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1,epi_isl_433696_England_20200401_null_1,epi_isl_416704_Washington_20200315_null_1,epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1,epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_1,epi_isl_424140_England_20200321_null_1,(epi_isl_433827_England_20200408_null_1,epi_isl_433893_England_20200410_null_1)Node121,epi_isl_429315_Unknown_20200318_null_4,epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1,epi_isl_432276_Wales_20200407_null_2,epi_isl_425919_Scotland_20200324_null_7,epi_isl_423445_England_20200327_null_1,epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_430802_Buenos_Aires_20200331_null_1,epi_isl_423217_England_20200325_null_1,epi_isl_426086_Washington_20200325_null_3,epi_isl_415453_Wales_20200310_null_1,epi_isl_429129_Norrbotten_20200327_null_5,epi_isl_430398_New_York_20200410_null_1,epi_isl_419936_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_418692_England_20200317_null_1,epi_isl_424099_England_20200313_null_1,epi_isl_430234_Washington_20200319_null_1,epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_9,epi_isl_427080_Victoria_20200323_null_11,epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1,epi_isl_402127_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_428922_Sverdlovsk_Region_20200330_null_6,(epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1,epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_4)Node21,epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_424440_Reykjavik_20200319_null_2,epi_isl_420687_England_20200328_null_3,epi_isl_415742_Taoyuan_20200227_null_1,epi_isl_418992_Singapore_20200210_null_1,epi_isl_425672_Scotland_20200311_null_3,epi_isl_427717_New_South_Wales_20200317_null_1,epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_1,epi_isl_421414_New_York_20200318_null_2,epi_isl_420179_South_Yorkshire_20200327_null_1,epi_isl_432352_Wales_20200327_null_3,epi_isl_416153_Copenhagen_20200302_null_1,epi_isl_429467_Unknown_20200323_null_2,epi_isl_434340_Washington_20200325_null_1,epi_isl_418357_Ontario_20200312_null_1,((epi_isl_426161_Iowa_20200406_null_1,epi_isl_429844_Iowa_20200409_null_1)Node52,epi_isl_430719_Madrid_20200311_null_2)Node51,epi_isl_430639_Victoria_20200326_null_45,epi_isl_419884_Victoria_20200319_null_1,epi_isl_426054_Connecticut_20200330_null_1,epi_isl_428346_Istanbul_20200417_null_29,(epi_isl_432745_England_20200401_null_1,epi_isl_432942_England_20200330_null_1)Node97,epi_isl_422534_New_York_20200319_null_3)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node121":"test",
"Node173":"test",
"Node174":"test",
"Node199":"test",
"Node21":"test",
"Node239":"test",
"Node240":"test",
"Node276":"test",
"Node298":"test",
"Node51":"test",
"Node52":"test",
"Node72":"test",
"Node97":"test",
"epi_isl_402121_Hubei_20191230_null_1":"test",
"epi_isl_402127_Hubei_20191230_null_1":"test",
"epi_isl_413015_Ontario_20200123_null_13775":"test",
"epi_isl_414007_England_20200228_null_3":"test",
"epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_414588_Minnesota_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_414590_Minnesota_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_415453_Wales_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_415622_Washington_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_415742_Taoyuan_20200227_null_1":"test",
"epi_isl_416153_Copenhagen_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_416346_Shanghai_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_416401_Shanghai_20200202_null_2":"test",
"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1":"test",
"epi_isl_416703_Washington_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_416704_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_417005_Li_ge_20200305_null_2":"test",
"epi_isl_417388_New_South_Wales_20200305_null_4":"test",
"epi_isl_417538_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_2":"test",
"epi_isl_418022_Portugal_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1":"test",
"epi_isl_418252_Madrid_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_418357_Ontario_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418405_Finland_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_418692_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418992_Singapore_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_2":"test",
"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419840_Victoria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419884_Victoria_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419936_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_420179_South_Yorkshire_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420270_South_Yorkshire_20200322_null_9":"test",
"epi_isl_420282_South_Yorkshire_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420687_England_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_420759_England_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_420841_Sud_Kivu_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420943_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421236_Hangzhou_20200120_null_2":"test",
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":"test",
"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_1":"test",
"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421414_New_York_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_421552_Wyoming_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421969_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_9":"test",
"epi_isl_422507_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422534_New_York_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422804_Netherlands_20200307_null_3":"test",
"epi_isl_422849_Netherlands_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_422875_Noord_Brabant_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_422886_Noord_Brabant_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_422957_Zuid_Holland_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422958_Zuid_Holland_20200329_null_10":"test",
"epi_isl_423092_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423107_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423217_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423319_England_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_423445_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423829_England_20200323_null_7":"test",
"epi_isl_423903_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423969_England_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_424099_England_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_424140_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424185_USA_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_424440_Reykjavik_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_14":"test",
"epi_isl_424973_Taoyuan_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425130_Duesseldorf_20200321_null_4":"test",
"epi_isl_425645_England_20200318_null_14":"test",
"epi_isl_425672_Scotland_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_425797_Scotland_20200306_null_5":"test",
"epi_isl_425896_Scotland_20200322_null_3":"test",
"epi_isl_425919_Scotland_20200324_null_7":"test",
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_6":"test",
"epi_isl_426054_Connecticut_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_426086_Washington_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_426161_Iowa_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426914_Victoria_20200329_null_4":"test",
"epi_isl_427032_Victoria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427080_Victoria_20200323_null_11":"test",
"epi_isl_427158_Victoria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427380_Liege_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_427527_New_York_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_427717_New_South_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_427732_New_South_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_427775_New_South_Wales_20200325_null_11":"test",
"epi_isl_428286_Wisconsin_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_428306_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_428346_Istanbul_20200417_null_29":"test",
"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_428717_Kocaeli_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_428773_New_York_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_428789_New_York_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_428922_Sverdlovsk_Region_20200330_null_6":"test",
"epi_isl_428957_Luxembourg_20200407_null_5":"test",
"epi_isl_429129_Norrbotten_20200327_null_5":"test",
"epi_isl_429134_Norrbotten_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_429315_Unknown_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_429467_Unknown_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_429607_Washington_20200331_null_6":"test",
"epi_isl_429640_Connecticut_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_429641_Connecticut_20200406_null_5":"test",
"epi_isl_429844_Iowa_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_430234_Washington_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_2":"test",
"epi_isl_430394_New_Jersey_20200409_null_2":"test",
"epi_isl_430398_New_York_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430639_Victoria_20200326_null_45":"test",
"epi_isl_430679_Victoria_20200410_null_9":"test",
"epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_4":"test",
"epi_isl_430719_Madrid_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_430742_Beijing_20200129_null_28":"test",
"epi_isl_430802_Buenos_Aires_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_430867_Washington_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_430881_USA_20200313_null_10":"test",
"epi_isl_430892_Washington_20200312_null_3":"test",
"epi_isl_430918_Washington_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_432276_Wales_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_432352_Wales_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_432378_Wales_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_432403_Wales_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_432745_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_432942_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_433194_Scotland_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_433696_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_433827_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_433893_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_434024_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_434077_Washington_20200404_null_2":"test",
"epi_isl_434340_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_434370_Antwerp_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_434622_Occitanie_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_434941_Texas_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":20
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":7
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":28
}
}
}